Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 699 total aligned reads displayed.
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|
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AAATTAGGAAATAAACATTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTC < SRR13214403.3242827/150‑1 (MQ=40)
AAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTC > SRR13214403.3947920/1‑150 (MQ=21)
AATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCG > SRR13214403.3294852/1‑150 (MQ=47)
AAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCG > SRR13214403.4100981/1‑150 (MQ=21)
ATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGT > SRR13214403.2770602/1‑150 (MQ=45)
AGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGT > SRR13214403.674666/1‑150 (MQ=21)
GTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTT < SRR13214403.3545463/150‑1 (MQ=21)
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GAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGAT > SRR13214403.1845565/1‑150 (MQ=12)
GAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGAT > SRR13214403.2817942/1‑150 (MQ=12)
AATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAA > SRR13214403.2910781/1‑150 (MQ=8)
NTAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAA > SRR13214403.4521694/1‑150 (MQ=3)
ATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAA < SRR13214403.1945406/150‑1 (MQ=29)
ATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAA < SRR13214403.3035460/150‑1 (MQ=29)
TAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAG < SRR13214403.664290/150‑1 (MQ=3)
TAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAG > SRR13214403.2388722/1‑150 (MQ=27)
AAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGC > SRR13214403.942517/1‑150 (MQ=1)
AAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGC > SRR13214403.1191091/1‑150 (MQ=25)
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ACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGT > SRR13214403.1510565/1‑150 (MQ=20)
ACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGT > SRR13214403.2945226/1‑150 (MQ=20)
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CTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTC > SRR13214403.3740637/1‑150 (MQ=20)
CTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTC < SRR13214403.2586921/150‑1 (MQ=20)
TTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCT < SRR13214403.2552145/150‑1 (MQ=20)
TTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCT < SRR13214403.1247018/150‑1 (MQ=20)
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GTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTG > SRR13214403.3858377/1‑150 (MQ=20)
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TGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTC > SRR13214403.1328796/1‑150 (MQ=0)
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GTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAACAGTCAGATGTTGCAAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAG < SRR13214403.3460393/150‑1 (MQ=0)
GTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAG > SRR13214403.2218613/1‑150 (MQ=20)
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CTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAA > SRR13214403.1604285/1‑150 (MQ=16)
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AGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATA < SRR13214403.569534/150‑1 (MQ=5)
GCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGCGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAA < SRR13214403.3778017/150‑1 (MQ=5)
GCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAA > SRR13214403.1109935/1‑150 (MQ=5)
GCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGCTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAA > SRR13214403.4050347/1‑150 (MQ=5)
CTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAA < SRR13214403.542759/150‑1 (MQ=5)
CTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAA < SRR13214403.3637502/150‑1 (MQ=5)
TTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAAC < SRR13214403.3939285/150‑1 (MQ=5)
TTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAAC > SRR13214403.1649973/1‑150 (MQ=5)
TTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAAC > SRR13214403.2445880/1‑150 (MQ=5)
TTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCGTAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACA < SRR13214403.4188974/150‑1 (MQ=5)
TTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACA > SRR13214403.3686272/1‑150 (MQ=6)
TTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACA < SRR13214403.2102262/150‑1 (MQ=5)
TAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAA > SRR13214403.2981641/1‑150 (MQ=6)
TAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAA > SRR13214403.3268855/1‑150 (MQ=5)
AAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAA < SRR13214403.3593970/150‑1 (MQ=3)
AAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAA < SRR13214403.3106060/150‑1 (MQ=3)
AGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAA > SRR13214403.23060/1‑150 (MQ=1)
GCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAA < SRR13214403.552462/150‑1 (MQ=0)
GCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAA < SRR13214403.1594502/150‑1 (MQ=0)
CGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAAC > SRR13214403.3017813/1‑150 (MQ=0)
CGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAAC > SRR13214403.1572400/1‑150 (MQ=0)
GTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACT < SRR13214403.887709/150‑1 (MQ=0)
TTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTT > SRR13214403.4589743/1‑150 (MQ=0)
TTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTT > SRR13214403.1088551/1‑150 (MQ=0)
TCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAccaccg < SRR13214403.4155598/150‑7 (MQ=0)
TCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTT < SRR13214403.1546659/150‑1 (MQ=0)
TCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTT > SRR13214403.3700854/1‑150 (MQ=0)
CACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTG > SRR13214403.779583/1‑150 (MQ=0)
ACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGG < SRR13214403.2616894/150‑1 (MQ=0)
TAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGA < SRR13214403.3660633/150‑1 (MQ=0)
TAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGA > SRR13214403.733459/1‑150 (MQ=0)
AAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAG > SRR13214403.3924789/1‑150 (MQ=0)
AAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAG < SRR13214403.2876242/150‑1 (MQ=0)
AAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGT < SRR13214403.222271/150‑1 (MQ=0)
AATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTG > SRR13214403.3094811/1‑150 (MQ=0)
TGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTG < SRR13214403.1009684/150‑1 (MQ=0)
GCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGC > SRR13214403.2851109/1‑150 (MQ=0)
CAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCT < SRR13214403.851558/150‑1 (MQ=0)
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GTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTAT < SRR13214403.4024799/150‑1 (MQ=0)
GTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTAT < SRR13214403.3371988/150‑1 (MQ=0)
TACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATT > SRR13214403.642505/1‑150 (MQ=0)
ACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAGTGTGCTATTA > SRR13214403.833031/1‑150 (MQ=0)
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GCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATA < SRR13214403.596740/150‑1 (MQ=0)
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GTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATA > SRR13214403.4603895/1‑150 (MQ=8)
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TCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGC < SRR13214403.2983687/150‑1 (MQ=8)
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TTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCAC > SRR13214403.3554895/1‑150 (MQ=10)
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TTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAATCGCTTCAATGCTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATA < SRR13214403.2882460/150‑1 (MQ=0)
TTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATT < SRR13214403.1753224/150‑1 (MQ=22)
TTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATT < SRR13214403.315074/150‑1 (MQ=0)
TTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATT < SRR13214403.4488558/150‑1 (MQ=0)
GAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTA < SRR13214403.4627299/150‑1 (MQ=0)
CCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTT < SRR13214403.2968328/150‑1 (MQ=0)
CCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTT < SRR13214403.87191/150‑1 (MQ=22)
CCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTT > SRR13214403.2073696/1‑150 (MQ=22)
CTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTACTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTT > SRR13214403.1504083/1‑150 (MQ=0)
CTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTT > SRR13214403.453900/1‑150 (MQ=22)
CTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTT < SRR13214403.3836115/150‑1 (MQ=22)
CTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTT < SRR13214403.2146793/150‑1 (MQ=0)
TCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGTGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTC < SRR13214403.1173167/150‑1 (MQ=0)
TCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTC < SRR13214403.2006268/150‑1 (MQ=0)
CAAGGGGAACACTCGTTTGATAAATCGCTTCAATGCTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGATTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTTTTC < SRR13214403.502946/150‑1 (MQ=0)
AAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCA > SRR13214403.4064573/1‑150 (MQ=0)
AAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCA > SRR13214403.3517317/1‑150 (MQ=0)
AAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCAA < SRR13214403.2620968/150‑1 (MQ=0)
AAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCA > SRR13214403.1135093/1‑150 (MQ=22)
AAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCA > SRR13214403.3806294/1‑150 (MQ=0)
AAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCA > SRR13214403.79469/1‑150 (MQ=0)
AGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAA < SRR13214403.772317/150‑1 (MQ=0)
GGGGAACACTCGTTTGATAAATCGCTTCAATGCTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTCGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTTTTCAAT > SRR13214403.2795493/1‑150 (MQ=0)
GGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAAT > SRR13214403.908534/1‑150 (MQ=0)
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GGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATG < SRR13214403.4225101/150‑1 (MQ=0)
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GGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATG > SRR13214403.4346111/1‑150 (MQ=0)
GGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGA < SRR13214403.228035/150‑1 (MQ=0)
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GAACACTCGTTTGATAAAGTGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGTTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGAGAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAA > SRR13214403.1122478/1‑150 (MQ=0)
AACACTCGTTTGATAAATCGCTTCAATGCTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGTAAGCGTGCTATTATAAGTCATATAGGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATATATTTTTCAATGAAA < SRR13214403.1695654/150‑1 (MQ=0)
ACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAAT < SRR13214403.1496078/150‑1 (MQ=0)
ACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAAT < SRR13214403.2693866/150‑1 (MQ=0)
CACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATT > SRR13214403.979772/1‑150 (MQ=0)
ACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTA < SRR13214403.2336584/150‑1 (MQ=22)
|
AGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTA > CP043523/248516‑248814
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
