Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F83 I1 R1
|
393 |
530.9 |
9427126 |
91.1% |
8588111 |
148.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 589 total aligned reads displayed.
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|
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ATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGG < SRR13214404.86347/150‑1 (MQ=60)
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ATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATC < SRR13214404.2950322/150‑1 (MQ=60)
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ttttTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATC < SRR13214404.3549235/146‑1 (MQ=60)
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ATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCT > SRR13214404.2068667/1‑150 (MQ=60)
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TAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTC < SRR13214404.680062/150‑1 (MQ=60)
AGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCC < SRR13214404.4256079/150‑1 (MQ=60)
GACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCT > SRR13214404.1339553/1‑150 (MQ=60)
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AATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATAT > SRR13214404.32713/1‑150 (MQ=60)
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TTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATGCCTCCTATATAAAACGTT > SRR13214404.1791410/1‑150 (MQ=60)
TTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTT < SRR13214404.3552427/150‑1 (MQ=60)
TTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTT < SRR13214404.2072586/150‑1 (MQ=60)
CCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGT > SRR13214404.3321535/1‑150 (MQ=60)
CCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGG > SRR13214404.666238/1‑150 (MQ=60)
AATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGT > SRR13214404.2653408/1‑150 (MQ=60)
TCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTT < SRR13214404.3893915/150‑1 (MQ=60)
CCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTA < SRR13214404.1470868/150‑1 (MQ=60)
AATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGG > SRR13214404.1640473/1‑150 (MQ=60)
ATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGG < SRR13214404.2290986/150‑1 (MQ=60)
TTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGT > SRR13214404.4502666/1‑150 (MQ=60)
TTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGT < SRR13214404.1437930/150‑1 (MQ=60)
TAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTT < SRR13214404.427429/150‑1 (MQ=60)
TAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTT < SRR13214404.927554/150‑1 (MQ=60)
AAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTA < SRR13214404.3998484/150‑1 (MQ=60)
AAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTA > SRR13214404.1817234/1‑150 (MQ=60)
AAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTAT > SRR13214404.1095340/1‑150 (MQ=60)
AAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTAT > SRR13214404.3835737/1‑150 (MQ=60)
AAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATC > SRR13214404.3239371/1‑150 (MQ=60)
AATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCG > SRR13214404.736275/1‑150 (MQ=60)
ATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGT > SRR13214404.3667971/1‑150 (MQ=60)
ATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGT > SRR13214404.754613/1‑150 (MQ=60)
ATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGT > SRR13214404.3385889/1‑150 (MQ=60)
TAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATC < SRR13214404.370887/150‑1 (MQ=60)
AAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTT < SRR13214404.1367196/150‑1 (MQ=60)
ACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTA < SRR13214404.1753291/150‑1 (MQ=60)
CCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTAC < SRR13214404.2438746/150‑1 (MQ=60)
CCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTAC < SRR13214404.2604093/150‑1 (MQ=60)
CAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACT > SRR13214404.369094/1‑150 (MQ=60)
AGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTT > SRR13214404.4353048/1‑150 (MQ=60)
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AGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTT > SRR13214404.4103764/1‑150 (MQ=60)
AGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTT < SRR13214404.4680422/150‑1 (MQ=60)
AATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAA < SRR13214404.622484/150‑1 (MQ=60)
AATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAA > SRR13214404.4191997/1‑150 (MQ=60)
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ATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAAT > SRR13214404.3759473/1‑150 (MQ=60)
ATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAAT < SRR13214404.2711692/150‑1 (MQ=60)
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ATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAAT < SRR13214404.2692219/150‑1 (MQ=60)
CATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGT > SRR13214404.2746729/1‑150 (MQ=60)
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ATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTA < SRR13214404.2315616/150‑1 (MQ=60)
TTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTAT < SRR13214404.2162895/150‑1 (MQ=60)
TTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTAT < SRR13214404.1239185/150‑1 (MQ=60)
TTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATT < SRR13214404.3175036/150‑1 (MQ=60)
TTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATT > SRR13214404.2527370/1‑150 (MQ=60)
TCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGCCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGA < SRR13214404.569639/150‑1 (MQ=60)
CAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACT < SRR13214404.195325/150‑1 (MQ=60)
CAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACT < SRR13214404.81164/150‑1 (MQ=60)
TCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTAC > SRR13214404.4374866/1‑150 (MQ=60)
CCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACT > SRR13214404.2194832/1‑150 (MQ=60)
ATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTA > SRR13214404.3936192/1‑150 (MQ=60)
TAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAA > SRR13214404.2919278/1‑150 (MQ=60)
TAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAA < SRR13214404.4053853/150‑1 (MQ=60)
TGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAG < SRR13214404.2115972/150‑1 (MQ=60)
AGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAG > SRR13214404.4001415/1‑150 (MQ=60)
GTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGT > SRR13214404.4490020/1‑150 (MQ=60)
GTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGT > SRR13214404.249035/1‑150 (MQ=60)
GTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGT > SRR13214404.2189746/1‑150 (MQ=60)
TGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTT > SRR13214404.1662626/1‑150 (MQ=60)
GAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTT < SRR13214404.176514/150‑1 (MQ=60)
AAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTA > SRR13214404.3652354/1‑150 (MQ=60)
AAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTA > SRR13214404.3038096/1‑150 (MQ=60)
AAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTA < SRR13214404.2801257/150‑1 (MQ=60)
AGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAA < SRR13214404.3054769/150‑1 (MQ=60)
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GATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAAC < SRR13214404.2496722/150‑1 (MQ=60)
ATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACC < SRR13214404.727031/150‑1 (MQ=60)
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TACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCG < SRR13214404.3200302/150‑1 (MQ=60)
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ACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTAT < SRR13214404.3015840/150‑1 (MQ=60)
ACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTAT < SRR13214404.829550/150‑1 (MQ=60)
CAGAGCAATGTGTGCATCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATG < SRR13214404.2342769/150‑1 (MQ=60)
AGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGT > SRR13214404.152866/1‑150 (MQ=60)
AGCAATGAGTTCTCCTACTATTCTCCCTTTAATTGGTTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGTCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTC < SRR13214404.2244199/150‑1 (MQ=60)
GCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCC > SRR13214404.329278/1‑150 (MQ=60)
GCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCC > SRR13214404.2542290/1‑150 (MQ=60)
GCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCC < SRR13214404.1538358/150‑1 (MQ=60)
ATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAAT < SRR13214404.1447378/150‑1 (MQ=60)
TGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATC < SRR13214404.2994511/150‑1 (MQ=60)
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GAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCC < SRR13214404.4315484/150‑1 (MQ=60)
AGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCA > SRR13214404.4622443/1‑150 (MQ=60)
AGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCA < SRR13214404.2206015/150‑1 (MQ=60)
AGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCA < SRR13214404.3540029/150‑1 (MQ=60)
GTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAA > SRR13214404.1022134/1‑150 (MQ=60)
GTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAA > SRR13214404.3216813/1‑150 (MQ=60)
TGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAA < SRR13214404.3233567/150‑1 (MQ=60)
TGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAA < SRR13214404.3232894/150‑1 (MQ=60)
CACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGA > SRR13214404.4327876/1‑150 (MQ=60)
CTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAAC < SRR13214404.415630/150‑1 (MQ=60)
TACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACT > SRR13214404.1219006/1‑150 (MQ=60)
TACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACT > SRR13214404.3095788/1‑150 (MQ=60)
ACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTT > SRR13214404.113419/1‑150 (MQ=60)
CGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTT > SRR13214404.2418090/1‑150 (MQ=60)
CGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTT < SRR13214404.3287478/150‑1 (MQ=60)
ATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTT < SRR13214404.2633783/150‑1 (MQ=60)
TTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTA > SRR13214404.1298757/1‑150 (MQ=60)
CCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAAC > SRR13214404.2835370/1‑150 (MQ=60)
CCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACC > SRR13214404.1312352/1‑150 (MQ=60)
CCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACC < SRR13214404.187090/150‑1 (MQ=60)
CCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCC > SRR13214404.698435/1‑150 (MQ=60)
CCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCT < SRR13214404.2106530/150‑1 (MQ=60)
TATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTC > SRR13214404.2308975/1‑150 (MQ=60)
ATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCA > SRR13214404.972665/1‑150 (MQ=60)
ATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCA < SRR13214404.781694/150‑1 (MQ=60)
TAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCagaatc > SRR13214404.4038562/1‑144 (MQ=60)
TAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAA > SRR13214404.3337263/1‑150 (MQ=60)
AATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAAT < SRR13214404.2010890/150‑1 (MQ=60)
AATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAAT < SRR13214404.1721748/150‑1 (MQ=60)
AATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAAT < SRR13214404.919641/150‑1 (MQ=60)
AATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAAT < SRR13214404.3993711/150‑1 (MQ=60)
ATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATA < SRR13214404.4111800/150‑1 (MQ=60)
TTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGA > SRR13214404.4721967/1‑150 (MQ=60)
TCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAA < SRR13214404.612991/150‑1 (MQ=60)
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TTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAAT > CP043523/839034‑839332
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |