Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 486 total aligned reads displayed.
TCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGG > CP043523/839054‑839352
|
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tgattttTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATA < SRR13214403.911212/143‑1 (MQ=60)
attttTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAAT < SRR13214403.4144988/145‑1 (MQ=60)
ttttTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATC < SRR13214403.1029848/146‑1 (MQ=60)
ttttTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATC < SRR13214403.2148994/146‑1 (MQ=60)
ttttTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATC > SRR13214403.1641638/5‑150 (MQ=60)
TCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCA < SRR13214403.4438416/150‑1 (MQ=60)
TTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCAT > SRR13214403.1457992/1‑150 (MQ=60)
CTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCAT < SRR13214403.1188589/150‑1 (MQ=60)
TTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATT > SRR13214403.3116223/1‑150 (MQ=60)
TTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATT > SRR13214403.2920830/1‑150 (MQ=60)
TTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTG < SRR13214403.825133/150‑1 (MQ=60)
TAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGA > SRR13214403.1922430/1‑150 (MQ=60)
atggatcaacacgctgtgcttggaaaagagtgtagatctcggtggtcgccgtatcatCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGAT > SRR13214403.2072792/58‑150 (MQ=60)
AAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATC < SRR13214403.1220436/150‑1 (MQ=60)
AAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATC < SRR13214403.1295183/150‑1 (MQ=60)
AAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCC < SRR13214403.3030959/150‑1 (MQ=60)
AAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCC > SRR13214403.1401739/1‑150 (MQ=60)
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TAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTC < SRR13214403.1246691/150‑1 (MQ=60)
AGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCC < SRR13214403.2813186/150‑1 (MQ=60)
AGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCC > SRR13214403.570955/1‑150 (MQ=60)
GACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCT > SRR13214403.4416497/1‑150 (MQ=60)
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GACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCT < SRR13214403.1636247/150‑1 (MQ=60)
ACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTA > SRR13214403.3842744/1‑150 (MQ=60)
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TAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTC < SRR13214403.3715228/150‑1 (MQ=60)
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AACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTT < SRR13214403.4327721/150‑1 (MQ=60)
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AAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTT > SRR13214403.1260405/1‑150 (MQ=60)
AAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTT > SRR13214403.1924152/1‑150 (MQ=60)
AAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTT > SRR13214403.895512/1‑150 (MQ=60)
AATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTT < SRR13214403.4426459/150‑1 (MQ=60)
atcacATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTA < SRR13214403.3508313/145‑1 (MQ=60)
ATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTA < SRR13214403.2362686/150‑1 (MQ=60)
ATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTA > SRR13214403.4091785/1‑150 (MQ=60)
ATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTA > SRR13214403.1760122/1‑150 (MQ=60)
ATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTA < SRR13214403.1341405/150‑1 (MQ=60)
ATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTA < SRR13214403.4543649/150‑1 (MQ=60)
ATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTA < SRR13214403.2739833/150‑1 (MQ=60)
TCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTAC > SRR13214403.2006890/1‑150 (MQ=60)
CAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTT < SRR13214403.2879867/150‑1 (MQ=60)
CAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTT > SRR13214403.1505067/1‑150 (MQ=60)
CAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTT < SRR13214403.2428803/150‑1 (MQ=60)
CAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTT < SRR13214403.2918722/150‑1 (MQ=60)
AATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTT < SRR13214403.2941757/150‑1 (MQ=60)
AATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGAACCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTT < SRR13214403.726259/150‑1 (MQ=60)
ATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTA > SRR13214403.15648/1‑150 (MQ=60)
ATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTA > SRR13214403.270246/1‑150 (MQ=60)
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TAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAA < SRR13214403.117168/150‑1 (MQ=60)
TAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAA > SRR13214403.1274344/1‑150 (MQ=60)
TAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAA > SRR13214403.2895481/1‑150 (MQ=60)
TAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAA > SRR13214403.1579515/1‑150 (MQ=60)
GTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGT < SRR13214403.3532666/150‑1 (MQ=60)
GTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGT < SRR13214403.3478356/150‑1 (MQ=60)
GTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGT < SRR13214403.4058475/150‑1 (MQ=60)
TGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTT < SRR13214403.3423643/150‑1 (MQ=60)
GAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTT < SRR13214403.494570/150‑1 (MQ=60)
GAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTT > SRR13214403.2549736/1‑150 (MQ=60)
GAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTT < SRR13214403.3158055/150‑1 (MQ=60)
AAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTA < SRR13214403.4124929/150‑1 (MQ=60)
AAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTA > SRR13214403.3350852/1‑150 (MQ=60)
AAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTA > SRR13214403.2851340/1‑150 (MQ=60)
AGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAA > SRR13214403.3602538/1‑150 (MQ=60)
GATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAAC < SRR13214403.369168/150‑1 (MQ=60)
GATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAAC > SRR13214403.149120/1‑150 (MQ=60)
ATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACT > SRR13214403.2784160/1‑150 (MQ=60)
TACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCG < SRR13214403.846932/150‑1 (MQ=60)
ACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGT > SRR13214403.4034938/1‑150 (MQ=60)
ACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGT < SRR13214403.743157/150‑1 (MQ=60)
ACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGT < SRR13214403.663341/150‑1 (MQ=60)
ACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGT > SRR13214403.2970965/1‑150 (MQ=60)
CACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTA > SRR13214403.2720984/1‑150 (MQ=60)
ACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTAT > SRR13214403.3045072/1‑150 (MQ=60)
ACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTAT < SRR13214403.631243/150‑1 (MQ=60)
CAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTT < SRR13214403.536551/150‑1 (MQ=60)
AGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTC < SRR13214403.4592140/150‑1 (MQ=60)
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GCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCC < SRR13214403.733663/150‑1 (MQ=60)
GCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCC < SRR13214403.462920/150‑1 (MQ=60)
aattaaaaagacaactggctaaagttaaggaagaaCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATC < SRR13214403.1252991/115‑1 (MQ=60)
TGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATC < SRR13214403.1358810/150‑1 (MQ=60)
GAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCC < SRR13214403.2425705/150‑1 (MQ=60)
GAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCC < SRR13214403.1743632/150‑1 (MQ=60)
AGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCA < SRR13214403.3471999/150‑1 (MQ=60)
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TGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAA > SRR13214403.2876554/1‑150 (MQ=60)
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CACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGA > SRR13214403.2857879/1‑150 (MQ=60)
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TCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTATTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAA < SRR13214403.3981255/150‑1 (MQ=60)
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TATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTC > SRR13214403.1011371/1‑150 (MQ=60)
TATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTC < SRR13214403.1877398/150‑1 (MQ=60)
TATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTC > SRR13214403.3910659/1‑150 (MQ=60)
ATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCA > SRR13214403.1363126/1‑150 (MQ=60)
ATAATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCA > SRR13214403.555467/1‑150 (MQ=60)
AATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAAT < SRR13214403.357263/150‑1 (MQ=60)
AATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAAT < SRR13214403.3847510/150‑1 (MQ=60)
ATTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATG < SRR13214403.1720567/150‑1 (MQ=60)
ATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAAaatatacggcgaccaccg < SRR13214403.4320175/150‑19 (MQ=60)
ATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATA < SRR13214403.3956024/150‑1 (MQ=60)
TTGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGA > SRR13214403.2507699/1‑150 (MQ=60)
TGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGAT > SRR13214403.2848658/1‑150 (MQ=60)
CGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAAT > SRR13214403.3386204/1‑150 (MQ=60)
GGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATT < SRR13214403.1418323/150‑1 (MQ=60)
GGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTT > SRR13214403.2948992/1‑150 (MQ=60)
GTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTC > SRR13214403.1176067/1‑150 (MQ=60)
GTATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTC > SRR13214403.2616994/1‑150 (MQ=60)
TATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCC < SRR13214403.3459594/150‑1 (MQ=60)
TATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCC < SRR13214403.3458310/150‑1 (MQ=60)
TATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCC < SRR13214403.4488420/150‑1 (MQ=60)
TATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCC > SRR13214403.3236680/1‑150 (MQ=60)
TATCGA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCC > SRR13214403.3080561/1‑150 (MQ=60)
CGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCGATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGT > SRR13214403.3922104/1‑150 (MQ=60)
GA‑TTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTT > SRR13214403.2622254/1‑150 (MQ=60)
A‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTC > SRR13214403.1679778/1‑150 (MQ=60)
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TTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGA < SRR13214403.2165611/150‑1 (MQ=60)
TTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGA > SRR13214403.3402072/1‑150 (MQ=60)
TTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAAC < SRR13214403.1290061/150‑1 (MQ=60)
CGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTT > SRR13214403.3576665/1‑150 (MQ=60)
AGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGG < SRR13214403.1080570/150‑1 (MQ=60)
AATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAG > SRR13214403.799211/1‑150 (MQ=60)
AATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAG > SRR13214403.3277157/1‑150 (MQ=60)
AATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAG < SRR13214403.2521135/150‑1 (MQ=60)
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TCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA‑TTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGG > CP043523/839054‑839352
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |