Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F83 I1 R1
|
393 |
530.9 |
9427126 |
91.1% |
8588111 |
148.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 446 total aligned reads displayed.
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|
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AAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGA > SRR13214404.3312022/1‑150 (MQ=60)
ATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGA < SRR13214404.4646927/150‑1 (MQ=60)
ATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGA > SRR13214404.4687801/1‑150 (MQ=60)
TAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGAT > SRR13214404.1138464/1‑150 (MQ=60)
TAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGAT < SRR13214404.4086268/150‑1 (MQ=60)
TTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAA < SRR13214404.358793/150‑1 (MQ=60)
TTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAA < SRR13214404.1656379/150‑1 (MQ=60)
TTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAAT < SRR13214404.2485268/150‑1 (MQ=60)
TTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAAT < SRR13214404.2473595/150‑1 (MQ=60)
TTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATA < SRR13214404.2423315/150‑1 (MQ=60)
TTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATA < SRR13214404.485512/150‑1 (MQ=60)
ATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTGTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTC > SRR13214404.4229024/1‑150 (MQ=60)
TTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCT < SRR13214404.4183582/150‑1 (MQ=60)
TTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCT < SRR13214404.4444735/150‑1 (MQ=60)
TCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTG < SRR13214404.1982104/150‑1 (MQ=60)
CACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGC < SRR13214404.1856626/150‑1 (MQ=60)
CACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGC > SRR13214404.734698/1‑150 (MQ=60)
ACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCT > SRR13214404.1389961/1‑150 (MQ=60)
CATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTT > SRR13214404.1101160/1‑150 (MQ=60)
CATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTT < SRR13214404.3182872/150‑1 (MQ=60)
ATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTA > SRR13214404.1286578/1‑150 (MQ=60)
TTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAA < SRR13214404.2753752/150‑1 (MQ=60)
TTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAA > SRR13214404.2820882/1‑150 (MQ=60)
AAAACTTATTAGCAGAATTTAATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATATCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAACGTATTTTGCTGAAAAATTATTAAAAAGTTTCCATTATATAGATTAATATTCTGCTTCATTT > SRR13214404.2497639/1‑150 (MQ=60)
AAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTG < SRR13214404.2786969/150‑1 (MQ=60)
AACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGA < SRR13214404.551612/150‑1 (MQ=60)
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CTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGT > SRR13214404.4454583/1‑150 (MQ=60)
CTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGT > SRR13214404.2319567/1‑150 (MQ=60)
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TTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTA < SRR13214404.726284/150‑1 (MQ=60)
TTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTA < SRR13214404.3758130/150‑1 (MQ=60)
TTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTA > SRR13214404.1603212/1‑150 (MQ=60)
TATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAA > SRR13214404.3478284/1‑150 (MQ=60)
TATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATGCTGCTTAATTTGAGTAA > SRR13214404.4544908/1‑150 (MQ=60)
TTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCAGCTTAATTTGAGTAAAT > SRR13214404.4517954/1‑150 (MQ=60)
TAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATT > SRR13214404.3073172/1‑150 (MQ=60)
TAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATT > SRR13214404.1896502/1‑150 (MQ=60)
AGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTT > SRR13214404.1835087/1‑150 (MQ=60)
GCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTA < SRR13214404.2806771/150‑1 (MQ=60)
CAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTAT > SRR13214404.2176237/1‑150 (MQ=60)
CAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTAT < SRR13214404.2430058/150‑1 (MQ=60)
AGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATG < SRR13214404.645833/150‑1 (MQ=60)
AGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATG > SRR13214404.1967645/1‑150 (MQ=60)
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TTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAA > SRR13214404.1631843/1‑150 (MQ=60)
TTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGagatc > SRR13214404.4124615/1‑145 (MQ=60)
tagctttaaggcagtatatcctccccgTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGG < SRR13214404.1988823/123‑1 (MQ=60)
TCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGG < SRR13214404.2837610/150‑1 (MQ=60)
TCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGG > SRR13214404.658137/1‑150 (MQ=60)
TCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGG > SRR13214404.481750/1‑150 (MQ=60)
CATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGG < SRR13214404.3549331/150‑1 (MQ=60)
ATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGA < SRR13214404.508798/150‑1 (MQ=60)
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TCATTATAGCATAGAGACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGT < SRR13214404.229312/150‑1 (MQ=60)
TCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGT > SRR13214404.2264939/1‑150 (MQ=60)
TCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGT < SRR13214404.2458469/150‑1 (MQ=60)
ATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTC > SRR13214404.13821/1‑150 (MQ=60)
ATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTC > SRR13214404.4599315/1‑150 (MQ=60)
ATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTC > SRR13214404.2344393/1‑150 (MQ=60)
TTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCA > SRR13214404.2128839/1‑150 (MQ=60)
TAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACC < SRR13214404.2330983/150‑1 (MQ=60)
ACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCC > SRR13214404.1431584/1‑150 (MQ=60)
CATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCA < SRR13214404.4241475/150‑1 (MQ=60)
ATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAA > SRR13214404.2726291/1‑150 (MQ=60)
ATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAA > SRR13214404.264624/1‑150 (MQ=60)
ATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAA > SRR13214404.3780191/1‑150 (MQ=60)
AGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAG < SRR13214404.69759/150‑1 (MQ=60)
GAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGG > SRR13214404.191129/1‑150 (MQ=60)
GAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGG < SRR13214404.1006926/150‑1 (MQ=60)
GAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGG < SRR13214404.3353627/150‑1 (MQ=60)
AAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATGATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGC < SRR13214404.585852/150‑1 (MQ=60)
AAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGC > SRR13214404.3496043/1‑150 (MQ=60)
ACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGC > SRR13214404.3842896/1‑150 (MQ=60)
CGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAGAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCA < SRR13214404.4276474/150‑1 (MQ=60)
GGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCGCAA > SRR13214404.3424056/1‑150 (MQ=60)
GGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCGCAATA > SRR13214404.3220381/1‑150 (MQ=60)
AGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAATAAA > SRR13214404.1583538/1‑150 (MQ=60)
GGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAATAAAA > SRR13214404.289214/1‑150 (MQ=60)
GGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAATAAAA > SRR13214404.639445/1‑150 (MQ=60)
GGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAATAAAA < SRR13214404.3414945/150‑1 (MQ=60)
GATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCGCAATAAAAG > SRR13214404.2572994/1‑150 (MQ=60)
ATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCGCAATAAAAGA > SRR13214404.3714582/1‑150 (MQ=60)
TATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCGCAATAAAAGAA > SRR13214404.4020128/1‑150 (MQ=60)
TAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAATAAAAGAA < SRR13214404.3706170/150‑1 (MQ=60)
TAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAATAAAAGAA < SRR13214404.2950646/150‑1 (MQ=60)
ATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCGCAATAAAAGAAC > SRR13214404.2312374/1‑150 (MQ=60)
TACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCGCAATAAAAGAACG < SRR13214404.1786811/150‑1 (MQ=60)
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TTCAGTAATTTCATTTCTATTCTTAGCCATGAAGCTCACTCCTTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAATAAAAGAACG > CP043523/1318913‑1319211
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |