Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
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90.5% |
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150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 458 total aligned reads displayed.
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|
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ATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTA > SRR13214403.1162577/1‑150 (MQ=60)
ATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTA < SRR13214403.857507/150‑1 (MQ=60)
TTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAA < SRR13214403.2378974/150‑1 (MQ=60)
TTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAAT < SRR13214403.3128023/150‑1 (MQ=60)
TTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAAT > SRR13214403.3433196/1‑150 (MQ=60)
TTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATAT < SRR13214403.97542/150‑1 (MQ=60)
ATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTC > SRR13214403.3367129/1‑150 (MQ=60)
TCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTG < SRR13214403.3874555/150‑1 (MQ=60)
TCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTG < SRR13214403.2128993/150‑1 (MQ=60)
TCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTG > SRR13214403.422614/1‑150 (MQ=60)
NCATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCT > SRR13214403.269429/1‑150 (MQ=60)
ACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCT > SRR13214403.2761695/1‑150 (MQ=60)
CATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTT < SRR13214403.2643779/150‑1 (MQ=60)
CATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTT > SRR13214403.3217903/1‑150 (MQ=60)
TTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAA < SRR13214403.585009/150‑1 (MQ=60)
cgatctTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTCTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATT < SRR13214403.3609136/144‑1 (MQ=60)
AAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTtctaattctggtgaacttgaccaagcttcaccaacagtgagatagtcctttttaccaaaa > SRR13214403.630164/1‑90 (MQ=60)
AACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGA > SRR13214403.1785497/1‑150 (MQ=60)
ACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAG > SRR13214403.1419472/1‑150 (MQ=60)
CTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGT < SRR13214403.48839/150‑1 (MQ=60)
TATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAA < SRR13214403.1250470/150‑1 (MQ=60)
ATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAA < SRR13214403.3824757/150‑1 (MQ=60)
ATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAA < SRR13214403.4422063/150‑1 (MQ=60)
TAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATT < SRR13214403.3025232/150‑1 (MQ=60)
TAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTAGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATT > SRR13214403.4001260/1‑150 (MQ=60)
AGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTTGGTAAATTT > SRR13214403.1708700/1‑150 (MQ=60)
AGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTT < SRR13214403.4497995/150‑1 (MQ=60)
AGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTT > SRR13214403.3862592/1‑150 (MQ=60)
GCAGAATTTCATTCATTCATATCGTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTA < SRR13214403.4474377/150‑1 (MQ=60)
GCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTA > SRR13214403.3568087/1‑150 (MQ=60)
CAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTAT > SRR13214403.2292890/1‑150 (MQ=60)
CAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTAT < SRR13214403.3687127/150‑1 (MQ=60)
AGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATG > SRR13214403.2796623/1‑150 (MQ=60)
ATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAA < SRR13214403.1443752/150‑1 (MQ=60)
ATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAA > SRR13214403.3216676/1‑150 (MQ=60)
TTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAA < SRR13214403.726619/150‑1 (MQ=60)
TTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAG < SRR13214403.2772311/150‑1 (MQ=60)
TCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGG < SRR13214403.755919/150‑1 (MQ=60)
CATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGG < SRR13214403.4278658/150‑1 (MQ=60)
CATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGG < SRR13214403.482289/150‑1 (MQ=60)
ATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGA > SRR13214403.476852/1‑150 (MQ=60)
ATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGA > SRR13214403.976606/1‑150 (MQ=60)
ATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGA < SRR13214403.3308840/150‑1 (MQ=60)
TTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGAT > SRR13214403.3389266/1‑150 (MQ=60)
TCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATT > SRR13214403.3190864/1‑150 (MQ=60)
TCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATT < SRR13214403.4333377/150‑1 (MQ=60)
CATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTT > SRR13214403.1484598/1‑150 (MQ=60)
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ATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTC > SRR13214403.4356619/1‑150 (MQ=60)
TTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCA < SRR13214403.1910553/150‑1 (MQ=60)
TTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCA < SRR13214403.1358494/150‑1 (MQ=60)
TCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCAT > SRR13214403.751830/1‑150 (MQ=60)
TATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCAT < SRR13214403.4626697/150‑1 (MQ=60)
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TATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCAT < SRR13214403.171873/150‑1 (MQ=60)
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ATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATC > SRR13214403.479028/1‑150 (MQ=60)
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CTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAA > SRR13214403.1836475/1‑150 (MQ=60)
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TCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGGAAATTAATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTT > SRR13214403.4393009/1‑150 (MQ=60)
CTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTC < SRR13214403.2320153/150‑1 (MQ=60)
GCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAA > SRR13214403.3635669/1‑150 (MQ=60)
CTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAG < SRR13214403.4080742/150‑1 (MQ=60)
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ATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTC > SRR13214403.3262313/1‑150 (MQ=60)
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ATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAAC < SRR13214403.1226328/150‑1 (MQ=60)
TAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATC < SRR13214403.143102/150‑1 (MQ=60)
TAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATC < SRR13214403.1999/150‑1 (MQ=60)
TAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATC < SRR13214403.311519/150‑1 (MQ=60)
TAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACC < SRR13214403.4037747/150‑1 (MQ=60)
AACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCC > SRR13214403.2662272/1‑150 (MQ=60)
GCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCC < SRR13214403.3752827/150‑1 (MQ=60)
ATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAA > SRR13214403.1845099/1‑150 (MQ=60)
ATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAA > SRR13214403.3447762/1‑150 (MQ=60)
AGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAG > SRR13214403.2641518/1‑150 (MQ=60)
GAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGG < SRR13214403.2985677/150‑1 (MQ=60)
AAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGC > SRR13214403.425321/1‑150 (MQ=60)
AACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCG > SRR13214403.2534506/1‑150 (MQ=60)
AACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCG < SRR13214403.3621685/150‑1 (MQ=60)
ACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGC > SRR13214403.227599/1‑150 (MQ=60)
CGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCGCA > SRR13214403.2070286/1‑150 (MQ=60)
CGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCGCA > SRR13214403.3529285/1‑150 (MQ=60)
CGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCA > SRR13214403.356002/1‑150 (MQ=60)
GGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAA > SRR13214403.1955674/1‑150 (MQ=60)
GGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAA < SRR13214403.3242032/150‑1 (MQ=60)
GGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCGCAAT > SRR13214403.4585635/1‑150 (MQ=60)
GGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAAT < SRR13214403.1725377/150‑1 (MQ=60)
GGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAAT < SRR13214403.1390664/150‑1 (MQ=60)
GGAGGATAGACTTCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAATA < SRR13214403.530906/150‑1 (MQ=60)
GAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCGCAATAA > SRR13214403.1453419/1‑150 (MQ=60)
AGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAATAAA > SRR13214403.2006005/1‑150 (MQ=60)
GGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAATAAAA > SRR13214403.3736417/1‑150 (MQ=60)
GATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCGCAATAAAAG > SRR13214403.2731376/1‑150 (MQ=60)
ATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAATAAAAGA > SRR13214403.3550752/1‑150 (MQ=60)
ATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAATAAAAGA > SRR13214403.1323186/1‑150 (MQ=60)
ATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAATAAAAGA > SRR13214403.1298515/1‑150 (MQ=60)
TATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATCTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCGCAATAAAAGAA > SRR13214403.4240037/1‑150 (MQ=60)
TACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCCAAAGGCGCAATAAAAGCACG > SRR13214403.4128378/1‑150 (MQ=60)
GACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAATAAAAGAACG < SRR13214403.1613801/150‑1 (MQ=60)
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TTCAGTAATTTCATTTCTATTCTTAGCCATGAAGCTCACTCCTTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCCAAAGGCGCAATAAAAGAACG > CP043523/1318913‑1319211
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |