Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F83 I1 R1
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393 |
530.9 |
9427126 |
91.1% |
8588111 |
148.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 554 total aligned reads displayed.
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|
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TAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAAT < SRR13214404.1378032/150‑1 (MQ=60)
AAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCA > SRR13214404.2816598/1‑150 (MQ=60)
AAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCA > SRR13214404.1486184/1‑150 (MQ=60)
AGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCAC > SRR13214404.4091998/1‑150 (MQ=60)
AGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCAC > SRR13214404.2490735/1‑150 (MQ=60)
TCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGT > SRR13214404.2418683/1‑150 (MQ=60)
TCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGT > SRR13214404.4231740/1‑150 (MQ=60)
CAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTT > SRR13214404.3348249/1‑150 (MQ=60)
CAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTT < SRR13214404.440414/150‑1 (MQ=60)
AATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTG > SRR13214404.4368136/1‑150 (MQ=60)
AATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTG > SRR13214404.4611597/1‑150 (MQ=60)
ATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGA < SRR13214404.129208/150‑1 (MQ=60)
TCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAG > SRR13214404.787300/1‑150 (MQ=60)
CAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGT > SRR13214404.4245209/1‑150 (MQ=60)
AAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTA > SRR13214404.4741568/1‑150 (MQ=60)
AACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTAT < SRR13214404.2461525/150‑1 (MQ=60)
AACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTAT < SRR13214404.1782283/150‑1 (MQ=60)
AACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTAT > SRR13214404.4431784/1‑150 (MQ=60)
ACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATT > SRR13214404.3978685/1‑150 (MQ=60)
AACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGA > SRR13214404.1010220/1‑150 (MQ=60)
AACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGA > SRR13214404.4547594/1‑150 (MQ=60)
AACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGA < SRR13214404.4662098/150‑1 (MQ=60)
AACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGA > SRR13214404.1843227/1‑150 (MQ=60)
AACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGA < SRR13214404.3624723/150‑1 (MQ=60)
ACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAA < SRR13214404.67458/150‑1 (MQ=60)
ACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAA > SRR13214404.4049281/1‑150 (MQ=60)
GTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCCATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAAC > SRR13214404.2792608/1‑150 (MQ=60)
GTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAAC < SRR13214404.1015883/150‑1 (MQ=60)
GTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAAC > SRR13214404.3896/1‑150 (MQ=60)
GTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAAC > SRR13214404.1674874/1‑150 (MQ=60)
GTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAAC > SRR13214404.991166/1‑150 (MQ=60)
TTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACG < SRR13214404.2213085/150‑1 (MQ=60)
TAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGCAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGT > SRR13214404.3223678/1‑150 (MQ=60)
TAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGT < SRR13214404.4672340/150‑1 (MQ=60)
AGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTT < SRR13214404.2865675/150‑1 (MQ=60)
GCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTA < SRR13214404.692187/150‑1 (MQ=60)
GCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTA > SRR13214404.4359437/1‑150 (MQ=60)
CATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAACCCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGA < SRR13214404.1339531/150‑1 (MQ=60)
CATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGA > SRR13214404.2386043/1‑150 (MQ=60)
CATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGA < SRR13214404.375161/150‑1 (MQ=60)
TTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGT < SRR13214404.125824/150‑1 (MQ=60)
TTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGT < SRR13214404.644237/150‑1 (MQ=60)
TGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTC > SRR13214404.1075998/1‑150 (MQ=60)
TGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATC < SRR13214404.1944466/150‑1 (MQ=60)
TGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATC > SRR13214404.449745/1‑150 (MQ=60)
TGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATA > SRR13214404.2230030/1‑150 (MQ=60)
GTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCT > SRR13214404.2769650/1‑150 (MQ=60)
TAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTT < SRR13214404.54911/150‑1 (MQ=60)
TAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTT < SRR13214404.3517496/150‑1 (MQ=60)
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GTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTA < SRR13214404.2605920/150‑1 (MQ=60)
TAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGAGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTAT < SRR13214404.1004544/150‑1 (MQ=60)
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ATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGG > SRR13214404.2921643/1‑150 (MQ=60)
tacactataatcaatcaCATGATAATGAATATCACCCTTATGGTGATCGTTTGCCACATATGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCGTTTGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGC < SRR13214404.4596617/133‑1 (MQ=60)
TGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGC < SRR13214404.4603349/150‑1 (MQ=60)
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ACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATT < SRR13214404.4031816/150‑1 (MQ=60)
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AAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAAC < SRR13214404.2863489/150‑1 (MQ=60)
AAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAAC > SRR13214404.2076856/1‑150 (MQ=60)
GTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGAC < SRR13214404.3010161/150‑1 (MQ=60)
GTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATCGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGAC > SRR13214404.589005/1‑150 (MQ=60)
TCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACA < SRR13214404.1633991/150‑1 (MQ=60)
TCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACA > SRR13214404.1695366/1‑150 (MQ=60)
CATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAG < SRR13214404.3520280/150‑1 (MQ=60)
TGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTT > SRR13214404.2898296/1‑150 (MQ=60)
NATAATGNATANCACCTTTNTGGNGAGCATTTGCCACTTGTGGNGGAAGAAGNTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACNGCANCAGCNGTCAAATCACGTTGAGTNTTGAAAACGTTANAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTN < SRR13214404.2304541/150‑1 (MQ=60)
GATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTT < SRR13214404.3383746/150‑1 (MQ=60)
GATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTT > SRR13214404.2024227/1‑150 (MQ=60)
GATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTT > SRR13214404.838312/1‑150 (MQ=60)
ATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTG > SRR13214404.2535714/1‑150 (MQ=60)
ATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTG < SRR13214404.3772455/150‑1 (MQ=60)
TAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGG < SRR13214404.1603544/150‑1 (MQ=60)
TGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCG < SRR13214404.2837144/150‑1 (MQ=60)
TGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCG < SRR13214404.3466492/150‑1 (MQ=60)
GAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGC > SRR13214404.3421530/1‑150 (MQ=60)
AATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCG > SRR13214404.2186246/1‑150 (MQ=60)
ATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGA < SRR13214404.3268510/150‑1 (MQ=60)
ATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGA > SRR13214404.1580366/1‑150 (MQ=60)
ATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATT < SRR13214404.2776299/150‑1 (MQ=60)
ATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATT < SRR13214404.3485915/150‑1 (MQ=60)
TCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTA > SRR13214404.4329551/1‑150 (MQ=60)
ACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAAT > SRR13214404.110598/1‑150 (MQ=60)
ACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAAT < SRR13214404.2143859/150‑1 (MQ=60)
ACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAAT > SRR13214404.2572745/1‑150 (MQ=60)
ACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAAT > SRR13214404.3374860/1‑150 (MQ=60)
CCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATT > SRR13214404.2636130/1‑150 (MQ=60)
CCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTA < SRR13214404.543351/150‑1 (MQ=60)
TTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAA < SRR13214404.1928638/150‑1 (MQ=60)
TTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAA > SRR13214404.707263/1‑150 (MQ=60)
TTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAA < SRR13214404.2345605/150‑1 (MQ=60)
CTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAA > SRR13214404.1063353/1‑150 (MQ=60)
TTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTT < SRR13214404.3925948/150‑1 (MQ=60)
TGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTT > SRR13214404.583380/1‑150 (MQ=60)
TGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTT > SRR13214404.2034157/1‑150 (MQ=60)
TGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTT < SRR13214404.4703892/150‑1 (MQ=60)
TGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTT > SRR13214404.4572532/1‑150 (MQ=60)
TGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTT < SRR13214404.1361197/150‑1 (MQ=60)
TGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCA < SRR13214404.3760244/150‑1 (MQ=60)
TGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCA < SRR13214404.48712/150‑1 (MQ=60)
GAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAA < SRR13214404.2121528/150‑1 (MQ=60)
AGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAAT < SRR13214404.4115530/150‑1 (MQ=60)
GCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATC < SRR13214404.527775/150‑1 (MQ=60)
GCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATC < SRR13214404.3797557/150‑1 (MQ=60)
CATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATCG > SRR13214404.868801/1‑150 (MQ=60)
GTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATCGT > SRR13214404.3803821/1‑150 (MQ=60)
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TGAATTGATTTTGGCGAATCTACTTGCGCATTTCCAAGTTTAAAACCATTTTCAAACATATTTTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAATTTTTCAATCGT > CP043523/1706973‑1707271
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |