Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F83 I1 R1
|
393 |
530.9 |
9427126 |
91.1% |
8588111 |
148.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGATAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAGCTG > CP043523/1860772‑1860991
|
TAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGAC < SRR13214404.1728470/150‑1 (MQ=60)
gtTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACA < SRR13214404.4384308/148‑1 (MQ=60)
AGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACA > SRR13214404.3882205/1‑150 (MQ=60)
TTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAA < SRR13214404.2113280/150‑1 (MQ=60)
TCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCA > SRR13214404.2172914/1‑150 (MQ=60)
TCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCA < SRR13214404.3784607/150‑1 (MQ=60)
CGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAA > SRR13214404.3953710/1‑150 (MQ=60)
CGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAA < SRR13214404.4606150/150‑1 (MQ=60)
GCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAG < SRR13214404.4150200/150‑1 (MQ=60)
CAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGA > SRR13214404.3609071/1‑150 (MQ=60)
ATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAAT < SRR13214404.2001118/150‑1 (MQ=60)
TTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATT > SRR13214404.1553050/1‑150 (MQ=60)
TTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATT > SRR13214404.577762/1‑150 (MQ=60)
TCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTT > SRR13214404.921360/1‑150 (MQ=60)
taatttttaaattcgtaagttcaaatcttaaaaatcatcaaacAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAG < SRR13214404.1738041/107‑1 (MQ=31)
acaggagcgtgacTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAG > SRR13214404.3029918/14‑150 (MQ=60)
AAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAG < SRR13214404.2348870/150‑1 (MQ=60)
AAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCCGCTGACAAACCAAGAATTTCAG < SRR13214404.1558773/150‑1 (MQ=60)
AAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGC > SRR13214404.2729133/1‑150 (MQ=60)
AAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGC > SRR13214404.138041/1‑150 (MQ=60)
AAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGC > SRR13214404.136944/1‑150 (MQ=60)
AAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGC > SRR13214404.3206719/1‑150 (MQ=60)
AGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCT < SRR13214404.2609776/150‑1 (MQ=60)
GTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTT > SRR13214404.1493653/1‑150 (MQ=60)
TCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTT < SRR13214404.4434868/150‑1 (MQ=60)
TCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTT > SRR13214404.936366/1‑150 (MQ=60)
CACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTT < SRR13214404.3980941/150‑1 (MQ=60)
CAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGA > SRR13214404.2444140/1‑150 (MQ=60)
AGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGAT > SRR13214404.3738166/1‑150 (MQ=60)
AAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGA < SRR13214404.967739/150‑1 (MQ=60)
AGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAA < SRR13214404.3533940/150‑1 (MQ=60)
GTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAAT < SRR13214404.3282796/150‑1 (MQ=60)
GTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAAT > SRR13214404.322239/1‑150 (MQ=60)
GTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAAT < SRR13214404.1651657/150‑1 (MQ=60)
TTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGGTTGAAGATGGTGTGTTAGCGACTGTTAATACGGGGTGGTTAGAAAAGGCAGAAATTCCTGCGGCCAAAACAAGAATTTCAGCTTTTGAGGAATT > SRR13214404.3613334/1‑150 (MQ=41)
TCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTA > SRR13214404.1484955/1‑150 (MQ=60)
TCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTA < SRR13214404.298198/150‑1 (MQ=60)
CAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAG < SRR13214404.1137813/150‑1 (MQ=60)
actttgtgtgttgttctttgtttatttaaagtagactgtgatattatatggttttatgatgctttattcgtttctgttactgttgattgattggatattgtagaattttCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTA < SRR13214404.1792457/41‑1 (MQ=0)
AATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTA > SRR13214404.2241982/1‑150 (MQ=60)
ATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTAC < SRR13214404.3818316/150‑1 (MQ=60)
TTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACT < SRR13214404.3514310/150‑1 (MQ=60)
TTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTA < SRR13214404.702549/150‑1 (MQ=60)
TTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTA > SRR13214404.200829/1‑150 (MQ=60)
TATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAA < SRR13214404.2426182/150‑1 (MQ=60)
TATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAA > SRR13214404.1872226/1‑150 (MQ=60)
TATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAA < SRR13214404.3459095/150‑1 (MQ=60)
TATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAA < SRR13214404.4366878/150‑1 (MQ=60)
GATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCAGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAA < SRR13214404.3955546/150‑1 (MQ=45)
TTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCGGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAGAATG > SRR13214404.1020050/1‑150 (MQ=58)
TGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGA > SRR13214404.390264/1‑150 (MQ=59)
GCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAA < SRR13214404.2815819/150‑1 (MQ=53)
GCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAA > SRR13214404.1585387/1‑150 (MQ=53)
CTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAAattcttggtttgtcagcagga > SRR13214404.634951/1‑129 (MQ=53)
CTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAA < SRR13214404.1527598/150‑1 (MQ=50)
CTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAA < SRR13214404.449886/150‑1 (MQ=50)
TTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAA < SRR13214404.3233967/150‑1 (MQ=48)
TTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAA > SRR13214404.2982271/1‑150 (MQ=48)
TTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAA < SRR13214404.3230975/150‑1 (MQ=48)
TTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAA > SRR13214404.3138452/1‑150 (MQ=48)
TTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAA < SRR13214404.2936996/150‑1 (MQ=48)
TCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAA < SRR13214404.230697/150‑1 (MQ=46)
CTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAAT > SRR13214404.2255367/1‑150 (MQ=44)
TTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATT < SRR13214404.182692/150‑1 (MQ=42)
TTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATT < SRR13214404.3394456/150‑1 (MQ=42)
TTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTT < SRR13214404.3212265/150‑1 (MQ=40)
TTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTG < SRR13214404.624658/150‑1 (MQ=38)
TTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTG > SRR13214404.2983284/1‑150 (MQ=38)
TATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCattttctaaccattcagcattaacagtagcgaataaat > SRR13214404.2169353/1‑112 (MQ=40)
TATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGG > SRR13214404.4594739/1‑150 (MQ=36)
TATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGG > SRR13214404.4687842/1‑150 (MQ=36)
TTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCT < SRR13214404.3556095/150‑1 (MQ=32)
AAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAA > SRR13214404.1693646/1‑150 (MQ=27)
AAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAA > SRR13214404.3632537/1‑150 (MQ=27)
AAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAA < SRR13214404.1826481/150‑1 (MQ=27)
AAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAA < SRR13214404.4080536/150‑1 (MQ=25)
AAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAA > SRR13214404.2825367/1‑150 (MQ=25)
AAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAG < SRR13214404.42644/150‑1 (MQ=23)
AAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAG > SRR13214404.3026800/1‑150 (MQ=23)
AAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGA < SRR13214404.3394880/150‑1 (MQ=21)
AAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGAT < SRR13214404.965890/150‑1 (MQ=19)
AAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGAT < SRR13214404.3426744/150‑1 (MQ=19)
GAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTA > SRR13214404.4667073/1‑150 (MQ=10)
GAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTA > SRR13214404.418276/1‑150 (MQ=10)
AGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAG < SRR13214404.4647115/150‑1 (MQ=8)
AGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAG > SRR13214404.3465147/1‑150 (MQ=8)
AGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAG > SRR13214404.3482019/1‑150 (MQ=8)
AGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAG < SRR13214404.2508332/150‑1 (MQ=8)
GTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAGC > SRR13214404.2719433/1‑150 (MQ=5)
GTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATGCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAGC < SRR13214404.1166776/150‑1 (MQ=5)
TTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAGCTG > SRR13214404.3319062/1‑150 (MQ=1)
TTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAGCTG > SRR13214404.3317251/1‑150 (MQ=1)
TTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAGCTG > SRR13214404.2457779/1‑150 (MQ=1)
|
TAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGATAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAGCTG > CP043523/1860772‑1860991
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
