Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP043523 |
1,860,921 |
T→C |
D25D (GAT→GAC) |
FTN78_chr1908 → |
neutral endopeptidase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP043523 | 1,860,921 | 0 | T | C | 99.6%
| 758.1
/ NA
| 225 | D25D (GAT→GAC) | FTN78_chr1908 | neutral endopeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (107/116); total (109/116) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.82e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
TTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGATAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAGCTGA > CP043523/1860775‑1860992
|
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tttCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAAc > 2:3469153/1‑150 (MQ=255)
aaTTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGaa < 1:3074325/150‑1 (MQ=255)
aaTTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGaa > 2:2099501/1‑150 (MQ=255)
aaTTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGaa < 2:801309/150‑1 (MQ=255)
aTTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAAt < 2:3992595/150‑1 (MQ=255)
aTTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAAt < 2:1535411/150‑1 (MQ=255)
aTTCTAAAGTCACAGAAGGTCAAATTTATGATTTGAGGTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTGTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCGGCTGACAAACCAAGAAt < 2:693243/150‑1 (MQ=21)
tAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTcn < 2:2873282/150‑2 (MQ=255)
tAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCa < 1:4528507/150‑1 (MQ=255)
aaaGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAg > 2:934023/1‑150 (MQ=255)
aaaGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAg > 2:3390570/1‑150 (MQ=255)
aaaGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAg > 1:4385285/1‑150 (MQ=255)
aaGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGc < 1:2546691/150‑1 (MQ=255)
aGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCt > 2:1229368/1‑150 (MQ=255)
aGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCt < 2:829832/150‑1 (MQ=255)
gTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCtt > 1:542308/1‑150 (MQ=255)
gTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCtt > 2:1844917/1‑150 (MQ=255)
gTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCtt < 1:342487/150‑1 (MQ=255)
tCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCttt < 1:3362938/150‑1 (MQ=255)
cacaGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGCAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCtttt > 1:4020961/1‑150 (MQ=255)
cacaGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCtttt > 2:3983233/1‑150 (MQ=255)
cacaGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCtttt > 1:614683/1‑150 (MQ=255)
cacaGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCtttt > 2:906023/1‑150 (MQ=255)
caGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTtga > 1:3038396/1‑150 (MQ=255)
caGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTtga < 2:1559269/150‑1 (MQ=255)
aGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTtgat < 1:1603157/150‑1 (MQ=255)
aGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTtgat < 1:3687588/150‑1 (MQ=255)
aGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTAGCTACTGTTAAAGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTtgat < 2:2915024/150‑1 (MQ=255)
gAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTtgatg > 1:957617/1‑150 (MQ=255)
aaGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTtgatga < 2:3969117/150‑1 (MQ=255)
aaGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTtgatga > 1:2693411/1‑150 (MQ=255)
aaGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTtgatga < 2:2234086/150‑1 (MQ=255)
aaGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTtgatga > 1:321374/1‑150 (MQ=255)
ttCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAAtt > 1:2956090/1‑150 (MQ=255)
tCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTa > 1:4588077/1‑150 (MQ=255)
tCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTa < 1:140793/150‑1 (MQ=255)
cAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAg > 2:2710102/1‑150 (MQ=255)
cAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAg > 1:4467389/1‑150 (MQ=255)
cAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAg < 1:147503/150‑1 (MQ=255)
aaaTTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGt < 1:2255719/150‑1 (MQ=255)
aTTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTAc > 2:1276746/1‑150 (MQ=255)
aTTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTAc < 2:4273987/150‑1 (MQ=255)
ttATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTa < 1:2911707/150‑1 (MQ=255)
ttATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTa > 1:3638012/1‑150 (MQ=255)
ttATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTa > 1:3638468/1‑150 (MQ=255)
aTGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTaaa < 2:1186302/150‑1 (MQ=255)
gATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTaaaaa < 2:571346/150‑1 (MQ=255)
gATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTaaaaa > 2:2808862/1‑150 (MQ=255)
gATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTaaaaa > 2:1805877/1‑150 (MQ=255)
gATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTaaaaa > 2:1805395/1‑150 (MQ=255)
aTTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTaaaaaa > 1:1182443/1‑150 (MQ=255)
gAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATgag > 1:2388349/1‑150 (MQ=255)
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aGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATgaga > 2:1006197/1‑150 (MQ=255)
aGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATgaga < 1:3272263/150‑1 (MQ=255)
aGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATgaga < 1:2109326/150‑1 (MQ=255)
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gCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGaa < 2:313633/150‑1 (MQ=255)
cttcttTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACAAAAAAATGAGaaa < 2:753920/150‑1 (MQ=255)
ttcttTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGaaaa < 1:2007569/150‑1 (MQ=255)
tcttTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGaaaaa > 1:2211339/1‑150 (MQ=255)
cttTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAAt < 2:4607191/150‑1 (MQ=255)
cttTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAAt < 2:4016056/150‑1 (MQ=255)
cttTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAAt > 1:3540949/1‑150 (MQ=255)
cttTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAAt > 1:1954603/1‑150 (MQ=255)
cttTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAAt > 2:1380403/1‑150 (MQ=255)
ttttATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAAtt < 2:3658893/150‑1 (MQ=255)
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tttATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAAttt > 2:1157239/1‑150 (MQ=255)
tttATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAAttt > 1:2149653/1‑150 (MQ=255)
tttATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAAttt < 1:2759943/150‑1 (MQ=255)
tttATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAAttt < 1:3765286/150‑1 (MQ=255)
actataaATAAAGGAGTTTGATCTGATAAGGATTCAAGATGAATTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTTGAAAATGCAGAAATTCCTGCTTACAAACTAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATGAGTACTAAAAAATGAGAAACAttt < 2:1947481/148‑1 (MQ=11)
ttattaAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAAtttn < 2:1501495/150‑2 (MQ=255)
ttattaAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTg < 1:3981204/150‑1 (MQ=255)
ttattaAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTg < 2:4120672/150‑1 (MQ=255)
ttattaAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTg < 2:261971/150‑1 (MQ=255)
tattaAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTgg > 1:415919/1‑150 (MQ=255)
tattaAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTgg > 2:2285553/1‑150 (MQ=255)
attaTAAAAGGAGTTTGCTATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTATAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGCACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGc < 2:3859213/150‑1 (MQ=11)
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ttaAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTCTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCt > 2:3344339/1‑150 (MQ=255)
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AGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGA < SRR13214403.3286900/150‑1 (MQ=55)
AGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGA < SRR13214403.2119018/150‑1 (MQ=55)
AGCTTCGTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGA < SRR13214403.2118498/150‑1 (MQ=43)
GCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAA < SRR13214403.3534207/150‑1 (MQ=53)
TTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAA < SRR13214403.2016834/150‑1 (MQ=48)
TTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAA < SRR13214403.4223530/150‑1 (MQ=48)
TTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAA > SRR13214403.4625769/1‑150 (MQ=48)
TCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAA > SRR13214403.2224116/1‑150 (MQ=46)
TCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAA > SRR13214403.2221513/1‑150 (MQ=46)
TCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAA > SRR13214403.1368625/1‑150 (MQ=46)
TCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAA > SRR13214403.1367765/1‑150 (MQ=46)
CTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAAT > SRR13214403.1963640/1‑150 (MQ=44)
CTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAAT > SRR13214403.1963272/1‑150 (MQ=44)
CTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAAT > SRR13214403.3556939/1‑150 (MQ=44)
TTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTT < SRR13214403.3781636/150‑1 (MQ=40)
TTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTT < SRR13214403.3782394/150‑1 (MQ=40)
TTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTT < SRR13214403.2772409/150‑1 (MQ=40)
TTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTT > SRR13214403.2159545/1‑150 (MQ=40)
TTCATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAAGTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTGTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTT > SRR13214403.4021921/1‑150 (MQ=31)
TTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTG > SRR13214403.3640634/1‑150 (MQ=38)
TTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTG < SRR13214403.4000101/150‑1 (MQ=38)
TATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGG > SRR13214403.418214/1‑150 (MQ=36)
ATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGC < SRR13214403.3668231/150‑1 (MQ=34)
TAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTA > SRR13214403.1660716/1‑150 (MQ=29)
AAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAA > SRR13214403.924799/1‑150 (MQ=25)
AAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAA < SRR13214403.1272934/150‑1 (MQ=25)
AAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTGCTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAG > SRR13214403.2752806/1‑150 (MQ=22)
AAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGA < SRR13214403.3179011/150‑1 (MQ=21)
AAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGA < SRR13214403.2403547/150‑1 (MQ=21)
AAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGA < SRR13214403.2156113/150‑1 (MQ=21)
GGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTT < SRR13214403.1230328/150‑1 (MQ=12)
GGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTT < SRR13214403.1229660/150‑1 (MQ=12)
GAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTA > SRR13214403.31725/1‑150 (MQ=10)
GAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTA > SRR13214403.30786/1‑150 (MQ=10)
AGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAGAAATTTGGCTAAAGATTTAG < SRR13214403.234280/150‑1 (MQ=7)
AGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAG < SRR13214403.235123/150‑1 (MQ=8)
TTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAGCT < SRR13214403.1853490/150‑1 (MQ=3)
TTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAGCTG < SRR13214403.622438/150‑1 (MQ=1)
TGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAGCTGA < SRR13214403.546899/150‑1 (MQ=0)
TGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGACAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAGCTGA < SRR13214403.332772/150‑1 (MQ=0)
|
TAGTTTTCGCAATTCTAAAGTCACAGAAGTTCAAATTTATGATTTGAGCTTCTTTTATTAAAAAAGGAGTTTGATATGACAAGGATTCAAGATGATTTATTCGCTACTGTTAATGCTGAATGGTTAGAAAATGCAGAAATTCCTGCTGATAAACCAAGAATTTCAGCTTTTGATGAATTAGTACTAAAAAATGAGAAAAATTTGGCTAAAGATTTAGCTGA > CP043523/1860772‑1860992
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
