Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP043523 |
1,882,498 |
A→T |
intergenic (+209/‑346) |
FTN78_chr1926 → / → FTN78_chr1927 |
hypothetical protein/3‑ketoacyl‑CoA thiolase, Acetyl‑CoA acetyltransferase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP043523 | 1,882,498 | 0 | A | T | 99.8%
| 1010.4
/ NA
| 418 | intergenic (+209/‑346) | FTN78_chr1926/FTN78_chr1927 | hypothetical protein/3‑ketoacyl‑CoA thiolase, Acetyl‑CoA acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (262/155); total (263/155) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 418 total aligned reads displayed.
AAGCAATACCGAAAAACCGAAGAGCTTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATGCCTCGAATAGTCTCCATGCCCTTTATCGTGGTTGAGGCAGTACGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCTATTAGATTGTTAAGGTATTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAATTCATTACTCTGTAATTTTCTAAAGGCAGAGCCAATAGACGG > CP043523/1882402‑1882644
|
agtagacaCCGAAAAGCCGAAGAGCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGctc < 1:1977994/143‑1 (MQ=14)
agtagaTACCGAAAATCTGAAGAGCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGctc < 1:4196939/145‑1 (MQ=17)
gtagacaCCGAAAAGCCGAAGAGCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGctca > 1:4033091/7‑149 (MQ=14)
agaTACCGAAAATCCGAAGAGCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTAt < 1:4563869/148‑1 (MQ=14)
agaTACCGAAAATCCGAAGAGCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTAt < 2:1381444/148‑1 (MQ=14)
acaCCGAAAAGCCGAAGAGCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAAtga > 1:1242671/3‑148 (MQ=17)
tACCGAAAATCCGAAGAGCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGctcaatgag < 1:1757508/150‑7 (MQ=17)
aCCGAAAATCCGAAGAGCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTaaa < 2:588680/150‑3 (MQ=11)
aCCGAAAAGCCGAAGAGCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAAtgagg > 1:61720/1‑146 (MQ=17)
ccGAACATCCGCAGAGCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTGGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTaaan < 1:2765875/150‑4 (MQ=11)
cGAAAATCCGAAGAGCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAggtt > 1:4266026/1‑147 (MQ=17)
gAAAATCCGAAGAGCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTg > 1:1060582/1‑150 (MQ=11)
gAAAATCCGAAGAGCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTg > 1:1333147/1‑150 (MQ=11)
gAAAATCCGAAGAGCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTg > 1:1374799/1‑150 (MQ=11)
aaatCCGAAGAGCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGtt > 1:1732789/1‑150 (MQ=11)
ccGAAGAGCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAga > 1:3113834/1‑149 (MQ=11)
gAAGAGCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAgata > 1:4159457/1‑147 (MQ=17)
agagCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAGATact > 2:3992816/1‑148 (MQ=11)
agagCGTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAGATact < 2:3096845/150‑3 (MQ=11)
agcgctCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGTAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGATCTATTAAATTGTTTAGATACTTc < 2:3841057/145‑1 (MQ=11)
gcgttCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTTCTCGAAGGGTCTCCATGACCTTCATCTTGATGGAGGCAGTTCGTAGACTTCGAGAGAAGGTATTGCGTCGTTTGATTGGAGGATGGCGTTGTTCTATGAGATTGTTAAGATAATTCa > 2:3009271/4‑150 (MQ=2)
gttCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAGATACTTCAca > 2:3261046/2‑149 (MQ=11)
gttCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAGATACTTCAca > 2:2797343/2‑149 (MQ=11)
gatCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAGATTTATTGCTTCGTTTGATTAGTCGTTTGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAGATACTTCAca > 2:2284736/3‑149 (MQ=11)
ttCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAGATACTTCAcag > 2:344280/1‑148 (MQ=11)
ttCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAAGGGTCTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAGATACTTCAcag < 2:1196296/150‑3 (MQ=11)
cATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTc > 2:283576/1‑150 (MQ=17)
aTTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATGCTTCGCGGTTCg > 1:2278898/1‑150 (MQ=255)
aTTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCg > 2:3551861/1‑150 (MQ=255)
aTTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCg > 2:3376028/1‑150 (MQ=255)
tttCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGa > 1:2057352/1‑150 (MQ=17)
cttcGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGc < 2:145143/150‑1 (MQ=255)
cttcGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGc > 2:2556406/1‑150 (MQ=255)
cttcGGTTCTTTTTGTATATGCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGc < 1:3361527/150‑1 (MQ=255)
ttcGGTTCTTTTTGTTTTTTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGct > 2:1233264/1‑150 (MQ=18)
ttcGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGACCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGct > 2:4516769/1‑150 (MQ=255)
tcGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGctc < 2:4429609/150‑1 (MQ=18)
tcGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGctc > 1:2714491/1‑150 (MQ=255)
tcGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGctc > 1:2429793/1‑150 (MQ=255)
ggTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTg > 2:873995/1‑150 (MQ=255)
ggTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTg > 1:1893510/1‑150 (MQ=255)
ggTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTg > 2:1761178/1‑150 (MQ=255)
gTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGTTCTATTAAATTGTTAAGATACTTCACAGTTCGGTGCTCTGt > 1:4397783/1‑150 (MQ=11)
tCTTTTTTTTTATTCTTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTCTGATTGGTCGATGTTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCt > 2:537207/1‑150 (MQ=255)
tCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCt < 1:1631025/150‑1 (MQ=255)
tCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTATTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCt > 2:2480303/1‑150 (MQ=255)
ttttGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAg > 1:3868829/1‑150 (MQ=255)
tttGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGt > 1:3933413/1‑150 (MQ=255)
tGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGtat < 2:494325/150‑1 (MQ=255)
ngTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGtat > 2:167611/2‑150 (MQ=17)
gTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGtata > 2:3758432/1‑150 (MQ=255)
tataTTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGtatat > 2:317280/1‑150 (MQ=255)
atatTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGtatata > 2:801794/1‑150 (MQ=255)
atatTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGtatata > 1:3273534/1‑150 (MQ=255)
attccTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGAGTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTGAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATaaa < 2:4221304/147‑2 (MQ=18)
tccTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATaaacc < 2:20215/149‑4 (MQ=18)
cGAATTGTTTCCATGACCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATaaaccgtta < 2:1939534/150‑8 (MQ=17)
aattgtttcCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTAct > 2:2062667/8‑150 (MQ=17)
attgtttcCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTActc > 2:3908899/7‑150 (MQ=17)
tgtttcCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTg < 1:2201885/146‑1 (MQ=17)
tgtttcCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTg > 1:3618362/5‑150 (MQ=17)
gtttcCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGt > 1:3517955/4‑150 (MQ=17)
ttcCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTaa > 1:3434814/2‑150 (MQ=18)
tcCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTaac > 1:2146327/1‑149 (MQ=18)
tcCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTaac > 1:1103760/1‑149 (MQ=18)
ccATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTaact > 2:2956025/1‑148 (MQ=17)
cATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAActt < 2:2910661/150‑1 (MQ=17)
cATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTaactt > 1:3183483/1‑147 (MQ=17)
aTGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAActtt > 2:2144114/1‑150 (MQ=17)
aTGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAActtt > 1:1517020/1‑150 (MQ=17)
gCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCt > 2:2363248/1‑150 (MQ=17)
gCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCt > 1:2943380/1‑150 (MQ=18)
cccTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTa > 1:3678120/1‑150 (MQ=17)
ncTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTaa > 1:4063785/2‑150 (MQ=17)
ccTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTaa > 1:1015293/1‑150 (MQ=17)
ccTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTaa > 1:2834904/1‑150 (MQ=17)
ccTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTaa > 1:2615621/1‑150 (MQ=17)
ccTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTaa > 2:1869546/1‑150 (MQ=17)
cTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTaaa > 2:4316137/1‑150 (MQ=17)
ttaaTCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTaaat < 2:768196/147‑2 (MQ=17)
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TTCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGAT < SRR13214403.4025438/150‑1 (MQ=60)
TCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATG < SRR13214403.4070979/150‑1 (MQ=60)
TCTTCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATG < SRR13214403.4070865/150‑1 (MQ=60)
CTTCGGTTCTTTTTGTATATGCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCaatgaggttattgagatacttcgcggttcgatgc < SRR13214403.3376551/150‑35 (MQ=60)
TCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTC > SRR13214403.2726787/1‑150 (MQ=60)
TCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTC > SRR13214403.2543716/1‑150 (MQ=60)
TCGGTTCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTC > SRR13214403.2440894/1‑150 (MQ=60)
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TCTTTTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCT < SRR13214403.1638624/150‑1 (MQ=60)
CTTTTTGTATATTCCTCGAGTTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTT < SRR13214403.3771249/150‑1 (MQ=60)
CTTTTTGTATATTCCTCGAATTGCTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCGCGGTTCGATGCTCTGTCTT < SRR13214403.4445337/150‑1 (MQ=60)
TNTTGTATATTCCTCGAATTGTTTCCATGCCCTTAATCGTGGTTGAGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCGCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAG > SRR13214403.3896482/1‑150 (MQ=60)
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AGGCAGTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAATGTAGAACCAATAG > SRR13214403.2117977/1‑150 (MQ=44)
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GTTCGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCAATGAGGTTATTGAGATACTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAAACCGTTACTCTGTAACTTTCTAAAtgtagaaccaatagagggc > SRR13214403.392764/1‑131 (MQ=44)
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AACACCTTAATTATGCTGATATCCTCCGTAAACCTTAAATTTCAAGCAATACCGAAAAACCGAAGAGCTTTCCATTTCTTCGGTTCTTTTTGTATATGCCTCGAATAGTCTCCATGCCCTTTATCGTGGTTGAGGCAGTACGTAGACTTCGATAAAATTTATTGCGTCGTTTGATTGGTCGATGGTCTTGCTCTATTAGATTGTTAAGGTATTTCACGGTTCGATGCTCTGTCTTAGTATATAATTCATTACTCTGTAATTTTCTAAAGGCAGAGCCAATAGACGGA > CP043523/1882359‑1882645
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |