Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP043523 |
1,884,801 |
G→A |
E161E (GAG→GAA) |
FTN78_chr1930 → |
Putative UV‑damage repair protein UvrX |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP043523 | 1,884,801 | 0 | G | A | 100.0%
| 961.6
/ NA
| 289 | E161E (GAG→GAA) | FTN78_chr1930 | Putative UV‑damage repair protein UvrX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (147/142); total (147/142) |
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
ATATGTCGCTTTCATTGAATCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCACAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATAGAAGTTACGGATATTCTAACCAATTATACATCAATTGATGAAATTCATTCTTACTCGATTGATGAGTCGTTTCTTGACGTAACAGAATCACTCAATTTCTTTTATCCTGAGATTAAAAATCGTTATGAACAAATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTCGGACTATATGTGACTGTGGGCATGGGA > CP043523/1884654‑1884942
|
atatGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATc > 1:1480877/1‑150 (MQ=255)
atatGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACGCGATTGATGAATc > 2:2151801/1‑150 (MQ=255)
tatGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATct < 1:962960/150‑2 (MQ=255)
tatGTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATct < 1:2093011/150‑2 (MQ=255)
gTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGGCTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCtttt > 2:4017101/1‑150 (MQ=255)
gTCGCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCtttt < 1:1890701/150‑1 (MQ=255)
gCTTTTATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTAATGAATCAtttttg > 2:10803/1‑147 (MQ=255)
ttttATTGAGTCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCttttttgga > 2:454854/1‑145 (MQ=12)
cGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCattga > 2:1458957/1‑146 (MQ=9)
aaaCGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCattgaac > 2:3515177/1‑144 (MQ=255)
aaCGCACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCattgaact < 1:3463238/150‑8 (MQ=255)
cACGTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAActtctt < 1:1260069/150‑1 (MQ=255)
gTGGATTGTTCCTCCTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTCTAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGACTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGCATCATTGAACTTCTTCTa < 2:4506488/150‑1 (MQ=255)
tcctccTCAAATGCAGCTCTATGTGGAGTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGAt < 1:4061924/150‑1 (MQ=255)
tcctccTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGAt < 2:131154/150‑1 (MQ=255)
tcctccTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGAt < 1:1131457/150‑1 (MQ=255)
tccTCAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTaa > 2:2293269/1‑150 (MQ=255)
ctcaAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCATTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTaaaa > 2:3899600/3‑150 (MQ=2)
ctcaAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTaaaa < 1:1044079/148‑1 (MQ=255)
tcaAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTaaaaa < 2:2355828/149‑1 (MQ=255)
tcaAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTaaaaa < 2:2330112/149‑1 (MQ=255)
tcaAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTaaaaa < 1:4471312/149‑1 (MQ=255)
tcaAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTaaaaa > 1:198995/2‑150 (MQ=255)
caAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAAt < 1:1792472/150‑1 (MQ=255)
aaaTGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATc < 1:3900333/150‑1 (MQ=255)
aaaTGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATc < 2:1357022/150‑1 (MQ=255)
aaTGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCg < 2:157225/150‑1 (MQ=255)
aaTGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCg > 1:4518056/1‑150 (MQ=255)
aaTGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCg > 1:509568/1‑150 (MQ=255)
cAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGatat < 2:4124340/150‑1 (MQ=255)
cAGCTCTATGTGGACTATAAAATTAAAGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGatat < 1:823845/150‑1 (MQ=255)
aaGTGACAGATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAg < 1:4036428/150‑1 (MQ=255)
gtgacagATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGAc < 1:1024740/144‑1 (MQ=255)
gacagATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACtt > 2:944160/5‑150 (MQ=255)
gacagATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACtt > 2:3645911/5‑150 (MQ=255)
acagATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTg < 1:2887281/147‑1 (MQ=255)
agATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCa > 1:3508285/2‑150 (MQ=255)
gATATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCaa < 2:775501/150‑1 (MQ=255)
atatACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAAc > 1:2718503/1‑150 (MQ=255)
atatACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAAc > 1:582288/1‑150 (MQ=255)
tatactgaCCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACg < 1:2905944/143‑1 (MQ=255)
tatactgaCCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACg < 2:4240623/143‑1 (MQ=255)
tatactgaCCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACg < 1:324710/143‑1 (MQ=255)
actgaCCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTga > 1:531815/5‑150 (MQ=255)
ctgaCCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTgag < 2:812981/147‑1 (MQ=255)
ctgaCCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTgag < 2:2266491/147‑1 (MQ=255)
ctgaCCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTgag < 2:624679/147‑1 (MQ=255)
gaCCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGAt < 1:401037/149‑1 (MQ=255)
aCCAATTATACGTCAATTGATGAGATTAAATCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTAAAAAAAAAATAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGAtt < 2:494576/150‑1 (MQ=255)
ccAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTc > 1:1679356/1‑150 (MQ=255)
cAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCg > 1:340536/1‑150 (MQ=255)
aaTTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCga > 1:219437/1‑150 (MQ=255)
tataCGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGAt > 1:3524935/1‑150 (MQ=255)
ataCGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATa > 2:3071002/1‑150 (MQ=255)
ataCGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATa < 1:3480332/150‑1 (MQ=255)
taCGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATaa > 2:3176651/1‑150 (MQ=255)
taCGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATaa > 1:863267/1‑150 (MQ=255)
acgtCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATaaa > 2:2907920/4‑150 (MQ=255)
acgtCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATaaa < 2:936264/147‑1 (MQ=255)
cgtCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATaaag < 2:2635315/148‑2 (MQ=255)
cgtCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAAc > 1:3156837/3‑150 (MQ=255)
cgtCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAAc > 2:846100/3‑150 (MQ=255)
cgtCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAAc > 2:2692103/3‑150 (MQ=255)
gtCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACt < 2:238624/149‑1 (MQ=255)
tCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACta > 2:3787604/1‑149 (MQ=255)
tCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACta < 2:2757915/150‑2 (MQ=255)
tCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACta < 2:1705609/150‑2 (MQ=255)
aTTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGa > 2:66284/1‑150 (MQ=255)
aTTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGa > 1:4092351/1‑150 (MQ=255)
aTTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGa > 2:335704/1‑150 (MQ=255)
aTTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGa > 1:773611/1‑150 (MQ=255)
aTTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGa > 1:4268388/1‑150 (MQ=255)
ttGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGAc > 2:1760346/1‑150 (MQ=255)
tgatgaGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACt > 1:3117620/1‑150 (MQ=255)
tgatgaGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACt < 2:2813193/150‑1 (MQ=255)
gatgaGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACta > 2:1548182/1‑150 (MQ=255)
gatgaGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACta < 1:1600661/150‑1 (MQ=255)
atgaGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACtat < 1:35699/150‑1 (MQ=255)
tgaGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACtata > 2:874627/1‑150 (MQ=255)
agattcactcCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATAtg < 1:4538630/148‑1 (MQ=255)
agattcactcCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATAtg > 1:2416601/3‑150 (MQ=255)
agattcactcCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATAtg < 2:1036537/148‑1 (MQ=255)
agattcactcCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATAtg > 1:2684121/3‑150 (MQ=255)
gattcactcCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATAtgt < 2:2519758/149‑1 (MQ=255)
gattcactcCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATAtgt > 2:2071220/2‑150 (MQ=255)
gattcactcCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATAtgt < 2:2550515/149‑1 (MQ=255)
attcactcCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATAtgtg < 2:1836539/150‑1 (MQ=255)
attcactcCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGACTATAtgtg < 2:4308822/150‑1 (MQ=255)
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TATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACG < SRR13214403.2918984/150‑1 (MQ=42)
TATACTGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACG < SRR13214403.326529/150‑1 (MQ=42)
actgACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGA > SRR13214403.534699/5‑150 (MQ=48)
TGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGA < SRR13214403.400638/150‑1 (MQ=50)
TGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGA > SRR13214403.3345015/1‑150 (MQ=50)
TGACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGA < SRR13214403.3471723/150‑1 (MQ=50)
GACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGAT < SRR13214403.403254/150‑1 (MQ=51)
GACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGAT > SRR13214403.90925/1‑150 (MQ=51)
GACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGAT < SRR13214403.378560/150‑1 (MQ=51)
GACCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGAT > SRR13214403.3517147/1‑150 (MQ=51)
CCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTC > SRR13214403.1087993/1‑150 (MQ=53)
CCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTC > SRR13214403.1687180/1‑150 (MQ=53)
CCAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTC > SRR13214403.1882622/1‑150 (MQ=53)
CAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCG < SRR13214403.4325231/150‑1 (MQ=53)
CAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCG < SRR13214403.785101/150‑1 (MQ=53)
CAATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCG > SRR13214403.342438/1‑150 (MQ=53)
AATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGA > SRR13214403.4151860/1‑150 (MQ=53)
AATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGA > SRR13214403.220704/1‑150 (MQ=53)
ATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAG < SRR13214403.2832486/150‑1 (MQ=53)
ATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAG < SRR13214403.4243945/150‑1 (MQ=53)
ATTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAG > SRR13214403.2170362/1‑150 (MQ=53)
TTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGA < SRR13214403.514636/150‑1 (MQ=53)
TTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGA > SRR13214403.844792/1‑150 (MQ=53)
TTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGA < SRR13214403.511593/150‑1 (MQ=53)
TTATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGA < SRR13214403.508817/150‑1 (MQ=53)
TATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGAT > SRR13214403.3540837/1‑150 (MQ=53)
TATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGAT > SRR13214403.3540608/1‑150 (MQ=53)
TATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGAT > SRR13214403.3541285/1‑150 (MQ=53)
ATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATA < SRR13214403.3495979/150‑1 (MQ=53)
ATACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATA > SRR13214403.4030298/1‑150 (MQ=53)
TACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAA > SRR13214403.4260717/1‑150 (MQ=55)
TACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAA > SRR13214403.867686/1‑150 (MQ=55)
TACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAA < SRR13214403.1652101/150‑1 (MQ=55)
ACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAA < SRR13214403.4554590/150‑1 (MQ=56)
ACGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAA < SRR13214403.138693/150‑1 (MQ=56)
CGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAAC > SRR13214403.3170949/1‑150 (MQ=58)
CGTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAAC > SRR13214403.3171270/1‑150 (MQ=58)
GTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACT > SRR13214403.2959526/1‑150 (MQ=60)
GTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACT < SRR13214403.3160359/150‑1 (MQ=60)
GTCAATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACT > SRR13214403.3477424/1‑150 (MQ=60)
AATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGG < SRR13214403.3484264/150‑1 (MQ=60)
ATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGA > SRR13214403.777687/1‑150 (MQ=60)
ATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGA < SRR13214403.2204050/150‑1 (MQ=60)
ATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGA > SRR13214403.4111903/1‑150 (MQ=60)
ATTGATGAGATTCACTCCTACTCGATTGATGAATCTTTTTTGGATATCACAGAATCATTGAACTTCTTCTACCCTGAGATTAAAAATCGATATGAACAGATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTAGGA > SRR13214403.4289532/1‑150 (MQ=60)
|
CAATATGTCGCTTTCATTGAATCTTGGGCGAAACGCACGTGGATTGTTCCTCCACAAATGCAGCTCTATGTGGACTATAAAATAGAAGTTACGGATATTCTAACCAATTATACATCAATTGATGAAATTCATTCTTACTCGATTGATGAGTCGTTTCTTGACGTAACAGAATCACTCAATTTCTTTTATCCTGAGATTAAAAATCGTTATGAACAAATGAATCGAATTGCTTTAGACTTGCAACGTGAGATTCGAGATAAACTCGGA > CP043523/1884652‑1884918
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
