Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
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90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 536 total aligned reads displayed.
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|
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TAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAG > SRR13214403.1078197/1‑150 (MQ=60)
TAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATTATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAG > SRR13214403.2177489/1‑150 (MQ=60)
AACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGG < SRR13214403.4225444/150‑1 (MQ=60)
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ACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAAC < SRR13214403.2866967/150‑1 (MQ=60)
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TTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAAT < SRR13214403.3234612/150‑1 (MQ=60)
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TTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCAACTTCCACTCGAGGACCAATCTCACCC > SRR13214403.583985/1‑150 (MQ=60)
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gcgttatcaTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTATCCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTT < SRR13214403.372497/141‑1 (MQ=60)
GGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTT < SRR13214403.1829168/150‑1 (MQ=60)
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GCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTAT > SRR13214403.3098242/1‑150 (MQ=60)
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TTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGT < SRR13214403.560023/150‑1 (MQ=60)
TTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTG < SRR13214403.408283/150‑1 (MQ=60)
TACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGA > SRR13214403.1788428/1‑150 (MQ=60)
TACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGA > SRR13214403.1924261/1‑150 (MQ=60)
TACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGA > SRR13214403.439597/1‑150 (MQ=60)
ACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAA > SRR13214403.946254/1‑150 (MQ=60)
CTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAA > SRR13214403.4422244/1‑150 (MQ=60)
CTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAA > SRR13214403.4418189/1‑150 (MQ=60)
CTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAA < SRR13214403.2422046/150‑1 (MQ=60)
TTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAAC > SRR13214403.3630962/1‑150 (MQ=60)
TTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAAC < SRR13214403.713406/150‑1 (MQ=60)
AAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGC < SRR13214403.1719700/150‑1 (MQ=60)
AAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGC < SRR13214403.1152594/150‑1 (MQ=60)
AGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTA > SRR13214403.1661431/1‑150 (MQ=60)
GTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAA > SRR13214403.3653174/1‑150 (MQ=60)
TTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGcgatt < SRR13214403.1096381/150‑6 (MQ=60)
TAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTT > SRR13214403.3871192/1‑150 (MQ=60)
AACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTT < SRR13214403.3943755/150‑1 (MQ=60)
TATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGT > SRR13214403.2973321/1‑150 (MQ=60)
ATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTT > SRR13214403.3541950/1‑150 (MQ=60)
ATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTT > SRR13214403.3773234/1‑150 (MQ=60)
ATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTT < SRR13214403.4558173/150‑1 (MQ=60)
TGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTT > SRR13214403.230403/1‑150 (MQ=60)
TGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTT > SRR13214403.4233317/1‑150 (MQ=60)
TGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTT < SRR13214403.3796036/150‑1 (MQ=60)
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GTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTT < SRR13214403.2812434/150‑1 (MQ=60)
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AAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATC > SRR13214403.3042273/1‑150 (MQ=60)
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AAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTT < SRR13214403.93051/150‑1 (MQ=60)
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AACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACT > SRR13214403.523465/1‑150 (MQ=60)
ACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTT < SRR13214403.4528743/150‑1 (MQ=60)
ACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTT < SRR13214403.1552185/150‑1 (MQ=60)
ACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTT < SRR13214403.1960647/150‑1 (MQ=60)
CCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTT > SRR13214403.2412369/1‑150 (MQ=60)
CCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTT < SRR13214403.4018394/150‑1 (MQ=60)
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TTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTC < SRR13214403.2669745/150‑1 (MQ=60)
TTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTC > SRR13214403.1875701/1‑150 (MQ=60)
TCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCA > SRR13214403.3489905/1‑150 (MQ=60)
CAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCAC < SRR13214403.4332565/150‑1 (MQ=60)
CAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCAC < SRR13214403.1611409/150‑1 (MQ=60)
AATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACC < SRR13214403.4095858/150‑1 (MQ=60)
ATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCT < SRR13214403.4411235/150‑1 (MQ=60)
ATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCT < SRR13214403.1334210/150‑1 (MQ=60)
ATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCT > SRR13214403.741916/1‑150 (MQ=60)
ATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCT > SRR13214403.2053776/1‑150 (MQ=60)
TGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTA > SRR13214403.412044/1‑150 (MQ=60)
TTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAA > SRR13214403.4302948/1‑150 (MQ=60)
TTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAA < SRR13214403.2695265/150‑1 (MQ=60)
TCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAA > SRR13214403.2308445/1‑150 (MQ=60)
GTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTT < SRR13214403.2928350/150‑1 (MQ=60)
CCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAA > SRR13214403.2187635/1‑150 (MQ=60)
CAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAAT < SRR13214403.1975669/150‑1 (MQ=60)
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AACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGC > SRR13214403.2807680/1‑150 (MQ=60)
AACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGC < SRR13214403.1377463/150‑1 (MQ=60)
AACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGC < SRR13214403.1486649/150‑1 (MQ=60)
ACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCA > SRR13214403.1401395/1‑150 (MQ=60)
CTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAG < SRR13214403.3072081/150‑1 (MQ=60)
CTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAG > SRR13214403.2341542/1‑150 (MQ=60)
TTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGA < SRR13214403.2046551/150‑1 (MQ=60)
TGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGAC < SRR13214403.1056784/150‑1 (MQ=60)
GGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTT > SRR13214403.3915111/1‑150 (MQ=60)
GGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTT < SRR13214403.612326/150‑1 (MQ=60)
AGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTT < SRR13214403.1206001/150‑1 (MQ=60)
GCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTC < SRR13214403.529349/150‑1 (MQ=60)
TTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTT < SRR13214403.4433654/150‑1 (MQ=60)
TTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTT < SRR13214403.1522571/150‑1 (MQ=60)
TNTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCNCCCTTTANATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTNTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTT < SRR13214403.3899770/150‑1 (MQ=60)
TTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTA < SRR13214403.3249848/150‑1 (MQ=60)
TTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTA > SRR13214403.2648716/1‑150 (MQ=60)
TGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAA > SRR13214403.3080779/1‑150 (MQ=60)
TGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAA < SRR13214403.246181/150‑1 (MQ=60)
GTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAAG > SRR13214403.1449394/1‑150 (MQ=60)
GTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAAG > SRR13214403.164500/1‑150 (MQ=60)
GGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGT < SRR13214403.4327594/150‑1 (MQ=60)
CACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAAGTTAA < SRR13214403.2262656/150‑1 (MQ=60)
CACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGTTAA < SRR13214403.4073524/150‑1 (MQ=60)
CTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAAGTTAAAT < SRR13214403.418709/150‑1 (MQ=60)
CTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAAGTTAAAT < SRR13214403.2326735/150‑1 (MQ=60)
CTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGTTAAAT > SRR13214403.3620530/1‑150 (MQ=60)
TTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGTTAAATC < SRR13214403.598869/150‑1 (MQ=60)
TTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGTTAAATC < SRR13214403.2701836/150‑1 (MQ=60)
TCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGTTAAATCT < SRR13214403.1907198/150‑1 (MQ=60)
TCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAAGTTAAATCTCCATT < SRR13214403.2153439/150‑1 (MQ=60)
CTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAAGTTAAATCTCCATTA > SRR13214403.188973/1‑150 (MQ=60)
CGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGTTAAATCTCCATTA < SRR13214403.128765/150‑1 (MQ=60)
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TATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAAGTTAAATCTCCATTAT > CP043523/839225‑839523
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |