Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 524 total aligned reads displayed.
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|
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GTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAA < SRR13214403.3005517/150‑1 (MQ=60)
GTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAA > SRR13214403.2316180/1‑150 (MQ=60)
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TTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACA > SRR13214403.1615432/1‑150 (MQ=60)
TAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAG < SRR13214403.1545755/150‑1 (MQ=60)
AAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGC < SRR13214403.1152594/150‑1 (MQ=60)
AAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGC < SRR13214403.749162/150‑1 (MQ=60)
TTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGcgatt < SRR13214403.1096381/150‑6 (MQ=60)
TAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTT > SRR13214403.3871192/1‑150 (MQ=60)
AACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTT > SRR13214403.3940819/1‑150 (MQ=60)
CCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTG > SRR13214403.4524863/1‑150 (MQ=60)
TGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGA > SRR13214403.561810/1‑150 (MQ=60)
CGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGcgctttttga > SRR13214403.1844170/1‑140 (MQ=60)
GTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAG < SRR13214403.3361116/150‑1 (MQ=60)
GTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAG < SRR13214403.3920393/150‑1 (MQ=60)
GTATGTCCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGCGCTTTTTGGGCCACTTCAGCTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTGTTATCTTATTTGTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAG < SRR13214403.686084/150‑1 (MQ=60)
TATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGT > SRR13214403.2973321/1‑150 (MQ=60)
ATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTT > SRR13214403.4096807/1‑150 (MQ=60)
TGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTT < SRR13214403.4398439/150‑1 (MQ=60)
GTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTT > SRR13214403.267506/1‑150 (MQ=60)
GTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTT > SRR13214403.438508/1‑150 (MQ=60)
CAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAG < SRR13214403.4554535/150‑1 (MQ=60)
AATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGG > SRR13214403.3712653/1‑150 (MQ=60)
AATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGG > SRR13214403.3745940/1‑150 (MQ=60)
AATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGG > SRR13214403.1478859/1‑150 (MQ=60)
ATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGT < SRR13214403.24159/150‑1 (MQ=60)
CCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAA < SRR13214403.1086541/150‑1 (MQ=60)
CCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAA > SRR13214403.777642/1‑150 (MQ=60)
CAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCACCTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGGTTTTAAGGTAAT > SRR13214403.2247906/1‑150 (MQ=60)
CAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAAT < SRR13214403.2294248/150‑1 (MQ=60)
CAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAAT > SRR13214403.303068/1‑150 (MQ=60)
CAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAAT > SRR13214403.3206515/1‑150 (MQ=60)
CAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAAT < SRR13214403.726248/150‑1 (MQ=60)
AAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATC > SRR13214403.3042035/1‑150 (MQ=60)
AAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATC > SRR13214403.2033652/1‑150 (MQ=60)
AAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATC > SRR13214403.4258848/1‑150 (MQ=60)
AAAGAAACCTTTTAACCCTTCCATGAATTCCTGTTCCACAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATC < SRR13214403.3894192/150‑1 (MQ=60)
AGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCAT < SRR13214403.3224839/150‑1 (MQ=60)
AGAAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACGCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCAT < SRR13214403.3621275/150‑1 (MQ=60)
AAACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTT < SRR13214403.2666769/150‑1 (MQ=60)
AAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTT < SRR13214403.93051/150‑1 (MQ=60)
AAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTCGAGTTTTTAAGGTAATCATTT < SRR13214403.3093604/150‑1 (MQ=60)
AACTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTT > SRR13214403.3049021/1‑150 (MQ=60)
AACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTT > SRR13214403.1048362/1‑150 (MQ=60)
AACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTT < SRR13214403.2369044/150‑1 (MQ=60)
CTTTTTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCT < SRR13214403.651708/150‑1 (MQ=60)
CTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCT > SRR13214403.2428561/1‑150 (MQ=60)
TTTTAACCCTTCAATAAGTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTT < SRR13214403.4231201/150‑1 (MQ=60)
TTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTT < SRR13214403.2349076/150‑1 (MQ=60)
TTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTA > SRR13214403.2810421/1‑150 (MQ=60)
TTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTA < SRR13214403.703018/150‑1 (MQ=60)
TTAACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTA < SRR13214403.3140500/150‑1 (MQ=60)
AACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACT < SRR13214403.3564325/150‑1 (MQ=60)
AACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACT > SRR13214403.523409/1‑150 (MQ=60)
AACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACT > SRR13214403.523829/1‑150 (MQ=60)
AACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACT > SRR13214403.171406/1‑150 (MQ=60)
ACCCTTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTT < SRR13214403.1552185/150‑1 (MQ=60)
ACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTT < SRR13214403.1961631/150‑1 (MQ=60)
ACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTT < SRR13214403.4303555/150‑1 (MQ=60)
CTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTT > SRR13214403.1660779/1‑150 (MQ=60)
CTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTT < SRR13214403.54267/150‑1 (MQ=60)
TTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTC > SRR13214403.1875701/1‑150 (MQ=60)
TTCAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTC < SRR13214403.1256716/150‑1 (MQ=60)
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TCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCA > SRR13214403.3914072/1‑150 (MQ=60)
CAATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCAC > SRR13214403.2826236/1‑150 (MQ=60)
cagtggcgacgctcttccgatctgaGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACC > SRR13214403.4075838/26‑150 (MQ=60)
AATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACC > SRR13214403.4426443/1‑150 (MQ=60)
ATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCT < SRR13214403.1334210/150‑1 (MQ=60)
ATGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCT < SRR13214403.4411235/150‑1 (MQ=60)
ATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCT > SRR13214403.2053776/1‑150 (MQ=60)
TGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTA > SRR13214403.412044/1‑150 (MQ=60)
TGATTTCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTA > SRR13214403.2483939/1‑150 (MQ=60)
TAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTA < SRR13214403.2172005/150‑1 (MQ=60)
TCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAA < SRR13214403.1028301/150‑1 (MQ=60)
TCCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAA > SRR13214403.2308445/1‑150 (MQ=60)
CCTGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTAGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAAC < SRR13214403.4003325/150‑1 (MQ=60)
TGTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCT < SRR13214403.1637016/150‑1 (MQ=60)
GTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTT < SRR13214403.291482/150‑1 (MQ=60)
GTTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTT < SRR13214403.2928350/150‑1 (MQ=60)
TTCCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTC > SRR13214403.1782455/1‑150 (MQ=60)
TCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCA > SRR13214403.6171/1‑150 (MQ=60)
CCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAA > SRR13214403.2187635/1‑150 (MQ=60)
CCAGAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAA < SRR13214403.2884038/150‑1 (MQ=60)
GAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGG < SRR13214403.2393963/150‑1 (MQ=60)
GAACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGG > SRR13214403.1491147/1‑150 (MQ=60)
AACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGC > SRR13214403.2807680/1‑150 (MQ=60)
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AACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGC < SRR13214403.1377463/150‑1 (MQ=60)
ACTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCA > SRR13214403.1401048/1‑150 (MQ=60)
CTTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAG > SRR13214403.2341542/1‑150 (MQ=60)
TTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGA < SRR13214403.2046551/150‑1 (MQ=60)
TTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGA > SRR13214403.2700227/1‑150 (MQ=60)
TTGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGA < SRR13214403.1697994/150‑1 (MQ=60)
TGAGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGAC < SRR13214403.1056784/150‑1 (MQ=60)
AGCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTT < SRR13214403.1206001/150‑1 (MQ=60)
GCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTC < SRR13214403.528262/150‑1 (MQ=60)
GCTTTTTGGGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTC < SRR13214403.529349/150‑1 (MQ=60)
TTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTA < SRR13214403.1609203/150‑1 (MQ=60)
TGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAA > SRR13214403.3080779/1‑150 (MQ=60)
TGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAA < SRR13214403.3889735/150‑1 (MQ=60)
GGCCACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGT < SRR13214403.4327594/150‑1 (MQ=60)
CACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAAGTTAA < SRR13214403.2262656/150‑1 (MQ=60)
CACTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGTTAA < SRR13214403.3351820/150‑1 (MQ=60)
ACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAAGTTAAA < SRR13214403.2152194/150‑1 (MQ=60)
CTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAAGTTAAAT < SRR13214403.2326735/150‑1 (MQ=60)
CTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAAGTTAAAT < SRR13214403.418709/150‑1 (MQ=60)
CTTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGTTAAAT > SRR13214403.3620196/1‑150 (MQ=60)
TTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAAGTTAAATC < SRR13214403.2727078/150‑1 (MQ=60)
TTCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGTTAAATC > SRR13214403.2688035/1‑150 (MQ=60)
TCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAAGTTAAATCT < SRR13214403.3714445/150‑1 (MQ=60)
TCAACTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGTTAAATCT > SRR13214403.195468/1‑150 (MQ=60)
CAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAAGTTAAATCTC < SRR13214403.4537478/150‑1 (MQ=60)
CTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGTTAAATCTCCAT < SRR13214403.2501262/150‑1 (MQ=60)
CTCGAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGTTAAATCTCCAT < SRR13214403.2597075/150‑1 (MQ=60)
GAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGTTAAATCTCCATTAT > SRR13214403.1286211/1‑150 (MQ=60)
GAGGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGTTAAATCTCCATTAT < SRR13214403.4178061/150‑1 (MQ=60)
GGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGTTAAATCTCCATTATTT < SRR13214403.2909959/150‑1 (MQ=60)
GGAACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGTTAAATCTCCATTATTT < SRR13214403.1881215/150‑1 (MQ=60)
GAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAAGTTAAATCTCCATTATTTG > SRR13214403.75544/1‑150 (MQ=60)
GAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAAGTTAAATCTCCATTATTTG < SRR13214403.1740344/150‑1 (MQ=60)
AACAATCTCACCCTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGCGATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTCTTTAAAGTTAAATCTCCATTATTTGA > SRR13214403.4630974/1‑150 (MQ=60)
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ACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCCTTCAATAATTTCCTGTTCCAGAACTTGGGCTTTTTGTGCCACTTCAACTCTAGGAATAATCTCACCTTTTATATCAATTTTTATCTTATTTTTAAAAAGTGAAACAGTAATTTTTGAGTTTTTAAGGTAATCATTTTCTTTTACTTTTTCACCTACAAAACCTTCAATGGCAGACTTTTTTAAAGTTAAATCTCCATTATTTGAAG > CP043523/839231‑839529
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |