Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 509 total aligned reads displayed.
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|
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TTCCGCTAGTTTAAGATCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAG > SRR13214403.4335056/1‑150 (MQ=60)
TTCCGCTAGTTTAAGATCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAG > SRR13214403.3186130/1‑150 (MQ=60)
CCGCTAGTTTAAGATCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTG > SRR13214403.2835256/1‑150 (MQ=60)
CGCTAGTTTAAGATCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGtgt > SRR13214403.3616259/1‑147 (MQ=60)
GCTAGTTTAAGATCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGtgtc < SRR13214403.235638/150‑5 (MQ=60)
GCTAGTTTAAGATCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGAT > SRR13214403.612794/1‑150 (MQ=60)
GTTTAAGATCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTA < SRR13214403.211441/150‑1 (MQ=60)
GTTTAAGATCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTA > SRR13214403.123843/1‑150 (MQ=60)
TTAAGATCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAAT < SRR13214403.2615735/150‑1 (MQ=60)
TTAAGATCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTAGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGtgtcttcaat < SRR13214403.3288371/150‑11 (MQ=60)
TAAGATCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGtgtcttcaatc > SRR13214403.3560141/1‑139 (MQ=60)
TAAGATCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATC > SRR13214403.4201836/1‑150 (MQ=60)
AAGATCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATGAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCT < SRR13214403.197129/150‑1 (MQ=60)
AAGATCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGtgtcttcaatct < SRR13214403.3351276/150‑13 (MQ=60)
GATCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGtgtcttcaatctca > SRR13214403.1663584/1‑136 (MQ=60)
ATCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGtgtcttcaatctcag < SRR13214403.704768/150‑16 (MQ=60)
TCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGtgtcttcaatctcagc > SRR13214403.3318271/1‑134 (MQ=60)
TCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGtgtcttcaatctcagc < SRR13214403.2165184/150‑17 (MQ=60)
TCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATC < SRR13214403.1131490/150‑1 (MQ=60)
CAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCCTCT > SRR13214403.1159959/1‑150 (MQ=60)
AACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTT > SRR13214403.50894/1‑150 (MQ=60)
ACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGtgtcttcaatctcagcttc > SRR13214403.586622/1‑131 (MQ=60)
ACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTC > SRR13214403.3072007/1‑150 (MQ=60)
AATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTG > SRR13214403.3260876/1‑150 (MQ=60)
AATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTG < SRR13214403.2790193/150‑1 (MQ=60)
TAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAG > SRR13214403.3631338/1‑150 (MQ=60)
TAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAG > SRR13214403.3047670/1‑150 (MQ=60)
TAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAG < SRR13214403.38685/150‑1 (MQ=60)
TAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAG > SRR13214403.3647479/1‑150 (MQ=60)
TAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAG < SRR13214403.2588407/150‑1 (MQ=60)
AAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGtgtcttcaatctcagcttctgagt > SRR13214403.3227492/1‑126 (MQ=60)
TGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTT < SRR13214403.3268443/150‑1 (MQ=60)
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TGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTT < SRR13214403.761637/150‑1 (MQ=60)
GGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGtgtcttcaatctcagcttctgagtttta < SRR13214403.2011432/150‑29 (MQ=60)
GTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGA > SRR13214403.1155148/1‑150 (MQ=60)
TATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGtgtcttcaatctcagcttctgagttttaaa < SRR13214403.2490816/150‑31 (MQ=60)
ATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAA < SRR13214403.1365512/150‑1 (MQ=60)
TTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAAT < SRR13214403.2996492/150‑1 (MQ=60)
TTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAAT > SRR13214403.1394684/1‑150 (MQ=60)
TTGTCAGTAACTTTCGTGAAAAAAAAGTCAGGCGTAATTGCTCAATACGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATACTTGTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAAT < SRR13214403.2511159/150‑1 (MQ=60)
TGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCACTCGCAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATC < SRR13214403.3548224/150‑1 (MQ=60)
GTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCT > SRR13214403.1459274/1‑150 (MQ=60)
GTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCT < SRR13214403.2067256/150‑1 (MQ=60)
GTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCT < SRR13214403.2878019/150‑1 (MQ=60)
CAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAA > SRR13214403.561981/1‑150 (MQ=60)
AGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAAT < SRR13214403.617439/150‑1 (MQ=60)
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CTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCA > SRR13214403.2744675/1‑150 (MQ=60)
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TTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATA > SRR13214403.4600046/1‑150 (MQ=60)
GTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAAT > SRR13214403.3761419/1‑150 (MQ=60)
TGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATA < SRR13214403.946616/150‑1 (MQ=60)
TGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATA < SRR13214403.706750/150‑1 (MQ=60)
TGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATA > SRR13214403.2532413/1‑150 (MQ=60)
TGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATA < SRR13214403.3787681/150‑1 (MQ=60)
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ATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGA > SRR13214403.1592716/1‑150 (MQ=60)
TAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAA < SRR13214403.1783311/150‑1 (MQ=60)
TAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAA < SRR13214403.2267386/150‑1 (MQ=60)
AAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAA > SRR13214403.1440080/1‑150 (MQ=60)
AAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAA > SRR13214403.1868810/1‑150 (MQ=60)
AAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAAC < SRR13214403.230662/150‑1 (MQ=60)
AAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACgg > SRR13214403.3060134/1‑148 (MQ=60)
AAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggt > SRR13214403.2716049/1‑147 (MQ=60)
AAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATACTAGAAACCTC > SRR13214403.2198924/1‑150 (MQ=60)
AGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggtt < SRR13214403.500086/150‑5 (MQ=60)
GGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttc < SRR13214403.687465/150‑6 (MQ=60)
CAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctg < SRR13214403.1351285/150‑8 (MQ=60)
CAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctg < SRR13214403.4102342/150‑8 (MQ=60)
CAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATT > SRR13214403.1044636/1‑150 (MQ=60)
TCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTC > SRR13214403.4628655/1‑150 (MQ=60)
GTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctgttgca > SRR13214403.794260/1‑138 (MQ=60)
TAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGA > SRR13214403.4319584/1‑150 (MQ=60)
AATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctgttgcaaa > SRR13214403.4232254/1‑136 (MQ=60)
ATTGCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctgttgcaaag > SRR13214403.2663415/1‑135 (MQ=60)
ATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAA > SRR13214403.1420493/1‑150 (MQ=60)
ATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAA > SRR13214403.3680911/1‑150 (MQ=60)
ATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATCAATCAGGGATTTTAATCTCATCTCCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATCTTCTGAAA > SRR13214403.2577893/1‑150 (MQ=60)
GCTCAATAAGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctgttgcaaagttt < SRR13214403.3391175/150‑19 (MQ=60)
GCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAAAT > SRR13214403.4576146/1‑150 (MQ=60)
GCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAAAT > SRR13214403.2973589/1‑150 (MQ=60)
CAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAAATAGA > SRR13214403.519737/1‑150 (MQ=60)
CAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAAATAGA > SRR13214403.3612551/1‑150 (MQ=60)
AGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctgttgcaaagttttctgataa > SRR13214403.1107257/1‑124 (MQ=60)
AGTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctgttgcaaagttttctgataa < SRR13214403.3239705/150‑27 (MQ=60)
GTCGTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctgttgcaaagttttctgataag < SRR13214403.1734351/150‑28 (MQ=60)
GTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAAATAGACTAGAT < SRR13214403.3708409/150‑1 (MQ=60)
GTCCTTGACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctgttgcaaagttttctgataagtct < SRR13214403.3370614/150‑31 (MQ=60)
GTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAAATAGACTAGATTTT > SRR13214403.2924625/1‑150 (MQ=60)
TCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAAATAGACTAGATTTTT < SRR13214403.2474703/150‑1 (MQ=60)
CCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAAATAGACTAGATTTTTT > SRR13214403.2867909/1‑150 (MQ=60)
cttgaCCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctgttgcaaagttttctgataagtctatt > SRR13214403.3714206/6‑117 (MQ=60)
ttgaCCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctgttgcaaagttttctgataagtctattt < SRR13214403.1816512/146‑35 (MQ=60)
TTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAAATAGACTAGATTTTTTTG < SRR13214403.3037304/150‑1 (MQ=60)
ACCAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTAGATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATGATAGAAACggttctgttgcaaagttttctgataagtctattttag < SRR13214403.913353/150‑38 (MQ=51)
CAAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctgttgcaaagttttctgataagtctattttagtg > SRR13214403.2092757/1‑111 (MQ=60)
AAAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctgttgcaaagttttctgataagtctattttagtgt < SRR13214403.1558527/150‑41 (MQ=60)
AAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAAATAGACTAGATTTTTTTGAAGTTC < SRR13214403.2665389/150‑1 (MQ=60)
AAAGGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctgttgcaaagttttctgataagtctattttagtgta > SRR13214403.4167388/1‑109 (MQ=60)
GGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctgttgcaaagttttctgataagtctattttagtgtaaaa < SRR13214403.3338550/150‑45 (MQ=60)
GGGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctgttgcaaagttttctgataagtctattttagtgtaaaa < SRR13214403.88481/150‑45 (MQ=60)
GGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAAATAGACTAGATTTTTTTGAAGTTCTGTT > SRR13214403.3004886/1‑150 (MQ=60)
GGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctgttgcaaagttttctgataagtctattttagtgtaaaat < SRR13214403.1296295/150‑46 (MQ=60)
GGATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTCCCACGCAAATCTTCATGAATCAGTGTCTTCAATCTCAGCTTCTGAGTTTTAAAATCTAATTCCCAATAATAGAAACggttctgttgcaaagttttctgataagtctattttagtgtaaaat < SRR13214403.2633643/150‑46 (MQ=60)
GAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAAATAGACTAGATTTTTTTGAAGTTCTGTTA > SRR13214403.1728032/1‑150 (MQ=60)
GAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAAATAGACTAGATTTTTTTGAAGTTCTGTTA < SRR13214403.1950357/150‑1 (MQ=60)
GAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAAATAGACTAGATTTTTTTGAAGTTCTGTTA > SRR13214403.4564770/1‑150 (MQ=60)
GAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAAATAGACTAGATTTTTTTGAAGTTCTGTTA > SRR13214403.4549973/1‑150 (MQ=60)
GAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAAATAGACTAGATTTTTTTGAAGTTCTGTTA < SRR13214403.3578150/150‑1 (MQ=60)
AATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAGATAGACTAGATTTTTTTGAAGTTCTGTTAT > SRR13214403.188270/1‑150 (MQ=60)
AATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAAATAGACTAGATTTTTTTGAAGTTCTGTTAT > SRR13214403.1795125/1‑150 (MQ=60)
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TGAAGTTTCAACCATTTTGGTGAACAATAATAAAGTTGCCGACGAATAAATTCCGCTAGTTTAAGATCAACAATAAGTGGTATTGTCAGTAACTTTTGTGATAAAAAAGGCAGTCGTAATTGCTCAATAAGTCGTCCTTCCCCAAAAGGAATTTCTTCTTGTAAATAAATAATTTTTCCACGCAAATCTTCATGAATCAGGGATTTTAATCTCATCTTCTGAGCTTTGAAATCTAACTCCCAATAATAGAAACCTCTATTTTCTGAAAAATAGACTAGATTTTTTTGAAGTTCTGTTAT > CP043523/1319261‑1319559
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
