Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 557 total aligned reads displayed.
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|
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TGCCATGGAGTCACCCGTTTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAAC < SRR13214403.3891801/150‑1 (MQ=60)
TGCCATGGAGTCACCCGTTTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAAC < SRR13214403.523281/150‑1 (MQ=60)
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cgatctGTCACCCGTTTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTC < SRR13214403.4270162/144‑1 (MQ=60)
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TGGAGTCACCCGTTTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCAC > SRR13214403.2106434/1‑150 (MQ=60)
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GGAGTCACCCGTTTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGACTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACC > SRR13214403.2739890/1‑150 (MQ=60)
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CGTTTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAG > SRR13214403.962482/1‑150 (MQ=60)
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CACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAAT < SRR13214403.3082129/150‑1 (MQ=60)
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TTCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATC < SRR13214403.565695/150‑1 (MQ=60)
TTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATC < SRR13214403.350371/150‑1 (MQ=60)
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TCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCA < SRR13214403.3394290/150‑1 (MQ=60)
CTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCAT < SRR13214403.4130184/150‑1 (MQ=60)
CTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCAT < SRR13214403.849535/150‑1 (MQ=60)
atggtttaaagacatttagtccttctttatgaAGTTTGATTTTGGTTGTTTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGGTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAATCTTCACCACGTCGAAGACTTAAATCAATATCATAA < SRR13214403.1217804/118‑1 (MQ=60)
TCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGCTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAA < SRR13214403.4035113/150‑1 (MQ=60)
CTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAAT > SRR13214403.1046933/1‑150 (MQ=60)
CTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAAT > SRR13214403.2923184/1‑150 (MQ=60)
CTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAAT < SRR13214403.816682/150‑1 (MQ=60)
TCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATT > SRR13214403.2445272/1‑150 (MQ=60)
CATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTG < SRR13214403.2939251/150‑1 (MQ=60)
ATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGC > SRR13214403.818882/1‑150 (MQ=60)
TCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCT < SRR13214403.34658/150‑1 (MQ=60)
TCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCT > SRR13214403.697133/1‑150 (MQ=60)
TCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCT > SRR13214403.2172161/1‑150 (MQ=60)
CAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTT > SRR13214403.2113157/1‑150 (MQ=60)
CAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTT > SRR13214403.2698391/1‑150 (MQ=60)
ATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTT < SRR13214403.124252/150‑1 (MQ=60)
ATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTT > SRR13214403.1655804/1‑150 (MQ=60)
TAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTG < SRR13214403.1531163/150‑1 (MQ=60)
AAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGA > SRR13214403.2889740/1‑150 (MQ=60)
AAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAA > SRR13214403.1092632/1‑150 (MQ=60)
AATTGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGGACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAA < SRR13214403.1847157/150‑1 (MQ=60)
ATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAAT > SRR13214403.1205999/1‑150 (MQ=60)
ATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAAT > SRR13214403.250635/1‑150 (MQ=60)
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ATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTAC < SRR13214403.2214886/150‑1 (MQ=60)
AGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTAC < SRR13214403.3369999/150‑1 (MQ=60)
AGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTAC < SRR13214403.2275017/150‑1 (MQ=60)
CCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCA > SRR13214403.736870/1‑150 (MQ=60)
CTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAG < SRR13214403.3012473/150‑1 (MQ=60)
CTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAG > SRR13214403.1799974/1‑150 (MQ=60)
TGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGC > SRR13214403.4347069/1‑150 (MQ=60)
GTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCA < SRR13214403.3671712/150‑1 (MQ=60)
GTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCA < SRR13214403.3672537/150‑1 (MQ=60)
AATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAAT < SRR13214403.1969340/150‑1 (MQ=60)
AATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAAT < SRR13214403.4297/150‑1 (MQ=60)
AATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAAT < SRR13214403.821697/150‑1 (MQ=60)
ATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATC > SRR13214403.964770/1‑150 (MQ=60)
TTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCC < SRR13214403.2389872/150‑1 (MQ=60)
TTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCG > SRR13214403.503901/1‑150 (MQ=60)
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GAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAA < SRR13214403.2298962/150‑1 (MQ=60)
GTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAA < SRR13214403.11119/150‑1 (MQ=60)
TGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCA > SRR13214403.4097244/1‑150 (MQ=60)
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GATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAA < SRR13214403.83473/150‑1 (MQ=60)
GATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAA > SRR13214403.928086/1‑150 (MQ=60)
ATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAAC > SRR13214403.3228353/1‑150 (MQ=60)
TTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACA < SRR13214403.1378808/150‑1 (MQ=60)
TGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACT < SRR13214403.2667803/150‑1 (MQ=60)
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TGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACT > SRR13214403.190805/1‑150 (MQ=60)
GTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCAC > SRR13214403.4593055/1‑150 (MQ=60)
GTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCAC > SRR13214403.1777094/1‑150 (MQ=60)
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TGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGT < SRR13214403.3338604/150‑1 (MQ=60)
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AATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTT < SRR13214403.1140055/150‑1 (MQ=60)
AATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTT < SRR13214403.3584302/150‑1 (MQ=60)
ATCCCATAACAGCAGTTACCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTG < SRR13214403.4189219/150‑1 (MQ=60)
CCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCT > SRR13214403.2013579/1‑150 (MQ=60)
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ATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCC > SRR13214403.410255/1‑150 (MQ=60)
AACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAA > SRR13214403.2864783/1‑150 (MQ=60)
CAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAA < SRR13214403.108410/150‑1 (MQ=60)
CAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAA < SRR13214403.209834/150‑1 (MQ=60)
CAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATAT < SRR13214403.3441342/150‑1 (MQ=60)
CAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATAT < SRR13214403.4307813/150‑1 (MQ=60)
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GCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCA > SRR13214403.1341738/1‑150 (MQ=60)
CAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACT < SRR13214403.1571646/150‑1 (MQ=60)
AAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTT < SRR13214403.3004692/150‑1 (MQ=60)
AAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTT < SRR13214403.2415880/150‑1 (MQ=60)
AAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTT < SRR13214403.3026885/150‑1 (MQ=60)
GTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCC < SRR13214403.4325421/150‑1 (MQ=60)
TTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCA < SRR13214403.4463707/150‑1 (MQ=60)
tgatcTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCAT < SRR13214403.3519347/145‑1 (MQ=60)
TGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCAC < SRR13214403.46661/150‑1 (MQ=60)
ACTTCCCAGAACCTGATCCCCCAACAATAGCTAAAACGTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACAT < SRR13214403.4225250/150‑1 (MQ=60)
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TCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCATATTTA < SRR13214403.3642128/150‑1 (MQ=60)
CCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCATATTTAC > SRR13214403.2022642/1‑150 (MQ=60)
CCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCATATTTAC < SRR13214403.381773/150‑1 (MQ=60)
CAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAATCTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCATATTTACCT < SRR13214403.3529742/150‑1 (MQ=60)
CAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCATATTTACCT > SRR13214403.1496546/1‑150 (MQ=60)
AGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCATATTTACCTC < SRR13214403.2200925/150‑1 (MQ=60)
AGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCATATTTACCTC > SRR13214403.1272222/1‑150 (MQ=60)
AGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTC > SRR13214403.4100295/1‑150 (MQ=60)
AGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTC < SRR13214403.1483182/150‑1 (MQ=60)
CCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATT < SRR13214403.3480225/150‑1 (MQ=60)
CCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATT < SRR13214403.1328997/150‑1 (MQ=60)
CCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATT > SRR13214403.4017599/1‑150 (MQ=60)
CTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCATATTTACCTCaatga < SRR13214403.1700141/150‑6 (MQ=60)
CTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATTC < SRR13214403.2128304/150‑1 (MQ=60)
CTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATTC < SRR13214403.2001598/150‑1 (MQ=60)
GATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCATATTTACCTCaatgaaa > SRR13214403.3245388/1‑143 (MQ=60)
GATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATTCTG < SRR13214403.3099844/150‑1 (MQ=60)
GATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATTCTG > SRR13214403.608735/1‑150 (MQ=60)
GATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATTCTG < SRR13214403.919706/150‑1 (MQ=60)
ATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCATATTTACCTCaatgaaat > SRR13214403.60022/1‑142 (MQ=60)
TTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCATATTTACCTCaatgaaatc < SRR13214403.4580312/150‑10 (MQ=60)
TCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATTCTGTAT < SRR13214403.985479/150‑1 (MQ=60)
CCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCATATTTACCTCaatgaaatcttt < SRR13214403.3165029/150‑13 (MQ=60)
CCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCATATTTACCTCaatgaaatctttc < SRR13214403.2116562/150‑14 (MQ=60)
CAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATTCTGTATTCTT < SRR13214403.729780/150‑1 (MQ=60)
CAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATTCTGTATTCTT < SRR13214403.3680763/150‑1 (MQ=60)
AACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATTCTGTATTCTTA < SRR13214403.1649051/150‑1 (MQ=60)
AACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATTCTGTATTCTTA < SRR13214403.3739608/150‑1 (MQ=60)
ACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCATATTTACCTCaatgaaatctttctaa < SRR13214403.70523/150‑17 (MQ=60)
CAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATTCTGTATTCTTATT > SRR13214403.1740713/1‑150 (MQ=60)
ATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCATATTTACCTCaatgaaatctttctaaata > SRR13214403.2841369/1‑131 (MQ=60)
ATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATTCTGTATTCTTATTTA < SRR13214403.1643494/150‑1 (MQ=60)
TGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCATATTTACCTCaatgaaatctttctaaatag < SRR13214403.2240213/150‑21 (MQ=60)
TAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATTCTGTATTCTTATTTAT > SRR13214403.2531299/1‑150 (MQ=60)
AGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATTCTGTATTCTTATTTATA < SRR13214403.3039713/150‑1 (MQ=60)
AGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATTCTGTATTCTTATTTATA > SRR13214403.49483/1‑150 (MQ=60)
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CGAATACTTGCCATGGAGTCACCCGTTTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATTTACCTCCATTCTGTATTCTTATTTATA > CP043523/1444655‑1444953
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |