Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CATTTGCGACTGGGGAATTAACTGAAGCCCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGAAGATAAGATAATTCAAGCATTACCACATCATCTCGTGCTTCATCTTCTTAACCAGTCCTTTTCTAATCAGGTGCAAATTAAAATTCAATATCAAGCCAAAGATAAATTAACTGAAGTCTATGGTAATGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTAAGCAAATCGTAAATATATCATAAAAAAAGCTATCCT > CP043523/1885851‑1886138
|
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TTTGCGACTGGAGAACTCACGGAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAA < SRR13214403.606949/150‑1 (MQ=31)
TTTGCGACTGGAGAACTCACGGAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAA < SRR13214403.1492108/150‑1 (MQ=31)
tggagaactcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGA < SRR13214403.790222/131‑1 (MQ=34)
tggagaactcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGA < SRR13214403.790557/131‑1 (MQ=34)
gagaactcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATA < SRR13214403.719449/133‑1 (MQ=33)
gaactcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAA < SRR13214403.2543320/135‑1 (MQ=33)
gaactcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAA < SRR13214403.4163634/135‑1 (MQ=33)
gaactcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAA < SRR13214403.829733/135‑1 (MQ=33)
aactcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTCACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAAT < SRR13214403.3993428/136‑1 (MQ=27)
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actcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATT < SRR13214403.95713/137‑1 (MQ=36)
ctcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTA < SRR13214403.660469/138‑1 (MQ=37)
ctcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTA < SRR13214403.668947/138‑1 (MQ=37)
tcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAA > SRR13214403.1503906/12‑150 (MQ=38)
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tcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAA > SRR13214403.2822749/12‑150 (MQ=38)
cacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAA < SRR13214403.3198875/140‑1 (MQ=38)
acggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAAT < SRR13214403.4400511/141‑1 (MQ=38)
acggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAAT < SRR13214403.4311693/141‑1 (MQ=38)
ggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGA > SRR13214403.3486802/8‑150 (MQ=38)
ggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGA > SRR13214403.1195151/8‑150 (MQ=38)
GAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAA > SRR13214403.4482076/1‑150 (MQ=36)
GAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAA > SRR13214403.448505/1‑150 (MQ=36)
GAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAA < SRR13214403.3982593/150‑1 (MQ=36)
aggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAG < SRR13214403.2998825/145‑1 (MQ=39)
GCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTC > SRR13214403.3757111/1‑150 (MQ=41)
CTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCT > SRR13214403.4142568/1‑150 (MQ=42)
CTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCT < SRR13214403.3702808/150‑1 (MQ=42)
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CAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTAT < SRR13214403.3098900/150‑1 (MQ=45)
CAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTAT > SRR13214403.776694/1‑150 (MQ=45)
AAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATG > SRR13214403.2592544/1‑150 (MQ=45)
AAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATG > SRR13214403.736039/1‑150 (MQ=45)
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AATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGT < SRR13214403.2438870/150‑1 (MQ=45)
AATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGT < SRR13214403.366578/150‑1 (MQ=45)
AATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGT > SRR13214403.316482/1‑150 (MQ=45)
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ATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTT > SRR13214403.1305097/1‑150 (MQ=44)
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TTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTA < SRR13214403.2095084/150‑1 (MQ=36)
TTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTAT > SRR13214403.3649597/1‑150 (MQ=35)
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ATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAG < SRR13214403.3958459/150‑1 (MQ=11)
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GAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAG < SRR13214403.515843/150‑1 (MQ=12)
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AATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGT < SRR13214403.2117663/150‑1 (MQ=16)
AATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGT > SRR13214403.3684192/1‑150 (MQ=16)
ATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTT < SRR13214403.453005/150‑1 (MQ=16)
ATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTT < SRR13214403.467320/150‑1 (MQ=16)
TTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTA > SRR13214403.2197920/1‑150 (MQ=16)
TCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAA > SRR13214403.438194/1‑150 (MQ=16)
CAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAA > SRR13214403.3549473/1‑150 (MQ=16)
CAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAA > SRR13214403.681367/1‑150 (MQ=16)
CAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAA < SRR13214403.3003835/150‑1 (MQ=16)
AAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAAT > SRR13214403.2685688/1‑150 (MQ=16)
AGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATC < SRR13214403.3112194/150‑1 (MQ=18)
AGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATC < SRR13214403.3112032/150‑1 (MQ=18)
GCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCA > SRR13214403.2288476/1‑150 (MQ=19)
CTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAA < SRR13214403.1019702/150‑1 (MQ=20)
TACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGG > SRR13214403.3409854/1‑150 (MQ=23)
ACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAA < SRR13214403.2349400/150‑1 (MQ=28)
CATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAA > SRR13214403.2351692/1‑150 (MQ=29)
CATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAA > SRR13214403.3105794/1‑150 (MQ=29)
CATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAA < SRR13214403.694423/150‑1 (MQ=29)
GTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTC < SRR13214403.356948/150‑1 (MQ=43)
GTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTC < SRR13214403.357187/150‑1 (MQ=43)
GTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTC < SRR13214403.357556/150‑1 (MQ=43)
TCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCA > SRR13214403.2317221/1‑150 (MQ=45)
CTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATA > SRR13214403.4149474/1‑150 (MQ=48)
CTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATA > SRR13214403.3202542/1‑150 (MQ=48)
TTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATAT > SRR13214403.3824958/1‑150 (MQ=50)
TTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATAT > SRR13214403.3826256/1‑150 (MQ=50)
TTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATAT > SRR13214403.3830764/1‑150 (MQ=50)
TTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATC > SRR13214403.4292143/1‑150 (MQ=52)
TATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCC > SRR13214403.2961165/1‑150 (MQ=54)
TATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCC > SRR13214403.3985236/1‑150 (MQ=54)
TATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCC > SRR13214403.2961469/1‑150 (MQ=54)
TATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAAACAATCTCATATCC > SRR13214403.4286560/1‑150 (MQ=37)
TCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCAT > SRR13214403.3481851/1‑150 (MQ=59)
CTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATT < SRR13214403.3393368/150‑1 (MQ=60)
TTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTG < SRR13214403.2820248/150‑1 (MQ=60)
TCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGA < SRR13214403.4550459/150‑1 (MQ=60)
TCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGA > SRR13214403.1057608/1‑150 (MQ=60)
AATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAA < SRR13214403.2269099/150‑1 (MQ=60)
ATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAAA < SRR13214403.3550827/150‑1 (MQ=60)
CAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaatt < SRR13214403.314959/150‑10 (MQ=60)
TCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattata < SRR13214403.4246584/150‑13 (MQ=60)
TTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataaat < SRR13214403.1435033/150‑16 (MQ=60)
TTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAAATTATAAATA > SRR13214403.187020/1‑150 (MQ=60)
ATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataaatatttcct < SRR13214403.3039876/150‑23 (MQ=60)
CAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataaatatttcctaaataaaa < SRR13214403.3157107/150‑31 (MQ=60)
CAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataaatatttcctaaataaaa < SRR13214403.2680563/150‑31 (MQ=60)
CAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataaatatttcctaaataaaa < SRR13214403.2708330/150‑31 (MQ=60)
CAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataaatatttcctaaataaaa > SRR13214403.4099063/1‑120 (MQ=60)
AATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataaatatttcctaaataaaaag > SRR13214403.611452/1‑118 (MQ=60)
AAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataaatatttcctaaataaaaaggggc < SRR13214403.2741596/150‑37 (MQ=60)
AAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacagattataaatatttcctaaataaaaaggggct > SRR13214403.4181321/1‑113 (MQ=60)
AAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacagattataaatatttcctaaataaaaaggggct > SRR13214403.4180630/1‑113 (MQ=60)
AAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataaatatttcctaaataaaaaggggct > SRR13214403.2705739/1‑113 (MQ=60)
AAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataaatatttcctaaataaaaaggggct < SRR13214403.934323/150‑38 (MQ=60)
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CATTTGCGACTGGGGAATTAACTGAAGCCCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGAAGATAAGATAATTCAAGCATTACCACATCATCTCGTGCTTCATCTTCTTAACCAGTCCTTTTCTAATCAGGTGCAAATTAAAATTCAATATCAAGCCAAAGATAAATTAACTGAAGTCTATGGTAATGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTAAGCAAATCGTAAATATATCATAAAAAAAGCTATCCT > CP043523/1885851‑1886138
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
