Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGGGGAATTAACTGAAGCCCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGAAGATAAGATAATTCAAGCATTACCACATCATCTCGTGCTTCATCTTCTTAACCAGTCCTTTTCTAATCAGGTGCAAATTAAAATTCAATATCAAGCCAAAGATAAATTAACTGAAGTCTATGGTAATGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTAAGCAAATCGTAAATATATCATAAAAAAAGCTATCCTTGTTGTATATT > CP043523/1885861‑1886149
|
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tggagaactcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGA < SRR13214403.790557/131‑1 (MQ=34)
gagaactcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATA < SRR13214403.719449/133‑1 (MQ=33)
gaactcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAA < SRR13214403.2543320/135‑1 (MQ=33)
gaactcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAA < SRR13214403.4163634/135‑1 (MQ=33)
gaactcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAA < SRR13214403.829733/135‑1 (MQ=33)
aactcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTCACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAAT < SRR13214403.3993428/136‑1 (MQ=27)
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actcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATT < SRR13214403.95711/137‑1 (MQ=36)
ctcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTA < SRR13214403.660469/138‑1 (MQ=37)
ctcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTA < SRR13214403.668947/138‑1 (MQ=37)
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tcacggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAA > SRR13214403.2822749/12‑150 (MQ=38)
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acggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAAT < SRR13214403.4400511/141‑1 (MQ=38)
ggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGA > SRR13214403.1195151/8‑150 (MQ=38)
ggaggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGA > SRR13214403.3486802/8‑150 (MQ=38)
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GAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAA > SRR13214403.4482076/1‑150 (MQ=36)
GAGGCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAA > SRR13214403.448505/1‑150 (MQ=36)
aggctCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAG < SRR13214403.2998825/145‑1 (MQ=39)
GCTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTC > SRR13214403.3757111/1‑150 (MQ=41)
CTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCT > SRR13214403.4142568/1‑150 (MQ=42)
CTCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCT < SRR13214403.3702808/150‑1 (MQ=42)
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CAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTAT < SRR13214403.3098900/150‑1 (MQ=45)
CAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTAT > SRR13214403.776694/1‑150 (MQ=45)
AAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATG > SRR13214403.736039/1‑150 (MQ=45)
AAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATG > SRR13214403.2592544/1‑150 (MQ=45)
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AATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGT < SRR13214403.366578/150‑1 (MQ=45)
AATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGT > SRR13214403.316482/1‑150 (MQ=45)
AATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGT < SRR13214403.2438870/150‑1 (MQ=45)
ATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTT > SRR13214403.109152/1‑150 (MQ=44)
ATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTT > SRR13214403.117445/1‑150 (MQ=44)
ATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTT > SRR13214403.1305097/1‑150 (MQ=44)
TACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTtt > SRR13214403.614828/1‑148 (MQ=43)
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ACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGATGATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTttt < SRR13214403.692993/150‑4 (MQ=41)
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ATAAGAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAG < SRR13214403.3959570/150‑1 (MQ=11)
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GAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAG < SRR13214403.515741/150‑1 (MQ=12)
GAAAATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAG > SRR13214403.2996233/1‑150 (MQ=12)
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ATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTT < SRR13214403.453005/150‑1 (MQ=16)
ATTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTT < SRR13214403.467320/150‑1 (MQ=16)
TTCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTA > SRR13214403.2197920/1‑150 (MQ=16)
TCAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAA > SRR13214403.438194/1‑150 (MQ=16)
CAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAA > SRR13214403.3549473/1‑150 (MQ=16)
CAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAA > SRR13214403.681367/1‑150 (MQ=16)
CAAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAA < SRR13214403.3003835/150‑1 (MQ=16)
AAGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAAT > SRR13214403.2685688/1‑150 (MQ=16)
AGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATC < SRR13214403.3112194/150‑1 (MQ=18)
AGCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATC < SRR13214403.3112032/150‑1 (MQ=18)
GCTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCA > SRR13214403.2288476/1‑150 (MQ=19)
CTTTACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAA < SRR13214403.1019702/150‑1 (MQ=20)
TACCACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGG > SRR13214403.3409854/1‑150 (MQ=23)
ACATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAA < SRR13214403.2349400/150‑1 (MQ=28)
CATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAA < SRR13214403.694423/150‑1 (MQ=29)
CATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAA > SRR13214403.3105794/1‑150 (MQ=29)
CATCATGTAGTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAA > SRR13214403.2351692/1‑150 (MQ=29)
atcatgtagtcctttatcttctcaatcagtctttttcaaatcagctacaaatcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAA > SRR13214403.4332229/61‑150 (MQ=49)
atcatgtagtcctttatcttctcaatcagtctttttcaaatcagctacaaatcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAA < SRR13214403.1774703/90‑1 (MQ=49)
catgtagtcctttatcttctcaatcagtctttttcaaatcagctacaaatcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATC < SRR13214403.3106360/92‑1 (MQ=53)
atgtagtcctttatcttctcaatcagtctttttcaaatcagctacaaatcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCT > SRR13214403.433352/58‑150 (MQ=55)
gtagtcctttatcttctcaatcagtctttttcaaatcagctacaaatcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTAT > SRR13214403.2523529/56‑150 (MQ=59)
agtcctttatcttctcaatcagtctttttcaaatcagctacaaatcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCT > SRR13214403.2015768/54‑150 (MQ=60)
GTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTC < SRR13214403.356948/150‑1 (MQ=43)
GTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTC < SRR13214403.357187/150‑1 (MQ=43)
GTCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTC < SRR13214403.357556/150‑1 (MQ=43)
TCCTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCA > SRR13214403.2317221/1‑150 (MQ=45)
cctttatcttctcaatcagtctttttcaaatcagctacaaatcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCAT > SRR13214403.4620904/51‑150 (MQ=60)
cctttatcttctcaatcagtctttttcaaatcagctacaaatcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCAT > SRR13214403.4622341/51‑150 (MQ=60)
CTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATA > SRR13214403.3202542/1‑150 (MQ=48)
CTTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATA > SRR13214403.4149474/1‑150 (MQ=48)
TTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATAT > SRR13214403.3824958/1‑150 (MQ=50)
TTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATAT > SRR13214403.3826256/1‑150 (MQ=50)
TTTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATAT > SRR13214403.3830764/1‑150 (MQ=50)
TTATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATC > SRR13214403.4292143/1‑150 (MQ=52)
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TATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCC > SRR13214403.2961165/1‑150 (MQ=54)
TATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCC > SRR13214403.2961469/1‑150 (MQ=54)
TATCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAAACAATCTCATATCC > SRR13214403.4286560/1‑150 (MQ=37)
TCTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCAT > SRR13214403.3481851/1‑150 (MQ=59)
CTTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATT < SRR13214403.3393368/150‑1 (MQ=60)
TTCTCAATCAGTCTTTTTCAAATCAGCTACAAATCAAAGTTAAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTG < SRR13214403.2820248/150‑1 (MQ=60)
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tcaatcagtctttttcaaatcagctacaaatcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaac < SRR13214403.3330187/111‑5 (MQ=60)
caatcagtctttttcaaatcagctacaaatcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaaca > SRR13214403.1512055/39‑145 (MQ=60)
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tcagtctttttcaaatcagctacaaatcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTGAACAAAT < SRR13214403.2296066/115‑1 (MQ=60)
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ctttttcaaatcagctacaaatcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataa > SRR13214403.2419156/31‑137 (MQ=60)
ctttttcaaatcagctacaaatcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataa < SRR13214403.2523608/120‑14 (MQ=60)
ctttttcaaatcagctacaaatcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataa < SRR13214403.4512493/120‑14 (MQ=60)
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tcaaatcagctacaaatcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataaatatt < SRR13214403.1498960/125‑19 (MQ=60)
aaatcagctacaaatcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataaatatttc > SRR13214403.2821472/24‑130 (MQ=60)
natcagctacaaatcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataaatatttcc > SRR13214403.1934588/23‑129 (MQ=60)
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ctacaaatcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataaatatttcctaaata > SRR13214403.89907/17‑123 (MQ=60)
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atcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataaatatttcctaaataaaaagg < SRR13214403.4421531/140‑34 (MQ=60)
tcaaagttaAATATCAATCAAAAGATAAATTAAATGAAGTCTATGGTTTTGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTgaacaaattataaatatttcctaaataaaaaggg > SRR13214403.546205/10‑116 (MQ=60)
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TGGGGAATTAACTGAAGCCCAAAATACTTTTGAAAAAGAAAAAAAAGAAGATAAGATAATTCAAGCATTACCACATCATCTCGTGCTTCATCTTCTTAACCAGTCCTTTTCTAATCAGGTGCAAATTAAAATTCAATATCAAGCCAAAGATAAATTAACTGAAGTCTATGGTAATGTATCAGAATTTATCAATAATCAAGTAAGAGTTAAATCAACGGATAAAATCTATCTCATATCCATTAAGCAAATCGTAAATATATCATAAAAAAAGCTATCCTTGTTGTATATT > CP043523/1885861‑1886149
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
