Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
26 |
102.0 |
3326124 |
78.0% |
2594376 |
98.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP002094 |
444,791 |
(T)8→9 |
intergenic (+275/‑718) |
LLNZ_02320 → / → glmM |
hypothetical protein/phosphoglucosamine mutase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP002094 | 444,783 | 1 | . | T | 100.0%
| 260.7
/ NA
| 65 | intergenic (+267/‑726) | LLNZ_02320/glmM | hypothetical protein/phosphoglucosamine mutase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base T (38/27); total (38/27) |
TAAATACTTTGTCAGTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAA‑TTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGACGGCA > CP002094/444685‑444873
|
taaataCTTTGTCAGTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGaaa < 1:1039707/99‑1 (MQ=255)
ataCTTTGTCAGTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAA‑ttt < 2:47854/99‑1 (MQ=255)
ataCTTTGTCAGTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAA‑ttt > 2:894755/1‑99 (MQ=255)
taCTTTGTCAGTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAA‑tttt > 2:1172918/1‑99 (MQ=255)
aCTTTGTCAGTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAA‑ttttt < 2:1636966/99‑1 (MQ=255)
cTTTGTCAGTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAA‑tttttt > 2:713172/1‑99 (MQ=255)
tttGTCAGTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAA‑ttttttt < 1:1034291/99‑1 (MQ=255)
tGTCAGTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAA‑ttttttttt < 1:1041623/99‑2 (MQ=255)
cAGTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAA‑tttttttttaag > 2:1348617/1‑95 (MQ=255)
cAGTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAA‑tttttttttaag < 1:401453/99‑5 (MQ=255)
gTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAgtg < 1:797475/99‑1 (MQ=255)
gTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAgtg < 2:1627444/99‑1 (MQ=255)
ggTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGtt < 2:1540582/99‑1 (MQ=255)
ggTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGtt < 2:6789/99‑1 (MQ=255)
gTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTg < 2:487667/99‑1 (MQ=255)
gTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGCATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTg > 2:1254273/1‑99 (MQ=255)
ttATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGa > 2:328172/1‑99 (MQ=255)
tataACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGAt > 1:1055463/1‑99 (MQ=255)
ataACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGAtt < 1:1397899/99‑1 (MQ=255)
cagcagTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAAc < 2:1123364/99‑1 (MQ=255)
agcagTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACt > 1:176205/1‑99 (MQ=255)
gcagTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTa > 1:683652/1‑99 (MQ=255)
cagTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTaa > 2:828957/1‑99 (MQ=255)
agTGTAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGTCTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTaaa < 1:199329/99‑1 (MQ=255)
tGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAAtt > 2:1007375/1‑99 (MQ=255)
aaCAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGaa > 1:1447017/1‑99 (MQ=255)
aGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAAc < 2:1447017/99‑1 (MQ=255)
gTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACt < 1:836814/99‑1 (MQ=255)
gTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACt > 2:334506/1‑99 (MQ=255)
cATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGt < 2:1438617/99‑1 (MQ=255)
tttATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTaa > 1:1273967/1‑99 (MQ=255)
tATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAAt < 2:1340163/99‑1 (MQ=255)
aTCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAAtt > 2:667117/1‑99 (MQ=255)
tCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAAttt > 2:714805/1‑99 (MQ=255)
atatAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGt > 2:1396134/1‑99 (MQ=255)
tataATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAAc > 2:1143989/1‑83 (MQ=255)
tataATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAAc < 1:1143989/83‑1 (MQ=255)
ataATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTc < 2:421352/99‑1 (MQ=255)
aTCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCaa < 2:825031/99‑1 (MQ=255)
aTCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCaa > 2:384434/1‑99 (MQ=255)
aTCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCaa > 1:1088230/1‑99 (MQ=255)
aTCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCaa < 1:76370/99‑1 (MQ=255)
cGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATc < 1:557811/99‑1 (MQ=255)
cGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATc < 2:492103/99‑1 (MQ=255)
aCTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAg > 2:9501/1‑99 (MQ=255)
aCTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAg > 1:1190041/1‑99 (MQ=255)
cTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGa > 1:130518/1‑99 (MQ=255)
cTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGa > 1:1617420/1‑99 (MQ=255)
tttCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGaa < 2:803070/99‑1 (MQ=255)
tttCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGaa < 2:668049/99‑1 (MQ=255)
ttCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAAt > 2:415959/1‑99 (MQ=255)
ttCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAAt > 1:948062/1‑99 (MQ=255)
tCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAAtt < 2:22940/99‑1 (MQ=255)
aaTTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGa < 2:1079899/99‑1 (MQ=255)
aTTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGaa < 1:781066/99‑1 (MQ=255)
tACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGaaca > 2:1164939/1‑99 (MQ=255)
aCCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGaacaa > 2:1108575/1‑99 (MQ=255)
ccAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGaacaac < 2:855208/99‑1 (MQ=255)
cAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACt > 2:1467530/1‑99 (MQ=255)
aTGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTc > 1:1564780/1‑99 (MQ=255)
tGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTcc > 2:146917/1‑99 (MQ=255)
aagaaAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAg > 2:100702/1‑99 (MQ=255)
aagaaAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAg > 2:84981/1‑99 (MQ=255)
gaaAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGt < 1:1348617/99‑1 (MQ=255)
aaaCTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTgg < 2:1005215/99‑1 (MQ=255)
aaCTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTggg > 1:1082682/1‑99 (MQ=255)
cTCAGATGCTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGt > 1:515555/1‑99 (MQ=255)
cAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGa < 2:1656395/99‑1 (MQ=255)
cAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGa > 2:1159764/1‑99 (MQ=255)
cAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGa > 2:1502940/1‑99 (MQ=255)
aGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGAc > 1:9894/1‑99 (MQ=255)
gATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGACg > 2:1619625/1‑99 (MQ=255)
tACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGAAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAAAAACTTCCAGGTGGGGTGACGGc > 2:811240/1‑99 (MQ=255)
aCTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGACGGca > 1:585878/1‑99 (MQ=255)
aCTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGACGGca > 1:305467/1‑99 (MQ=255)
|
TAAATACTTTGTCAGTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAA‑TTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGACGGCA > CP002094/444685‑444873
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTTGTCAGTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAA‑TTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGACGGCAACAATTGAGCCTAAAAC > CP002094/444692‑444890
|
TTTGTCAGTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAA‑TTTTTTTT < SRR7892090.1041520/100‑1 (MQ=60)
TGTCAGTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAA‑TTTTTTTTTA < SRR7892090.1048875/100‑1 (MQ=60)
CAGTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGT < SRR7892090.405376/100‑1 (MQ=60)
GTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGT < SRR7892090.803848/100‑1 (MQ=60)
TTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGAT > SRR7892090.1062769/1‑100 (MQ=60)
ATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTT < SRR7892090.1405991/100‑1 (MQ=60)
CAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACT > SRR7892090.177790/1‑100 (MQ=60)
AGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTA > SRR7892090.689447/1‑100 (MQ=60)
AGTGTAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGTCTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAAT < SRR7892090.201167/100‑1 (MQ=60)
CAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAA > SRR7892090.1455512/1‑100 (MQ=60)
gtgctcttccgatctATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACT < SRR7892090.1151526/85‑1 (MQ=60)
tggtacaTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTG < SRR7892090.1364598/93‑1 (MQ=60)
GTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTG < SRR7892090.843373/100‑1 (MQ=60)
ATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAA > SRR7892090.1281823/1‑100 (MQ=60)
tataatctttttttaaatatccaaagaAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGT < SRR7892090.925451/73‑1 (MQ=60)
AATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAA > SRR7892090.1095642/1‑100 (MQ=60)
ATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAAT < SRR7892090.77041/100‑1 (MQ=60)
ATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAA‑TTTTTTTTgaagtgtttttttttttaaaatataaaaaaaaaaaaaattttttttttt > SRR7892090.1666973/1‑51 (MQ=60)
CGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCA < SRR7892090.562850/100‑1 (MQ=60)
GACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAG > SRR7892090.1197717/1‑100 (MQ=60)
ACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGA > SRR7892090.1627612/1‑100 (MQ=60)
ACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGA > SRR7892090.131682/1‑100 (MQ=60)
TTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAAT > SRR7892090.955042/1‑100 (MQ=60)
ATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAAC < SRR7892090.787258/100‑1 (MQ=60)
AATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTC > SRR7892090.1574442/1‑100 (MQ=60)
GAAAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTG < SRR7892090.1356633/100‑1 (MQ=60)
AAACTCAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGG > SRR7892090.1090075/1‑100 (MQ=60)
ACTCAGATGCTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGT > SRR7892090.520231/1‑100 (MQ=60)
CAGATACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGAC > SRR7892090.10003/1‑100 (MQ=60)
TACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGACGGCA > SRR7892090.591111/1‑100 (MQ=60)
TACTAGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGACGGCA > SRR7892090.308413/1‑100 (MQ=60)
AGAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGACGGCAACAA > SRR7892090.1435617/1‑100 (MQ=60)
GAAATTTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGACGGCAACAAT < SRR7892090.503688/100‑1 (MQ=60)
AAT‑TTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGACGGCAACAATTG > SRR7892090.278505/1‑100 (MQ=60)
AAT‑TTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGACGGCAACAATTG > SRR7892090.170928/1‑100 (MQ=60)
TTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGACGGCAACAATTGAGCC > SRR7892090.1157804/1‑100 (MQ=60)
TTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGACGGCAACAATTGAGCCT < SRR7892090.1334451/100‑1 (MQ=60)
TTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGACGGCAACAATTGAGCCTAAA > SRR7892090.376367/1‑100 (MQ=60)
TAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGACGGCAACAATTGAGCCTAAAAC > SRR7892090.1597813/1‑100 (MQ=60)
|
TTTGTCAGTGGTTATAACAGCAGTGCAACAGTTCATTTATCAGGATATAATCGACTTTCAATTACCAATGAAGAAAACTCAGATACTAGAAA‑TTTTTTTTAAGTGTTGATTTAACTAAATTGAAAACTGGTAAATTTGATGTTCCAATCAGAATTGAACAACTTCCAGGTGGGGTGACGGCAACAATTGAGCCTAAAAC > CP002094/444692‑444890
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
