Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
775 |
327.3 |
10718052 |
97.2% |
10417946 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,649,037 |
T→C |
*771* (TAA→TAG) |
pbpC ← |
peptidoglycan glycosyltransferase PbpC |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,649,037 | 0 | T | C | 100.0%
| 552.8
/ NA
| 164 | *771* (TAA→TAG) | pbpC | peptidoglycan glycosyltransferase PbpC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (108/56); total (108/56) |
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
TAAATTGTTCTGTTGTTGTCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGATTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCAC > NZ_CP025268/2648900‑2649172
|
tAAATTGTTCTGTTGTTGTCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGacta > 2:3859254/1‑140 (MQ=255)
ttCTGTTGTTGTCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATg > 2:5190376/1‑140 (MQ=255)
tCTGTTGTTGTCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGa > 2:611305/1‑140 (MQ=255)
tCTGTTGTTGTCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGa > 2:2059081/1‑140 (MQ=255)
tCTGTTGTTGTCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGa > 1:2459371/1‑140 (MQ=255)
tCTGTTGTTGTCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGa > 2:4871434/1‑140 (MQ=255)
tCTGTTGTTGTCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTCTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGa > 1:2459457/1‑140 (MQ=255)
ttgttgtCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACaaa < 1:913431/140‑1 (MQ=255)
ttgttgtCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACaaa > 2:3550932/1‑140 (MQ=255)
ttgttgtCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACaaa > 2:3550922/1‑140 (MQ=255)
gtCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAACTAAAATGAGTTTTAGCCACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCa > 1:2333779/1‑140 (MQ=255)
gtCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGGTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTACATGACAAATTTCa > 2:56939/1‑140 (MQ=255)
tACCAGCGTACGAGATGGCGCGGGTTATAATGAGGAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTGGTAAAATAAAATGAGGTTTAGCAACAATCAGGGACGAAACAGACTATTGCATGACAAAGGACACTGTc > 2:1762585/1‑140 (MQ=255)
tACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTc < 2:318131/140‑1 (MQ=255)
tACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTc > 1:2238628/1‑140 (MQ=255)
tACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTc > 1:1779632/1‑140 (MQ=255)
tACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTc > 2:1682307/1‑140 (MQ=255)
gCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATGTCACTGTCGCGAt > 2:239663/1‑140 (MQ=255)
ccGTACGAGATGGCGCGGATTATAATTAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGAt < 2:5123088/139‑1 (MQ=255)
cGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATTAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGAtt > 1:3084450/1‑140 (MQ=255)
cGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGAtt > 1:3103556/1‑140 (MQ=255)
cGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGAtt > 1:4680642/1‑140 (MQ=255)
cGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGAtt > 1:4369622/1‑140 (MQ=255)
cGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTAACTGTCGCGAtt > 2:1557313/1‑140 (MQ=255)
cGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATCGCATGACAAATTTCACTGTCGCGAtt > 2:1950504/1‑140 (MQ=255)
tACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTg > 1:831807/1‑140 (MQ=255)
tACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTg > 1:1957482/1‑140 (MQ=255)
tACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTg > 1:831808/1‑140 (MQ=255)
cGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGcc > 1:3714161/1‑140 (MQ=255)
cGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGcc > 1:2619057/1‑140 (MQ=255)
cGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGcc > 1:1197737/1‑140 (MQ=255)
cGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGcc > 1:138814/1‑140 (MQ=255)
cGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGcc > 2:2715043/1‑140 (MQ=255)
cGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGc > 1:5157404/1‑139 (MQ=255)
gagaTGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCCGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGccc < 2:1402114/140‑1 (MQ=255)
cagaTGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGccc < 1:4730089/139‑1 (MQ=255)
tGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACg < 2:5263435/140‑1 (MQ=255)
ggCGCGGATTATAATGAGCAACCGGGCCGTTGACTAGTTATGCCGGTAACATTTTTTTAAAATACAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATAACAAATTTCACTTTCGCGATTTGCCGCACGt > 2:4701465/1‑140 (MQ=255)
ggCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGt > 2:1383624/1‑140 (MQ=255)
ggCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGt > 1:4678064/1‑140 (MQ=255)
ggCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGt > 1:1690607/1‑140 (MQ=255)
ggCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGt > 1:1690712/1‑140 (MQ=255)
ggCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCACACgg > 2:1083374/1‑139 (MQ=255)
cgcgGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCATTGTCGCGATTTGCCCCACGTca > 1:3858104/1‑140 (MQ=255)
cgcgGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTca > 1:2035325/1‑140 (MQ=255)
aTGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAg < 1:3550932/140‑1 (MQ=255)
gCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAGATGAGGTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATTCATCACCAGCAAt > 2:1136785/1‑140 (MQ=255)
gCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAAt < 2:2823969/140‑1 (MQ=255)
gCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAAt > 2:3732706/1‑140 (MQ=255)
gCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAAt > 2:156164/1‑140 (MQ=255)
aaCAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTg < 1:2175871/140‑1 (MQ=255)
cAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGAt > 1:4220035/1‑140 (MQ=255)
cAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGAt > 1:284993/1‑140 (MQ=255)
gggCCGTTGGCTATTGATGAAGGTAACAGGGTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACGATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATaa < 2:3662578/140‑1 (MQ=255)
gggCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATaa < 2:544412/140‑1 (MQ=255)
gggCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATaa < 2:1713299/140‑1 (MQ=255)
ggCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAAt < 1:611305/140‑1 (MQ=255)
ggCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAAt < 1:3277081/140‑1 (MQ=255)
gCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTGGCGATTTGCCCCAAGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATc > 2:4253980/1‑140 (MQ=255)
gCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATc < 1:3418064/140‑1 (MQ=255)
ttGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCAGCAGCAATTGATAATCACCt > 1:1338199/1‑140 (MQ=255)
ttGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCt > 1:282539/1‑140 (MQ=255)
ttGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCt > 2:1541618/1‑140 (MQ=255)
ttGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCt > 2:5029109/1‑140 (MQ=255)
gACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCttt > 1:3373655/1‑140 (MQ=255)
gACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCttt > 1:3883919/1‑140 (MQ=255)
cTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTAt < 1:4852739/140‑1 (MQ=255)
ttGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCg > 2:4008791/1‑140 (MQ=255)
tgatgaAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCTACGTCATCCATCCCCATCAATTGATAATCACCTTTATCCGt > 2:78227/1‑140 (MQ=255)
gatgaAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGCGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTc < 1:3984085/140‑1 (MQ=255)
aGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATg < 1:2083374/140‑1 (MQ=255)
aGGTAACATTTTCTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATg < 2:3766215/140‑1 (MQ=255)
ggTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAATAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACATCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTAATCCGTCAAATGc > 2:4623541/1‑140 (MQ=255)
ggTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACCAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGc > 2:2953674/1‑140 (MQ=255)
ggTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAGCAGACTATTGCATGACAAATTTCAATGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGc > 2:1035878/1‑140 (MQ=255)
ggTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGc > 2:280107/1‑140 (MQ=255)
ggTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGc > 2:3092326/1‑140 (MQ=255)
ggTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGc > 1:2714295/1‑140 (MQ=255)
gTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCa < 1:4410009/140‑1 (MQ=255)
gTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCa < 2:2127881/140‑1 (MQ=255)
gTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCa < 2:1356240/140‑1 (MQ=255)
cATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGt > 2:3938294/1‑140 (MQ=255)
cATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGt < 1:2128313/140‑1 (MQ=255)
ttttAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGt > 1:1561286/1‑140 (MQ=255)
ttttAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGt > 2:1694389/1‑140 (MQ=255)
tttAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGtt > 1:327014/1‑140 (MQ=255)
aatGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCACATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGt < 2:4788506/140‑1 (MQ=255)
aatGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGt < 2:2456506/140‑1 (MQ=255)
aatGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGt < 2:2651116/140‑1 (MQ=255)
aatGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGt < 2:2650162/140‑1 (MQ=255)
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CTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGC < SRR14920189.4865013/151‑1 (MQ=60)
GATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGT < SRR14920189.2063869/151‑1 (MQ=60)
GATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACACACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGT < SRR14920189.2682160/151‑1 (MQ=60)
GATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGCGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGT < SRR14920189.3993920/151‑1 (MQ=60)
AGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGT > SRR14920189.1564840/1‑151 (MQ=60)
AGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGT < SRR14920189.2088202/151‑1 (MQ=60)
GGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTT > SRR14920189.327894/1‑151 (MQ=60)
GTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTG < SRR14920189.4420846/151‑1 (MQ=60)
CATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCC < SRR14920189.4987574/151‑1 (MQ=60)
CATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCC < SRR14920189.2133255/151‑1 (MQ=60)
AATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTT > SRR14920189.3698952/1‑151 (MQ=60)
AATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTT > SRR14920189.3699497/1‑151 (MQ=60)
ATGAGTTTTAGCAAAAATCAGGGACACAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTTTCGCGCTTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCCATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGT < SRR14920189.5249995/151‑1 (MQ=60)
GAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTC > SRR14920189.19476/1‑151 (MQ=60)
AGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTC < SRR14920189.1463375/151‑1 (MQ=60)
AGCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTC < SRR14920189.4135219/151‑1 (MQ=60)
GCAACAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCA > SRR14920189.4878230/1‑151 (MQ=60)
CAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAA > SRR14920189.5140452/1‑151 (MQ=60)
CAATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAAGGCAGGGTCACGTTTCGCCCGCGTTCAGTTAACGTTTCGCCATTCAGAAA > SRR14920189.2065583/1‑151 (MQ=60)
ATCAGGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACC > SRR14920189.3420803/1‑151 (MQ=60)
GGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCA > SRR14920189.2571158/1‑151 (MQ=60)
GGGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCA > SRR14920189.5011595/1‑151 (MQ=60)
GGACAAAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCAG < SRR14920189.2138734/151‑1 (MQ=60)
AAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCAGCGTTC > SRR14920189.2734554/1‑151 (MQ=60)
AAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCAGCGTTC > SRR14920189.1100446/1‑151 (MQ=60)
AAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCAGCGTTC > SRR14920189.133736/1‑151 (MQ=60)
AAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCAGCGTTC > SRR14920189.2033906/1‑151 (MQ=60)
AAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCAGCGTTC > SRR14920189.2033957/1‑151 (MQ=60)
AAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCAGCGTTC > SRR14920189.2033994/1‑151 (MQ=60)
AAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCACCATTCAGAAACCACCAGCGTTC > SRR14920189.585145/1‑151 (MQ=60)
AAACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCACCATTCAGAAACCACCAGCGTTC > SRR14920189.585323/1‑151 (MQ=60)
ACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCAGCGTTCAC > SRR14920189.2377536/1‑151 (MQ=60)
ACAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCAGCGTTCAC > SRR14920189.4164608/1‑151 (MQ=60)
CAGACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCAGCGTTCACC < SRR14920189.1842826/151‑1 (MQ=60)
GACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCAGCGTTCACCTG > SRR14920189.1975302/1‑151 (MQ=60)
GACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCAGCGTTCACCTG > SRR14920189.4996256/1‑151 (MQ=60)
GACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCAGCGTTCACCTG > SRR14920189.2644768/1‑151 (MQ=60)
GACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCAGCGTTCACCTG > SRR14920189.3801170/1‑151 (MQ=60)
GACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCAGCGTTCACCTG > SRR14920189.400495/1‑151 (MQ=60)
GACTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCAGCGTTCACCTG > SRR14920189.4290164/1‑151 (MQ=60)
CTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCAGCGTTCACCTGCC < SRR14920189.240316/151‑1 (MQ=60)
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ATTTTTACCTCTGTAAATTGTTCTGTTGTTGTCTGTACCAGCGTACGAGATGGCGCGGATTATAATGAGCAACAGGGCCGTTGACTATTGATGAAGGTAACATTTTTTTAAAATAAAATGAGTTTTAGCAACAATCAGGGACAAAACAGATTATTGCATGACAAATTTCACTGTCGCGATTTGCCCCACGTCATCCATCACCAGCAATTGATAATCACCTTTATCCGTCAAATGCAGGGTCACGTTGCGCCCGCGTTCAGTTAACGGTTCGCCATTCAGAAACCACCAGCGTTCACCTGCC > NZ_CP025268/2648887‑2649187
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |