Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
775 |
327.3 |
10718052 |
97.2% |
10417946 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,309,691 |
A→G |
intergenic (‑82/+26) |
nlpI ← / ← pnp |
lipoprotein NlpI/polyribonucleotide nucleotidyltransferase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,309,691 | 0 | A | G | 92.5%
| 1068.8
/ 49.9
| 346 | intergenic (‑82/+26) | nlpI/pnp | lipoprotein NlpI/polyribonucleotide nucleotidyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (148/172); minor base C (13/13); total (161/185) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.39e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.48e-01 |
Only 100 of 346 total aligned reads displayed.
CAAGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAG‑CC‑C‑CCA‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCAGAAC > NZ_CP025268/3309561‑3309827
|
cAAGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAG‑CC‑C‑CCCGCCGCAGCg > 2:2203972/1‑140 (MQ=255)
cAAGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCATCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCg > 1:733981/1‑140 (MQ=255)
gCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGAGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAg > 1:5272682/1‑140 (MQ=255)
gCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCAGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAg > 2:5315341/1‑140 (MQ=255)
cGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAgg > 2:1111337/1‑140 (MQ=255)
tAAGTGCTGTCGCAACGAAACATCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTTCCGAAGACCACGGGTGAATGAACGGCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCGCGGTTAAATGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCggggggg > 1:2606203/1‑139 (MQ=255)
tAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGc < 2:5202821/140‑1 (MQ=255)
tAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGc < 2:5154467/140‑1 (MQ=255)
aGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAGAACGGCTGCAGTTGCTACTTTCGAAGACAACGGGTGAATAAACGTCCTGCTACAGCGGAGTAACACGGCGCCCGGTCCGGTAAGAAG‑CCGC‑CCG‑CCGCAACTGAGGTCaa > 2:3986307/1‑140 (MQ=255)
aGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCaa > 2:1215641/1‑140 (MQ=255)
aGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCaa > 2:2295778/1‑140 (MQ=255)
tGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCATGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGc > 1:4302301/1‑140 (MQ=255)
tGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGc > 1:2120028/1‑140 (MQ=255)
tGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGc > 1:2305420/1‑140 (MQ=255)
tGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGc > 2:2366057/1‑140 (MQ=255)
tCGCAAAGAAACAACAGGGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCaa < 2:2030878/140‑1 (MQ=255)
cGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAAc < 1:1760901/140‑1 (MQ=255)
cGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAAc < 1:2508462/140‑1 (MQ=255)
cGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAAc < 1:4844539/140‑1 (MQ=255)
cGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAAc < 1:4865453/140‑1 (MQ=255)
cGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAAc < 2:2828248/140‑1 (MQ=255)
cGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAG‑CC‑C‑CCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAAc < 1:3045039/140‑1 (MQ=255)
aCGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTa > 1:594144/1‑140 (MQ=255)
aCGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTa > 1:5211989/1‑140 (MQ=255)
cGAAACACCAGCGCAAACAAGGCTTCATTTCCCACACCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTAc < 2:1538251/140‑1 (MQ=255)
aaCACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCg < 1:3857934/140‑1 (MQ=255)
cacCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGcc < 2:344195/140‑1 (MQ=255)
cacCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGcc < 1:1631236/140‑1 (MQ=255)
aGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTGGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGt < 2:3799092/140‑1 (MQ=255)
gcgcAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAGGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGtt > 2:2907465/1‑140 (MQ=255)
cgcAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTc > 1:2981485/1‑140 (MQ=255)
gcAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTca < 1:1997556/140‑1 (MQ=255)
cAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTcag > 1:4477733/1‑140 (MQ=255)
gCTTCCTTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGa < 2:4671349/140‑1 (MQ=255)
gCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAG‑CC‑C‑CCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGa < 1:4223481/140‑1 (MQ=255)
aTTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTc < 2:2114601/140‑1 (MQ=255)
ttCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCATCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCg < 1:281274/140‑1 (MQ=255)
tCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCgg < 2:625814/140‑1 (MQ=255)
ccACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAACGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGCGCTTCCGGtg < 1:1787941/140‑1 (MQ=255)
aCTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGtgct < 2:76333/140‑1 (MQ=255)
aCTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGtgct > 1:858625/1‑140 (MQ=255)
ccGAAGGCCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTgcag < 2:4925300/140‑1 (MQ=255)
ccGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTgcag < 1:1149492/140‑1 (MQ=255)
ccGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTgcag < 1:743805/140‑1 (MQ=255)
ccGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTgcag < 1:1439836/140‑1 (MQ=255)
ccGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCACGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCACCCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTgcag < 1:3177595/140‑1 (MQ=255)
ccGAAGACCACGGTTGAATGAACGACCTGTACCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTgcag < 2:1022849/140‑1 (MQ=255)
aaGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAG‑CC‑C‑CCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGcagcag > 1:3571906/1‑140 (MQ=255)
cACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTAc < 2:3310195/95‑1 (MQ=255)
cACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTga > 1:922505/1‑140 (MQ=255)
cACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCAGGTGCTGCAGCAGGTTga > 2:2769639/1‑140 (MQ=255)
cACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCACTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTga > 2:4555741/1‑140 (MQ=255)
cACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAG‑CC‑C‑CCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTGAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTga > 2:4354677/1‑140 (MQ=255)
cACGGTTGAATGAACGTCCTGGTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAG‑CC‑C‑CCCGCCGCAGCGGCGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTga > 2:4040699/1‑140 (MQ=255)
cGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACGAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTgaga > 2:3263309/1‑140 (MQ=255)
gaatgaaCGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCt < 1:3607180/140‑1 (MQ=255)
aaggaaCGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTc > 1:3763387/4‑140 (MQ=255)
gaaCGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGt < 2:1482847/140‑1 (MQ=255)
gaaCGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGt < 2:390066/140‑1 (MQ=255)
gaaCGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGt < 2:3564575/140‑1 (MQ=255)
gaaCGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGt < 2:2120028/140‑1 (MQ=255)
gaaCGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGt < 1:1845158/140‑1 (MQ=255)
cGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGc < 2:1788993/140‑1 (MQ=255)
cGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGc > 1:343528/1‑140 (MQ=255)
cGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGc > 1:4942584/1‑140 (MQ=255)
cGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGc < 1:2933326/140‑1 (MQ=255)
gTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTTAGTCggt > 2:4800021/1‑138 (MQ=255)
tCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGctt < 1:661877/140‑1 (MQ=255)
tCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCAGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGCAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGTAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCCCTGTCGctt < 2:4242464/140‑1 (MQ=255)
tGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGcttctt < 2:2736164/140‑1 (MQ=255)
gTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCttt < 1:962982/140‑1 (MQ=255)
ttCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTa < 2:825029/140‑1 (MQ=255)
cccGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAG‑CC‑C‑CCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAAt > 1:338078/1‑140 (MQ=255)
ggTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAACGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCt < 2:4859194/140‑1 (MQ=255)
gTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTc > 2:4738230/1‑140 (MQ=255)
gCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGa < 1:4577314/140‑1 (MQ=255)
cTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGAc > 1:4043359/1‑140 (MQ=255)
cTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGAc > 1:1401550/1‑140 (MQ=255)
cTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGAc > 2:1927206/1‑140 (MQ=255)
cTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAGCCC‑C‑CCG‑CCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTGAATGCTCAGAc > 1:2884644/1‑140 (MQ=255)
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cTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAG‑CC‑C‑CCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGAc > 1:5019339/1‑140 (MQ=255)
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CACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTT‑AAAAGCCCCCC‑‑GCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAG < SRR14920189.1634951/151‑1 (MQ=60)
CACCAGCGCAAAAAAGACTTCATTTCCCACCCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCCGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAAAC‑CCCCC‑‑GCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAG < SRR14920189.2958705/151‑1 (MQ=60)
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AGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTT‑AAAAGCCCCCC‑‑GCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGG < SRR14920189.1427202/151‑1 (MQ=60)
GCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTT‑AAAAGCCCCCC‑‑GCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGA > SRR14920189.2009776/1‑151 (MQ=60)
GCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTT‑AAAAGCCCCCC‑‑GCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGC < SRR14920189.2002157/151‑1 (MQ=60)
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CATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTT‑AAAAGCCCCCC‑‑GCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCA > SRR14920189.3416212/1‑151 (MQ=60)
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TGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTT‑AAAAGCCCCCC‑‑GCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGC < SRR14920189.3029590/151‑1 (MQ=60)
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CTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTT‑AAAAGCCCCCC‑‑GCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCC > SRR14920189.3529936/1‑151 (MQ=60)
CTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTT‑AAAAGCCCCCC‑‑GCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCC > SRR14920189.2250967/1‑151 (MQ=60)
CTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTT‑AAAAGCCCCCC‑‑GCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGATGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCC > SRR14920189.2862973/1‑151 (MQ=60)
gaacagggcgagtaaggttgccatttgcCCCCC‑‑GCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCT > SRR14920189.1632869/29‑151 (MQ=60)
AACAAGGCGTCCTGCCCGGTT‑AAAAGCCCCCC‑‑GCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTG > SRR14920189.1530525/1‑151 (MQ=60)
AACAAGGCGTCCTGCCCGGTT‑AAAAGCCCCCC‑‑GCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTG > SRR14920189.2628528/1‑151 (MQ=60)
ACAAGGCGTCCTGCCCGGTT‑AAAAGCCCCCC‑‑GCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGG < SRR14920189.3951736/151‑1 (MQ=60)
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T‑AAAAGCCCCCC‑‑GCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTGCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCAGAACTT > SRR14920189.3178769/1‑151 (MQ=60)
AAAGCCCCCC‑‑GCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCAGAACTTTC > SRR14920189.95761/1‑151 (MQ=60)
gcCCCCC‑‑GCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCAGAACTTTCACC > SRR14920189.5293326/3‑151 (MQ=60)
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ACTACATCCTGCAAGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTT‑AAAAG‑CCCCC‑‑ACCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCAGAACTTTCACC > NZ_CP025268/3309550‑3309834
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |