Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R7
|
781 |
589.5 |
21734725 |
98.3% |
21365234 |
134.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
169,476 |
G→A |
C721Y (TGC→TAC) |
fhuA → |
ferrichrome porin FhuA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 169,476 | 0 | G | A | 99.5%
| 2240.1
/ NA
| 582 | C721Y (TGC→TAC) | fhuA | ferrichrome porin FhuA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (326/251); minor base T (0/3); total (328/254) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.34e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 583 total aligned reads displayed.
TTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGC > NZ_CP025268/169339‑169612
|
ttATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACg < 1:10357293/140‑1 (MQ=255)
tGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCg > 1:6430026/1‑140 (MQ=255)
aTCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAgc < 2:6072949/140‑1 (MQ=255)
aTCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAgc > 1:7537711/1‑140 (MQ=255)
aTCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAgc < 1:1279712/140‑1 (MQ=255)
aTCCGGCTAACTCCATTAAAGTGTGAAGTTATACTGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGATGGCTCCAACGTGGAGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAgc < 2:4222602/140‑1 (MQ=255)
tCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAgct > 1:785145/1‑140 (MQ=255)
ccGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAgctg > 1:1388935/1‑140 (MQ=255)
ccGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAgctg > 2:9374880/1‑140 (MQ=255)
ccGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAgctg > 2:3429104/1‑140 (MQ=255)
gCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCtt > 2:5126455/1‑140 (MQ=255)
tAAAGTGGGAAGGTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAGTACGTCGCCAGCTGGTTTTACACtgtgg > 2:10580980/1‑136 (MQ=255)
aaGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGgc < 2:6624486/140‑1 (MQ=255)
aaGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGgc < 2:1784768/140‑1 (MQ=255)
aaGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGgc < 2:2339706/140‑1 (MQ=255)
aaGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGgc < 1:971107/140‑1 (MQ=255)
aaGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGgc < 1:7024399/140‑1 (MQ=255)
aaGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGgc < 2:7819973/140‑1 (MQ=255)
tGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGgctgc > 1:20125/1‑140 (MQ=255)
tGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGgctgc > 1:8931222/1‑140 (MQ=255)
ggAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCtt > 2:10402435/1‑140 (MQ=255)
ggAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCtt > 1:9004520/1‑140 (MQ=255)
ggAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCtt < 2:8380098/140‑1 (MQ=255)
ggAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCtt > 1:1814801/1‑140 (MQ=255)
gAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTc < 2:2511142/140‑1 (MQ=255)
aGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTg < 2:5515313/140‑1 (MQ=255)
aGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTCGCGCGACTCGGCATGGCTGGCTCCACCGAGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGCTCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTg < 2:1625048/140‑1 (MQ=255)
tataCGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTgggg < 2:4747448/140‑1 (MQ=255)
ataCGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGgc > 2:3723195/1‑140 (MQ=255)
taCGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGgcg > 1:2146379/1‑140 (MQ=255)
cGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCa < 1:4637327/140‑1 (MQ=255)
ggTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAg < 1:2270161/140‑1 (MQ=255)
ggTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAg < 2:9884128/140‑1 (MQ=255)
tCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGaa > 1:4854966/1‑140 (MQ=255)
tCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGaa < 1:5845317/140‑1 (MQ=255)
gTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTTGTCGAGCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTATCACTGATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACg > 2:885938/1‑140 (MQ=255)
gTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACg < 2:7579335/140‑1 (MQ=255)
gTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACg > 2:3951863/1‑140 (MQ=255)
gTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACg > 1:8135334/1‑140 (MQ=255)
gTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACg > 1:4415205/1‑140 (MQ=255)
gTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTACAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACg > 1:3527055/1‑140 (MQ=255)
gTGGATGCGTTAGTACGGTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCAGGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACGTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACg > 2:3079948/1‑140 (MQ=255)
tGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGt > 2:8473632/1‑140 (MQ=255)
tGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGt > 2:10154733/1‑140 (MQ=255)
gTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCg > 1:6884622/1‑140 (MQ=255)
gTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCGGGGGCGCTGAACGTCAGGTCg > 2:9658960/1‑140 (MQ=255)
gTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAAAAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGACAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCg > 2:2752675/1‑140 (MQ=255)
tATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTgcaaccgc > 1:157885/1‑140 (MQ=255)
tATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTgcaaccgc > 1:5666424/1‑140 (MQ=255)
tATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTgcaaccgc > 1:5431899/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACCCTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCt > 1:8473080/1‑140 (MQ=255)
cTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCtt < 2:8971301/140‑1 (MQ=255)
gcgcGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCg > 1:7210218/1‑140 (MQ=255)
gcgcGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCg > 1:2434513/1‑140 (MQ=255)
gcgcGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCg > 2:6494291/1‑140 (MQ=255)
gcgcGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCg > 1:9200010/1‑140 (MQ=255)
cgcgAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGGTGCAACCGCAACCTTCCGt > 2:7124124/1‑140 (MQ=255)
gCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAAttt < 1:3305780/140‑1 (MQ=255)
ggctCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTg < 2:635920/140‑1 (MQ=255)
ctCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTggg < 1:10781112/140‑1 (MQ=255)
ctCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTGTCTAATTTCTCTTTTggg > 1:3189497/1‑140 (MQ=255)
aaCGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCAc < 1:4981202/140‑1 (MQ=255)
aaCGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCAc > 1:10008456/1‑140 (MQ=255)
aCGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACg > 2:6753104/1‑140 (MQ=255)
cGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGAGCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCTGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGGTTCTCGTTTCGCGTTTGGGGCACgg > 2:4366935/1‑140 (MQ=255)
gTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACGTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATGTCTCTTTTGGGGCACggt > 2:4943406/1‑139 (MQ=255)
gcgcTGCATGTTAACAACCAGTTCGATCGTGAATAAGTCCCCAGCTGCTTTAAAAAAAATTGCAGCTTCTGGGGCGCATAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCAAACGTTTATAATTTCTATTTTGGGGCACGGAttt > 2:1334267/1‑140 (MQ=255)
cgcTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTc > 1:6235952/1‑140 (MQ=255)
tGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGt < 2:2880024/140‑1 (MQ=255)
gCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTg < 1:6087747/140‑1 (MQ=255)
cATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGc > 1:595276/1‑140 (MQ=255)
cATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGc > 1:10652428/1‑140 (MQ=255)
aTGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTCACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCATGTCGTTGCAACCTCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCAGTGcc < 2:2104889/140‑1 (MQ=255)
aTGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGATTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGcc < 1:7636353/140‑1 (MQ=255)
tGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGccc > 1:10483234/1‑140 (MQ=255)
aacaacCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCAttt < 1:2841322/140‑1 (MQ=255)
caacCGGTTCGCACGTGTCTACGTCGCCAGCTGCTTTAACACATATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTACTTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTca < 2:530587/140‑1 (MQ=255)
acCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTGTAATTTGTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTccca > 2:8222103/1‑140 (MQ=255)
acCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTcaca > 1:8738981/1‑140 (MQ=255)
acCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTcaca > 1:6584199/1‑140 (MQ=255)
acCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTcaca > 2:2045603/1‑140 (MQ=255)
acCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATGTCTCGTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTcaca > 1:10138964/1‑140 (MQ=255)
gTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGtt > 2:3250694/1‑140 (MQ=255)
gTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGtt > 1:8349772/1‑140 (MQ=255)
ttCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTg > 1:4137205/1‑140 (MQ=255)
ttCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTg > 2:5767791/1‑140 (MQ=255)
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GCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATGTCTCGTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACA > SRR14920197.10570122/1‑151 (MQ=60)
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ATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAG < SRR14920197.9859186/151‑1 (MQ=60)
ATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGATTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAG < SRR14920197.7965562/151‑1 (MQ=60)
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GTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATAC > SRR14920197.11036323/1‑151 (MQ=60)
TGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACA > SRR14920197.9848593/1‑151 (MQ=60)
GAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACAC < SRR14920197.6935998/151‑1 (MQ=60)
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GAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACNTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACANGTTGGCTGTTATGCAGGAATACAC < SRR14920197.6007659/151‑1 (MQ=60)
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TACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAA < SRR14920197.2804236/151‑1 (MQ=60)
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TACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAA < SRR14920197.3885349/151‑1 (MQ=60)
TACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAA < SRR14920197.5775293/151‑1 (MQ=60)
|
ATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATGCGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAAT > NZ_CP025268/169326‑169626
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
