Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R7
|
781 |
589.5 |
21734725 |
98.3% |
21365234 |
134.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,459,111 |
A→C |
G122G (GGA→GGC) |
paaA → |
1,2‑phenylacetyl‑CoA epoxidase subunit A |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,459,111 | 0 | A | C | 100.0%
| 1813.3
/ NA
| 516 | G122G (GGA→GGC) | paaA | 1,2‑phenylacetyl‑CoA epoxidase subunit A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (321/195); total (321/195) |
Only 100 of 524 total aligned reads displayed.
TGTATCTCTATAGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGCCTGCATG > NZ_CP025268/1458975‑1459246
|
tGTATCTCTATAGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTgg < 1:10030723/140‑1 (MQ=255)
tGTATCTCTATAGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTgg < 1:5683807/140‑1 (MQ=255)
tGTATCTCTATAGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTgg > 2:4440423/1‑140 (MQ=255)
gTATCTCTATAGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGc > 2:1581753/1‑140 (MQ=255)
tataGCGCCGCCGAAACACTGGTCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGTACGGATGAAATATTCCTCCATCTTAAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGa > 2:9605022/1‑140 (MQ=255)
tataGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGa < 2:8161759/140‑1 (MQ=255)
tataGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGa > 1:9966393/1‑140 (MQ=255)
tataGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGa > 1:9643442/1‑140 (MQ=255)
tataGCGACGCCGAAACACTGGGATGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGAGGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGa > 2:2549371/1‑140 (MQ=255)
taGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATg > 1:7572320/1‑140 (MQ=255)
aGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATgg < 1:6088175/140‑1 (MQ=255)
gcgcCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGgc > 2:3150760/1‑140 (MQ=255)
gcgcCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGgc > 1:6742586/1‑140 (MQ=255)
cgccgcCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGgcg < 2:5668968/140‑1 (MQ=255)
ccgccgAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGCTGGCGCa > 2:6701392/1‑140 (MQ=255)
ccgccgAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCa > 1:2148047/1‑140 (MQ=255)
ccgccgAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCa > 2:9539590/1‑140 (MQ=255)
ccgccgAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCa > 1:400333/1‑140 (MQ=255)
ccgccgAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACAGTGAGTTGGGCTGATCTCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCa > 2:2496538/1‑140 (MQ=255)
cgccgAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAg < 1:10798938/140‑1 (MQ=255)
ccgAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCg > 1:9069890/1‑140 (MQ=255)
ccgAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCg > 1:5038568/1‑140 (MQ=255)
ccgAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCg > 2:7047606/1‑140 (MQ=255)
gAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGAt < 1:2475984/140‑1 (MQ=255)
aaaCACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATc < 2:764718/140‑1 (MQ=255)
gggCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATc > 1:4270834/1‑140 (MQ=255)
gggCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATc > 1:5907626/1‑140 (MQ=255)
ggCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCa > 2:10683244/1‑140 (MQ=255)
cTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAgg < 2:1192356/140‑1 (MQ=255)
cTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAgg < 2:8061616/140‑1 (MQ=255)
cTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAgg < 2:5357312/140‑1 (MQ=255)
cTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAgg < 1:2912210/140‑1 (MQ=255)
cTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAgg < 1:4843867/140‑1 (MQ=255)
cgcCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTCTCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTgg > 2:8651218/1‑140 (MQ=255)
cgcCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTgg > 1:4219619/1‑140 (MQ=255)
cgcCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTgg > 1:6541666/1‑140 (MQ=255)
cgcCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTgg > 1:8267764/1‑140 (MQ=255)
cgcCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTgg > 1:10358815/1‑140 (MQ=255)
ccAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATAGTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCg < 2:7422099/140‑1 (MQ=255)
gagaAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTa > 1:2261933/1‑140 (MQ=255)
gagaAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATGGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTa > 1:452222/1‑140 (MQ=255)
gaagaCATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATg < 2:7685212/140‑1 (MQ=255)
aagaCATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTCATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGc < 1:1277902/140‑1 (MQ=255)
aCATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGc < 2:9327625/140‑1 (MQ=255)
aTCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCAc > 2:3677577/1‑140 (MQ=255)
aTCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCAc < 1:9713483/140‑1 (MQ=255)
aTCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCAc < 1:8531830/140‑1 (MQ=255)
cTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCActt > 1:1058706/1‑140 (MQ=255)
cTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATGGTGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGATATGCGGCActg > 2:10450372/1‑139 (MQ=255)
tACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGTGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCActtc > 2:5723608/1‑140 (MQ=255)
tACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCActtc > 2:4820590/1‑140 (MQ=255)
ccAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTACTCCATCTTTAATTATCCGAAATTGAGTTGGGCTGATATCTGTGTTATCGGCTTGCTTGTGGATGTCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCAGCActtctt > 1:260885/1‑140 (MQ=255)
aaaaaaTGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTAt < 2:6773909/140‑1 (MQ=255)
aaaaaTGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATg < 1:1492747/140‑1 (MQ=255)
aaaaaTGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATg < 1:5471058/140‑1 (MQ=255)
aaaaaTGCTCGACGGACGGAAGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTGATg > 1:7717730/1‑140 (MQ=255)
aaaTGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGc < 2:3962466/140‑1 (MQ=255)
gacggacgGATGAAATAGTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGc < 2:6504028/140‑1 (MQ=255)
cggacggaTGAAAGATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCa < 2:282127/140‑1 (MQ=255)
ggaTGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCa > 2:1291008/1‑140 (MQ=255)
gaTGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCaa < 2:9059912/140‑1 (MQ=255)
cctccATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATc > 2:8865509/1‑140 (MQ=255)
cctccATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATc > 1:5136904/1‑140 (MQ=255)
cctccATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATc > 1:6269333/1‑140 (MQ=255)
cATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCATGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCa < 2:3555300/140‑1 (MQ=255)
cATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCTCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCa > 1:6811526/1‑140 (MQ=255)
cATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCAGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCa > 2:2267840/1‑140 (MQ=255)
cATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGATGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGGGGATGGCGCAGCGATCGTCCATCAGGTGGCGTTCTGCAGCACTTCTTATTGCCCGGATGCCAGAGCAATGGTGTACATCTgaa > 2:10308048/1‑138 (MQ=255)
aTCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTCTCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCaa < 2:3790380/140‑1 (MQ=255)
tCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCaaa > 2:2205081/1‑140 (MQ=255)
tCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCaaa > 1:3093405/1‑140 (MQ=255)
tCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCaaa > 1:3531825/1‑140 (MQ=255)
tttAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAaaga > 1:438490/1‑140 (MQ=255)
ttAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAaagaa > 2:4252740/1‑140 (MQ=255)
tCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGtt > 2:5932003/1‑140 (MQ=255)
tCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGtt > 1:3837012/1‑140 (MQ=255)
tCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGtt > 2:5176099/1‑140 (MQ=255)
tCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGtt > 2:1749068/1‑140 (MQ=255)
tCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGtt > 1:1835315/1‑140 (MQ=255)
ccGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGttt > 1:8582765/1‑140 (MQ=255)
aTTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCAcc < 2:7514208/140‑1 (MQ=255)
ttGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCa > 1:8687197/1‑140 (MQ=255)
tGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCa < 1:690409/140‑1 (MQ=255)
ggCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAgg > 2:4697661/1‑140 (MQ=255)
ggCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAgg > 2:2959100/1‑140 (MQ=255)
ggCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAgg > 1:9529703/1‑140 (MQ=255)
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ggCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAgg > 2:6945840/1‑140 (MQ=255)
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ACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGG > SRR14920197.9531128/1‑151 (MQ=60)
ATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGG < SRR14920197.5482781/151‑1 (MQ=60)
GAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTT > SRR14920197.10602783/1‑151 (MQ=60)
GAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTT > SRR14920197.857111/1‑151 (MQ=60)
GAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTT > SRR14920197.11185461/1‑151 (MQ=60)
GTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGA > SRR14920197.10592057/1‑151 (MQ=60)
GTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGA < SRR14920197.2314114/151‑1 (MQ=60)
TGGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAG < SRR14920197.721229/151‑1 (MQ=60)
GGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGC > SRR14920197.3963802/1‑151 (MQ=60)
GGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGC > SRR14920197.1010144/1‑151 (MQ=60)
GGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGC < SRR14920197.3359165/151‑1 (MQ=60)
GGGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCACGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGC > SRR14920197.6084485/1‑151 (MQ=60)
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GGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGCC < SRR14920197.7232446/151‑1 (MQ=60)
GGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGCC > SRR14920197.2627022/1‑151 (MQ=60)
GGCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGCC > SRR14920197.1237812/1‑151 (MQ=60)
GCTGATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGCCT > SRR14920197.4501379/1‑151 (MQ=60)
GATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGCCTGCA > SRR14920197.8283755/1‑151 (MQ=60)
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ATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGCCTGCAT < SRR14920197.1551161/151‑1 (MQ=60)
ATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGCCTGCAT > SRR14920197.7459786/1‑151 (MQ=60)
ATATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGCCTGCAT > SRR14920197.1766777/1‑151 (MQ=60)
TATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGCCTGCATG > SRR14920197.1256811/1‑151 (MQ=60)
TATCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGCCTGCATG < SRR14920197.10727702/151‑1 (MQ=60)
TCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGCCTGCATGGC < SRR14920197.3908955/151‑1 (MQ=60)
TCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGCCTGCATGGC < SRR14920197.211400/151‑1 (MQ=60)
TCGGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGCCTGCATGGC < SRR14920197.4206107/151‑1 (MQ=60)
GGTGTTATCGGCTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGCCTGCATGGCAC < SRR14920197.10613931/151‑1 (MQ=60)
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CTGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGCCTGCATGGCACTGGCGCAGGGC < SRR14920197.10092470/151‑1 (MQ=60)
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GGTCATGGTCTGTATCTCTATAGCGCCGCCGAAACACTGGGCTGCGCCAGAGAAGACATCTACCAAAAAATGCTCGACGGACGGATGAAATATTCCTCCATCTTTAATTATCCGACATTGAGTTGGGCTGATATCGGTGTTATCGGATGGCTGGTGGATGGCGCAGCGATCGTCAATCAGGTGGCGTTATGCCGCACTTCTTATGGCCCGTATGCCAGAGCAATGGTGAAAATCTGCAAAGAAGAGAGTTTTCACCAGCGTCAGGGGTTTGAAGCCTGCATGGCACTGGCGCAGGGC > NZ_CP025268/1458965‑1459261
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |