Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R7
|
781 |
589.5 |
21734725 |
98.3% |
21365234 |
134.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,514,921 |
A→G |
*419* (TAA→TAG) |
yfeO → |
ion channel protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,514,921 | 0 | A | G | 99.7%
| 2217.8
/ NA
| 639 | *419* (TAA→TAG) | yfeO | ion channel protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (329/308); minor base T (1/1); total (330/309) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 639 total aligned reads displayed.
GCGGCAGTCGTTGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGAATAACAATGTTCAGGTCACTGTTTCTG > NZ_CP025268/2514784‑2515056
|
gcggcAGTCGTTGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCa > 1:2041422/1‑140 (MQ=255)
tCGTTGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGACGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATg < 1:6648227/140‑1 (MQ=255)
gTTGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGct < 1:475492/140‑1 (MQ=255)
gTTGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGct < 1:4081289/140‑1 (MQ=255)
gTTGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGct < 1:8502111/140‑1 (MQ=255)
tGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGctct > 2:135073/1‑140 (MQ=255)
cAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTa > 1:5349022/1‑140 (MQ=255)
cAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTa < 1:9290030/140‑1 (MQ=255)
aCCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGAt < 2:4493538/140‑1 (MQ=255)
cacaTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGAttt < 2:5308633/140‑1 (MQ=255)
cacaTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGAttt > 1:3009239/1‑140 (MQ=255)
cacaTTGCTACCGCTGCTCTGTAGCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGGTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCTACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAGATGCTCTCCgttcggatgt > 2:1959883/1‑133 (MQ=255)
caTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCACCAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGAGTTaa > 2:9702207/1‑140 (MQ=255)
caTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTaa > 1:8748227/1‑140 (MQ=255)
caTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTaa > 2:9214619/1‑140 (MQ=255)
caTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTaa < 2:2792358/140‑1 (MQ=255)
caTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGAGTTaa > 1:6725335/1‑140 (MQ=255)
caTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCCCTCCTTTATGATTTaa > 2:4178152/1‑140 (MQ=255)
aTTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAag > 1:9932461/1‑140 (MQ=255)
tGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAagag > 1:8368888/1‑140 (MQ=255)
cTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATCACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTAGGATTTAAGAGtt > 2:3995290/1‑140 (MQ=255)
cTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGtt > 2:4815409/1‑140 (MQ=255)
cTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGtt > 1:10020635/1‑140 (MQ=255)
aCCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAATAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTAt > 2:10146345/1‑140 (MQ=255)
aCCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTAt > 1:1867136/1‑140 (MQ=255)
ccGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATg > 1:3530593/1‑140 (MQ=255)
ccGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATg > 1:9020580/1‑140 (MQ=255)
ccGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTAGGATTTAAGAGTTATg > 2:10275400/1‑140 (MQ=255)
ccGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCCATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATg > 2:513136/1‑140 (MQ=255)
ctgctCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCg > 2:875835/1‑140 (MQ=255)
tgctCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCga < 2:5706921/140‑1 (MQ=255)
gctCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCgat > 2:6757189/1‑140 (MQ=255)
ctctGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCCAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCgatg > 2:1479207/1‑140 (MQ=255)
tctGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCgatga > 2:5503824/1‑140 (MQ=255)
tGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATa < 1:6886601/140‑1 (MQ=255)
tGTATAGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTTGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATa < 1:7314508/140‑1 (MQ=255)
tATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACg > 1:1054578/1‑140 (MQ=255)
aTCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACgg < 2:5619186/140‑1 (MQ=255)
aTCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACgg < 2:940639/140‑1 (MQ=255)
tGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGct > 2:8206854/1‑97 (MQ=255)
gCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTAc < 1:8223917/140‑1 (MQ=255)
gCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTAc < 1:3890742/140‑1 (MQ=255)
gCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTAc < 2:630607/140‑1 (MQ=255)
gCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTAc < 2:1628473/140‑1 (MQ=255)
gCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTAc < 2:7110665/140‑1 (MQ=255)
cTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGAttt < 2:6587718/109‑1 (MQ=255)
cTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTAcc > 1:1379335/1‑140 (MQ=255)
cTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTGTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTAcc > 2:7783176/1‑140 (MQ=255)
cTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGGAAGCCGATGATGTTGGTCATTCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCATAAATTGCTCTCCTTTATGATGTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTAcc > 1:573680/1‑140 (MQ=255)
ttCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCt < 2:8435311/140‑1 (MQ=255)
ttCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCt < 1:5853320/140‑1 (MQ=255)
ttCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCt < 2:3558677/140‑1 (MQ=255)
ccGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTcc < 2:2463861/140‑1 (MQ=255)
ccGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTcc < 1:513136/140‑1 (MQ=255)
ccGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTcc < 2:10607245/140‑1 (MQ=255)
ggCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTcccc < 1:3102988/140‑1 (MQ=255)
tGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTaa > 2:3403493/1‑140 (MQ=255)
ggCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAat < 1:10395427/140‑1 (MQ=255)
ggCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAat < 1:4344765/140‑1 (MQ=255)
ggCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAat < 1:2381941/140‑1 (MQ=255)
gCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAata > 1:2862563/1‑140 (MQ=255)
gCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAata > 1:4629236/1‑140 (MQ=255)
gCTGTTAGTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAata < 2:7597379/140‑1 (MQ=255)
cTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAatat < 1:7251131/140‑1 (MQ=255)
cAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACa > 2:741639/1‑140 (MQ=255)
ggTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAgg < 2:1183333/140‑1 (MQ=255)
gTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGc > 2:9062836/1‑140 (MQ=255)
gTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGc > 1:80943/1‑140 (MQ=255)
aaGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAAc < 1:2488029/134‑1 (MQ=255)
aGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGc > 2:4730975/1‑140 (MQ=255)
ccGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTg < 1:9714024/140‑1 (MQ=255)
gatgatgatGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGAc < 2:2132578/140‑1 (MQ=255)
atgatgatgGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTa < 2:10464648/70‑1 (MQ=255)
gatgatgGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGc > 2:7969482/1‑140 (MQ=255)
gatgGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTc < 1:10860252/140‑1 (MQ=255)
tCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCg > 1:8869784/1‑140 (MQ=255)
tCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCg > 1:6002312/1‑140 (MQ=255)
tCAATCGTAAGAATCAACAGCCACCCCAAGATTAGTTTGAGCATAAAATTCTATAATTTATTATTTTATAGTTATTTCTATTATACTGGTCTTTACCTCCCCGTAATATTGATTTAACAGTCCGATGACGTCTTCGAGCg < 2:595468/140‑1 (MQ=255)
aTCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGa > 1:10099847/1‑140 (MQ=255)
tCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGa < 2:8872282/139‑1 (MQ=255)
cGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAg < 1:5578355/140‑1 (MQ=255)
cGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAg < 1:6186758/140‑1 (MQ=255)
cGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAg < 2:6982196/140‑1 (MQ=255)
ccGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGgag < 1:7803796/140‑1 (MQ=255)
cGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCg > 2:10858656/1‑94 (MQ=255)
gAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTAc > 1:1571062/1‑86 (MQ=255)
gAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGaa < 2:3056681/140‑1 (MQ=255)
gCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGTGCGTGAAGGAGAATaa < 1:3366177/140‑1 (MQ=255)
aaCAGCCACCCCTCGATATCGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTGTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGAATAACa < 2:3237723/140‑1 (MQ=255)
aaCAGCCACCCCACCATACCCTTTAGCAACAAATGCTCTCCTTGCTGAGTTAAGAGTTATGGCTATGATACGGGGACTGACCACCCCGTAATCTAGCGATAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGAATAACa < 2:6430995/140‑1 (MQ=255)
aCAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGAATAACaa > 1:10726151/1‑140 (MQ=255)
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CGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCAGGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGG < SRR14920197.6527879/151‑1 (MQ=60)
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GATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGG < SRR14920197.360777/151‑1 (MQ=60)
GATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGG < SRR14920197.11322307/151‑1 (MQ=60)
GATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGG < SRR14920197.9143827/151‑1 (MQ=60)
ATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacctctctacatctcgtatgccgtcttctgcttgaatagggggg > SRR14920197.1456447/1‑75 (MQ=60)
GGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGA > SRR14920197.6426665/1‑151 (MQ=60)
GTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacctctctaca > SRR14920197.1640022/1‑108 (MQ=60)
GTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGAA > SRR14920197.6843281/1‑151 (MQ=60)
CAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGAATA > SRR14920197.10970114/1‑151 (MQ=60)
ATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGAATAAC > SRR14920197.10252070/1‑151 (MQ=60)
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CGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGAATAACAA > SRR14920197.11182769/1‑151 (MQ=60)
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AAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacctctctacatctcgtatgc > SRR14920197.2533056/1‑98 (MQ=60)
AAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGAATAACAATGTTCA > SRR14920197.7013397/1‑151 (MQ=60)
TCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGctgactcttatacacatatccgatccaacgagacaactctacatcgcgtctgccgtcatctgcttgaaaaggggggggggggggggggggggg > SRR14920197.635339/1‑58 (MQ=60)
GCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGAATAACAATGTTCAGG > SRR14920197.11288860/1‑151 (MQ=60)
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ACGTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGAATAACAATGTTCAGGTCACTGTTTCTGGCGGCCGC > SRR14920197.5819616/1‑151 (MQ=60)
GTTTAGCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGAATAACAATGTTCAGGTCACTGTTTCTGGCGGCCGCCC > SRR14920197.6770174/1‑151 (MQ=60)
GCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGAATAACAATGTTCAGGTCACTGTTTCTGGCGGCCGCCCTGATG > SRR14920197.6206404/1‑151 (MQ=60)
GCAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGAATAACAATGTTCAGGTCACTGTTTCTGGCGGCCGCCCTGATG < SRR14920197.6358811/151‑1 (MQ=60)
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GTCTTTTTATGGCGGCAGTCGTTGTACCCAATACCACATTGCTACCGCTGCTCTGTATCGTCATGCTTCCGGCATGGCTGTTATTAGCAGGTAAGCCGATGATGATGGTCAATCGTCCGAAGCAACAGCCACCCCACGATAACGTTTAACAAAAAATGCTCTCCTTTATGATTTAAGAGTTATGGCGATGATACGGGGCTTTACCTCCCCGTAATATTGCGTTAACAGGCCGCTGACGGCTTCGAGCGTGAAGGAGAATAACAATGTTCAGGTCACTGTTTCTGGCGGCCGCCCTGATG > NZ_CP025268/2514773‑2515071
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |