Vishwa_Patel_2021: long
Stats |
Metadata |
Mutations |
Converged Mutations |
Fixed Mutations |
Filter
Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A1 F21 I1 R7 | 781 | 589.5 | 21734725 | 98.3% | 21365234 | 134.3 |
Breseq alignment
| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,579,872 | T→C | M1M (ATG→GTG) † *460* (TAA→TAG) |
mcrC ← mcrB ← |
5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease system specificity protein McrC 5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease subunit McrB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,579,872 | 0 | T | C | 99.9% | 6897.5 / NA | 1964 | M1M (ATG→GTG) † *460* (TAA→TAG) | mcrC mcrB | 5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease system specificity protein McrC 5‑methylcytosine‑specific restriction endonuclease subunit McrB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (1051/910); minor base A (2/1); total (1053/911) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 1964 total aligned reads displayed.
TAATACATACCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCATTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCT > NZ_CP025268/4579735‑4580007 | tacatacCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGa > 2:3140791/1‑140 (MQ=255) tacatacCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGa > 1:4902554/1‑140 (MQ=255) acatacCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAg > 1:10308380/1‑140 (MQ=255) acatacCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAg < 1:2840190/140‑1 (MQ=255) acatacCCCAGGATATCAAGAAGATGGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAg < 2:2427868/140‑1 (MQ=255) tacCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTcc < 2:5105027/140‑1 (MQ=255) acCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATg > 2:4457780/1‑134 (MQ=255) acCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTccc > 2:830803/1‑140 (MQ=255) acCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTccc > 2:3238149/1‑140 (MQ=255) acCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTccc > 1:3298571/1‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) acCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTccc > 2:6993148/1‑140 (MQ=255) acCCCAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTAAGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTAAGGACAGGTATCACGGGCTGCTCCACTATGAGTccc > 1:7896970/1‑140 (MQ=255) cccAGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCt > 2:4071704/1‑140 (MQ=255) aGGATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCtaat > 1:8573316/1‑140 (MQ=255) gATATCAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGt > 2:593059/1‑130 (MQ=255) cAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGt > 2:9445154/1‑125 (MQ=255) 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(MQ=255) aagaTTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGt > 1:569361/1‑140 (MQ=255) ttACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTc > 2:6334735/1‑140 (MQ=255) cGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCtgtt < 2:5419627/140‑1 (MQ=255) cGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCtgtt < 1:2038196/140‑1 (MQ=255) ggTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCtgttgt > 2:3862073/1‑140 (MQ=255) ggTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCtgttgt < 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ttttcaagcagaagacggcatacgagatgtagagaggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTC < SRR14920197.1782755/81‑1 (MQ=60) cccccccccccccccccccccccttttcaagcagaagacggcatacgcgatgtagagaggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTC < SRR14920197.1284600/58‑1 (MQ=60) CAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTC < SRR14920197.4715570/151‑1 (MQ=60) CAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTC < SRR14920197.462156/151‑1 (MQ=60) CAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTC < SRR14920197.6196361/151‑1 (MQ=60) CAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTC > SRR14920197.10008031/1‑151 (MQ=60) CAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTGC > SRR14920197.6673260/1‑151 (MQ=60) CAAGAAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCATGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGTACAGGTATCACGGGCTGATCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTC > SRR14920197.1580047/1‑151 (MQ=60) AAGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTT < SRR14920197.8076276/151‑1 (MQ=60) AGATTGTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTG < SRR14920197.8842140/151‑1 (MQ=60) cccccccccccccccccccccccccccccttttcaagcagaagacggcatacgagatgtagagaggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacaGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTAT < SRR14920197.44971/53‑1 (MQ=60) GTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagacct > SRR14920197.256392/1‑116 (MQ=60) GTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTAT > SRR14920197.8648795/1‑151 (MQ=60) GTTACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTAT < SRR14920197.2929104/151‑1 (MQ=60) TACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAG < SRR14920197.5150724/151‑1 (MQ=60) TACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAG < SRR14920197.850002/151‑1 (MQ=60) ACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGG > SRR14920197.2456290/1‑151 (MQ=60) ACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGG < SRR14920197.10379460/151‑1 (MQ=60) ACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGG < SRR14920197.9538286/151‑1 (MQ=60) ACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGG > SRR14920197.2240725/1‑151 (MQ=60) ACCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCAACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGG < SRR14920197.10729526/151‑1 (MQ=60) CCGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGATTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGG < SRR14920197.9695795/151‑1 (MQ=60) gatgtagagaggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGG < SRR14920197.7614267/106‑1 (MQ=60) CGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGG < SRR14920197.10025003/151‑1 (MQ=60) CGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGG < SRR14920197.10984440/151‑1 (MQ=60) CGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGG < SRR14920197.5023911/151‑1 (MQ=60) CGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGG < SRR14920197.7297527/151‑1 (MQ=60) CGGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGG < SRR14920197.3829658/151‑1 (MQ=60) GGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCGTGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGT > SRR14920197.10473809/1‑151 (MQ=60) GGGTATGGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGT > SRR14920197.4833963/1‑151 (MQ=60) GGCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAA < SRR14920197.11220579/151‑1 (MQ=60) GCTTCAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAA > SRR14920197.6486836/1‑151 (MQ=60) CAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAA < SRR14920197.827979/151‑1 (MQ=60) CAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAA < SRR14920197.5411074/151‑1 (MQ=60) CAAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAA < SRR14920197.3678198/151‑1 (MQ=60) gctcggagatgtgtataagagacagAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAAT < SRR14920197.3033562/126‑1 (MQ=60) AAGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTGAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAAT > SRR14920197.2651567/1‑151 (MQ=60) AGGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATA > SRR14920197.4929178/1‑151 (MQ=60) agacggcatacgagatgtagagaggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATAT < SRR14920197.3186021/93‑1 (MQ=60) GGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATAT < SRR14920197.10933059/151‑1 (MQ=60) GGTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATAT < SRR14920197.1384460/151‑1 (MQ=60) GTTTGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATT > SRR14920197.7086256/1‑151 (MQ=60) TTTGCCTGCTTAATTTCCTGTATATAACCCCATTCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTC < SRR14920197.3574366/151‑1 (MQ=60) TGCCTGCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGctgtctcttatacacatctcc > SRR14920197.4341084/1‑130 (MQ=60) GCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTGCGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGT < SRR14920197.5672719/151‑1 (MQ=60) GCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGT > SRR14920197.6425346/1‑151 (MQ=60) GCTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGT > SRR14920197.506886/1‑151 (MQ=60) CTTAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTA > SRR14920197.2826929/1‑151 (MQ=60) TAATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAA < SRR14920197.5085386/151‑1 (MQ=60) ATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGG < SRR14920197.9289863/151‑1 (MQ=60) ATTTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGG < SRR14920197.5588303/151‑1 (MQ=60) TTCCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGG < SRR14920197.7456326/151‑1 (MQ=60) CCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCGTTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCG > SRR14920197.10080139/1‑151 (MQ=60) CCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCG > SRR14920197.10896766/1‑151 (MQ=60) CCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCG > SRR14920197.10311637/1‑151 (MQ=60) CCTGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGGTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCG > SRR14920197.1113050/1‑151 (MQ=60) TGTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGAT < SRR14920197.740823/151‑1 (MQ=60) GTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAActgtctcttatacacatctccgagcccacgagacctctctacatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaa > SRR14920197.7016092/1‑81 (MQ=60) GTAAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATA < SRR14920197.3593591/151‑1 (MQ=60) agacggcatacgagatgtagagaggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATC < SRR14920197.7189255/93‑1 (MQ=60) AAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacctctctacatctcgtatgccgtcttctgcttgta > SRR14920197.1443783/1‑83 (MQ=60) AAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATC < SRR14920197.8130367/151‑1 (MQ=60) AAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATC < SRR14920197.1312263/151‑1 (MQ=60) AAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATC > SRR14920197.9166084/1‑151 (MQ=60) AAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATC > SRR14920197.9491227/1‑151 (MQ=60) AAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATC > SRR14920197.354868/1‑151 (MQ=60) AAATAACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATC > SRR14920197.67496/1‑151 (MQ=60) AACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTC < SRR14920197.9089717/151‑1 (MQ=60) AACCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTC < SRR14920197.446596/151‑1 (MQ=60) CCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCAT > SRR14920197.3413088/1‑151 (MQ=60) CCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCAT > SRR14920197.8477896/1‑151 (MQ=60) CCCCATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCAT > SRR14920197.66787/1‑151 (MQ=60) atgtgtataagagacagGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCAC < SRR14920197.544922/134‑1 (MQ=60) ATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACA > SRR14920197.9409274/1‑151 (MQ=60) ATGCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACA > SRR14920197.6910856/1‑151 (MQ=60) GCATAGGTAAGCATGTAATNGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTAGGAGTCCCCTAATANTTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAAT > SRR14920197.6075529/1‑151 (MQ=60) GCATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAAT > SRR14920197.2800422/1‑151 (MQ=60) CATAGGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAActgtctcttatacacatctccgagcccacgagacctctctacatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaagggggggggggg > SRR14920197.5806198/1‑69 (MQ=60) GGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCAT > SRR14920197.3932387/1‑151 (MQ=60) GGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCAT < SRR14920197.4248631/151‑1 (MQ=60) GGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCAT > SRR14920197.5612029/1‑151 (MQ=60) GGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCAT > SRR14920197.4015950/1‑151 (MQ=60) GGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCAT > SRR14920197.6792448/1‑151 (MQ=60) GGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCAT < SRR14920197.8950054/151‑1 (MQ=60) GGTAAGCATGTAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCAT > SRR14920197.389988/1‑151 (MQ=60) 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TAATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacctctctacatctcgtatgccgtcttctgcttg > SRR14920197.2144088/1‑85 (MQ=60) AATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGC > SRR14920197.2317475/1‑151 (MQ=60) ATAGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCG < SRR14920197.3958569/151‑1 (MQ=60) AGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATctgtctcttataca > SRR14920197.3306339/1‑137 (MQ=60) AGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTA > SRR14920197.11324323/1‑151 (MQ=60) AGATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTA > SRR14920197.4881222/1‑151 (MQ=60) ATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATC < SRR14920197.4446157/151‑1 (MQ=60) ATATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATC > SRR14920197.1233875/1‑151 (MQ=60) ATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacctctctacatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaggggggggggggg > SRR14920197.1635947/1‑68 (MQ=60) ATTACGGACAGGTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCAGCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCG > SRR14920197.10656148/1‑151 (MQ=60) 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GTATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacctctctacatctcgtatgccgtctgctgcttgaaa > SRR14920197.4674642/1‑82 (MQ=60) ATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATC < SRR14920197.5854570/151‑1 (MQ=60) ATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATC > SRR14920197.3719771/1‑151 (MQ=60) ATCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATC > SRR14920197.7944364/1‑151 (MQ=60) TCACGGGCTGTTCCACTATGAGTCCCCTAATAATTTGTTGGTCCATTTCTGTTGTTTATAGGGGTCATCAAAGAAATATTCTTCGAGTAAAGGGGCGATATCCGTCATCACAATTTCATTAAGCCATTGCGTATCCGGAGAGGTGCCATCT < SRR14920197.1678108/151‑1 (MQ=60) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |