Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R3
|
782 |
676.6 |
23254289 |
97.6% |
22696186 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,660,166 |
T→C |
K109R (AAG→AGG) |
ynfA ← |
YnfA family protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,660,166 | 0 | T | C | 99.4%
| 2273.7
/ NA
| 657 | K109R (AAG→AGG) | ynfA | YnfA family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (318/335); minor base A (2/2); total (320/337) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 657 total aligned reads displayed.
TAAAGATCGAAAAAAGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCTTACGTGC‑G‑CCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACGCCGTGCAGACATAAACGCCAC > NZ_CP025268/1660029‑1660301
|
taAAGATCGAAAAAAGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTa < 2:5000272/140‑1 (MQ=255)
taAAGATCGAAAAAAGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTa > 1:9290801/1‑140 (MQ=255)
taAAGATCGAAAAAAGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTCTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTa > 1:4571546/1‑140 (MQ=255)
gATCGAAAAAAGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTg < 1:4079728/140‑1 (MQ=255)
aTCGAAAAAAGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTgc > 2:2308894/1‑140 (MQ=255)
aTCGAAAAAAGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTgc < 1:5766148/140‑1 (MQ=255)
aTCGAAAAAAGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTgc > 1:1211674/1‑140 (MQ=255)
aTCGAAAAAAGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTgc < 1:5463309/140‑1 (MQ=255)
cGAAAAAAGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTgc‑g‑c > 1:2751112/1‑140 (MQ=255)
aaaaaGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑G‑ccc‑c < 2:6634581/140‑1 (MQ=255)
aaaGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑G‑ccc‑cca < 1:6432717/140‑3 (MQ=255)
aaaGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑G‑ccc‑cca < 1:10450288/140‑3 (MQ=255)
gCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑G‑ccc‑ccagcc > 1:144270/1‑135 (MQ=255)
cGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCg < 1:9620545/140‑1 (MQ=255)
gAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATA‑TTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATCCCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGcaa < 2:5108088/140‑1 (MQ=255)
aGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGcaa < 1:9024742/140‑1 (MQ=255)
tGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAAGACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGcaaca < 2:10747258/140‑1 (MQ=255)
cGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGc < 2:8396057/140‑1 (MQ=255)
gTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGACTACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCa < 1:9477711/140‑1 (MQ=255)
gTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAAGACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCa > 2:1469301/1‑140 (MQ=255)
tataTTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCaa < 2:4456045/140‑1 (MQ=255)
atatTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCaaa < 1:2045277/140‑1 (MQ=255)
cgcTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAAt > 1:4341315/1‑140 (MQ=255)
cTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAATTAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCa > 2:6187461/1‑140 (MQ=255)
cTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCa > 2:10634134/1‑140 (MQ=255)
tgtgAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCaa < 1:3987918/140‑1 (MQ=255)
tgAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACg < 1:688760/140‑1 (MQ=255)
tgAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCGTATTGATCATATGGATTTATGGTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCACCg > 2:6853545/1‑140 (MQ=255)
agAATGGTTGACAACAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACg < 1:7131853/139‑1 (MQ=255)
gAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGc > 1:7374671/1‑140 (MQ=255)
aaTGGTTGACAAAAGATGACATAGAAGACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCCTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCa < 1:7694030/140‑1 (MQ=255)
aTGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCAc < 1:1148895/140‑1 (MQ=255)
aTGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCAc < 1:10621881/140‑1 (MQ=255)
tGACACAAGATGACAGAGACTCCCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTGAGGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCACTCAACGCACCCGTc < 2:8810855/140‑1 (MQ=255)
tGACAAATTATGAAATAGAATTCCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTTTGTTCCTACGTGCTC‑CCC‑CAGCCCGCTACAATGATCAACTTTCCTAAAAGCGCAATCAACGCACCCGTc < 2:7524103/140‑1 (MQ=255)
tGACAAAAGATGACATAGAATACCTTTTGCCAGCTGACACGTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTc < 2:3986729/140‑1 (MQ=255)
tGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTc < 1:8612736/140‑1 (MQ=255)
tGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTGGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTc < 2:9699783/140‑1 (MQ=255)
acacAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGACGCTAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCa > 2:8083695/1‑140 (MQ=255)
aCAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTcct > 2:4300720/1‑139 (MQ=255)
aCAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCa > 2:8904067/1‑140 (MQ=255)
aCAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCa > 1:10980673/1‑140 (MQ=255)
aCAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCa > 1:4485743/1‑140 (MQ=255)
aaaaGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATCATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGt > 1:8157437/1‑140 (MQ=255)
gATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATa > 2:1942500/1‑140 (MQ=255)
aTGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATaa > 1:5264785/1‑140 (MQ=255)
aTAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGt < 2:4705620/140‑1 (MQ=255)
taTACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTTCGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGt < 1:10129859/139‑1 (MQ=255)
aaTACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGt > 1:3028661/1‑140 (MQ=255)
aTACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGtt > 2:7021401/1‑140 (MQ=255)
aTACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGtt > 2:9866039/1‑140 (MQ=255)
aCCTTTTGTCAGCTGACACGTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGGTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTc < 2:5297593/140‑1 (MQ=255)
ccTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCa > 1:2456683/1‑140 (MQ=255)
cTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCAc > 2:3552704/1‑140 (MQ=255)
ttttGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGCTCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACg < 2:3099268/140‑1 (MQ=255)
ttttGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACg < 2:10858194/140‑1 (MQ=255)
tttGTCAGCTGACGCTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGc > 1:9998876/1‑140 (MQ=255)
tttGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAg > 1:6568640/1‑96 (MQ=255)
tttGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGc > 2:5953745/1‑140 (MQ=255)
tttGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGc < 2:123821/140‑1 (MQ=255)
tGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCa < 1:3668501/140‑1 (MQ=255)
tGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCa > 1:1315929/1‑140 (MQ=255)
gCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCcac > 1:7825371/1‑140 (MQ=255)
cTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCcaca > 1:3567225/1‑140 (MQ=255)
cTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGACCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCcaca > 2:7826222/1‑140 (MQ=255)
acacTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGcc < 1:1752544/130‑1 (MQ=255)
ccTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGCTCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGc < 2:7282758/140‑1 (MQ=255)
ccTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGc < 2:4818364/140‑1 (MQ=255)
ccTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGc < 2:5837782/140‑1 (MQ=255)
ccTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGc < 1:10825384/140‑1 (MQ=255)
ccTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGAAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGc < 1:622567/140‑1 (MQ=255)
ccTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGGTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGc < 2:9215516/140‑1 (MQ=255)
ccTCTTATCTGAGTGATACAATGGATTGATGGTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAGTGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGc < 2:6455471/140‑1 (MQ=255)
ctctTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCACAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGcc > 2:3420017/1‑140 (MQ=255)
ctctTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGcc > 1:6002034/1‑140 (MQ=255)
ctctTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTCCCTACGTGC‑G‑CCCACAGCCCGCAACAATGATCAACATGACGCAAAGCGCAATCAACGAACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACTCCATCCAAAACGCGCAGcc > 2:1135761/1‑140 (MQ=255)
cttatTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCaa > 2:9522499/1‑140 (MQ=255)
tatTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACg < 2:3737337/140‑1 (MQ=255)
atTGATAAATTGTATTTATCTTCCGACGTGC‑GACCA‑CAGCACGCAACAATGATCAACAAGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCTCTCCATCCACAACGCTCAGCAACATCAAAGc > 2:10454952/1‑140 (MQ=255)
atTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACGc < 2:9083954/140‑1 (MQ=255)
atTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACGc > 2:2026455/1‑140 (MQ=255)
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atTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGC‑GCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACGc > 1:8378901/1‑140 (MQ=255)
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ACCATACAAGTATAAAGATCGAAAAAAGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCTTACGTGCG‑CCCCAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACGCCGTGCAGACATAAACGCCACCATAAGCCGCGTA > NZ_CP025268/1660017‑1660314
|
| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |