Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R3
|
782 |
676.6 |
23254289 |
97.6% |
22696186 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,660,178 |
+C |
coding (314/351 nt) |
ynfA ← |
YnfA family protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,660,174 | 1 | . | C | 97.7%
| 2038.1
/ 33.9
| 600 | coding (318/351 nt) | ynfA | YnfA family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (8/6); new base C (276/306); total (286/314) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.91e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 649 total aligned reads displayed.
TCGAAAAAAGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCTTACGTGCG‑CCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACGCCGTGCAGACATAAACGCCACCATAAGCCG > NZ_CP025268/1660035‑1660310
|
cGACAAAAGCCGGAGTGATCAAAAAAAAAGGCGTATATGTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTGTGTCAGCTGCCACTTCCTCTTATCTTATTGATCATATGGATTTATGGTCCTACGGgcg‑c > 2:3795045/1‑140 (MQ=255)
cGAAAAAAGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTgcg‑c > 2:8058639/1‑140 (MQ=255)
cGAAAAAAGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTgcg‑c > 1:2546165/1‑140 (MQ=255)
gAAAAAAGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCG‑cc > 2:10576735/1‑140 (MQ=255)
gAAAAAAGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCG‑cc > 1:6415193/1‑140 (MQ=255)
aaaaaaGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCG‑ccc > 2:2307183/1‑140 (MQ=255)
aaaaaGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCG‑ccc‑c < 1:194198/140‑1 (MQ=255)
aaaGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCG‑ccc‑cca < 1:10450288/140‑3 (MQ=255)
aaaGCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCG‑ccc‑cca < 2:7001055/140‑3 (MQ=255)
gCCGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCG‑ccc‑ccagcc > 1:9551099/1‑135 (MQ=255)
cGGAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCg < 2:5463249/140‑1 (MQ=255)
gAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGca > 2:4332565/1‑140 (MQ=255)
gAGTGATCACAAAAAAAGGCGTATA‑TTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATCCCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGcaa < 2:5108088/140‑1 (MQ=255)
acaAAAAAAGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGAt < 2:10845375/140‑1 (MQ=255)
accaaaaGGCGGAGATTTCCGCTGTGACAGGGAGACAAAAGATGAACGAGAAGCCCATTTGTCAGCTGACACTTCCTCTAATCTAAAGGATAAACTGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCa < 2:7282096/137‑1 (MQ=255)
aaaaaGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAAc < 1:4236203/140‑1 (MQ=255)
aaaGGCGTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACAt > 2:10718437/1‑140 (MQ=255)
gTATATTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCa > 2:1469168/1‑140 (MQ=255)
tataTTTGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCaa > 2:8574881/1‑140 (MQ=255)
ttGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAgcgc < 1:1476804/140‑1 (MQ=255)
gtGCGCGGTGAATGGTTGACAAAAGATGACATAGAATCCCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCGTCTCTTATGGATAAAATGGATTGAGGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAgcgc < 1:4498810/139‑1 (MQ=255)
tGCGCTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCa < 2:5893312/140‑1 (MQ=255)
cgcTGTGAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAAt > 1:135294/1‑140 (MQ=255)
cTGTGAATGGTTGNGAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAANGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCa > 1:6252652/1‑140 (MQ=255)
gtgAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGcaa < 1:6003671/108‑1 (MQ=255)
gtgAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTAATTGATAAAATGGAATTATGTACCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCTCAAAGCGCAATCAAc > 1:3589592/1‑140 (MQ=255)
tgAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACg > 1:5420190/1‑140 (MQ=255)
tgAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACg < 1:688760/140‑1 (MQ=255)
tgAATGGTTGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACg < 1:11571311/140‑1 (MQ=255)
aaTGGTTGACAAAAGATGACATAGAAGACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCCTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCa < 1:7694030/140‑1 (MQ=255)
tGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTc < 1:5667854/140‑1 (MQ=255)
tGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTc > 2:10215469/1‑140 (MQ=255)
tGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTc < 1:9937829/140‑1 (MQ=255)
tGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTc < 2:7523384/140‑1 (MQ=255)
tGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTc < 1:8545704/140‑1 (MQ=255)
tGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTc < 1:2305366/140‑1 (MQ=255)
tGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTAATGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGAGAAATCAACGCACCCGTc < 2:7794156/140‑1 (MQ=255)
tGACAAAAGATGAAATAGAATACCTTTGGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTc < 2:9699783/140‑1 (MQ=255)
aaaaGATGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGt > 1:11004160/1‑140 (MQ=255)
aTGAAATAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATaa > 1:4992252/1‑140 (MQ=255)
aTAGAATACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGt < 2:4705620/140‑1 (MQ=255)
aaTACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCa > 2:8355740/1‑138 (MQ=255)
aaTACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGt > 2:2586502/1‑140 (MQ=255)
aTACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGtt > 2:9866039/1‑140 (MQ=255)
aTACCTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGtt < 1:10368525/140‑1 (MQ=255)
cTTTTGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCAc > 2:3552704/1‑140 (MQ=255)
ttttGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGCTCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACg < 2:3099268/140‑1 (MQ=255)
tttGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAg > 1:6568640/1‑96 (MQ=255)
tttGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGc < 1:282784/140‑1 (MQ=255)
tttGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGc < 2:123821/140‑1 (MQ=255)
tGTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCa < 1:3668501/140‑1 (MQ=255)
gTCAGCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCAt > 1:4018740/1‑140 (MQ=255)
gCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCcac > 1:7825371/1‑140 (MQ=255)
gCTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGAGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCcac > 2:4812601/1‑140 (MQ=255)
cTGACACTTCCTCTTATCTTATTGTTAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCcaca > 2:6188419/1‑140 (MQ=255)
cTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCATCGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCcaca > 1:835730/1‑140 (MQ=255)
cTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCcaca > 1:11296262/1‑140 (MQ=255)
cTGACACTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCcaca > 1:9374306/1‑140 (MQ=255)
gACACTTCCTCTTATCTTATTGATACAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAAc < 2:5002401/140‑1 (MQ=255)
cacTTCCTCTGATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCTCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAAcgc < 2:9500009/140‑1 (MQ=255)
cTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACgcgc > 1:1821163/1‑140 (MQ=255)
cTTCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACgcgc > 2:5965887/1‑140 (MQ=255)
ttCCTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCa < 2:4293533/140‑1 (MQ=255)
ccTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGc < 1:7179095/140‑1 (MQ=255)
ccTCTTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGGTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGc < 2:9215516/140‑1 (MQ=255)
ccTCTTATCTGAGTGATACAATGGATTGATGGTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAGTGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGc < 2:6455471/140‑1 (MQ=255)
actctTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGc < 1:8827891/139‑1 (MQ=255)
ctctTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCACAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGcc > 2:3420017/1‑140 (MQ=255)
ctctTATCTTATTGATAAAATGGATTTATGTCCCTACGTGCG‑CCCACAGCCCGCAACAATGATCAACATGACGCAAAGCGCAATCAACGAACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACTCCATCCAAAACGCGCAGcc > 2:1135761/1‑140 (MQ=255)
tcttatTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCa < 2:887643/140‑1 (MQ=255)
tatTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACg < 1:8109557/140‑1 (MQ=255)
tatTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACg > 2:6803656/1‑140 (MQ=255)
atTGATAAATTGTATTTATCTTCCGACGTGCGACCA‑CAGCACGCAACAATGATCAACAAGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCTCTCCATCCACAACGCTCAGCAACATCAAAGc > 2:10454952/1‑140 (MQ=255)
atTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACGc > 2:2026455/1‑140 (MQ=255)
atTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACGc > 2:5650798/1‑140 (MQ=255)
atTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACGc < 2:9083954/140‑1 (MQ=255)
atTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACGc > 2:11074242/1‑140 (MQ=255)
atTGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACGc > 1:6146643/1‑140 (MQ=255)
ttGATAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACGcc > 1:1228424/1‑140 (MQ=255)
aTAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACGCCGTg < 1:4766383/140‑1 (MQ=255)
aTAAAATGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACGCCGTg < 1:9769965/140‑1 (MQ=255)
aaaaTGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACGCCGTGCa > 1:4419053/1‑140 (MQ=255)
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aaaaTGGATTTATGTTCCTACGTGCGCCCC‑CAGCCCGCAACAATGATCAACATGCCGCAAAGCGCAATCAACGCACCCGTCCAGTCATAAAGAGTCAGTTTCACGCCATCCACAACGCGCAGCCACATCAACGCCGTGCa > 1:10820694/1‑140 (MQ=255)
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|
| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |