Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R3
|
782 |
676.6 |
23254289 |
97.6% |
22696186 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,960,614 |
C→T |
A192A (GCG→GCA) |
ptrA ← |
pitrilysin |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,960,614 | 0 | C | T | 99.8%
| 2443.0
/ NA
| 639 | A192A (GCG→GCA) | ptrA | pitrilysin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (311/327); minor base G (1/0); total (312/327) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.88e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 663 total aligned reads displayed.
TTACTGTAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGCGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGGTTCAGCAATAGCAT > NZ_CP025268/2960477‑2960750
|
ataCTGTACATAACCGCCTTCATCAACTCGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTgtgc < 1:8299932/139‑1 (MQ=255)
tGTAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCggg < 1:7016201/140‑1 (MQ=255)
tGTAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCggg < 2:3259323/140‑1 (MQ=255)
tAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGtt > 1:6184521/1‑140 (MQ=255)
tAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGtt > 1:7452971/1‑140 (MQ=255)
tAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGtt > 1:4234695/1‑140 (MQ=255)
tAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGtt > 2:613024/1‑140 (MQ=255)
tAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGtt > 2:2080523/1‑140 (MQ=255)
tAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTACTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGtt > 1:10021785/1‑140 (MQ=255)
aTAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAAt < 1:9093111/140‑1 (MQ=255)
ccGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGtt > 1:9386155/1‑140 (MQ=255)
cGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGttt < 2:5746871/140‑1 (MQ=255)
cGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGttt < 2:10598447/140‑1 (MQ=255)
cGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGttt < 1:3347468/140‑1 (MQ=255)
ccTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCt > 1:4967935/1‑140 (MQ=255)
ccTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCt > 1:9719207/1‑140 (MQ=255)
ttCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTgc > 2:7225424/1‑140 (MQ=255)
tcatcaAATTGGCGGACTAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGCATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTgcg < 2:9565877/140‑1 (MQ=255)
tcatcaAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTgcg < 1:1751853/140‑1 (MQ=255)
tcatcaAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTgcg < 1:3664287/140‑1 (MQ=255)
tcatcaAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTgcg < 1:3248070/140‑1 (MQ=255)
tcatcaAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTgcg < 1:2941644/140‑1 (MQ=255)
tcatcaAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTGTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTgcg < 1:5138576/140‑1 (MQ=255)
atcaAATTGGCGGAATAGTACGTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCt < 1:1236497/140‑1 (MQ=255)
caAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGGTACCACCAGAAAACATTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGATTCTGCGCTGa < 2:5023654/140‑1 (MQ=255)
aaaTTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGAc < 1:3466906/140‑1 (MQ=255)
aTTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCt > 2:779697/1‑140 (MQ=255)
ttGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCtg > 1:10968557/1‑140 (MQ=255)
gCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGATTGTCGCTTAAAGTGTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGc < 2:10075554/140‑1 (MQ=255)
cGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGcc > 1:2586021/1‑140 (MQ=255)
cGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGcc > 2:5343424/1‑140 (MQ=255)
cGGAAGAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTCCCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGcc < 2:10463539/140‑1 (MQ=255)
tACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCAt < 1:6367742/140‑1 (MQ=255)
ctcGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGt > 1:10322756/1‑140 (MQ=255)
cGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCa > 2:6595766/1‑140 (MQ=255)
ggAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCAcgc > 1:114307/1‑140 (MQ=255)
ggAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCAcgc > 2:3964906/1‑140 (MQ=255)
aaTCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTa < 1:2845781/140‑1 (MQ=255)
aaTCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTa < 1:5376425/140‑1 (MQ=255)
aaTCTATCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGGTTGTCGCTTAAAGGTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTa < 2:7005089/140‑1 (MQ=255)
aTCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCGGTGCCATGCGCATCCCGACACGCGTAc > 2:10344390/1‑140 (MQ=255)
tttCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTAcgcg < 1:2233547/140‑1 (MQ=255)
tCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGcc < 1:5850446/140‑1 (MQ=255)
tCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGcc < 1:7707369/140‑1 (MQ=255)
tCAGCGCCAGCTGCACCGGATTACCAGGGTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGCAAACTGTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCGGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGcc < 2:2563139/140‑1 (MQ=255)
cAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACAGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCCCGCGTACGCGCCa > 2:1298979/1‑140 (MQ=255)
gcCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTAACACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGt > 2:2896438/1‑140 (MQ=255)
tgctgcACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTaa > 2:5824997/1‑140 (MQ=255)
gcACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCa < 1:8528167/140‑1 (MQ=255)
ggATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGtt < 1:11112587/140‑1 (MQ=255)
ggATTACCAGGTTCGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGcc > 2:10776588/1‑123 (MQ=255)
gATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTc > 2:3491632/1‑140 (MQ=255)
aTTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCa < 1:8810538/140‑1 (MQ=255)
ttACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCAc < 1:7882718/140‑1 (MQ=255)
ccAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGc > 2:9238652/1‑140 (MQ=255)
ccAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGc > 2:756284/1‑140 (MQ=255)
ccAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGc > 1:5646510/1‑140 (MQ=255)
cAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCa < 1:4501813/140‑1 (MQ=255)
cAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCa < 2:4503387/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTAc > 2:1389847/1‑140 (MQ=255)
ttGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACg > 2:9704219/1‑140 (MQ=255)
ttGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACg > 1:8029261/1‑140 (MQ=255)
gTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCt < 1:8887510/140‑1 (MQ=255)
tCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTc > 2:4100819/1‑140 (MQ=255)
cTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACg < 2:4791222/140‑1 (MQ=255)
ttAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCTTAACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGt < 2:167625/140‑1 (MQ=255)
tAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGtt < 1:4559353/140‑1 (MQ=255)
tAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGtt > 2:4282609/1‑140 (MQ=255)
tAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGtt < 1:5745896/140‑1 (MQ=255)
tAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGtt < 1:6846027/140‑1 (MQ=255)
aaaGTTTCGAGGGTACCACCAGAAAACATTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAAGGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTc < 1:9555181/140‑1 (MQ=255)
gTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGc < 2:8004290/140‑1 (MQ=255)
gTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGc < 2:11220127/140‑1 (MQ=255)
gTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCGGCGCGGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCAAGGTTAATACAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGc < 2:1899170/140‑1 (MQ=255)
tACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTg < 2:8861296/140‑1 (MQ=255)
accaccAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATTGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGt < 2:2319632/140‑1 (MQ=255)
accaccAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGt > 1:1471561/1‑140 (MQ=255)
accaccAGAAAACTGTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGGTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTCCGCGCCCGGGTTAATTCAGCGTTCTCCGCATTACGCTCACGTTCGGCATCTGTCTTGt > 2:11366426/1‑140 (MQ=255)
caccaGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCg < 1:2046870/140‑1 (MQ=255)
caGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGc < 1:5988745/140‑1 (MQ=255)
aGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCa > 1:3933880/1‑140 (MQ=255)
gAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCGCACGTTCGGCATCTTTCTTGTCGAGCaa > 2:63072/1‑140 (MQ=255)
gAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGGTTATGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGGTATGTCAGCGTTCACCTCTTTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCaa < 2:5193328/140‑1 (MQ=255)
aaaaCTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCaaa > 1:11220709/1‑140 (MQ=255)
cacaatGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGGTCACCTCATTACGCACACGTTCGGCATAATTCTTGTCGAGCAAAgg < 2:9808531/135‑1 (MQ=255)
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aaCTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTATGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAgg < 2:8202784/140‑1 (MQ=255)
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TCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGC < SRR14920200.3687311/151‑1 (MQ=60)
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ATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCA > SRR14920200.407291/1‑151 (MQ=60)
TAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCAC > SRR14920200.11234223/1‑151 (MQ=60)
AGTCCTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACG < SRR14920200.6951787/151‑1 (MQ=60)
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GTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGC > SRR14920200.4584612/1‑151 (MQ=60)
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AATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGT < SRR14920200.5410120/151‑1 (MQ=60)
AATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGT < SRR14920200.9379983/151‑1 (MQ=60)
ATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTT < SRR14920200.7151362/151‑1 (MQ=60)
TCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTA > SRR14920200.10236550/1‑151 (MQ=60)
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TCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTC < SRR14920200.5887149/151‑1 (MQ=60)
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GCCTGCTGCACCGGCTTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGT < SRR14920200.3431926/151‑1 (MQ=60)
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ctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCAC < SRR14920200.10490451/119‑1 (MQ=60)
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AAAGTTTCGAGGGTACCACCAGAAAACATTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAAGGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCT < SRR14920200.9621637/151‑1 (MQ=60)
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GTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTACCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGT > SRR14920200.7629890/1‑151 (MQ=60)
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GTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAA > SRR14920200.7304209/1‑151 (MQ=60)
GTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAA > SRR14920200.11300534/1‑151 (MQ=60)
TACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGG < SRR14920200.2935072/151‑1 (MQ=60)
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ACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATCCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGGT < SRR14920200.904886/151‑1 (MQ=60)
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CCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGGTTCAG > SRR14920200.4433108/1‑151 (MQ=60)
CCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGGTTCAG > SRR14920200.6594213/1‑151 (MQ=60)
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CAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGGTTCAGC < SRR14920200.6026368/151‑1 (MQ=60)
CAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGGTTCAGA > SRR14920200.9686101/1‑151 (MQ=60)
CAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCAGGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGGTTCAGC > SRR14920200.2825008/1‑151 (MQ=60)
AGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGGTTCAGCA < SRR14920200.1634888/151‑1 (MQ=60)
AGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGGTTCAGCA < SRR14920200.2863851/151‑1 (MQ=60)
GAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGGTTCAGCAA < SRR14920200.4030937/151‑1 (MQ=60)
AAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGGTTCAGCAAT < SRR14920200.8891586/151‑1 (MQ=60)
AAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTCCGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGGTTCAGCActc > SRR14920200.1219041/1‑148 (MQ=60)
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ACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGGTTCAGCAATAGC > SRR14920200.7829352/1‑151 (MQ=60)
ACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGGTTCAGCAATAGC > SRR14920200.8960487/1‑151 (MQ=60)
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AACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGGTTCAGCAATAGCATCGGC < SRR14920200.5625650/151‑1 (MQ=60)
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GCAGCGGTTTATTACTGTAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGCGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGGTTCAGCAATAGCATCGGCCAGGCGGTCT > NZ_CP025268/2960466‑2960764
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |