Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R4
|
781 |
701.7 |
22683696 |
98.1% |
22252705 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,960,614 |
C→T |
A192A (GCG→GCA) |
ptrA ← |
pitrilysin |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,960,614 | 0 | C | T | 99.9%
| 2719.0
/ NA
| 705 | A192A (GCG→GCA) | ptrA | pitrilysin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (344/360); minor base G (1/0); total (345/360) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.89e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 732 total aligned reads displayed.
ATTACTGTAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGCGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGGTTCAGCAATAGCAT > NZ_CP025268/2960476‑2960750
|
tGTAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCggg < 1:3293275/140‑1 (MQ=255)
gTAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGt > 2:5461995/1‑140 (MQ=255)
gTAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAAACGGGGTGTGCCGGGt > 1:5308571/1‑140 (MQ=255)
tAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCCGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGtt > 2:1603710/1‑140 (MQ=255)
tAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGTTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGtt > 2:10128313/1‑140 (MQ=255)
tAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGACAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGtt > 1:11074048/1‑140 (MQ=255)
tAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGtt > 1:7858/1‑140 (MQ=255)
tAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGtt > 1:4457072/1‑140 (MQ=255)
tAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGtt > 1:9475992/1‑140 (MQ=255)
tAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGtt > 1:9827986/1‑140 (MQ=255)
tAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGtt > 1:2154668/1‑140 (MQ=255)
tAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTACTCGAGGAAATCTTTCAGATCCTGCTGCTCCGGATTACCAGTTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTATGAAACGGGGTGTGACGGGtt > 2:9614041/1‑140 (MQ=255)
tAAATAACCGCCTGCATCAAATTGGAGGCATAGTAATTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGTATTAGCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTGACCACAAGATATCTTTGGAACGGGGTGTGCCGGGtt > 2:230281/1‑140 (MQ=255)
agaaCCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAAt < 1:4894752/138‑1 (MQ=255)
aTAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGACTAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAAt < 1:7086842/140‑1 (MQ=255)
aTAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAAt < 1:2641603/140‑1 (MQ=255)
cGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGttt < 1:6373859/140‑1 (MQ=255)
cGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGttt < 2:5874824/140‑1 (MQ=255)
ccTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCt > 1:8434026/1‑140 (MQ=255)
ccTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCt > 1:5053880/1‑140 (MQ=255)
ccTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCt > 2:7200879/1‑140 (MQ=255)
ccTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCt > 1:9686923/1‑140 (MQ=255)
ccTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCt > 2:4832498/1‑140 (MQ=255)
ccTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCt > 2:2846124/1‑140 (MQ=255)
ccTTCATCAAATTCGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCt > 1:5942080/1‑140 (MQ=255)
ccTTCATAAAATTGGCGGAATAGTACTTCTAGTGGAAATCATTCAGCGCCTGCTGCACAGGATTACAAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCTAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGATTAATTGTTTCt > 2:1871531/1‑140 (MQ=255)
ttCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTgc > 2:11048774/1‑140 (MQ=255)
ttCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTgc > 2:1356462/1‑140 (MQ=255)
tcatcaCATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTgcg < 1:6772503/140‑1 (MQ=255)
tcatcaCATGCGCGGAAGAGAACTTCTCGTGGAAATCTATCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCCGGTTGGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACATTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTgcg < 2:6354133/140‑1 (MQ=255)
tcatcaACTTGGCGGAATCGTACTTCCCGTGGACATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATGACCAGGTTTGTCGCTTACAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTgcg < 1:8085487/140‑1 (MQ=255)
tcatcaAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGGAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTgcg < 2:7394732/140‑1 (MQ=255)
tcatcaAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTgcg < 1:10230574/140‑1 (MQ=255)
tcatcaAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTgcg < 1:8860628/140‑1 (MQ=255)
tcatcaAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTgcg < 1:9271848/140‑1 (MQ=255)
atcaAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCATTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCt < 2:9194127/140‑1 (MQ=255)
aaaTTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGAc < 2:3655817/140‑1 (MQ=255)
aaaTTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCGGAc < 2:11301273/140‑1 (MQ=255)
aTTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCt > 1:6239401/1‑140 (MQ=255)
aTTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCt > 2:3192561/1‑140 (MQ=255)
aTTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCt < 2:428482/140‑1 (MQ=255)
ttGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTAAAAGTTGCGAGTTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGACGGGTTAATGGTTTCTGAGCTGACAtg > 2:10723560/1‑140 (MQ=255)
gCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATGACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGc < 2:8154508/140‑1 (MQ=255)
aaTAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATg < 2:10342869/140‑1 (MQ=255)
aGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATgcgc < 1:653677/140‑1 (MQ=255)
aGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATgcgc < 2:3889714/140‑1 (MQ=255)
gTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCa > 2:7573906/1‑140 (MQ=255)
tACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGATTAAAGTTTCGAGGTTCCCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCAt > 2:5354074/1‑140 (MQ=255)
tctcGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCg < 2:1720121/140‑1 (MQ=255)
ctcGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGt > 2:4059496/1‑140 (MQ=255)
ctcGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGt > 2:8615365/1‑140 (MQ=255)
ctcGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGt > 2:6137924/1‑140 (MQ=255)
cGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCa > 1:8646281/1‑140 (MQ=255)
cGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCa > 1:1866712/1‑140 (MQ=255)
gTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGGTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTAACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCTCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCAc > 2:502639/1‑140 (MQ=255)
ggAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCAcgc > 2:6440398/1‑140 (MQ=255)
tCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTAcg < 1:5515021/140‑1 (MQ=255)
tttCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTAcgcg < 2:3107225/140‑1 (MQ=255)
tCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGcc < 1:2747035/140‑1 (MQ=255)
tCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGcc < 1:7343217/140‑1 (MQ=255)
tCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGcc > 1:9151872/1‑140 (MQ=255)
tCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGcc < 2:8452188/140‑1 (MQ=255)
tCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGGTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGcc < 2:6633558/140‑1 (MQ=255)
tCAGCGCCTGCTGCACCGGATGACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGcc < 1:10590497/140‑1 (MQ=255)
ccTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGtt > 1:8208824/1‑140 (MQ=255)
ctgctgCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTa > 1:1523792/1‑140 (MQ=255)
tgctgcACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAATTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAAACGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTaa > 2:5665130/1‑140 (MQ=255)
ctgcACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAAtt < 1:6131540/140‑1 (MQ=255)
ctgcACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAAtt < 1:3598192/140‑1 (MQ=255)
aCCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGc < 2:2004796/140‑1 (MQ=255)
ggATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGtt < 2:2473529/140‑1 (MQ=255)
aTTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCa < 1:10790996/140‑1 (MQ=255)
ccAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGc > 1:11277683/1‑140 (MQ=255)
ggTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCAtt > 1:308762/1‑140 (MQ=255)
ggTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCAtt > 2:7761166/1‑140 (MQ=255)
gTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTa < 2:11147859/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTAc > 1:3872585/1‑140 (MQ=255)
tttGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTAc > 2:1195453/1‑140 (MQ=255)
gTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCt < 1:10464116/140‑1 (MQ=255)
gTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACCTTGAACCGGGGTGTGCCGTGTTATTGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCt < 2:3455267/140‑1 (MQ=255)
tCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTc > 1:29320/1‑140 (MQ=255)
tAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGTGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGtt < 1:4089131/140‑1 (MQ=255)
tAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGtt < 1:10079142/140‑1 (MQ=255)
tAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGtt < 1:1644361/140‑1 (MQ=255)
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CTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGGTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGTGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGGCACGCGTACGCGCCCTGGTTAA > SRR14920199.7223321/1‑151 (MQ=60)
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CGGCAGCGGTTTATTACTGTAAATAACCGCCTTCATCAAATTGGCGGAATAGTACTTCTCGTGGAAATCTTTCAGCGCCTGCTGCACCGGATTACCAGGTTTGTCGCTTAAAGTTTCGAGGTTACCACCAGAAAACTTTGAACCGGGGTGCGCCGGGTTAATGGTTTCTGCGCTGACCTGTGCCATGCGCATCCCGTCACGCGTACGCGCCATGGTTAATTCAGCGTTCACCGCATTACGCTCACGTTCGGCATATTTCTTGTCGAGCAAAGGTTCAGCAATAGCATCGGCCAGGCGGTCT > NZ_CP025268/2960464‑2960764
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |