Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F15 I1 R2
|
781 |
700.4 |
23289492 |
98.5% |
22940149 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NZ_CP025268 |
449,814 |
T→C |
T283A (ACT→GCT) |
cyoA ← |
cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NZ_CP025268 | 449,814 | 0 | T | C | 100.0%
| 2694.0
/ NA
| 770 | T283A (ACT→GCT) | cyoA | cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (521/249); total (521/249) |
Only 100 of 770 total aligned reads displayed.
TAATTTTCCGAACATCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGTCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACATGGTGTTCGGCGACTGCTTCGCT > NZ_CP025268/449677‑449950
|
tAATTTTCCGAACATCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCa > 2:11597588/1‑140 (MQ=255)
tAATTTTCCGAACATCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCa > 1:5331155/1‑140 (MQ=255)
tAATTTTCCGAACATCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCAGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTGCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCa > 2:9551415/1‑140 (MQ=255)
aaTTTTCCGAACATCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCAt < 1:4372244/140‑1 (MQ=255)
aaTTGTCCGAACATCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCAt < 1:7136639/140‑1 (MQ=255)
aTTTTCCGAACATCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATa < 1:1406628/140‑1 (MQ=255)
tCCGAACATCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACt > 1:6206064/1‑140 (MQ=255)
tCCGAACATCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCGGGGTCATGTCCATGCTCTTAACGTGAGCCCTAAACt > 2:8334696/1‑140 (MQ=255)
ttcttcCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCg < 1:3309580/140‑1 (MQ=255)
ccacAACCCCGTTCATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCAGGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCAATGCTCTTACCGTGAGCCATAATCTTGTTAATTACATCGGCtaa > 2:2344260/4‑140 (MQ=255)
ccTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCaaa > 1:3918845/1‑140 (MQ=255)
ccTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCaaa > 2:3313815/1‑140 (MQ=255)
ccTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGATCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCaaa > 2:9113332/1‑140 (MQ=255)
cTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAAc > 2:1560672/1‑140 (MQ=255)
tCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACa < 1:6603269/140‑1 (MQ=255)
ccTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTg > 1:10421236/1‑140 (MQ=255)
tttAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGt > 2:580775/1‑140 (MQ=255)
tttAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGt > 1:2146418/1‑140 (MQ=255)
tGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCAc < 1:4670076/140‑1 (MQ=255)
tGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCAc < 2:5645940/140‑1 (MQ=255)
ggCGGAGTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCAGGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGt < 1:10008354/140‑1 (MQ=255)
gCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGtt > 1:635234/1‑140 (MQ=255)
cGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGt < 1:563694/126‑1 (MQ=255)
cGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTg < 2:8184307/140‑1 (MQ=255)
cGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTg < 1:781218/140‑1 (MQ=255)
ttCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGgaga < 2:7897168/140‑1 (MQ=255)
tCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGaa < 2:8754199/140‑1 (MQ=255)
gcgTGGCTCATGTCCATGCCTTCCCTACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAata < 1:9631874/140‑1 (MQ=255)
gCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTACa > 1:1821442/1‑140 (MQ=255)
cTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGATCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCAc < 2:6303374/140‑1 (MQ=255)
tGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTgg < 2:4047827/140‑1 (MQ=255)
tGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTgg < 2:3720305/140‑1 (MQ=255)
aagCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTATTTACAACGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTa > 2:9736634/3‑140 (MQ=255)
tGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACACGTCTGGTTTCACGGTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTAt > 1:11129342/1‑140 (MQ=255)
tGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTAt > 2:6800087/1‑140 (MQ=255)
tGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTAt > 1:6941804/1‑140 (MQ=255)
tGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTGGTAt > 1:8072907/1‑140 (MQ=255)
tGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCGGGTTGTAt > 1:2735476/1‑140 (MQ=255)
cTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCg > 1:2272999/1‑140 (MQ=255)
ttCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGc > 1:375355/1‑140 (MQ=255)
ttCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGc < 1:5872820/140‑1 (MQ=255)
tCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCt > 2:10788943/1‑140 (MQ=255)
tCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCt > 1:9718717/1‑140 (MQ=255)
tCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTAGTCGCt > 2:11033830/1‑140 (MQ=255)
tCCATACCGTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCAAACACTTGTTAATTACATCGGCAAACACGTCTGTTTTCACGATGGAGAAATCTTCCAACTGGGAGTATTCGca > 2:725992/1‑139 (MQ=255)
ccATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTa > 1:4502593/1‑140 (MQ=255)
ccATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCAATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTa > 2:2230079/1‑140 (MQ=255)
cATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAg > 2:3574177/1‑140 (MQ=255)
tCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGc > 2:10400148/1‑140 (MQ=255)
tCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGc > 1:1086744/1‑140 (MQ=255)
cGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGcc < 2:9869079/140‑1 (MQ=255)
gtgtGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCa > 2:6047998/1‑140 (MQ=255)
tgtgCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAg > 2:11420368/1‑140 (MQ=255)
gtgCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGt > 1:11402522/1‑140 (MQ=255)
cgcTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGtttt < 1:4980264/140‑1 (MQ=255)
gcTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACTTCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTCTTCGCTAGGCGCGGCCAGttttt > 2:7466195/1‑140 (MQ=255)
gcTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCAGGTTGTATTCGCTCGGCGCGGCCAGttttt > 2:4660259/1‑140 (MQ=255)
tgCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTATGCGCGGCCAGTTTTTCGaa > 2:10517521/1‑140 (MQ=255)
gCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCACACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGacc < 1:6783711/140‑3 (MQ=255)
cTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACg > 1:738022/1‑140 (MQ=255)
cACCTTCTGCCTGGCTCATGACCATGCTCATACCGTGAGCCATCAACTTTTTAATTACATCGGCACACAAGTCATGTGTCACGATGGAGAAATATTACACCTGTTCGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCa < 2:658065/140‑1 (MQ=255)
cccTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAg < 2:7105667/139‑1 (MQ=255)
aCCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAg < 2:1350301/140‑1 (MQ=255)
aCCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAg < 2:4886861/140‑1 (MQ=255)
aCCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAg < 1:7633077/140‑1 (MQ=255)
aCCTTCTGGCAGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAAGTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATAGTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAg < 1:8983833/140‑1 (MQ=255)
cTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGcc < 2:5300459/140‑1 (MQ=255)
cTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGcc < 1:2946513/140‑1 (MQ=255)
cTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGcc < 1:10189274/140‑1 (MQ=255)
ctggctggGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATg > 1:2585545/1‑140 (MQ=255)
ctggctggGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATg > 1:3411515/1‑140 (MQ=255)
ctggctggGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATg > 1:8740853/1‑140 (MQ=255)
ctggctggGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATg > 1:8348893/1‑140 (MQ=255)
ggctggGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTc < 1:3549438/140‑1 (MQ=255)
ggTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACa > 1:9964094/1‑140 (MQ=255)
ggTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACa > 1:5469140/1‑140 (MQ=255)
ggTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACa > 2:1998364/1‑140 (MQ=255)
ggTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACa > 1:7960671/1‑140 (MQ=255)
ggTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAAATTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACa > 2:2703530/1‑140 (MQ=255)
gTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACAt < 2:1017879/140‑1 (MQ=255)
tCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGAGAGGCCAGTTTTTCGATCGCAGCCATGTCAGACATg > 2:7568087/1‑140 (MQ=255)
cATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACATgg > 2:11192379/1‑140 (MQ=255)
tGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACATGgtg < 1:6069515/140‑1 (MQ=255)
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GATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTACA > SRR14920161.1833493/1‑151 (MQ=60)
ATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCAC < SRR14920161.991458/151‑1 (MQ=60)
TTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACC > SRR14920161.2658352/1‑151 (MQ=60)
TTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACC > SRR14920161.4834231/1‑151 (MQ=60)
TTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACC < SRR14920161.1436376/151‑1 (MQ=60)
CCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTG > SRR14920161.3652565/1‑151 (MQ=60)
CCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTG > SRR14920161.4919550/1‑151 (MQ=60)
CCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTG > SRR14920161.11225760/1‑151 (MQ=60)
CGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGG > SRR14920161.10926622/1‑151 (MQ=60)
GCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCCTACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGT < SRR14920161.9696526/151‑1 (MQ=60)
GCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGT < SRR14920161.6681222/151‑1 (MQ=60)
GCGTGGCTCATGTCCATGCCGTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGT < SRR14920161.8222628/151‑1 (MQ=60)
GCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACACGTCTGGTTTCACGGTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTAT > SRR14920161.11203749/1‑151 (MQ=60)
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GTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGGATTCGCTA > SRR14920161.8841097/1‑151 (MQ=60)
CCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGG > SRR14920161.8058301/1‑151 (MQ=60)
ATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCG < SRR14920161.9289852/151‑1 (MQ=60)
GCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCG > SRR14920161.7621996/1‑151 (MQ=60)
CTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCNCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGC < SRR14920161.7049295/151‑1 (MQ=60)
TTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCC < SRR14920161.5912187/151‑1 (MQ=60)
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ACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGAC < SRR14920161.10954006/151‑1 (MQ=60)
CCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACA > SRR14920161.1147023/1‑151 (MQ=60)
CCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGCCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACA < SRR14920161.11091909/151‑1 (MQ=60)
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CTGCATCAAGTGATAATTTTCCGAACATCTTTATTCTTCCTCAACCCCTTTAATGGGCGGATTCCGCGTGGCTCATGTCCATGCCTTCCATACCTTCGTGTGCGCTGTGCTCACCTTCTGGCTGGGTCATGTCCATGCTCTTACCGTGAGTCATAAACTTGTTAATTACATCGGCAAACAAGTCTGGTTTCACGTTGGAGAAATATTCCACCTGGTTGTATTCGCTAGGCGCGGCCAGTTTTTCGAACGCAGCCATGTCAGACATGGTGTTCGGCGACTGCTTCGCTTTTGCGACCCACTG > NZ_CP025268/449664‑449964
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |