Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R2
|
781 |
700.4 |
23289492 |
98.5% |
22940149 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,785,155 |
C→T |
pseudogene (1594/4580 nt) |
ypjA ← |
adhesin‑like autotransporter YpjA/EhaD |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,785,155 | 0 | C | T | 99.7%
| 2323.4
/ NA
| 608 | pseudogene (1594/4580 nt) | ypjA | adhesin‑like autotransporter YpjA/EhaD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (297/308); minor base A (2/0); total (299/309) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.42e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 612 total aligned reads displayed.
CTACATTTTTAGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGCCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGT > NZ_CP025268/2785018‑2785291
|
tccATTTTGAGCTTCTGAATTACTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCt > 2:1228747/3‑140 (MQ=255)
tACATTTTTAGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCt > 2:6764451/1‑140 (MQ=255)
tACATGTTTAGCTTCTGAAGTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCt < 2:10477842/140‑1 (MQ=255)
aCATTTTTAGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTg < 1:6991641/140‑1 (MQ=255)
cATTTTTAGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGa < 1:10008133/140‑1 (MQ=255)
cATTTTTAGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGa < 1:5727141/140‑1 (MQ=255)
cATTTTTAGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGa > 1:365396/1‑140 (MQ=255)
cATTTTTAGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGa < 1:2522022/140‑1 (MQ=255)
cATTTTTAGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGa < 1:8698908/140‑1 (MQ=255)
tttAGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCt > 2:372814/1‑140 (MQ=255)
aGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGACCCTCCa > 1:8330225/1‑140 (MQ=255)
aGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGAGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTATCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCa > 2:647604/1‑140 (MQ=255)
gCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAg > 2:9362505/1‑140 (MQ=255)
ttCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGaa > 1:5107250/1‑140 (MQ=255)
cTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCC‑TCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAAcgc < 2:8185860/140‑1 (MQ=255)
tGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAAcgc < 1:6325780/140‑1 (MQ=255)
tGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAAcgc < 2:5364098/140‑1 (MQ=255)
aaTTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTGGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAAcgccg < 1:234198/140‑1 (MQ=255)
ttCCTGATGTAGAAAGCATCACCATCACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACgccgcc < 2:11416599/140‑1 (MQ=255)
ttCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACgccgcc < 2:704428/140‑1 (MQ=255)
aTGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCattatt < 2:8046109/140‑1 (MQ=255)
aTGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCattatt < 1:4731185/140‑1 (MQ=255)
aTGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCattatt < 2:5785643/140‑1 (MQ=255)
aGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGGTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGt < 1:11194500/140‑1 (MQ=255)
gAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTc < 1:9995562/140‑1 (MQ=255)
cATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTg < 2:4256922/140‑1 (MQ=255)
aTCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGc > 1:5894186/1‑140 (MQ=255)
tCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCt > 2:4365556/1‑140 (MQ=255)
tCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCt < 1:2754984/140‑1 (MQ=255)
aCCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTAt < 2:10745280/140‑1 (MQ=255)
aCCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTAt < 1:9106337/140‑1 (MQ=255)
aCCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTAt < 1:2102132/140‑1 (MQ=255)
ccATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATc > 1:3378507/1‑140 (MQ=255)
aTAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTg < 2:8875442/140‑1 (MQ=255)
gTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAg > 2:7175098/1‑140 (MQ=255)
ttGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGc > 2:1938281/1‑140 (MQ=255)
ttGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGc > 1:8050127/1‑140 (MQ=255)
ttGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGATTAGCCTCACCACCTTCCTGAACATCCATACCGACGCAATTATTAATTCTGGTGCTCTCTGTTTGAga > 2:9685207/1‑139 (MQ=255)
tGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGcc < 1:7915359/140‑1 (MQ=255)
tGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGcc < 1:5578077/140‑1 (MQ=255)
tGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGAGTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGcc < 2:5952220/140‑1 (MQ=255)
tGGTTCCTTCGAGAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGcc < 2:6307293/140‑1 (MQ=255)
ggTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGcct > 1:3834071/1‑140 (MQ=255)
ggTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGcct > 1:10676155/1‑140 (MQ=255)
ggTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGcct > 1:8908566/1‑140 (MQ=255)
ggTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGcct > 2:7613396/1‑140 (MQ=255)
ggTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGcct > 1:9816399/1‑140 (MQ=255)
tCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGcctcct > 1:8498891/1‑140 (MQ=255)
tCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGAGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGACTCACCACCCTCCTGAACCTCCAGAACGACGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATATGATTAAGcatcct > 2:10190945/1‑140 (MQ=255)
ttCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCt > 1:529803/1‑140 (MQ=255)
ttCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCt > 1:10850818/1‑140 (MQ=255)
tCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTg < 2:5026116/140‑1 (MQ=255)
aTAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTATGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGAc < 1:7849516/140‑1 (MQ=255)
aTAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGAc < 1:10560319/140‑1 (MQ=255)
aTAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGAc < 2:2469214/140‑1 (MQ=255)
tacgtgtTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACa > 2:2074559/4‑140 (MQ=255)
aGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAAt < 1:4893421/140‑1 (MQ=255)
ttCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGc > 2:160391/1‑140 (MQ=255)
ttCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGc > 2:4200324/1‑140 (MQ=255)
ccGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCtt > 2:11264379/1‑140 (MQ=255)
ccGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCtt > 2:4756434/1‑140 (MQ=255)
ggAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTAc > 2:356002/1‑140 (MQ=255)
aGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCg < 1:5222406/140‑1 (MQ=255)
ggTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGc < 1:11545074/140‑1 (MQ=255)
ggTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGc < 2:1464096/140‑1 (MQ=255)
ggTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGc < 1:3995229/140‑1 (MQ=255)
gTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGcc > 2:5180994/1‑140 (MQ=255)
gTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGcc > 2:9178530/1‑140 (MQ=255)
gTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGcc > 1:10156740/1‑140 (MQ=255)
gTCGTGGAAGCAACTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGcc > 2:8303515/1‑140 (MQ=255)
cGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTCTCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACATTCAGCTTACCGCCAg > 2:10850775/1‑140 (MQ=255)
cGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAg > 1:6505344/1‑140 (MQ=255)
tGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTa > 2:4573723/1‑140 (MQ=255)
gAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATc < 1:9237562/140‑1 (MQ=255)
gAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATc < 1:1233895/140‑1 (MQ=255)
gAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATc < 2:1779191/140‑1 (MQ=255)
aGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCaa < 1:11122058/140‑1 (MQ=255)
aGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCaa < 2:5482583/140‑1 (MQ=255)
gCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAAt > 2:10963601/1‑140 (MQ=255)
tGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTAt > 1:6835914/1‑140 (MQ=255)
ccgccgGATTGTTNCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTNCCGCCAGTATCAATGGTAGTAttttt > 1:6121140/1‑140 (MQ=255)
ccgccgGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTCTCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACACTCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTAttttt > 2:2323942/1‑140 (MQ=255)
ccgccgGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACACTCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTAttttt > 2:4037010/1‑140 (MQ=255)
ccgGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGc > 1:4311583/1‑115 (MQ=255)
ggATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCg < 2:7846889/140‑1 (MQ=255)
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ggATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCg < 2:2701400/140‑1 (MQ=255)
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GGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCC < SRR14920161.7165748/151‑1 (MQ=60)
GGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCC < SRR14920161.5819889/151‑1 (MQ=60)
GATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGGATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCA > SRR14920161.6894747/1‑151 (MQ=60)
ATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCAC < SRR14920161.4397582/151‑1 (MQ=60)
TTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACT > SRR14920161.921821/1‑151 (MQ=60)
GTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTAC > SRR14920161.2998100/1‑151 (MQ=60)
GTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTAC < SRR14920161.1074222/151‑1 (MQ=60)
GTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTAC > SRR14920161.3386437/1‑151 (MQ=60)
GTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTAC > SRR14920161.356587/1‑151 (MQ=60)
GTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTAC < SRR14920161.7958935/151‑1 (MQ=60)
TGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCG < SRR14920161.6480322/151‑1 (MQ=60)
TGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCG > SRR14920161.2398639/1‑151 (MQ=60)
GCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTAACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGT > SRR14920161.10526496/1‑151 (MQ=60)
CTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTC > SRR14920161.1123552/1‑151 (MQ=60)
CTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTC > SRR14920161.9807193/1‑151 (MQ=60)
CTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTC < SRR14920161.9635931/151‑1 (MQ=60)
CAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAG < SRR14920161.11266165/151‑1 (MQ=60)
CAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAG < SRR14920161.6607646/151‑1 (MQ=60)
CAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAG > SRR14920161.2507768/1‑151 (MQ=60)
CAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAG > SRR14920161.5593199/1‑151 (MQ=60)
ACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTCTCTGTGTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCCGTATCAATGGTAGTATTTGTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGgg > SRR14920161.10991972/1‑149 (MQ=60)
ACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTT < SRR14920161.4698523/151‑1 (MQ=60)
ACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTT > SRR14920161.5204226/1‑151 (MQ=60)
ACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTT > SRR14920161.7347016/1‑151 (MQ=60)
CATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTC > SRR14920161.5039842/1‑151 (MQ=60)
ATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCG > SRR14920161.3506721/1‑151 (MQ=60)
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TCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTATTTT > SRR14920161.5969754/1‑151 (MQ=60)
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ACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTATTTTCC < SRR14920161.6244683/151‑1 (MQ=60)
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CCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCA > SRR14920161.405636/1‑151 (MQ=60)
CGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCAC < SRR14920161.183069/151‑1 (MQ=60)
GTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACA > SRR14920161.8903074/1‑151 (MQ=60)
GTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACA > SRR14920161.11683425/1‑151 (MQ=60)
GTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACA > SRR14920161.396146/1‑151 (MQ=60)
TCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAA > SRR14920161.388416/1‑151 (MQ=60)
|
GCGTTTTCCAGCACTACATTTTTAGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGCCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAA > NZ_CP025268/2785005‑2785305
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
