Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R2
|
781 |
700.4 |
23289492 |
98.5% |
22940149 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
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mutation |
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| RA |
NZ_CP025268 |
2,828,512 |
T→C |
N362S (AAC→AGC) |
mltB ← |
lytic murein transglycosylase B |
| |
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new |
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reads |
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product |
| * | NZ_CP025268 | 2,828,512 | 0 | T | C | 99.9%
| 2429.6
/ NA
| 695 | N362S (AAC→AGC) | mltB | lytic murein transglycosylase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (207/487); minor base A (0/1); total (207/488) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 733 total aligned reads displayed.
CTGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGTTAC‑T‑TACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATC > NZ_CP025268/2828376‑2828645
|
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tGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctac‑t > 2:7251020/1‑140 (MQ=255)
tGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctac‑t > 1:10712348/1‑140 (MQ=255)
gtcagtcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctac‑tg > 2:11370275/1‑139 (MQ=255)
tcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTc > 1:1825083/1‑140 (MQ=255)
tcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTc > 2:11141165/1‑140 (MQ=255)
tcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTGTCGTCAGGAAGATGGTGTGGGCGGTGCAATGTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGCAGCGCACGCCCCCCTCTTGTACATAGCTAC‑TGTACTc > 2:9226701/1‑140 (MQ=255)
aaaaTTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTcgcg < 1:191583/140‑1 (MQ=255)
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tATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCgcgccagcg > 1:7794461/1‑140 (MQ=255)
tGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTANTCgcgccagcgcc < 1:9972921/140‑1 (MQ=255)
gACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGc < 1:11091567/140‑1 (MQ=255)
gACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGc < 1:7451299/140‑1 (MQ=255)
gACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGc < 1:399566/140‑1 (MQ=255)
gACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGc < 2:5175901/140‑1 (MQ=255)
aCAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCt < 2:2536098/140‑1 (MQ=255)
aCAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCt < 2:6770656/140‑1 (MQ=255)
gATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTc < 1:2213694/140‑1 (MQ=255)
gATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTCACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGGACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTc < 1:2421176/140‑1 (MQ=255)
tAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCt < 1:10961499/140‑1 (MQ=255)
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cgCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGNGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTa < 1:6144107/139‑1 (MQ=255)
cACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTACATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAAc > 2:8376330/1‑140 (MQ=255)
aCTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACt < 1:6774337/140‑1 (MQ=255)
tttCGTCAGGAAGATGGCGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGc < 1:9285155/140‑1 (MQ=255)
tCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCa > 1:2578258/1‑140 (MQ=255)
cGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTTCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAg > 2:4827218/1‑140 (MQ=255)
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aGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCg < 1:10015137/140‑1 (MQ=255)
gAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGcc > 2:4058826/1‑140 (MQ=255)
taGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCa < 2:2273359/139‑1 (MQ=255)
aaGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAACAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCa < 2:8444264/140‑1 (MQ=255)
gATGGTGTTGGCGTTGCAATTGTACGAGGAGGCTTCCGAACAAACCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTCAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGGTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCAtt < 2:10488075/140‑1 (MQ=255)
tgtTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTa > 1:7545482/1‑140 (MQ=255)
agtTGGCGTTGCAATTTTACGATGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTa < 2:10635913/139‑1 (MQ=255)
ttGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAAt > 1:4616167/1‑140 (MQ=255)
tGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATg < 1:3035217/140‑1 (MQ=255)
ggCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATgg > 1:6863449/1‑140 (MQ=255)
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tGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCt < 2:7948811/140‑1 (MQ=255)
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cAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCtgt < 2:1811580/140‑1 (MQ=255)
aaTTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCtgtg < 1:11510841/140‑1 (MQ=255)
aCGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTa < 1:8032679/140‑1 (MQ=255)
aCGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTa < 2:3628808/140‑1 (MQ=255)
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gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTgg > 1:5728469/1‑139 (MQ=255)
gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 1:491369/140‑1 (MQ=255)
gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 2:7524353/140‑1 (MQ=255)
gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 1:8759537/140‑1 (MQ=255)
gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGAACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 2:3206134/140‑1 (MQ=255)
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tCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATgg > 2:2043069/1‑140 (MQ=255)
cAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGgt > 1:8369372/1‑140 (MQ=255)
aGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGACGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGgtg > 1:9466147/1‑140 (MQ=255)
gAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGCACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGgtgt < 1:5593070/140‑1 (MQ=255)
aaaaaGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAg < 1:8305087/140‑1 (MQ=255)
aaaGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGaa < 1:7373485/140‑1 (MQ=255)
aGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTCGAAGt > 1:2842351/1‑140 (MQ=255)
gATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCgg < 2:1545013/140‑1 (MQ=255)
gATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCgg < 2:1036881/140‑1 (MQ=255)
gATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCgg < 2:5537968/140‑1 (MQ=255)
aTTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGc > 2:1200162/1‑140 (MQ=255)
aTTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGc > 1:1544578/1‑140 (MQ=255)
ttAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCa < 1:6228848/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 1:4338746/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 1:4474660/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 2:4575121/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGATTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 1:10405271/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCATGTAACTAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 2:9467383/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCACCCCTCCTGTCAATAGCTACTT‑TACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAAAGGGTGCTGTGGTTGTAACTGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 2:7714321/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGCGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGCACCTAGCGTC‑TCTACTCGCGCCCGCGCCACGGCTTGTCCAAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAAAGGGTGCTGTGCTTGTACCGGTTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 2:979375/140‑1 (MQ=255)
ccAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAcc > 1:11378952/1‑140 (MQ=255)
agGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCAGTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTAc < 2:9636290/140‑1 (MQ=255)
gggAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAACTAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTAcc < 1:6418911/140‑1 (MQ=255)
gggAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTAcc < 1:3831108/140‑1 (MQ=255)
gggAAGCTCACGCCCCCCTCTGGAAATTAGCTAC‑TGTGAGCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCATAACTGCCAGACCGCCATAGAGTAATGGGTGCTGGGGTTGTTGCGGGAGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTAcc > 2:10728929/1‑140 (MQ=255)
ggAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCa < 1:10256316/140‑1 (MQ=255)
gAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAg < 1:5359390/140‑1 (MQ=255)
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cggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAC < SRR14920161.9483125/115‑1 (MQ=60)
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GCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTAC < SRR14920161.7859637/151‑1 (MQ=60)
GCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTAC < SRR14920161.2616096/151‑1 (MQ=60)
GCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTAC < SRR14920161.3202461/151‑1 (MQ=60)
GCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTAC < SRR14920161.6439180/151‑1 (MQ=60)
GCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCACTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCAATGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGAAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTCCCAGGAC < SRR14920161.7041264/151‑1 (MQ=60)
CCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACT > SRR14920161.7314415/1‑151 (MQ=60)
CAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTG < SRR14920161.9563909/151‑1 (MQ=60)
AGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGG < SRR14920161.3957048/151‑1 (MQ=60)
AGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGG < SRR14920161.3979759/151‑1 (MQ=60)
GAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCctgtctctt > SRR14920161.3511240/1‑142 (MQ=60)
GAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGT < SRR14920161.4979035/151‑1 (MQ=60)
AGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTA > SRR14920161.2752735/1‑151 (MQ=60)
AGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTA < SRR14920161.9473353/151‑1 (MQ=60)
AGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTA < SRR14920161.11621992/151‑1 (MQ=60)
AGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTA < SRR14920161.2276418/151‑1 (MQ=60)
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GGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAG > SRR14920161.11529453/1‑151 (MQ=60)
GGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAG > SRR14920161.5285688/1‑151 (MQ=60)
GGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAG < SRR14920161.5721290/151‑1 (MQ=60)
GGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAG < SRR14920161.746963/151‑1 (MQ=60)
GGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAG > SRR14920161.6322352/1‑151 (MQ=60)
GGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTTTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCTGCAGTCCGTACCAGTACTGGTAGC < SRR14920161.6236862/151‑1 (MQ=60)
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GGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGC < SRR14920161.10324950/151‑1 (MQ=60)
GAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCC > SRR14920161.2568857/1‑151 (MQ=60)
AGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGG > SRR14920161.4639235/1‑151 (MQ=60)
AGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGG > SRR14920161.2166848/1‑151 (MQ=60)
AGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTACCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGG < SRR14920161.1498662/151‑1 (MQ=60)
GCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCtgtc > SRR14920161.588626/1‑147 (MQ=60)
CTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTTACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTG < SRR14920161.3644349/151‑1 (MQ=60)
CTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTG < SRR14920161.9124544/151‑1 (MQ=60)
CTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTG > SRR14920161.2956647/1‑151 (MQ=60)
TCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGC < SRR14920161.6418971/151‑1 (MQ=60)
CACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCC < SRR14920161.3843611/151‑1 (MQ=60)
CCGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTACCGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCA < SRR14920161.2724077/151‑1 (MQ=60)
CGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAA > SRR14920161.8917215/1‑151 (MQ=60)
CCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACA < SRR14920161.10643869/151‑1 (MQ=60)
CCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACA < SRR14920161.668778/151‑1 (MQ=60)
CCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACAT < SRR14920161.1268686/151‑1 (MQ=60)
CCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACctgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgtactagatctcgtatgccgtct > SRR14920161.4373199/1‑93 (MQ=60)
CCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATC > SRR14920161.8369387/1‑151 (MQ=60)
CCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATC < SRR14920161.10208377/151‑1 (MQ=60)
CTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAG > SRR14920161.270404/1‑151 (MQ=60)
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TCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGA < SRR14920161.4983538/151‑1 (MQ=60)
CTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGAC > SRR14920161.7658550/1‑151 (MQ=60)
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TGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGC < SRR14920161.5345205/151‑1 (MQ=60)
TGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGC > SRR14920161.8391764/1‑151 (MQ=60)
GTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCA > SRR14920161.9844543/1‑151 (MQ=60)
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AGTCATCACAACCTCTGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGTTAC‑T‑TACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGC > NZ_CP025268/2828362‑2828655
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |