Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R4
|
781 |
701.7 |
22683696 |
98.1% |
22252705 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,828,512 |
T→C |
N362S (AAC→AGC) |
mltB ← |
lytic murein transglycosylase B |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,828,512 | 0 | T | C | 99.4%
| 2460.5
/ NA
| 706 | N362S (AAC→AGC) | mltB | lytic murein transglycosylase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (226/476); minor base A (4/0); total (230/476) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.11e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 742 total aligned reads displayed.
TCTGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGTTACT‑TACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCC > NZ_CP025268/2828375‑2828646
|
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tctGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGcta < 2:10608034/140‑1 (MQ=255)
gtcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctactgtact < 1:6165844/140‑6 (MQ=255)
tcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTc > 1:5609847/1‑140 (MQ=255)
tcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTc > 2:6807576/1‑140 (MQ=255)
aaaaaTTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTcgc > 2:8976900/1‑140 (MQ=255)
aaaaaTTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTcgc > 2:5090461/1‑140 (MQ=255)
actttATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAAATTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCgcgcc < 2:10275699/138‑1 (MQ=255)
aaTTGATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCgcgcc < 2:6462462/140‑1 (MQ=255)
tGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCgcgccagcgcc < 1:10004978/140‑1 (MQ=255)
tGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCgcgccagcgcc < 1:3420881/140‑1 (MQ=255)
ccGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCAc < 1:2163680/140‑1 (MQ=255)
gACCAGATAGCACTTTCGTCCGGCAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTGACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTCCTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGc < 1:1806048/140‑1 (MQ=255)
gACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGc < 1:2321566/140‑1 (MQ=255)
gACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTAAGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGc > 1:6576248/1‑140 (MQ=255)
aCAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGAGTCAGAAACAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCGTGTAAATAGCGACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCt < 2:7633673/140‑1 (MQ=255)
gATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTc < 2:2757290/140‑1 (MQ=255)
tAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCt < 2:5038916/140‑1 (MQ=255)
aGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTa > 2:7544983/1‑140 (MQ=255)
cACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCTCGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAAc < 1:3953899/140‑1 (MQ=255)
cACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAAc > 2:1559333/1‑140 (MQ=255)
tCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCa > 1:4122599/1‑140 (MQ=255)
tCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCa > 1:3658224/1‑140 (MQ=255)
tCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCa > 2:9419064/1‑140 (MQ=255)
tCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCa > 1:10773223/1‑140 (MQ=255)
tCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCa > 1:5280643/1‑140 (MQ=255)
gTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGa < 1:4902969/140‑1 (MQ=255)
tCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGAc < 2:4208933/140‑1 (MQ=255)
aGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCg < 1:6915902/140‑1 (MQ=255)
gAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGcc < 1:4757795/140‑1 (MQ=255)
gAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGcc < 1:5086571/140‑1 (MQ=255)
gAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGcc < 2:8539813/140‑1 (MQ=255)
ccaGATGCGGTTGGCGTTGCAATTTTCCGCGGCGGAGTCAGAACAAAGCTGATTAGCCAGAGGGCAGCTCACGCCCCCCTCGTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTAGTCCTACCTGCCAGACCGcc < 2:9704693/138‑1 (MQ=255)
aaGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCa < 1:11182339/140‑1 (MQ=255)
aaGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCa < 2:6960242/140‑1 (MQ=255)
aaGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCa < 1:2517158/140‑1 (MQ=255)
aaGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCa < 1:8284043/140‑1 (MQ=255)
aaGATGGTGTTGGCGTTGCAATAGTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCa < 1:10213169/140‑1 (MQ=255)
aaGATGGTGGTGGCGTTGCAATTTGACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCGGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGccc < 2:8088536/140‑2 (MQ=255)
aGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGACAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCAt < 2:2975447/140‑1 (MQ=255)
aGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCAt < 1:7300359/140‑1 (MQ=255)
aGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCAt < 1:3048406/140‑1 (MQ=255)
gtTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTaa > 2:2164648/1‑140 (MQ=255)
gtGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATGAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCAGTGCGTAAt < 1:10404183/139‑1 (MQ=255)
tGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGATACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATg > 2:4813868/1‑140 (MQ=255)
gTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTg < 1:10957354/140‑1 (MQ=255)
ttGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATGAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGc < 2:8772051/140‑1 (MQ=255)
tGCAATTTTACGAGGAGGCTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAAAAGAAAATGTACTCGCGCCATCGCCAAGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATGGCGTAATGGGTGCt > 2:86352/1‑140 (MQ=255)
tGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCt < 1:7642410/140‑1 (MQ=255)
tGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCt < 1:11314091/140‑1 (MQ=255)
tGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCt < 1:8707334/140‑1 (MQ=255)
gCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCtg > 1:6854004/1‑140 (MQ=255)
gCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCtg > 1:9318914/1‑140 (MQ=255)
gCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCtg > 1:4533274/1‑140 (MQ=255)
gCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCtg > 2:2395025/1‑140 (MQ=255)
aaTTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCtgtg < 1:3794115/140‑1 (MQ=255)
aCGAGGAGGATTCAGAACAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCGTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTa < 1:6301867/140‑1 (MQ=255)
aCGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTa < 1:290125/140‑1 (MQ=255)
gaggaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCATGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACggg < 2:4034275/140‑1 (MQ=255)
aggaTTCAGACCAAAGCTGATTAGCCAGAGGGACGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGt < 2:5899159/140‑1 (MQ=255)
aggaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGt > 1:133404/1‑140 (MQ=255)
aggaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGt < 1:5121873/140‑1 (MQ=255)
gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTACATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGATTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 2:4413168/140‑1 (MQ=255)
gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 1:7056876/140‑1 (MQ=255)
gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGAGCTGTGGTTGTAACGGGTGa > 1:9958125/1‑140 (MQ=255)
aTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGAt < 2:6042441/140‑1 (MQ=255)
gAAACAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGgtgt < 1:9554370/140‑1 (MQ=255)
gAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGTTTGTAACGGGTGATGgtgt < 2:3555628/140‑1 (MQ=255)
gAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGgtgt < 2:7034787/140‑1 (MQ=255)
gAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGgtgt < 2:5465724/140‑1 (MQ=255)
aaaGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGaa > 2:6553582/1‑140 (MQ=255)
aaGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAg < 2:6245715/140‑1 (MQ=255)
aaGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGAGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGgtgtcgtag > 2:7745519/1‑135 (MQ=255)
tGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAACTAGCTACTGTACGCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCg < 2:5274006/140‑1 (MQ=255)
ttAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCa < 2:4604215/140‑1 (MQ=255)
ttAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCa < 1:1067420/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 1:8036072/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 1:7784041/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 1:2021949/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 2:3282223/140‑1 (MQ=255)
gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCATAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 2:5738186/140‑1 (MQ=255)
agagGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGt > 1:5815054/1‑140 (MQ=255)
agGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTAc < 2:1236673/140‑1 (MQ=255)
gggAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTAcc < 1:9702825/140‑1 (MQ=255)
gggAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTAcc > 2:8243560/1‑140 (MQ=255)
ggAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACTGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCa < 1:921964/140‑1 (MQ=255)
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GCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTAC < SRR14920199.695897/151‑1 (MQ=60)
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GCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTAC < SRR14920199.5238650/151‑1 (MQ=60)
GCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAAGAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTAC < SRR14920199.8307414/151‑1 (MQ=60)
CAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTG < SRR14920199.1525567/151‑1 (MQ=60)
CAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTG < SRR14920199.5121124/151‑1 (MQ=60)
AGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTACATCGCTACGG‑TACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGG < SRR14920199.11069534/151‑1 (MQ=60)
AGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGG < SRR14920199.9429067/151‑1 (MQ=60)
AGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTA < SRR14920199.3021574/151‑1 (MQ=60)
AGGGAAGCTCACCCCCCCCTCTAGTAAATAGCTAC‑TGTACACGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTA < SRR14920199.10965400/151‑1 (MQ=60)
GGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAG < SRR14920199.9746817/151‑1 (MQ=60)
GGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGC < SRR14920199.4998478/151‑1 (MQ=60)
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GAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCC < SRR14920199.4343532/151‑1 (MQ=60)
GAACCTCCCGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCAGTGCTTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCC < SRR14920199.6893160/151‑1 (MQ=60)
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AGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGG < SRR14920199.3193834/151‑1 (MQ=60)
GCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTCGCCGGT > SRR14920199.4623226/1‑151 (MQ=60)
GCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGT > SRR14920199.8597586/1‑151 (MQ=60)
GCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGT > SRR14920199.5140455/1‑151 (MQ=60)
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GCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAAC < SRR14920199.8354711/151‑1 (MQ=60)
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CCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACAGC > SRR14920199.11188732/1‑151 (MQ=60)
CCCTCTCGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCC < SRR14920199.8382707/151‑1 (MQ=60)
CCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCA > SRR14920199.1874794/1‑151 (MQ=60)
CTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAG > SRR14920199.5314338/1‑151 (MQ=60)
CTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAG > SRR14920199.11039260/1‑151 (MQ=60)
CTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGAC > SRR14920199.5100413/1‑151 (MQ=60)
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GTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACCGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCA > SRR14920199.7083019/1‑151 (MQ=60)
AAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGCCGCAGC < SRR14920199.1064997/151‑1 (MQ=60)
AATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCA > SRR14920199.10050214/1‑151 (MQ=60)
|
AGTCATCACAACCTCTGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGTTAC‑T‑TACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATCCAGACGCAGCAGG > NZ_CP025268/2828362‑2828658
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
