Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R2
|
781 |
700.4 |
23289492 |
98.5% |
22940149 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
4,505,921 |
A→G |
intergenic (‑557/‑52) |
insG ← / → nanX |
IS4‑like element IS4 family transposase/MFS transporter |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 4,505,921 | 0 | A | G | 99.0%
| 664.4
/ NA
| 193 | intergenic (‑557/‑52) | insG/nanX | IS4‑like element IS4 family transposase/MFS transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (86/105); minor base T (1/1); total (87/106) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
GTATCAGTTTTATCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGACTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGTATTTGATGGCT > NZ_CP025268/4505785‑4506057
|
gTATCAGTTTTATCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTc > 2:11234495/1‑140 (MQ=255)
tATCAGTTTTATCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTcc < 2:6941300/140‑1 (MQ=255)
tATCAGTTTTATCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTcc > 2:41252/1‑140 (MQ=255)
cAGTTTTATCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTa < 1:6033510/140‑1 (MQ=255)
tATCTTTCATAGAGTGAAATATGTCAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATAttt < 1:9095028/140‑1 (MQ=255)
ttCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACttt < 1:11137443/140‑1 (MQ=255)
tCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTa < 1:8479448/140‑1 (MQ=255)
cATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTaa > 2:8026430/1‑140 (MQ=255)
aTAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAg < 1:2968913/140‑1 (MQ=255)
agagTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAggg < 2:8076317/140‑1 (MQ=255)
agagTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAggg < 1:3979723/140‑1 (MQ=255)
agagTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAggg < 1:9045861/140‑1 (MQ=255)
agagTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATGTACTTTAAggg < 2:4344082/140‑1 (MQ=255)
agagTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGAGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAggg < 1:9897596/140‑1 (MQ=255)
agagTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGAGTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAggg < 1:112035/140‑1 (MQ=255)
agagTGAAATATGTAAAGAAGAAATCGATGCAAACATTGTACTGATTAGGAATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTCAAGACAATATAATTATTTCAGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAggg < 2:8022095/140‑1 (MQ=255)
gagTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGc < 2:9495010/140‑1 (MQ=255)
aaaTATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTatat > 2:3879695/1‑140 (MQ=255)
aaaTATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTatat < 1:2331062/140‑1 (MQ=255)
aaaTATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTatat < 1:3049852/140‑1 (MQ=255)
gTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAAt > 1:7253966/1‑140 (MQ=255)
agaagaAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGc > 2:9220138/1‑125 (MQ=255)
agaagaAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGc < 1:9220423/125‑1 (MQ=255)
agaagaAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAaca < 1:4250321/140‑1 (MQ=255)
agaagaAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAaca < 1:4761170/140‑1 (MQ=255)
gaagaaATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAacac < 1:9017702/140‑1 (MQ=255)
agaaATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATAAAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAg < 2:8262398/140‑1 (MQ=255)
aaaTGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGa > 2:3235574/1‑140 (MQ=255)
ggaggaAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGAGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACa < 2:6624508/140‑1 (MQ=255)
aaaGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCATAATATTTAGTTTATGGGCTTTATTAGTATAACACAGGAAACAAATATg > 2:9567028/1‑140 (MQ=255)
aGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGc < 1:10733681/140‑1 (MQ=255)
aGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGc < 2:3306201/140‑1 (MQ=255)
aTTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTCGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCaa < 1:2626583/140‑1 (MQ=255)
tACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGc < 1:7952727/140‑1 (MQ=255)
aCTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCa < 2:6070950/140‑1 (MQ=255)
aCTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCa < 1:10931619/140‑1 (MQ=255)
aCTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCa < 1:8053378/140‑1 (MQ=255)
aCTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCa < 2:6482398/140‑1 (MQ=255)
aTTATGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGt < 1:7537196/140‑1 (MQ=255)
aGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGtata < 1:6397366/140‑1 (MQ=255)
aGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGtata < 1:338027/140‑1 (MQ=255)
gTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCaa < 1:9405985/126‑1 (MQ=255)
gTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATaaa > 2:3381334/1‑140 (MQ=255)
ttGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTCTATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACaa > 2:7532697/1‑140 (MQ=255)
gagaccaatccatAGTAATTGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATAATGTTGAGTCTCCCTAATCTTTACTTTAAGGGCTAGATTAGAATAACACAGGAAACACATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGt < 2:7197230/135‑1 (MQ=255)
gATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGt > 2:10375472/1‑140 (MQ=255)
gATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGt > 2:861548/1‑140 (MQ=255)
gATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGt > 2:6925869/1‑140 (MQ=255)
gATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGt > 2:9908958/1‑140 (MQ=255)
gATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGt > 1:867559/1‑140 (MQ=255)
gATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGt > 1:1716450/1‑140 (MQ=255)
caatcaatAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATc < 2:6644847/140‑1 (MQ=255)
aatcaatAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATcc > 1:3485190/1‑140 (MQ=255)
atcaatAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATcca < 1:6998035/140‑1 (MQ=255)
tcaatAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATccac > 1:1753982/1‑140 (MQ=255)
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aCTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAatat > 2:10195149/1‑100 (MQ=255)
gCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAggg > 2:5479794/1‑66 (MQ=255)
gCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAggg < 1:5479794/66‑1 (MQ=255)
gCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCa > 1:294925/1‑106 (MQ=255)
gCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAg > 1:10106757/1‑140 (MQ=255)
gCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAg > 1:1828558/1‑140 (MQ=255)
gCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAg > 2:5894133/1‑140 (MQ=255)
gCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAg > 2:3012289/1‑140 (MQ=255)
gCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCAGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAg > 1:8779854/1‑140 (MQ=255)
tttGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCt < 1:2813545/44‑1 (MQ=255)
tttGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCt > 2:2813545/1‑44 (MQ=255)
aGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTc > 2:4993960/1‑140 (MQ=255)
cAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGc < 2:5086475/140‑1 (MQ=255)
aaaTATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGc < 2:4655874/139‑1 (MQ=255)
aaTATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCa < 1:2507048/140‑1 (MQ=255)
aaTATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCa < 2:10106757/140‑1 (MQ=255)
aaTATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCa < 2:1387655/140‑1 (MQ=255)
atatAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATAttt < 1:7842941/41‑1 (MQ=255)
atatAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGaaa < 2:5638835/124‑1 (MQ=255)
tataATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATg > 2:4924913/1‑140 (MQ=255)
tataATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATg > 1:7720943/1‑140 (MQ=255)
taATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGc < 1:5618850/140‑1 (MQ=255)
aaTTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCt < 1:11234495/140‑1 (MQ=255)
aaTTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCt < 2:867559/140‑1 (MQ=255)
aaTTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCt < 2:2323503/140‑1 (MQ=255)
tattTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTgg < 1:861548/140‑1 (MQ=255)
tattTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTgg < 1:3235574/140‑1 (MQ=255)
tattTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTgg > 2:929387/1‑140 (MQ=255)
tttCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGat < 1:1263749/140‑1 (MQ=255)
tttCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGat > 2:1046070/1‑140 (MQ=255)
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tCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCtat > 1:10377606/1‑44 (MQ=255)
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |