Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R4
|
781 |
701.7 |
22683696 |
98.1% |
22252705 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
4,327,077 |
G→A |
T5I (ACC→ATC) |
phnC ← |
phosphonate ABC transporter ATP‑binding protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 4,327,077 | 0 | G | A | 99.8%
| 1791.7
/ NA
| 465 | T5I (ACC→ATC) | phnC | phosphonate ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (105/358); minor base T (0/1); total (105/360) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 465 total aligned reads displayed.
TTAAGTGACGTAAAAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGGTAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAATTCGATGACAGTGCGGGAGGGCGGGCCT > NZ_CP025268/4326940‑4327213
|
ttAAGTGACGTAAAAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATa > 2:1092200/1‑140 (MQ=255)
ttAAGTGACGTAAAAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATa < 1:4203086/140‑1 (MQ=255)
ttAAGTGACGTAAAAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATa < 1:7486291/140‑1 (MQ=255)
tGACGTAATAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGTGCTTCTCGACACGGATAATCGt < 2:1778940/140‑1 (MQ=255)
tGACGTAAAAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGt < 2:10750122/140‑1 (MQ=255)
tGACGTAAAAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGt < 2:5028532/140‑1 (MQ=255)
tGACGTAAAAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGt < 1:4680652/140‑1 (MQ=255)
tGACGTAAAAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGt < 1:2947333/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGc > 1:3985717/1‑140 (MQ=255)
gTAAAAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGc < 1:1864035/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGc < 1:6720712/140‑1 (MQ=255)
tAACAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCa < 2:6948511/140‑1 (MQ=255)
tAAAAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCa < 2:6594628/140‑1 (MQ=255)
tAAAAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCa < 1:6218325/140‑1 (MQ=255)
tAAAAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCa < 1:6519088/140‑1 (MQ=255)
tAAAAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCa < 2:5432713/140‑1 (MQ=255)
tAAAAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCa < 2:4804942/140‑1 (MQ=255)
tAAAAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCa < 2:3564970/140‑1 (MQ=255)
aaaaGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCat < 2:3493932/140‑1 (MQ=255)
tGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAg > 2:3728923/1‑140 (MQ=255)
ggATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATCATCGTTTGCATGATGCAGc > 2:1039501/1‑140 (MQ=255)
ggATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGc < 2:1323740/140‑1 (MQ=255)
ggATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGc < 2:9296569/140‑1 (MQ=255)
ggATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGc < 1:7054415/140‑1 (MQ=255)
atgtcccGGACCCCGCCGGCCCACGCCGAGCCCCCAGTTCCCCGGGATGACTGGTCAGATCACCCGCATGCAGCGCCTGAAGCTGATTGACGGGTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGCCAACCGTTTGCATGCGGCAGCCt < 2:8551648/135‑1 (MQ=255)
aTTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCCCCATTTCACCGTGATGAATGTTCATCTCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGCAGGTATGGGCGAGCTACACGACACGGATAATCGTTGGCAAGATGCAGCCt < 2:819076/140‑1 (MQ=255)
aTTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCt < 1:1371467/140‑1 (MQ=255)
aTTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAAGGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGCTGCAGCCt < 1:10742758/140‑1 (MQ=255)
aTTGTCCTGACCCCGAGTGCCCAAGCAGCGCCACCAGTTCACCGTTATGAATGTTCAGTGCACCCGCAGGCAGCGCCGGATGCTGATTGTAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACTCGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCt < 2:6052079/140‑1 (MQ=255)
tCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCt > 1:168211/1‑140 (MQ=255)
ggAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTaaa < 1:8611159/140‑1 (MQ=255)
aaCCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTaaaaa > 2:6066240/1‑140 (MQ=255)
cccGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAg < 1:5537855/140‑1 (MQ=255)
ccGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGt < 1:4520246/140‑1 (MQ=255)
cGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCt < 2:9744824/140‑1 (MQ=255)
cccAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGATTTGGCGAGCTTCTCTACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGTCTCCa > 1:9003658/1‑140 (MQ=255)
aaGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCg < 1:438669/140‑1 (MQ=255)
aaGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCg < 1:3260836/140‑1 (MQ=255)
gCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTg < 1:10947732/140‑1 (MQ=255)
gCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTg < 2:1207680/140‑1 (MQ=255)
gagCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGGTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCg > 1:2067833/1‑140 (MQ=255)
gCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGa < 1:4480217/140‑1 (MQ=255)
gCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGa > 1:5827637/1‑140 (MQ=255)
gCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGa > 2:10089679/1‑140 (MQ=255)
aTTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATtg > 1:11312660/1‑140 (MQ=255)
ttCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTACAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATtgtg < 2:11290263/140‑1 (MQ=255)
ttCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATtgtg < 2:10331950/140‑1 (MQ=255)
aCCGTGATGAATGTTCAGACCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACg > 1:3773215/1‑140 (MQ=255)
atgaATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTgg < 1:2222351/140‑1 (MQ=255)
atgaATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTgg < 2:3989949/140‑1 (MQ=255)
atgaATGGTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTgg < 2:6305576/140‑1 (MQ=255)
tGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGttaat < 1:806329/140‑1 (MQ=255)
tGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGttaat > 1:6991414/1‑140 (MQ=255)
tCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGttaattaa < 2:769388/140‑1 (MQ=255)
tCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGttaattaa < 2:11168538/140‑1 (MQ=255)
gATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAg > 2:8662375/1‑140 (MQ=255)
aTCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGt < 1:5120282/140‑1 (MQ=255)
aaCCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGAc > 1:10061892/1‑140 (MQ=255)
aCCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACt > 1:8804249/1‑140 (MQ=255)
aCCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACt < 2:9424963/140‑1 (MQ=255)
cGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTaa < 1:4846675/140‑1 (MQ=255)
cGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTaa < 2:1474478/140‑1 (MQ=255)
cATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACa > 1:2566791/1‑140 (MQ=255)
tGCAGCGCCTGATGCTGAGTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCTTTTGCATGATGCAGCCTACCTAATATAGTGGATACAACGAGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTCATAGTGACTAACAGa > 1:7616698/1‑140 (MQ=255)
cAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATg < 2:10012899/140‑1 (MQ=255)
gcgcCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGTTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGaa < 1:8482590/140‑1 (MQ=255)
gcgcCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGaa < 1:281955/140‑1 (MQ=255)
cTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGACTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGt < 2:3336126/140‑1 (MQ=255)
gATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTa > 1:782567/1‑140 (MQ=255)
tcTGATTGTAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGAAACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCACTAAAAAATTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGAAGATTTTGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGCAGAGTTAACg < 2:840288/139‑1 (MQ=255)
tGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAACAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACggg < 2:4396006/140‑1 (MQ=255)
tGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACggg < 1:10351695/140‑1 (MQ=255)
tGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACggg < 2:8871785/140‑1 (MQ=255)
tGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACggg < 2:7332097/140‑1 (MQ=255)
tGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACggg < 2:7156007/140‑1 (MQ=255)
tGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACggg < 2:6703964/140‑1 (MQ=255)
tGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACggg < 1:7731883/140‑1 (MQ=255)
tGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATCAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACggg < 1:6311381/140‑1 (MQ=255)
tGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGAATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACggg < 2:2952636/140‑1 (MQ=255)
agATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCAAGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACggg < 1:9533327/139‑1 (MQ=255)
agATTGAAGGTTTTGGCGAGCGTCTCGACACGGATAATCGTTGGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACggg < 2:7445405/139‑1 (MQ=255)
agggAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAAGCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATGATTGGGACGATTTGGTTCATTAAAAGTGACTCACAGAGGAAGAGTGACCGGGaa > 2:2578475/4‑140 (MQ=255)
aTTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGaa < 2:599668/140‑1 (MQ=255)
aTTGAAGGATTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTCAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGaa < 1:10768970/140‑1 (MQ=255)
aaGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAATTCg > 1:9677048/1‑140 (MQ=255)
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TCTCGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAATTCGATGACTGTGCGGGAGGGCGGGCCTCCC > SRR14920199.8021442/1‑151 (MQ=60)
CGACACGGATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCATAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGCCGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAATTCGATGACAGTGCGGGAGGGCGGGCCTCCCGGC < SRR14920199.1668355/151‑1 (MQ=60)
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GATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGACGAGTTAACGGGAATTCGATGACAGTGCGGGAGGGCGGGCCTCCCGGCGGGTTAT > SRR14920199.8938713/1‑151 (MQ=60)
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GATAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAATTCGATGACAGTGCGGGAGGGCGGGCCTCCCGGCGGGTTAT > SRR14920199.5241160/1‑151 (MQ=60)
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GTAATCAAACCGCTTAAGTGACGTAAAAGGGTGGATTTTCCGGAACCCGACGGCCCAAGCAGAGCCACCATTTCACCGTGATGAATGTTCAGATCAACCGCATGCAGCGCCTGATGCTGATTGAAGGTTTTGGCGAGCTTCTCGACACGGGTAATCGTTTGCATGATGCAGCCTCCCTAAAAAAGTGGCTCCATCGTGGCGGATTATTGTGACGATTTGGTTAATTAAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAATTCGATGACAGTGCGGGAGGGCGGGCCTCCCGGCGGGTTAT > NZ_CP025268/4326927‑4327226
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |