Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F15 I1 R4
|
781 |
701.7 |
22683696 |
98.1% |
22252705 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NZ_CP025268 |
4,354,806 |
A→G |
*99* (TAA→TAG) |
ghoS → |
type V toxin‑antitoxin system endoribonuclease antitoxin GhoS |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NZ_CP025268 | 4,354,806 | 0 | A | G | 99.2%
| 845.4
/ NA
| 246 | *99* (TAA→TAG) | ghoS | type V toxin‑antitoxin system endoribonuclease antitoxin GhoS |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (68/176); minor base T (1/1); total (69/177) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.83e-01 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
TCCTTCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAACCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACT > NZ_CP025268/4354669‑4354937
|
ttCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagg < 2:1553878/140‑1 (MQ=255)
tCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 2:6865420/140‑1 (MQ=255)
tCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 2:11231349/140‑1 (MQ=255)
tCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 2:1749128/140‑1 (MQ=255)
tCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 2:2663138/140‑1 (MQ=255)
tCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 1:7527600/140‑1 (MQ=255)
tCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 1:6643995/140‑1 (MQ=255)
tCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 1:5111343/140‑1 (MQ=255)
tCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 2:7002525/140‑1 (MQ=255)
tCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 1:2476029/140‑1 (MQ=255)
tCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 1:10297193/140‑1 (MQ=255)
tCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 1:11053788/140‑1 (MQ=255)
aaTAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCaggaagga > 1:9415632/1‑140 (MQ=255)
aTAACGACATCGTTAGCCGCAATTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGAt < 1:5638986/140‑1 (MQ=255)
tAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATa > 1:1436528/1‑140 (MQ=255)
aCGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATaag < 1:5500366/140‑1 (MQ=255)
aCGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATaag > 1:4516761/1‑140 (MQ=255)
aCATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGAGATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATaagaag > 2:1872963/1‑140 (MQ=255)
tCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAAc > 1:897372/1‑140 (MQ=255)
tCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGATAAGACTTACCGGATATTGATTATGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGATTAACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAAc > 1:1821153/1‑140 (MQ=255)
ttAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATa < 2:923828/140‑1 (MQ=255)
gCCGCAAGTGACATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATaaaa > 1:1625320/1‑140 (MQ=255)
cGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATaaaaaa < 1:7873435/140‑1 (MQ=255)
aaGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATgg < 2:1503090/140‑1 (MQ=255)
aGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGc > 2:9701062/1‑140 (MQ=255)
gTGAAATCGAAGATTTAATCAGTCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCa < 1:862263/140‑1 (MQ=255)
gTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAACATGGCa < 1:1934786/140‑1 (MQ=255)
gTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCa < 2:7906610/140‑1 (MQ=255)
gTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCa < 2:10986151/140‑1 (MQ=255)
gTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCa < 2:8976559/140‑1 (MQ=255)
gAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACt < 1:4933448/140‑1 (MQ=255)
aaaTCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTa < 2:10122437/140‑1 (MQ=255)
aaaTCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTa > 1:8048285/1‑140 (MQ=255)
aaTCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTAt > 1:8197244/1‑140 (MQ=255)
aGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTACTTCATTTTTACACGTAGCCATGAAGGCTCAGACGACCATAAAAAATGGCACGAGTCTCTa > 2:982287/1‑140 (MQ=255)
gCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATGATGAAAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCCGGAAGGATAAGAAGAACATACATAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAAttt > 2:3082599/1‑140 (MQ=255)
cTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCa < 2:837211/117‑1 (MQ=255)
aaaTGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTa < 1:6852435/140‑1 (MQ=255)
gCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAA‑GATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGa < 2:7765334/140‑1 (MQ=255)
cTTAGACTTACCGGATTTTCATTTTGACCTCAACAATATGACAGTTGATGACTTTTTCCGTCAGTTTTTCAACTAGCAAGGTAGCATAAGTAGAACTTAAAAAATGCCACAATTCTCGAAAATATTAATTTTTTAtgtgc < 2:4420345/140‑2 (MQ=255)
cTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGa < 2:5702026/140‑1 (MQ=255)
cTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGa < 1:2122271/140‑1 (MQ=255)
cTTAGACTTACCGGATATTGATATTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGa < 2:6305254/140‑1 (MQ=255)
cTTAGACTTACCGGATAATGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGa < 1:10942219/140‑1 (MQ=255)
ttAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGAt < 1:10466356/140‑1 (MQ=255)
tAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGAtt > 2:8572463/1‑140 (MQ=255)
tAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGAtt < 2:10320345/140‑1 (MQ=255)
aGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTg > 2:1059178/1‑140 (MQ=255)
ccggaCCGGATAGTGATATAGACCTCAACATTATGACAGATGATGACTATTTCCGTCAGTATTACACGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATCTTAATTTTTTATGTGATTGgt < 1:6939364/136‑1 (MQ=255)
aCTTACCGGATATTGATATTGACCTCATCATTATGACAGTTGATGACTATTTCCTTAAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAAAGGCACTATTCTATAAAATATTAATTATTTATGAGATTCgt > 2:3268475/1‑140 (MQ=255)
cTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGgtg < 1:3620058/140‑1 (MQ=255)
cTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGgtg < 2:6009818/140‑1 (MQ=255)
cTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGgtg < 1:7407668/140‑1 (MQ=255)
cTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGgtg < 2:4376992/140‑1 (MQ=255)
attACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGgtg < 2:8953165/139‑1 (MQ=255)
tcccGGATATTGATTTGGACCTCAACATTCTGACAGGTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATACAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGtgtg < 1:9264150/138‑1 (MQ=255)
aCCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTCTTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAATAATGGCACTATTCTCTACAATATTAATTTTTTCTGTGATTGGtgtgt > 2:8679497/1‑139 (MQ=255)
aCCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTTCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGa > 2:927369/1‑140 (MQ=255)
aCCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGa > 1:9692419/1‑140 (MQ=255)
aCCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGa > 1:9692816/1‑140 (MQ=255)
aCCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGa > 1:10038552/1‑140 (MQ=255)
aCCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGa > 1:5784802/1‑140 (MQ=255)
aCCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGa > 1:8775148/1‑140 (MQ=255)
aCCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGa > 1:8282153/1‑140 (MQ=255)
cGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAAc < 2:802407/140‑1 (MQ=255)
tatttattTTGACCTCAACATTATGACAGTTGTTGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGTAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCCCTATTCTCTAAAATATTAATTTTTGATGTGATTGGTGTGAACatat > 2:1999166/1‑140 (MQ=255)
tatTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCagga < 1:4226218/67‑1 (MQ=255)
tatTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACatat < 1:4668295/140‑1 (MQ=255)
tGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCt < 1:10150349/140‑1 (MQ=255)
tGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCt < 2:4100484/140‑1 (MQ=255)
ttGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTc > 1:3503669/1‑140 (MQ=255)
tGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCa < 2:8497954/140‑1 (MQ=255)
tGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCa > 2:6299949/1‑140 (MQ=255)
ccTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTa < 1:1254978/140‑1 (MQ=255)
cTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTAt < 2:4716818/140‑1 (MQ=255)
cTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTAt < 1:9219883/140‑1 (MQ=255)
aTTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGtt < 2:3727404/140‑1 (MQ=255)
tATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTa > 2:2179475/1‑140 (MQ=255)
agACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTATCCAGGAAGGAAAAGAAGAACAAAAAAAATGGCACAATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTAtc > 1:3355028/2‑140 (MQ=255)
gACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTAtct < 1:1139694/140‑1 (MQ=255)
cAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTca < 2:5891830/140‑1 (MQ=255)
gTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTcaca > 1:719384/1‑140 (MQ=255)
gTTGATGACTATTTCCGTCAGATTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTcaca < 2:7442043/140‑1 (MQ=255)
ttGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACAt > 1:6208053/1‑140 (MQ=255)
ttGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACAt > 1:2901173/1‑140 (MQ=255)
ttGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACAt > 2:2659420/1‑140 (MQ=255)
gatgaCTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTATAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATga > 2:1006482/1‑140 (MQ=255)
gatgaCTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATga > 1:4888615/1‑140 (MQ=255)
aTTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAaca < 2:5454137/140‑1 (MQ=255)
ccGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACata < 1:9820824/140‑1 (MQ=255)
ccGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACata < 2:2038295/140‑1 (MQ=255)
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CTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAACAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAAC < SRR14920199.5502531/151‑1 (MQ=60)
CTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAAC < SRR14920199.2131505/151‑1 (MQ=60)
CTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAAC < SRR14920199.1191453/151‑1 (MQ=60)
CTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAAC < SRR14920199.8107820/151‑1 (MQ=60)
CTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAAC < SRR14920199.1882712/151‑1 (MQ=60)
CTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAAC < SRR14920199.10384311/151‑1 (MQ=60)
CTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAAC < SRR14920199.2395685/151‑1 (MQ=60)
CTTAGACTTACCGGATAATGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAAC < SRR14920199.10992267/151‑1 (MQ=60)
CTTAGACTGACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAAC < SRR14920199.4723557/151‑1 (MQ=60)
TTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACA < SRR14920199.10513889/151‑1 (MQ=60)
TTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACA < SRR14920199.3975110/151‑1 (MQ=60)
GACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATAT < SRR14920199.5663778/151‑1 (MQ=60)
ccggACCGGATAGTGATATAGACCTCAACATTATGACAGATGATGACTATTTCCGTCAGTATTACACGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATCTTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATC < SRR14920199.6970188/147‑1 (MQ=60)
ACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATC < SRR14920199.7031970/151‑1 (MQ=60)
ACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATC < SRR14920199.8230942/151‑1 (MQ=60)
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CTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCC < SRR14920199.3635698/151‑1 (MQ=60)
CTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCC < SRR14920199.3635725/151‑1 (MQ=60)
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CTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTCACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCC < SRR14920199.7079745/151‑1 (MQ=60)
TCCCGGATATTGATTTGGACCTCAACATTCTGACAGGTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATACAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTT < SRR14920199.9306157/151‑1 (MQ=60)
GGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTC < SRR14920199.7705812/151‑1 (MQ=60)
GGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTC > SRR14920199.3518819/1‑151 (MQ=60)
GATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAGCATATCCTTTGTCA < SRR14920199.10284730/151‑1 (MQ=60)
TATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATT < SRR14920199.4688407/151‑1 (MQ=60)
TGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATC < SRR14920199.10196519/151‑1 (MQ=60)
GATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCT > SRR14920199.9488680/1‑151 (MQ=60)
ACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTAT > SRR14920199.4385431/1‑151 (MQ=60)
CCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATC < SRR14920199.1260472/151‑1 (MQ=60)
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CTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCT < SRR14920199.9261682/151‑1 (MQ=60)
CTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCT < SRR14920199.2258984/151‑1 (MQ=60)
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ACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACA > SRR14920199.3405258/1‑151 (MQ=60)
ACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACA < SRR14920199.8440462/151‑1 (MQ=60)
CATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACAT > SRR14920199.2913679/1‑151 (MQ=60)
CATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACAT > SRR14920199.6235329/1‑151 (MQ=60)
TTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGA > SRR14920199.4909671/1‑151 (MQ=60)
ATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGA < SRR14920199.8310322/151‑1 (MQ=60)
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GACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTC < SRR14920199.4926025/151‑1 (MQ=60)
GACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTC > SRR14920199.6518965/1‑151 (MQ=60)
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TACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCC < SRR14920199.10758326/151‑1 (MQ=60)
TACAAGTAGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCC < SRR14920199.10841165/151‑1 (MQ=60)
AGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGG > SRR14920199.4141311/1‑151 (MQ=60)
AGCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGG > SRR14920199.4141862/1‑151 (MQ=60)
GCCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGA > SRR14920199.2370305/1‑151 (MQ=60)
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AATGAAAACTCCTTCGCAATAACGACATCGTTAGCCGCAAGTGAAATCGAAGATTTAATCAGGCTCAAATGCTTAGACTTACCGGATATTGATTTTGACCTCAACATTATGACAGTTGATGACTATTTCCGTCAGTTTTACAAGTAACCAGGAAGGATAAGAAGAACATAAAAAATGGCACTATTCTCTAAAATATTAATTTTTTATGTGATTGGTGTGAACATATCCTTTGTCATTATCTGGTTTATCTCACATGAGAAAACACATATTCGTTTACTTAGTGCATTCCTGGTCGGA > NZ_CP025268/4354660‑4354956
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |