Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R4
|
781 |
701.7 |
22683696 |
98.1% |
22252705 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC |
NZ_CP025268 |
4,621,394 |
(GAAAGCGGC)1→2 |
coding (1250/1314 nt) |
deoA → |
thymidine phosphorylase |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NZ_CP025268 |
4621379 = | 51 (0.080) | 860 (1.360) |
130/262 |
0.2 |
96.1% |
coding (1235/1314 nt) |
deoA |
thymidine phosphorylase |
| ? | NZ_CP025268 |
= 4621387 |
22 (0.030) | coding (1243/1314 nt) |
deoA |
thymidine phosphorylase |
Only 100 of 907 total aligned reads displayed.
TGCACGTTTCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCGCCGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP025268/4621521‑4621379
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccgcttTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCGTCC < NZ_CP025268/4621387‑4621249
TTCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGC > 1:4487895/1‑140
TCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCC > 2:7506319/1‑140
CATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCG < 1:8529915/140‑1
ATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGC > 1:994315/1‑140
ATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTT < 2:9117970/140‑1
CTCCGTACTCGGTGCTGCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGCGAGACAGTTGGTGTGCTGTCCGGTGCGGTAGCGGCACGGTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGC > 2:4277076/1‑140
CTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGTCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTACGGTTCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGC > 2:1938987/1‑140
CTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTTCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGC > 1:8081505/1‑140
CTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGC > 1:7809006/1‑140
CTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGC > 2:2526325/1‑140
CTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGC > 1:7494830/1‑140
CTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGC > 1:3664398/1‑140
CGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAG > 2:7685208/1‑140
CGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAG > 1:3044550/1‑140
ACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTG < 1:9776150/140‑1
AGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCGGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTGTT > 2:7808988/1‑140
AGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTT > 2:5623308/1‑140
AGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTT > 1:10916168/1‑140
GTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTC > 1:2065648/1‑140
GTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAAGTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTAGTGTTC > 2:7263862/1‑140
GCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGT > 2:3597180/1‑140
GCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGT > 1:9515414/1‑140
GCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGT > 1:5629297/1‑140
AATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCG < 1:9282203/140‑1
ATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGC > 1:7599606/1‑140
TTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGT > 1:4783346/1‑140
TTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTACGCCGCTTCCTGCCAGTTGATTTCGTCTTTCGCGT > 1:8779823/1‑140
TAAATGATCAGATCCGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCGTTATCGGCAAGTTTCCTTGCCGCGTTCACCGCTTTCGCCGCTGCCTGCCAGTTGTTGTCGTCTGTCGCGTG > 2:3099878/1‑140
ATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCA > 2:8929824/1‑140
TATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGA > 1:10211529/1‑140
TATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGA < 1:2535800/140‑1
TACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACG > 2:6641431/1‑140
ACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGC > 2:4690429/1‑140
CCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCT < 2:131952/140‑1
CCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCT < 1:6400063/140‑1
CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 2:11086675/1‑140
CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 1:3817874/1‑140
CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 1:9026969/1‑140
CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 1:7307682/1‑140
CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 1:180053/1‑140
CGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 2:8112630/1‑140
CGTAATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCTGCAAGTATAATTGCCGCTTTCACCGCTTGCGCCGCTTCATGCCCGTTGTTTTCGTCTGTCGCGAGGATAACCGCCAGCGGACGCTG > 1:8368501/1‑140
TTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGAC > 1:9589702/1‑140
TTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGAC > 1:7953415/1‑140
TATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACC < 1:3274251/140‑1
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 1:5270618/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 1:3993266/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 2:2685231/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 2:153646/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 1:5086592/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 1:2667481/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 1:11151060/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 2:840327/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 2:941117/1‑140
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TTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGGTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 2:3260284/1‑140
TTCGCTGATACGGCGATAGACAGGTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTGTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGT > 2:5804295/1‑140
TGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCCGCGGACGCTGTCCGTCTACC > 2:10589096/1‑140
ATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCACGGTTAATTGCCGCTTTCACCGCTGTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATACCCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTG > 2:6868279/1‑140
CGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGT < 1:2180894/100‑1
CGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGT > 2:2180894/1‑100
ATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCA > 2:3774588/1‑140
AGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGA > 1:9205851/1‑140
AGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGA < 2:1671484/140‑1
AGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGA < 2:5313756/140‑1
AGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGA < 1:10633897/140‑1
AGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGA < 2:2925584/140‑1
AGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGA < 1:411255/140‑1
AGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGA > 1:10008471/1‑140
AGACAGTTGGCGTGCTTTCCGGGGCTTTAGCGGCAAGTTGACGTGCCGCTTTCCCCGCTGTCCCCGCATCCAGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGA < 2:8701739/140‑1
ACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACG < 2:4008784/140‑1
AGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCG > 1:8207140/1‑140
AGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTACGCCGCTTCCTGCCAGGTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCG < 2:9725595/140‑1
AGTTGGTGTGCTTTCAGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCG < 2:8013193/140‑1
GTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCNGCAAGTTNAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCNACCTGGTCGCCCAGACGCGC < 1:5920054/140‑1
TTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCC > 1:1436635/1‑140
ggaGTGCTTTCCGGTGCTTGATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCAT < 2:10398612/137‑1
GTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATC > 2:10868585/1‑140
TGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCA > 1:3567876/1‑140
TGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCA > 2:6384784/1‑140
TGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCA > 1:2311590/1‑140
CTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCCGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGT > 2:7097568/1‑140
CTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGT > 1:6904382/1‑140
CTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGT < 1:1151210/140‑1
TTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAA > 2:5437944/1‑140
TTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAA > 2:7913920/1‑140
TTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAA > 1:3399783/1‑140
TTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTGTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAA > 2:4156896/1‑140
CGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATACCCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGC < 2:1015955/140‑1
TGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGA > 1:6611804/1‑140
TATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTG > 1:7002548/1‑140
GCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATC > 1:5480195/1‑140
CAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCGGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCG < 2:4990072/140‑1
AAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGA < 2:4570830/140‑1
TTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGG > 2:11289572/1‑140
GCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCCTATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGC > 1:4294744/1‑140
TTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTG < 2:4418776/140‑1
CCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACGG < 1:10399006/140‑1
CTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTGGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTACTCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCGT < 1:4619157/140‑1
TTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAGGCCGACGCTGAACTCGATGGTGTCAGCTGCCTGACGGCGTCC > 2:6252596/1‑140
TGCACGTTTCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCGCCGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP025268/4621521‑4621379
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccgcttTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCGTCC < NZ_CP025268/4621387‑4621249
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
