Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
782 |
316.7 |
10427156 |
97.0% |
10114341 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,371,754 |
T→C |
*326* (TAA→TAG) |
pspF ← |
phage shock protein operon transcriptional activator |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,371,754 | 0 | T | C | 100.0%
| 957.0
/ NA
| 286 | *326* (TAA→TAG) | pspF | phage shock protein operon transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (177/109); total (177/109) |
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
TGCGCTGAGCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAACT > NZ_CP025268/1371619‑1371890
|
tGCGCTGAGCGATTAATAGCCCAACGCAATACTGACGGATGCGCTGCGATTATCAGGGCAGCAAACGACGTATTGATGATGTATACG‑GAATAAAGCATGCACGCAGCATTCGGCAAGATGTATTGCACAACTTCGCTaaa > 2:2339619/1‑140 (MQ=255)
gAGCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGt < 1:1762771/140‑1 (MQ=255)
gAGCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGt < 1:5176458/140‑1 (MQ=255)
gCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGc > 2:1602812/1‑140 (MQ=255)
aGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTcaac > 1:2624435/1‑140 (MQ=255)
gCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTcaaca < 1:974053/140‑1 (MQ=255)
gCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTcaaca < 2:362685/140‑1 (MQ=255)
cccAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTcaacaa > 2:979280/1‑140 (MQ=255)
cccAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTcaacaa > 2:485544/1‑140 (MQ=255)
aaCGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgc > 1:3559353/1‑140 (MQ=255)
ccGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCATGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAATCATTCACGCCGAATCCGGAACGTTGTATTGCTCAACTTCGCGAAATCTGGTGCTTTGTCGACACcgcg < 2:3376753/139‑1 (MQ=255)
aCGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcg < 1:4715456/140‑1 (MQ=255)
aCGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcg < 1:3003121/140‑1 (MQ=255)
aCGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcg < 2:3323467/140‑1 (MQ=255)
aCGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATCTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcg < 2:3906809/140‑1 (MQ=255)
cGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCTCTTAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgc > 1:3272194/1‑140 (MQ=255)
cGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgc > 1:483194/1‑140 (MQ=255)
cGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgc > 1:438958/1‑140 (MQ=255)
gCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAAcgcgcg < 1:4216668/140‑1 (MQ=255)
taatGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAAc > 1:2789283/1‑140 (MQ=255)
taatGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAAc > 1:4091344/1‑140 (MQ=255)
taatGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACCTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAAc > 1:2720906/1‑140 (MQ=255)
tCTGCTGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATCAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCACAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgatg < 2:1519076/140‑1 (MQ=255)
tCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgatg < 2:3220897/140‑1 (MQ=255)
tCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGAGGAACtgatg > 2:2963791/1‑140 (MQ=255)
tCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGAC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGTAACtgatg < 1:3948353/140‑1 (MQ=255)
ccTGATTCGCTGCTCTTATCAGGCCTGCAAACGCCGTATTAATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTTTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgatg < 2:769351/139‑1 (MQ=255)
cTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACtgatga < 1:1285165/140‑1 (MQ=255)
taaTGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTACGCC‑GAATAACGCATTCACGCAGCATCCGGCAAGCTGTATTGCTCAACTTCGCTACATCTGGTGCTTCTTCAACAACGCGCGGAACTgatgat < 2:3724491/138‑1 (MQ=255)
tGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTgatgat > 1:1519955/1‑140 (MQ=255)
tGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCAGCTAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCAGCCGGCAAGTTGTATTGCTCACCTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTgatgat > 1:3100455/1‑140 (MQ=255)
gATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATa > 1:3932309/1‑140 (MQ=255)
gATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATa > 2:948216/1‑140 (MQ=255)
gATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATa > 2:2159181/1‑140 (MQ=255)
cgctgcgctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGtt < 2:3769883/140‑1 (MQ=255)
ctgcgctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTcaaca < 1:4537403/115‑1 (MQ=255)
ctgcgctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTaa > 1:1884677/1‑140 (MQ=255)
ctgcgctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATCCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTGTTTCAACAACGCGCGGAACTGATAATAAGTTaa > 2:2493033/1‑140 (MQ=255)
tgcgctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCCACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAc < 1:3427489/140‑1 (MQ=255)
tgcgctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAc > 2:1035353/1‑140 (MQ=255)
cgcgctTATCACGCCTGCAAACGGCGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTCACTCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAc < 1:64909/139‑1 (MQ=255)
gctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATACAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAcccc < 2:2886050/140‑1 (MQ=255)
gctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAcccc < 2:3262035/140‑1 (MQ=255)
gctTATCAGGCCTGCAAACGACGTATGGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAAcccc < 1:2348292/140‑1 (MQ=255)
ttATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAg < 2:2246702/140‑1 (MQ=255)
agcAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATACAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCGACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCACCAACGCGCGGACGTGATGATAAGTTAACCCCAGTa < 2:2547238/138‑1 (MQ=255)
gCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCAGGGGCTGTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTc > 2:3518152/1‑140 (MQ=255)
gCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCa > 2:1266676/1‑140 (MQ=255)
gCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCa > 1:3861539/1‑140 (MQ=255)
gCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCa > 2:3855967/1‑140 (MQ=255)
cTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATACGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGc > 2:552299/1‑140 (MQ=255)
tGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGcc > 1:4019251/1‑140 (MQ=255)
tGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTGAACCCCAGTAATTCAGcc > 2:3696771/1‑140 (MQ=255)
cAAACGACGTATTGATTATGTATGCT‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCcgc > 2:4671925/1‑140 (MQ=255)
cAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCcgc > 1:5061069/1‑140 (MQ=255)
cAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCcgc > 1:2123298/1‑140 (MQ=255)
cAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCcgc > 1:1371150/1‑140 (MQ=255)
cAAACGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCcgc > 2:3140158/1‑140 (MQ=255)
aaaCGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCcgcg < 1:591225/140‑1 (MQ=255)
aaaCGACGTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCcgcg < 2:2533050/140‑1 (MQ=255)
gacgTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCt < 1:5210161/140‑1 (MQ=255)
gacgTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCt < 2:1157338/140‑1 (MQ=255)
gacgTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCt < 1:4525317/140‑1 (MQ=255)
gacgTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCt > 1:2921535/1‑140 (MQ=255)
acgTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCATTAATTCAGCCGCGCGCtt < 1:1196874/140‑1 (MQ=255)
acgTATTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCtt < 1:2583016/140‑1 (MQ=255)
aTTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTgg < 2:1871826/140‑1 (MQ=255)
aTTGATTATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTgg > 1:1147750/1‑140 (MQ=255)
ttATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTtata > 1:1050649/1‑140 (MQ=255)
ttATGTATGCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTtata > 1:3659375/1‑140 (MQ=255)
atgtatgCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATAtt > 2:2570693/1‑140 (MQ=255)
tgtatgCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTAAGCCGCGCGCGTCTGGTTATAttt > 2:643783/1‑140 (MQ=255)
gtatgCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTc > 1:208133/1‑140 (MQ=255)
atgCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTccc < 1:2289626/140‑1 (MQ=255)
atgCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTccc < 2:4724059/140‑1 (MQ=255)
tgCC‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCt > 2:5106600/1‑140 (MQ=255)
cc‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCttg > 1:4812255/1‑140 (MQ=255)
cc‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCttg > 1:2538773/1‑140 (MQ=255)
cc‑GAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCttg > 2:3042520/1‑140 (MQ=255)
aaTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATCAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCttgttg > 1:2509875/1‑140 (MQ=255)
aTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGc > 1:4605488/1‑140 (MQ=255)
aTAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGGTGTATTGCTCAACTGCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGc > 2:340033/1‑140 (MQ=255)
aaGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCaaa < 2:3421984/140‑1 (MQ=255)
aaGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCaaa < 1:3391899/140‑1 (MQ=255)
aGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAAc > 1:4929771/1‑140 (MQ=255)
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TTGCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAACTC > SRR14920191.2481787/1‑151 (MQ=60)
GCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAACTCAC > SRR14920191.3433570/1‑151 (MQ=60)
GCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAACTCAC > SRR14920191.487184/1‑151 (MQ=60)
GCTCAACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAACTCAC > SRR14920191.3433888/1‑151 (MQ=60)
ACTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAACTCACGTAAA > SRR14920191.2230100/1‑151 (MQ=60)
CTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCACCTCTTTTTCCTGCTGAATCTGAAACTCACGTAAAT < SRR14920191.2350385/151‑1 (MQ=60)
CTTCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGAGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAACCTCACGTAAAT < SRR14920191.4423569/151‑1 (MQ=60)
TCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAACTCACGTAAATCC < SRR14920191.4717351/151‑1 (MQ=60)
TCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAACTCACGTAAATCC < SRR14920191.362154/151‑1 (MQ=60)
TCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAACTCACGTAAATCC < SRR14920191.2103181/151‑1 (MQ=60)
TCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAACTCACGTAAATCC < SRR14920191.2509485/151‑1 (MQ=60)
TCGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAACTCACGTAAATCC < SRR14920191.2509525/151‑1 (MQ=60)
CGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAACTCACGTAAATCCA > SRR14920191.2582797/1‑151 (MQ=60)
CGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAACTCACGTAAATCCA > SRR14920191.3003350/1‑151 (MQ=60)
CGCTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTGCCTGCTGCATCTGAAACTCACGTAAATCCA > SRR14920191.2462896/1‑151 (MQ=60)
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AAATTTTGCAGGATGCGCTGAGCGATTAATAGCCCAACGCAATAATGTCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTGCAAACGACGTATTGATTATGTATGCCGAATAAAGCATTCACGCCGCATCCGGCAAGTTGTATTGCTCAACTTCGTTAAATCTGGTGCTTTTTCAACAACGCGCGGAACTGATGATAAGTTAACCCCAGTAATTCAGCCGCGCGCTTCTGGTTATATTTCCCTTGTTGCAAACTGAGTTGCAGCAACTCTTTTTCCTGCTGCATCTGAAACTCACGTAAATCCA > NZ_CP025268/1371606‑1371902
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |