Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
782 |
316.7 |
10427156 |
97.0% |
10114341 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,619,609 |
T→C |
intergenic (‑86/‑15) |
sad ← / → yneJ |
succinate‑semialdehyde dehydrogenase/LysR family transcriptional regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,619,609 | 0 | T | C | 99.6%
| 870.5
/ NA
| 260 | intergenic (‑86/‑15) | sad/yneJ | succinate‑semialdehyde dehydrogenase/LysR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (175/84); minor base G (1/0); total (176/84) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
ACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCATGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCTGCGCCAGCTGGAAAC > NZ_CP025268/1619473‑1619745
|
aCCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGaa > 1:2128149/1‑140 (MQ=255)
ccGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATc < 2:2426857/140‑1 (MQ=255)
gTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCga < 1:302728/140‑1 (MQ=255)
tGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCgag > 1:3510716/1‑140 (MQ=255)
tGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCgag < 1:2837739/140‑1 (MQ=255)
gCAGGATTTATCTAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGaa < 2:3653670/140‑1 (MQ=255)
gCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCTGGGTATCTCCTTTATGAGTCATTGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGaa < 2:4646826/140‑1 (MQ=255)
gCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGaa < 2:649436/140‑1 (MQ=255)
gCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGaa < 2:1677490/140‑1 (MQ=255)
gCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGaa < 1:4275550/140‑1 (MQ=255)
gCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGaa > 2:2280344/1‑140 (MQ=255)
gCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGaa < 1:3560487/140‑1 (MQ=255)
tttATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTAt < 1:3782374/140‑1 (MQ=255)
aTTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGAc < 1:2293944/140‑1 (MQ=255)
aTTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGAATCTCCTTTATGAAGCCTGGTATGAAGATACGCAGATTCACTCTTGCTGTAAAATGAATAATATTGAGCCACTTGTTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGAc > 2:3814207/1‑140 (MQ=255)
ttGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGAcc > 1:931023/1‑140 (MQ=255)
cATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCaa > 1:3992538/1‑140 (MQ=255)
gCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGAt > 1:2371338/1‑140 (MQ=255)
gCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGAGACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGAt > 1:3111931/1‑140 (MQ=255)
caggAGTAATGGTCACCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGGCTGAAGGTACGCAGATTTGCGCGTGCTTTAAAATTAATAATATTAAGCCGCTTATGGAGGAATCGAGAAAGCTGTGGATTTGACACAACTGGAGGTg > 2:1041494/3‑140 (MQ=255)
tAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAAc > 2:2757635/1‑140 (MQ=255)
aTCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGc > 2:1766412/1‑140 (MQ=255)
aTCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGAGTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGc > 1:1569702/1‑140 (MQ=255)
cGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCg > 1:3400765/1‑140 (MQ=255)
aTCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTg < 1:655076/140‑1 (MQ=255)
aTCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTg > 1:872151/1‑140 (MQ=255)
ttttatttATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCCTGCTTTAAAATGAATCATATTAAGCCACTTATTCACGAATAGAGAATGCCATGTATCTGACCCAACCGGAGATGTCCAACGCGGTTGCCTAAGCTgg < 2:5053368/135‑1 (MQ=255)
tctcCTTTCTGAGTCATGGTATGAAGATACGCACATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTCAGCCACTTATTAACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGCAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTgg < 2:3171186/140‑1 (MQ=255)
tctcCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTgg < 1:4785598/140‑1 (MQ=255)
cTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGgcagc < 2:5007175/140‑1 (MQ=255)
tttATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGgcagca < 1:885511/140‑1 (MQ=255)
tttATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGgcagca < 1:3140312/140‑1 (MQ=255)
tttATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGgcagca < 2:4160584/140‑1 (MQ=255)
tttATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGgcagca < 2:375436/140‑1 (MQ=255)
ttATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCGCTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCAt > 2:2761002/1‑140 (MQ=255)
ttATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTc > 1:2931181/1‑114 (MQ=255)
ttATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCAt > 1:1544590/1‑140 (MQ=255)
ttATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCAt > 1:2416761/1‑140 (MQ=255)
ttATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCAt > 2:1824621/1‑140 (MQ=255)
tATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGCTTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGCGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATa > 1:4739395/1‑140 (MQ=255)
gTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCa > 2:3261302/1‑140 (MQ=255)
gTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCa > 2:4203046/1‑140 (MQ=255)
cATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGTTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAgg > 2:3961206/1‑140 (MQ=255)
cATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCCCGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAgg > 1:2225611/1‑140 (MQ=255)
cATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAgg > 1:4499015/1‑140 (MQ=255)
cATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAgg > 2:2060437/1‑140 (MQ=255)
cATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAgg > 1:1962996/1‑140 (MQ=255)
cATGGGATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATGATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGTTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAgg > 2:2060176/1‑140 (MQ=255)
aTGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGACTGCTATGGATCTGACACAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGc > 2:2101778/1‑140 (MQ=255)
aTGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGc > 1:1175937/1‑140 (MQ=255)
aTGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGc < 2:425590/140‑1 (MQ=255)
aTGGTATGAAGATACGCAGATGTACTCGTGCTTTAATATGAATAATAGTAAGCCACTTATTCACGACTCGAGAATGCTATGGATCTGAGCAAACTGGGGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCAGGCAGCATAAACCAGGc < 2:108618/140‑1 (MQ=255)
aTGGTAATAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTACAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGTATCTGACCCAACCGGACATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGc < 2:1316685/140‑1 (MQ=255)
ggTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGTTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTg > 2:1416092/1‑140 (MQ=255)
ggTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTg > 1:974488/1‑140 (MQ=255)
ggTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTg < 1:3891165/140‑1 (MQ=255)
aTGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAGTAGTACGCCACTTATTCACGAATCGAGAAGGCCATGGATCGGACCCAACTGTAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGTCAGCATAGCCCAGGCTgcag < 2:544457/140‑1 (MQ=255)
gAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTgcagca < 2:1935692/140‑1 (MQ=255)
aCGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTg > 1:1433814/1‑140 (MQ=255)
cGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTa < 1:1415063/65‑1 (MQ=255)
cGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGc > 1:2629133/1‑140 (MQ=255)
cGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGc > 1:2095162/1‑140 (MQ=255)
cGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGc > 1:614377/1‑140 (MQ=255)
cAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCAt > 2:3550431/1‑140 (MQ=255)
aCTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGc > 2:4313834/1‑140 (MQ=255)
tGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCg < 1:4966343/140‑1 (MQ=255)
gCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGa > 1:1721703/1‑140 (MQ=255)
gCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGa > 1:3742615/1‑140 (MQ=255)
gCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGa > 1:2333960/1‑140 (MQ=255)
gCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGa < 1:2586420/140‑1 (MQ=255)
cTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGaa < 2:4410412/140‑1 (MQ=255)
tttAAAATAAATAATATTAAGACACTTATTCACGAATCGAGAATGATATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAAt < 2:483686/140‑1 (MQ=255)
gAATAAGATTAAGCCACGTATTCACGAATCGACAATGCTATGGATCTGACCTAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTAGAATCTCACTAc < 2:3409110/140‑1 (MQ=255)
aataatATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTAcc > 1:2062800/1‑140 (MQ=255)
aataatATTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCGGACCCAACTGGAGATGTGCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCGAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAGTATGACTAcc > 2:4372190/1‑140 (MQ=255)
ataataTTAAGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTAccc > 1:1364946/1‑140 (MQ=255)
aGCCACTTATTCACGAATCGATAATGCTATGGATCGGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCTGCGcc > 1:3222062/1‑140 (MQ=255)
aGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCTGCGcc > 2:2837065/1‑140 (MQ=255)
aGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCTGCGcc > 2:3097345/1‑140 (MQ=255)
aGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCTGCGcc > 1:2847795/1‑140 (MQ=255)
aGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCTGCGcc > 2:1502608/1‑140 (MQ=255)
aGCCACTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCCGCGcc > 2:2668863/1‑140 (MQ=255)
cTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCATCTGGAGGTGTTCAAGGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAAGCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGGGCCGTGGAATCTGACTACCCGTCTGCGCGCGCTg > 2:441180/1‑140 (MQ=255)
cTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTgg < 1:2484729/70‑1 (MQ=255)
cTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCTGCGCCAGCTg > 1:111390/1‑140 (MQ=255)
cTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCTGCGCCAGCTg > 2:1414311/1‑140 (MQ=255)
cTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCTGCGCCAGCTg > 2:4526895/1‑140 (MQ=255)
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CTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCTGCGCCAGCTGGAAACAGAACT > SRR14920191.233515/1‑151 (MQ=60)
CTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCTGCGCCAGCTGGAAACAGAACT > SRR14920191.3051020/1‑151 (MQ=60)
CTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCTGCGCCAGCTGGAAACAGAACT > SRR14920191.975624/1‑151 (MQ=60)
CTTATTCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCTGCGCCAGCTGGAAACAGAACT > SRR14920191.4114485/1‑151 (MQ=60)
TCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCTGCGCCAGCTGGAAACAGAACTGGGGG < SRR14920191.3744923/151‑1 (MQ=60)
TCACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCTGCGCCAGCTGGAAACAGAACTGGGGG < SRR14920191.1204321/151‑1 (MQ=60)
CACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCACCTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCTGCGCCAGCTGGAAACAGAACTGGGGGT < SRR14920191.3468668/151‑1 (MQ=60)
CACGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCTGCGCCAGCTGGAAACAGAACTGGGGGT > SRR14920191.1258238/1‑151 (MQ=60)
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ACAGAAAGTTGTTCACCCGTGGCAGGATTTATCGAAATTGCATGAGTTGCCGGAGTAATGGTCATCGGGGTATCTCCTTTATGAGTCATGGTATGAAGATACGCAGATTTACTCTTGCTTTAAAATGAATAATATTAAGCCACTTATTCATGAATCGAGAATGCTATGGATCTGACCCAACTGGAGATGTTCAACGCGGTTGCCGAAGCTGGCAGCATAACCCAGGCTGCAGCAAAAGTGCATCGCGTGCCGTCGAATCTCACTACCCGTCTGCGCCAGCTGGAAACAGAACTGGGGGT > NZ_CP025268/1619459‑1619757
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
