Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
782 |
316.7 |
10427156 |
97.0% |
10114341 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,535,342 |
T→C |
R405G (AGG→GGG) |
envZ ← |
two‑component system sensor histidine kinase EnvZ |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,535,342 | 0 | T | C | 100.0%
| 901.3
/ NA
| 269 | R405G (AGG→GGG) | envZ | two‑component system sensor histidine kinase EnvZ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (161/108); total (161/108) |
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
CCTTCTTTTGTCGTGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCTTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTG > NZ_CP025268/3535206‑3535478
|
tcttTTGTCGTGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATcc > 2:1395517/1‑140 (MQ=255)
cttTTGTCGTGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATccc > 1:3834094/1‑140 (MQ=255)
cttTTGTCGTGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATccc < 1:2479234/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGTGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGt < 2:3174764/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGTGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCGCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGt < 2:3704707/140‑1 (MQ=255)
gTGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCt > 2:3865242/1‑140 (MQ=255)
gTGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCt > 1:961292/1‑140 (MQ=255)
cccTGCGCCCGCGTTACCGGCCCTGGCAGCCAGGCGCGAATGGACAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCCCAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAAt < 1:1376529/140‑1 (MQ=255)
cccTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAAt < 2:4241050/140‑1 (MQ=255)
cccTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAACGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAAt < 1:4779714/140‑1 (MQ=255)
cccTGCGCCCGCGGTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAAt < 1:1321133/140‑1 (MQ=255)
cgcCCGCGGTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCCAGCTCCAGCATCCCGTGATGGTTATCCACGATACGCTGCACAAGTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTCATGGGgc > 2:3501040/1‑140 (MQ=255)
gcCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTgcg < 2:4498073/140‑1 (MQ=255)
cccGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTgcgc > 2:3539169/1‑140 (MQ=255)
ccGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTgcgcg < 2:4771207/140‑1 (MQ=255)
ccGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGACCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTgcgcg < 1:4198301/140‑1 (MQ=255)
gcgTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCCAATGGAAATCCCGCCCCGGTCGCTGGTGCCAAGCTGCAGCAGCCCGTGATGGTTATCCACTGTACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCa > 2:2497953/1‑140 (MQ=255)
cgTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCAc > 2:4003147/1‑140 (MQ=255)
aCCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTc > 2:691105/1‑140 (MQ=255)
aCCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTc > 1:4138742/1‑140 (MQ=255)
ggCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTcgcc > 1:356781/1‑140 (MQ=255)
aCTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCcgcg < 1:796931/140‑1 (MQ=255)
cTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCgg > 1:3058578/1‑140 (MQ=255)
cAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACaa > 1:4470477/1‑140 (MQ=255)
cAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACaa > 1:4283814/1‑140 (MQ=255)
cAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACaa < 1:3493271/140‑1 (MQ=255)
gCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAAc < 1:2958015/140‑1 (MQ=255)
ccAGGCTCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAACGTCCAGCATCCCGTTAGGGTTATCCGCGATACGCTGCACAATATCCATCCCTAATTCCGTGCCTCTAATTGAGCGCAGACTGTCGCCGGGGGCAACCg > 2:2824005/1‑140 (MQ=255)
aGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGc < 2:2236876/140‑1 (MQ=255)
aGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGc < 1:2251261/140‑1 (MQ=255)
aGGAGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGc < 2:2723354/140‑1 (MQ=255)
gcgcGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTg > 1:1562192/1‑140 (MQ=255)
cgAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGaa < 2:5017272/140‑1 (MQ=255)
gAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAAc < 1:579480/140‑1 (MQ=255)
aaTGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACa < 2:2593459/140‑1 (MQ=255)
gAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGtt > 1:4602233/1‑139 (MQ=255)
aaaGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGc < 1:3202393/140‑1 (MQ=255)
aaaGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGc < 2:2070220/140‑1 (MQ=255)
aaaGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGc < 1:4658685/140‑1 (MQ=255)
aaaGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGc < 2:2062329/140‑1 (MQ=255)
aaGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCt < 1:3133938/140‑1 (MQ=255)
gcccgcccCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTa < 1:5157023/140‑1 (MQ=255)
cgccccgcTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACgt < 2:2495628/140‑1 (MQ=255)
cgccccgcTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACgt > 2:5053758/1‑140 (MQ=255)
ccccgcTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACgttg > 1:3952382/1‑140 (MQ=255)
ccgcTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACgttgtt > 1:3160141/1‑140 (MQ=255)
ctcgctGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCg > 1:2524739/1‑140 (MQ=255)
ctcgctGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCg > 1:3475534/1‑140 (MQ=255)
cttgTGACAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGgcgc < 2:2999187/137‑1 (MQ=255)
tGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAAtt > 2:56195/1‑140 (MQ=255)
ccAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTcc < 2:1402786/140‑1 (MQ=255)
ccAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTcc > 1:20108/1‑140 (MQ=255)
ccAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTcc > 1:1536917/1‑140 (MQ=255)
ccAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTcc > 1:4810421/1‑140 (MQ=255)
gCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGa < 2:4995942/140‑1 (MQ=255)
cTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGAc > 2:4278704/1‑140 (MQ=255)
cTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGAc < 1:1805582/140‑1 (MQ=255)
cTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGAc > 2:26713/1‑140 (MQ=255)
aGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTc < 2:1600709/140‑1 (MQ=255)
aGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAACTCCCGGACCTTc > 2:2030599/1‑140 (MQ=255)
ccccTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTAGCCGTTGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCtt < 2:436455/140‑1 (MQ=255)
cccGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCtt < 2:3343703/140‑1 (MQ=255)
cccGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCtt < 2:5166372/140‑1 (MQ=255)
cccGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCtt < 1:1988494/140‑1 (MQ=255)
ccGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTc > 1:1007064/1‑140 (MQ=255)
ccGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTc > 1:842046/1‑140 (MQ=255)
ccGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTc < 1:193764/140‑1 (MQ=255)
ccGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTc > 2:4835145/1‑140 (MQ=255)
tGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTTCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTAACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTg > 2:4446698/1‑140 (MQ=255)
tGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTg > 1:1620325/1‑140 (MQ=255)
gTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGa > 1:1783115/1‑140 (MQ=255)
gTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTAACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGa > 1:5089897/1‑140 (MQ=255)
aTCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCtt < 1:914376/128‑1 (MQ=255)
aTCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCtt > 2:914376/1‑128 (MQ=255)
aTCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCtt > 2:2251022/1‑128 (MQ=255)
aTCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAAcc > 1:1213414/1‑140 (MQ=255)
aTCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAAcc > 2:2364647/1‑140 (MQ=255)
aTCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAAcc > 2:4193753/1‑140 (MQ=255)
aTCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACCGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGAGCGTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCAACCCGGAAcc > 2:2139873/1‑140 (MQ=255)
tCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCa > 1:438351/1‑140 (MQ=255)
tCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCa > 1:4546451/1‑140 (MQ=255)
cACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAgg < 1:523753/140‑1 (MQ=255)
cGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGgcg < 1:2147313/140‑1 (MQ=255)
gATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCTGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCACgcgc > 2:396485/1‑140 (MQ=255)
gATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGgcgc > 1:3650376/1‑140 (MQ=255)
aTACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCCAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGcgcg > 2:1784338/1‑140 (MQ=255)
tACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACCGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTCGAACCAGGCGCGa > 2:4591371/1‑140 (MQ=255)
tACGCTGCACAATTGCCAGCCCGAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGa > 2:5022532/1‑140 (MQ=255)
gCTGCACAATTTCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTTTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTc > 1:1089027/1‑140 (MQ=255)
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TGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTG > SRR14920191.5066975/1‑151 (MQ=60)
TGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTG > SRR14920191.3963764/1‑151 (MQ=60)
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AAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTC < SRR14920191.3211563/151‑1 (MQ=60)
AAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCC < SRR14920191.1356339/151‑1 (MQ=60)
AAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCC < SRR14920191.3142977/151‑1 (MQ=60)
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CAATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGCGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCT > SRR14920191.2790328/1‑151 (MQ=60)
ATTGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACATGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGTAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGA > SRR14920191.450328/1‑151 (MQ=60)
TGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGCCCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACT > SRR14920191.4662728/1‑151 (MQ=60)
TGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACT > SRR14920191.2956550/1‑151 (MQ=60)
TGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACT > SRR14920191.5170629/1‑151 (MQ=60)
TGCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACT > SRR14920191.1319794/1‑151 (MQ=60)
GCCAGCCCTAATCCCGTGCCGCGAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGGGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCCCCGTTCCGCTGCTGACTT > SRR14920191.2249053/1‑151 (MQ=60)
CCAGCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACTTT < SRR14920191.2999734/151‑1 (MQ=60)
GCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGTACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACTTTGAT > SRR14920191.4463604/1‑151 (MQ=60)
GCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCTTTCCGCTGCTGACTTTGAT > SRR14920191.1937535/1‑151 (MQ=60)
GCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACTTTGAT < SRR14920191.3407710/151‑1 (MQ=60)
GCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACTTTGAT > SRR14920191.2361163/1‑151 (MQ=60)
GCCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACTTTGAT > SRR14920191.1937553/1‑151 (MQ=60)
CCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTTCTGACTTTGATC > SRR14920191.3656357/1‑151 (MQ=60)
CCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACTTTGATC > SRR14920191.1146640/1‑151 (MQ=60)
CCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACTTTGATC > SRR14920191.2096489/1‑151 (MQ=60)
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CCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACTTTGATC > SRR14920191.893759/1‑151 (MQ=60)
CCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACTTTGATC > SRR14920191.3445340/1‑151 (MQ=60)
CCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACTTTGATC > SRR14920191.1147007/1‑151 (MQ=60)
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CCCTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGGCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCACTTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACTTTGATC > SRR14920191.3441121/1‑151 (MQ=60)
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TCCCGTTTATTTACCCTTCTTTTGTCGTGCCCTGCGCCCGCGTTACCGGCACTGGCAGCCAGGCGCGAATGGAAAGCCCGCCCCGCTCGCTGGTGCCAAGCTCCAGCATCCCGTTATGGTTATCCACGATACGCTGCACAATTGCCAGCCTTAATCCCGTGCCGCTAATGGTGCGCGCACTGTCGCCGCGGACAAACGGCTGGAACAGGTGCTTACGTTGTTCCGGCGCAATTCCCGGACCGTCATCTTCCACCTGGAACCAGGCGCGATTCGGCTCCGTTCCGCTGCTGACTTTGATC > NZ_CP025268/3535192‑3535490
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |