Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
782 |
316.7 |
10427156 |
97.0% |
10114341 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
4,449,793 |
+T |
pseudogene (3757/3779 nt) |
tamB → |
autotransporter assembly complex protein TamB |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 4,449,791 | 1 | . | T | 98.2%
| 1641.4
/ 14.8
| 445 | pseudogene (3755/3779 nt) | tamB | autotransporter assembly complex protein TamB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (6/2); new base T (232/204); total (239/206) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.95e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 469 total aligned reads displayed.
GTCAGCGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGA‑TT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGTA > NZ_CP025268/4449652‑4449924
|
cGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGA‑tttgc > 1:2698621/1‑137 (MQ=255)
cGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGGGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCATGCACT‑GGA‑tttgc > 2:2335979/1‑137 (MQ=255)
ttGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGtt < 1:3551818/140‑1 (MQ=255)
gCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCg < 1:3616775/140‑1 (MQ=255)
ggTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGtt > 1:729339/1‑140 (MQ=255)
tcggCAAGTGAAATACTGCGTCGGTAGATTTGACTCTCTAGCAACCCCCACGTTCCGTTCTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGtttt > 2:601490/4‑140 (MQ=255)
tCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGGGTCGGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGtttt > 1:3570251/1‑140 (MQ=255)
tCTGCAAGTGAAATACGGCGGGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTAGCGCCGGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGgttt > 2:1360853/1‑140 (MQ=255)
ggCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑ACTCTATCAGTTCGAGGTTTat > 2:2938746/2‑139 (MQ=255)
aaGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCaa > 2:5161030/1‑140 (MQ=255)
gAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCg < 1:3161437/140‑1 (MQ=255)
gAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTATATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCg < 2:4666682/140‑1 (MQ=255)
aaaTACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAAGGCGa > 1:1911580/1‑140 (MQ=255)
aaTACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGaa < 1:5199629/140‑1 (MQ=255)
aCGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGCTGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGCCCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAatat < 2:4826168/140‑1 (MQ=255)
aCGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAatat < 1:172070/140‑1 (MQ=255)
aCGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAatat < 1:3478923/140‑1 (MQ=255)
cGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGt > 1:4141659/1‑140 (MQ=255)
cGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACCTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTCGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GATCTCTCAGTTCGAGTTTTAGAAATGCGAATATTAGt > 2:3547497/1‑140 (MQ=255)
tataTTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACgg < 1:683045/140‑1 (MQ=255)
tataTTTGACCCTATAGAAACCCTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTCTCTGGTGTAGCCCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACgg < 1:2815408/140‑1 (MQ=255)
tatTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCa < 1:1481731/140‑1 (MQ=255)
tGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGttt < 1:1975458/140‑1 (MQ=255)
aCTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTAc > 1:3283277/1‑140 (MQ=255)
aCTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTAc > 2:3277847/1‑140 (MQ=255)
aCTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTAc > 2:4003453/1‑140 (MQ=255)
ctctATAGCAACACTCACGTTCCGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGAGCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACTGCAGTTTACg > 1:3072963/1‑140 (MQ=255)
ctctATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACg < 1:877045/140‑1 (MQ=255)
ctATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGcc < 1:1386723/140‑1 (MQ=255)
tataGCAACCCTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCca < 2:2810697/140‑1 (MQ=255)
taGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCcaca > 1:2403864/1‑140 (MQ=255)
taGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCcaca < 1:2271029/140‑1 (MQ=255)
taGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCcaca > 1:3843454/1‑140 (MQ=255)
taGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCcaca > 1:335436/1‑140 (MQ=255)
aGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATTTCTGGAAGCCGTTTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGA‑TTGGCTCTAACAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACTGCAGTTTACGCCacaa > 1:2867196/1‑140 (MQ=255)
aaCACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCacaaaca < 1:1579466/140‑1 (MQ=255)
cacTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAg > 1:2542140/1‑140 (MQ=255)
cTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGc > 1:1179649/1‑140 (MQ=255)
cTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGc > 1:4336587/1‑140 (MQ=255)
cTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGc > 2:1786507/1‑140 (MQ=255)
cTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGc < 1:839828/140‑1 (MQ=255)
cACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa < 2:3741855/140‑1 (MQ=255)
cACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa < 2:1540280/140‑1 (MQ=255)
tacgttaTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTc < 1:3795768/140‑1 (MQ=255)
acgttaTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCacaaaca > 1:2076467/1‑128 (MQ=255)
aTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGa > 2:2160919/1‑140 (MQ=255)
aTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGa < 2:2575990/140‑1 (MQ=255)
tCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGAt < 2:952868/140‑1 (MQ=255)
tCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGAt > 1:4621949/1‑140 (MQ=255)
tGATGCCTAAGCTATAGCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCGCTGGGT‑TT‑GCTCTATGAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAATGCAACAGTCACTGGATGACCa > 2:2972736/1‑140 (MQ=255)
gATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCaa < 1:1335445/140‑1 (MQ=255)
gATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCaa < 1:1462015/140‑1 (MQ=255)
aTGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAAt > 2:4722925/1‑140 (MQ=255)
tGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATg < 2:301185/140‑1 (MQ=255)
tGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATg < 2:5069286/140‑1 (MQ=255)
ccTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCCCT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGcc < 2:2025526/140‑1 (MQ=255)
ccTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGcc < 2:4371351/140‑1 (MQ=255)
cTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCGCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGccc < 2:2398764/140‑1 (MQ=255)
aaGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGAt < 2:1473333/127‑1 (MQ=255)
aGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTGCGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGt > 2:4247762/1‑140 (MQ=255)
atCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTgg > 2:2194728/1‑140 (MQ=255)
atCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTgg > 2:3082446/1‑140 (MQ=255)
cTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCCATGCGAATATTTGTCTCCGGCAGTTTACGCCACAAACACGGCAACCGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGc < 2:1081111/140‑1 (MQ=255)
cTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGc < 2:1650294/140‑1 (MQ=255)
gAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGAt > 1:1120456/1‑140 (MQ=255)
gAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGAt > 1:3902782/1‑140 (MQ=255)
gAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGAt > 1:4461723/1‑140 (MQ=255)
aGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGAttt < 2:1971213/140‑1 (MQ=255)
ccGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCa > 1:5047307/1‑140 (MQ=255)
ccGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGAGGT‑GCTCTATCAGTGCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATGTCa > 2:671889/1‑140 (MQ=255)
tgtgtgGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAATGCGAGGTTTAGAATTGCGAAGATTTGTCGACGGCAGTCCACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAACCGCCAGTTACTGGGCGATGTCAgca > 2:4151867/1‑138 (MQ=255)
tgtCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTa < 1:2139786/140‑1 (MQ=255)
gtCTGGTGTAGACCAGGCGCT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGAAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCGACAAACAAGGCAACAGCCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTAt < 1:4801519/140‑1 (MQ=255)
tCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATc > 1:4096208/1‑140 (MQ=255)
gtgtAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATa < 2:1942008/140‑1 (MQ=255)
tcgACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCCGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGACACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACt < 1:2938746/138‑1 (MQ=255)
tAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCACTGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACt < 2:1281626/140‑1 (MQ=255)
tAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACt < 1:4755020/140‑1 (MQ=255)
tAGACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACt < 1:27427/140‑1 (MQ=255)
gACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTAc < 1:993260/140‑1 (MQ=255)
gACCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTAc < 2:2910787/140‑1 (MQ=255)
aCCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTAcc > 2:4212926/1‑140 (MQ=255)
aCCAGGCACT‑GGATTT‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTAcc > 1:2972569/1‑140 (MQ=255)
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TTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATTTCTGGAAGCCGTTTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑T‑TGGCTCTAACAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACTGCAGTTTACGCCACAA > SRR14920191.2874984/1‑151 (MQ=60)
TGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAAC < SRR14920191.691628/151‑1 (MQ=60)
TGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAAC < SRR14920191.1980808/151‑1 (MQ=60)
CTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAG > SRR14920191.1754963/1‑151 (MQ=60)
CTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAG > SRR14920191.2548933/1‑151 (MQ=60)
CTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAG < SRR14920191.879480/151‑1 (MQ=60)
CTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAG > SRR14920191.4636106/1‑151 (MQ=60)
CTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGGTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAG > SRR14920191.402008/1‑151 (MQ=60)
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CTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGC > SRR14920191.3617868/1‑151 (MQ=60)
CTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGC > SRR14920191.3531447/1‑151 (MQ=60)
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CTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGC > SRR14920191.1947274/1‑151 (MQ=60)
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CTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑T‑TGGCGCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGC > SRR14920191.3958414/1‑151 (MQ=60)
CTATAGCAACACTCACGTTACGGTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTGTGCGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGC > SRR14920191.4325723/1‑151 (MQ=60)
ATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAA > SRR14920191.695462/1‑151 (MQ=60)
TAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAAC < SRR14920191.2277144/151‑1 (MQ=60)
TAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAAC < SRR14920191.3667177/151‑1 (MQ=60)
cagACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAG < SRR14920191.4181524/148‑1 (MQ=60)
GCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAG < SRR14920191.2746711/151‑1 (MQ=60)
AACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTC < SRR14920191.1583728/151‑1 (MQ=60)
ACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCC > SRR14920191.2082133/1‑151 (MQ=60)
ACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGAAACAGTCA > SRR14920191.3443751/1‑151 (MQ=60)
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CGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATG > SRR14920191.124039/1‑151 (MQ=60)
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ACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCA < SRR14920191.2795919/151‑1 (MQ=60)
GTTATCGCCTTATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCGCTGGATGACCAAT > SRR14920191.4591014/1‑151 (MQ=60)
ATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCC > SRR14920191.203069/1‑151 (MQ=60)
TCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCC < SRR14920191.416812/151‑1 (MQ=60)
GCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCct > SRR14920191.1477296/1‑149 (MQ=60)
GATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTAC < SRR14920191.1465952/151‑1 (MQ=60)
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ATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCA > SRR14920191.598103/1‑151 (MQ=60)
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TCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTA > SRR14920191.3141094/1‑151 (MQ=60)
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GCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAA > SRR14920191.1241484/1‑151 (MQ=60)
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CACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGTATAGCCTGGGC < SRR14920191.198841/151‑1 (MQ=60)
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T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTctgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgatcagtatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaaatagagaaagagaaatgcattaatgggcat > SRR14920191.2936130/1‑50 (MQ=60)
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AGGTAGTGGTCAGCGGCTATGTATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑T‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGTATAGCCTGGGCCACTATCCA > NZ_CP025268/4449644‑4449943
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |