Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
782 |
316.7 |
10427156 |
97.0% |
10114341 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
4,449,815 |
A→G |
pseudogene (3779/3779 nt) |
tamB → |
autotransporter assembly complex protein TamB |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 4,449,815 | 0 | A | G | 99.8%
| 1500.3
/ NA
| 447 | pseudogene (3779/3779 nt) | tamB | autotransporter assembly complex protein TamB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (225/219); total (225/222) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 447 total aligned reads displayed.
AAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGA‑T‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGTATAGCCTGGGCCACTATCCAGGCGCA > NZ_CP025268/4449680‑4449949
|
aaGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCaa > 2:5161030/1‑140 (MQ=255)
gagaTACGGCGTGGGTATATTTGCCTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTACGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCg < 2:4742362/137‑1 (MQ=255)
aaaTACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAAGGCGa > 1:1911580/1‑140 (MQ=255)
aaTACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGaa < 1:5199629/140‑1 (MQ=255)
ccGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCCCGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTTTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAatat < 2:2273212/139‑1 (MQ=255)
aCGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTAACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCCTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCCGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAatat < 2:5031069/140‑1 (MQ=255)
cGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGt > 2:2580926/1‑140 (MQ=255)
tGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGttt < 1:1975458/140‑1 (MQ=255)
ctctATAGCAACACTCACGTTCCGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGAGCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACTGCAGTTTACg > 1:3072963/1‑140 (MQ=255)
ctctATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACg > 1:2701789/1‑140 (MQ=255)
tctATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGc < 2:1960225/140‑1 (MQ=255)
tctATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGc > 2:245163/1‑140 (MQ=255)
tctATAGCAACACTCACGATACGTTATCGCCTGATGCCTAAGTTATATCTGGAAGCAGTGTCTGGTGTAGACAAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGCTGTAGCAATGCGAATATTTGTGTAGGGCAGTGTACgg > 2:820420/1‑139 (MQ=255)
ctATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGcc < 1:1497118/140‑1 (MQ=255)
ctATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCGCAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGcc < 2:4692695/140‑1 (MQ=255)
tataGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCca > 1:2575234/1‑140 (MQ=255)
tataGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCca > 2:2980709/1‑140 (MQ=255)
taGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCcaca < 1:2271029/140‑1 (MQ=255)
taGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCcaca < 1:3657120/140‑1 (MQ=255)
taGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCGGGTGCAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTGCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTCGTCTACGGCAGTTTACGCcaca > 1:3399687/1‑140 (MQ=255)
gCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCacaaa < 2:4455680/140‑1 (MQ=255)
acacTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCacaaacaa > 2:1980565/1‑140 (MQ=255)
cacTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAg > 2:4966515/1‑140 (MQ=255)
cTCCCGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTCTATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACACACCAGGc > 2:1259190/1‑140 (MQ=255)
cTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTCGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGc > 1:2497755/1‑140 (MQ=255)
cTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGc > 1:2916592/1‑140 (MQ=255)
cTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGc > 2:2942891/1‑140 (MQ=255)
cTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGc > 1:1179649/1‑140 (MQ=255)
cccgttacgttaTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa < 2:1540393/138‑1 (MQ=255)
cACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa > 1:693458/1‑140 (MQ=255)
cACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa > 2:4233795/1‑140 (MQ=255)
cACGTTAAGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGACGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGCGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCaa < 1:4074836/140‑1 (MQ=255)
ttacgttaTCGCCTGATGCCTAAGCTCTATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGt < 2:4286174/140‑1 (MQ=255)
ttacgtcaTCGCCTGATGCCTAATCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGt < 2:5072288/140‑1 (MQ=255)
acgttaTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCa > 2:3039083/1‑140 (MQ=255)
acgttaTCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCa < 1:2788469/140‑1 (MQ=255)
tCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGAt < 2:952868/140‑1 (MQ=255)
tCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGAt > 1:4621949/1‑140 (MQ=255)
tCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGAt < 1:415615/140‑1 (MQ=255)
ccTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGAc < 1:2820766/140‑1 (MQ=255)
gATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCaa < 2:3940286/140‑1 (MQ=255)
tGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATg < 2:3463751/140‑1 (MQ=255)
aaGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGAt < 2:1473333/127‑1 (MQ=255)
aGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGt > 2:2736663/1‑140 (MQ=255)
tataTGTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTAc < 1:3533668/140‑1 (MQ=255)
tataTCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTAc < 1:4264699/140‑1 (MQ=255)
tatCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTg > 1:4435230/1‑140 (MQ=255)
tCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTggg > 1:2383037/1‑140 (MQ=255)
cTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGc < 1:3273420/140‑1 (MQ=255)
cTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGc < 2:2217575/140‑1 (MQ=255)
cTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGc < 1:1295838/140‑1 (MQ=255)
gAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGcc > 2:1347635/1‑125 (MQ=255)
gAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGAt > 1:1120456/1‑140 (MQ=255)
aaGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCaa > 1:904458/1‑120 (MQ=255)
aaGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGAtt > 1:3912122/1‑140 (MQ=255)
aaGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGAtt > 1:4369930/1‑140 (MQ=255)
aGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGAttt < 2:102785/140‑1 (MQ=255)
ccGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCa > 2:3609054/1‑140 (MQ=255)
ccGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCa > 1:5047307/1‑140 (MQ=255)
tgtgtgGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAATGCGAGGTTTAGAATTGCGAAGATTTGTCGACGGCAGTCCACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAACCGCCAGTTACTGGGCGATGTCAgca > 2:4151867/1‑138 (MQ=255)
tgtCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTa > 1:1450475/1‑140 (MQ=255)
tgtCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTa > 2:680344/1‑140 (MQ=255)
tgtCTGGTGTAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTa < 1:2139157/140‑1 (MQ=255)
gtgtAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATa > 2:1741800/1‑140 (MQ=255)
tAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACt < 1:4755020/140‑1 (MQ=255)
tAGACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACt < 2:1822557/140‑1 (MQ=255)
tAGACCAGGAACT‑GGA‑TCTGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACt < 2:609329/140‑1 (MQ=255)
gACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTAc < 1:1741434/140‑1 (MQ=255)
gACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTAc < 2:2910876/140‑1 (MQ=255)
gACCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCGATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTAc < 2:2367148/140‑1 (MQ=255)
aCCAGGGACTGGGT‑T‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTAcc > 2:1654341/1‑140 (MQ=255)
aCCAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTAcc > 1:4856713/1‑140 (MQ=255)
cAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAg < 2:3334546/140‑1 (MQ=255)
cAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAg < 1:3833497/140‑1 (MQ=255)
cAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAg < 1:1816782/140‑1 (MQ=255)
cAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAg < 2:210548/140‑1 (MQ=255)
cAGGCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGAACTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAg < 1:4304055/140‑1 (MQ=255)
ggCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGtt > 1:1032763/1‑140 (MQ=255)
ggCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGtt > 1:2953578/1‑140 (MQ=255)
ggCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGtt > 2:4875555/1‑140 (MQ=255)
ggCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGtt > 2:2162665/1‑140 (MQ=255)
gCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAg < 1:804846/137‑1 (MQ=255)
gCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTg > 1:35837/1‑140 (MQ=255)
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gCACT‑GGATT‑TGCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTg > 2:289666/1‑140 (MQ=255)
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CTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGC > SRR14920191.1401493/1‑151 (MQ=60)
CTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGC < SRR14920191.1501164/151‑1 (MQ=60)
CTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGC > SRR14920191.2798596/1‑151 (MQ=60)
CTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGC > SRR14920191.1947274/1‑151 (MQ=60)
CTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑T‑TGGCGCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGC > SRR14920191.3958414/1‑151 (MQ=60)
CTATAGCAACACTCACGTTACGGTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTGTGCGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGC > SRR14920191.4325723/1‑151 (MQ=60)
ATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAA > SRR14920191.1799486/1‑151 (MQ=60)
ATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAA > SRR14920191.695462/1‑151 (MQ=60)
ATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAA > SRR14920191.694596/1‑151 (MQ=60)
TAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAAC < SRR14920191.3667177/151‑1 (MQ=60)
TAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAAC < SRR14920191.2277144/151‑1 (MQ=60)
cagACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAG < SRR14920191.4181524/148‑1 (MQ=60)
GCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAG < SRR14920191.2746711/151‑1 (MQ=60)
AACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTC < SRR14920191.1583728/151‑1 (MQ=60)
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ACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGAAACAGTCA > SRR14920191.3443751/1‑151 (MQ=60)
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CACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGA < SRR14920191.1971649/151‑1 (MQ=60)
CACGTTAAGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGACGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGCGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGA < SRR14920191.4086570/151‑1 (MQ=60)
CGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATG > SRR14920191.124039/1‑151 (MQ=60)
TTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGAC > SRR14920191.1707603/1‑151 (MQ=60)
TACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACC < SRR14920191.3806412/151‑1 (MQ=60)
GTTATCGCCTTATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCGCTGGATGACCAAT > SRR14920191.4591014/1‑151 (MQ=60)
ATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCC > SRR14920191.203069/1‑151 (MQ=60)
GCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCct > SRR14920191.1477296/1‑149 (MQ=60)
TGATGCCTAAGCGATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTA < SRR14920191.4464591/151‑1 (MQ=60)
GATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTAC < SRR14920191.444995/151‑1 (MQ=60)
GATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTAC < SRR14920191.1338946/151‑1 (MQ=60)
GATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTAC < SRR14920191.2334101/151‑1 (MQ=60)
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atactgatcggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAAC < SRR14920191.953587/107‑1 (MQ=60)
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GGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGTATAGCCTGGGCCACT > SRR14920191.4695214/1‑151 (MQ=60)
GGATT‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGTATAGCCTGGGCCACT > SRR14920191.4693980/1‑151 (MQ=60)
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CGAGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGTATAGCCTGGGCCACTATCCAGGCGCAGTTCCGG < SRR14920191.4977138/151‑1 (MQ=60)
AGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGTATAGCCTGGGCCACTATCCAGGCGCAGTTCCGGGG > SRR14920191.4815827/1‑151 (MQ=60)
AGTTTTAGCAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGTATAGCCTGGGCCACTATCCAGGCGCAGTTCCGGGG > SRR14920191.4259585/1‑151 (MQ=60)
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ATTGCCAGGTCTGCAAGTGAAATACGGCGTGGGTATATTTGACTCTATAGCAACACTCACGTTACGTTATCGCCTGATGCCTAAGCTATATCTGGAAGCCGTGTCTGGTGTAGACCAGGCACTGGA‑T‑T‑GCTCTATCAGTTCGAGTTTTAACAATGCGAATATTTGTCTACGGCAGTTTACGCCACAAACAAGGCAACAGTCACTGGATGACCAATGCCCAGTTACTGGGCGATTTCAGTATCGATAACTACCAGTTGTATAGCCTGGGCCACTATCCAGGCGCAGTTCCGGGG > NZ_CP025268/4449666‑4449958
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |