Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R5
|
785 |
665.2 |
22963641 |
98.6% |
22642150 |
138.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,643,849 |
T→C |
*166* (TAA→TAG) |
rzpQ ← |
DUF2514 domain‑containing protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,643,849 | 0 | T | C | 98.2%
| 919.2
/ NA
| 274 | *166* (TAA→TAG) | rzpQ | DUF2514 domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (182/87); minor base A (5/0); total (187/87) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.82e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
ATTTATTAATAAAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCTTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTC > NZ_CP025268/1643712‑1643985
|
atttattAATAAAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTa > 1:8368016/1‑140 (MQ=255)
tttattAATAAAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTGAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTAc > 1:9661105/1‑140 (MQ=255)
attaATAAAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACAtt > 1:7691566/1‑140 (MQ=255)
taataaAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTg > 1:8271108/1‑140 (MQ=255)
taataaAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTg > 1:3101796/1‑140 (MQ=255)
aataaAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGa < 2:4615346/140‑1 (MQ=255)
aataaAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTGTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGa > 2:3772106/1‑140 (MQ=255)
aatcGTGTGATGCTGATTAAGACCTGTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCGTGGTATTTAAATTTTACATTCGGCGCGGTAAAGGTGCCGAGTTACTGGTAGGCTACGTTTGATGCt > 2:3990749/4‑140 (MQ=255)
aaaCGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCt > 2:5715385/1‑140 (MQ=255)
gtgtCATTCTGATTAAGACCGTGGATCTTACCCGTAAGATTTCAGGAATTTTGGCACATGGAAGAGTCCTTTGTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCttttt < 2:11128197/140‑1 (MQ=255)
gtCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTAt < 2:8365233/140‑1 (MQ=255)
gtCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTAt < 1:3016718/140‑1 (MQ=255)
gtCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTAt > 1:5816737/1‑140 (MQ=255)
tCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTAtc > 2:3476787/1‑140 (MQ=255)
tCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGACTTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCATACATTTGATGCTGGTTAGctctg > 1:6923162/1‑139 (MQ=255)
gATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGACTTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACCTTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTTATTTTACCCTACATTTGATGCTTTTTAGATCTTata > 2:9444539/1‑138 (MQ=255)
aTTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGACTTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATGTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAg > 1:11128198/1‑140 (MQ=255)
aTTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAg < 2:3240786/140‑1 (MQ=255)
aTTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAg > 2:10233104/1‑140 (MQ=255)
aTTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATATATTAAAg > 1:6188768/1‑140 (MQ=255)
tAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGAt > 1:5615773/1‑140 (MQ=255)
aCCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTAt > 2:5639625/1‑125 (MQ=255)
tttATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTTGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCTCGATGTAAATGTTCCGTTTTAATATTAACCTACATTTGATGCTTTTTTTCTCTTAAAGATGCGTAGAt > 2:10531240/1‑140 (MQ=255)
tttATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATg > 1:5651268/1‑113 (MQ=255)
tttATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTAt < 1:10965088/121‑1 (MQ=255)
tttATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTAt > 1:9425437/1‑121 (MQ=255)
tttATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTTAAGATTCATAGAt > 1:11232145/1‑140 (MQ=255)
tttATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCatatat > 2:5404131/1‑140 (MQ=255)
tttATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGAt > 1:3283265/1‑140 (MQ=255)
tttATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGGTCCGATTTTTTATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAgtt > 2:8178346/1‑138 (MQ=255)
cTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGtt > 1:1166773/1‑140 (MQ=255)
tACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGa < 1:10233105/140‑1 (MQ=255)
aCCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGTAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAATTGTTCCGTTTTAATATTACACTACATTTGTTGCTTTTTGTCTATTATAGATTCATAGATCTGTTgtc > 2:5885874/1‑138 (MQ=255)
aCCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGACGAGTCCTTTTTCTTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGAGTTAATATTACCCTACATGTGATGCTTTTTCTCTCTTAAAGATTCATCGATCTGTTGAc > 1:10001702/1‑140 (MQ=255)
aCCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGa > 2:5615643/1‑103 (MQ=255)
aCCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATATATCTGTTGAc > 1:2214181/1‑140 (MQ=255)
aCCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGAc > 1:3990659/1‑140 (MQ=255)
aCCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGAc > 1:1977414/1‑140 (MQ=255)
aCCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGAc > 2:3146307/1‑140 (MQ=255)
aCCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGAc > 1:5573652/1‑140 (MQ=255)
aCCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTACGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGAc > 2:9288161/1‑140 (MQ=255)
aaGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCa > 1:10780286/1‑140 (MQ=255)
aGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCAc < 2:9822458/140‑1 (MQ=255)
tttCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTcc < 1:2862484/140‑1 (MQ=255)
ttCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCt > 2:1540190/1‑140 (MQ=255)
ttCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCt > 1:7606351/1‑140 (MQ=255)
ttCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCt < 1:57044/140‑1 (MQ=255)
tCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGTCAAGTCACTCCTg > 1:9311602/1‑140 (MQ=255)
tCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTg > 1:3528993/1‑140 (MQ=255)
tCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTg < 2:11148343/140‑1 (MQ=255)
cAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGc < 2:1083425/140‑1 (MQ=255)
aGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCg > 2:1202353/1‑140 (MQ=255)
aGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCg < 2:6846619/140‑1 (MQ=255)
aGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTGTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACCAGTCACTCCTGCg > 1:2477792/1‑140 (MQ=255)
ttttGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGa < 1:542716/84‑1 (MQ=255)
ttttGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGa > 2:542716/1‑84 (MQ=255)
ttttGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGAt > 1:10191674/1‑113 (MQ=255)
tCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCg < 1:6698932/140‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTa < 1:7864950/83‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTa > 2:7864949/1‑83 (MQ=255)
tGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTa > 2:887531/1‑83 (MQ=255)
tGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTa < 1:887531/83‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCa > 1:2416799/1‑140 (MQ=255)
ggAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACa < 2:6584623/111‑1 (MQ=255)
ggAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACa > 1:9549911/1‑111 (MQ=255)
gTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAAttt < 1:6103202/140‑1 (MQ=255)
tCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTc > 1:684771/1‑140 (MQ=255)
tCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTc > 1:9712095/1‑140 (MQ=255)
ccTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAAtttaa > 2:10169277/1‑138 (MQ=255)
tttttATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATTTTCAGATTTAATATTACAATACATTTGTTGGTTTTTATATATTAAAGATTAATTTATATTTTGACCATTAACTACTGCGATGTAGAGTTAGTCAGCAATTTAAGc > 2:7328435/1‑140 (MQ=255)
tttatttaAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCAt > 2:4495638/1‑140 (MQ=255)
ttaAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGc > 1:4845507/1‑140 (MQ=255)
ttaAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGc > 1:5162305/1‑140 (MQ=255)
ttaAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGc > 1:6420566/1‑140 (MQ=255)
ttttACAGTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATCTTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGc < 2:6417253/140‑1 (MQ=255)
tCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTctgctg < 2:11232144/140‑1 (MQ=255)
cgATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGa > 1:8214977/1‑75 (MQ=255)
aaaTGTTCCGATTTAATATTACCCTACCTTTGATGCTTTTTCTCTCATAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTcc < 2:8206257/140‑1 (MQ=255)
aaaTGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTcc < 2:9588471/140‑1 (MQ=255)
aTGTTCCGATTTAATATTACCCTCCATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGa < 2:4910977/140‑1 (MQ=255)
gTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGc < 2:7768044/140‑1 (MQ=255)
ccGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTGATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATg > 1:2105739/1‑140 (MQ=255)
ccGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCCGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATg > 1:10533687/1‑140 (MQ=255)
ccGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGa > 2:8246098/1‑135 (MQ=255)
ccGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATg > 1:1364911/1‑140 (MQ=255)
ccGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATg > 1:11286646/1‑140 (MQ=255)
ccGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATg > 1:8079279/1‑140 (MQ=255)
ccGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATg > 2:10391346/1‑140 (MQ=255)
ccGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATg > 2:1786586/1‑140 (MQ=255)
ccGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATg > 2:4934351/1‑140 (MQ=255)
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GTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTT > SRR14920198.931983/1‑151 (MQ=60)
GTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTT > SRR14920198.9188493/1‑151 (MQ=60)
GTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTT > SRR14920198.1897591/1‑151 (MQ=60)
GTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTT > SRR14920198.1899870/1‑151 (MQ=60)
GTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTT > SRR14920198.4239659/1‑151 (MQ=60)
TAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacggactcctatctcgtatgccgtcttctg > SRR14920198.2633894/1‑89 (MQ=60)
AAATGGTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGG < SRR14920198.3104910/151‑1 (MQ=60)
ATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTG < SRR14920198.8300764/151‑1 (MQ=60)
ATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTG < SRR14920198.9349797/151‑1 (MQ=60)
CCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCAT < SRR14920198.989419/151‑1 (MQ=60)
GATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTC > SRR14920198.6337997/1‑151 (MQ=60)
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ATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTCC > SRR14920198.7690266/1‑151 (MQ=60)
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TTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTCCT < SRR14920198.11253348/151‑1 (MQ=60)
TAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCACTATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTCCTTC > SRR14920198.6132420/1‑151 (MQ=60)
TAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTCCTTC > SRR14920198.11133775/1‑151 (MQ=60)
TAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTCCTTC > SRR14920198.196796/1‑151 (MQ=60)
AATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTCCTTCG > SRR14920198.9590816/1‑151 (MQ=60)
ATGTTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTCCTTCGG > SRR14920198.11372604/1‑151 (MQ=60)
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ACCCTACAGTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGAATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCTATATCTCCGAGCCTGTTGGTGAGCATTCCTTCGGCGGTT > SRR14920198.10187116/1‑151 (MQ=60)
CCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTCCTTCGGCGGTTT > SRR14920198.6407726/1‑151 (MQ=60)
CCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTCCTTCGGCGGTTT > SRR14920198.8853064/1‑151 (MQ=60)
CCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTCCTTCGGCGGTTT > SRR14920198.3169827/1‑151 (MQ=60)
CCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCGTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTCCTTCGGCGGTTT > SRR14920198.7642643/1‑151 (MQ=60)
CCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTCCTTCGGCGGTTTT > SRR14920198.8990116/1‑151 (MQ=60)
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AAAGAATAGCTTTATTTATTAATAAAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCTTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTCCTTCGGCGGTTTT > NZ_CP025268/1643699‑1643998
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |