Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R2
|
781 |
700.4 |
23289492 |
98.5% |
22940149 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,643,849 |
T→C |
*166* (TAA→TAG) |
rzpQ ← |
DUF2514 domain‑containing protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,643,849 | 0 | T | C | 99.0%
| 698.4
/ NA
| 204 | *166* (TAA→TAG) | rzpQ | DUF2514 domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (146/56); minor base G (2/0); total (148/56) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
TTTATTAATAAAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCTTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTC > NZ_CP025268/1643713‑1643985
|
taataaAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGACTTTTGGCTCATGGAAGAGTGCTGTGTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTg > 1:9002026/1‑140 (MQ=255)
taataaAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTg > 1:7950073/1‑140 (MQ=255)
taataaAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTg > 2:4623561/1‑140 (MQ=255)
taataaAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTg > 1:9260688/1‑140 (MQ=255)
aataaAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATATTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGa < 2:6669367/140‑1 (MQ=255)
gtgtCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCttttt > 1:11478858/1‑140 (MQ=255)
tCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTGTTATTTAAATTGTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATGTCTTATTTCCGTACATGTGATGATTTTTAtc > 1:9149412/1‑140 (MQ=255)
ttCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATctct < 2:10467526/140‑1 (MQ=255)
cTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTa < 1:2255957/140‑1 (MQ=255)
tGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTAACCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTaa > 1:7106983/1‑140 (MQ=255)
aTTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGa < 2:78047/121‑1 (MQ=255)
aTTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGa > 1:1539283/1‑121 (MQ=255)
aTTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAg > 1:7538514/1‑140 (MQ=255)
aTTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAg > 1:735005/1‑140 (MQ=255)
aTTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAg > 1:2551535/1‑140 (MQ=255)
aTTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAg < 2:153019/140‑1 (MQ=255)
aTTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCAGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAg > 2:8313919/1‑140 (MQ=255)
aTTAAGACCTTTTATCTTACCCATAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATATAACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGTTGCTTTTTATATCTTAAAg > 1:4159377/1‑140 (MQ=255)
gACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCttttt > 1:5873606/1‑124 (MQ=255)
gACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCttttt < 2:5873606/124‑1 (MQ=255)
ccTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATa < 1:10331453/140‑1 (MQ=255)
cTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAg < 1:9308907/140‑1 (MQ=255)
tttATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGag > 2:1657964/1‑139 (MQ=255)
tttATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGAt > 1:429975/1‑140 (MQ=255)
tttATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGAt > 1:5356248/1‑140 (MQ=255)
tttATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGAt > 1:8893718/1‑140 (MQ=255)
tttATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGAt > 1:298604/1‑140 (MQ=255)
tttATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGAt > 1:2324436/1‑140 (MQ=255)
tttATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGAt > 2:10777709/1‑140 (MQ=255)
tttATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGAt < 2:1208263/140‑1 (MQ=255)
tttATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATGTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGAt > 1:7623375/1‑140 (MQ=255)
tttATCTTACCCTTAAGAATTCAGGAATTTAGGCTCATGGATGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTAAATTCCGCGATGTAAATGTTACGATTTAATATAACCCTACATTTGATGATTTTTTTCTCTTAAAGATTAATAGag > 2:9508382/1‑139 (MQ=255)
tttATCTTACACTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGag > 2:11532442/1‑139 (MQ=255)
tCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGt < 2:1489957/140‑1 (MQ=255)
tACCCTTTAGATTTCATGAATTTTTGCTCATGTCAGAGTCATTTTTATTTAATTTTTCCATTCCGCTATGTAATTGTTCCCATTTATGATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTATTAAATTTTCATAGATCTGTTgt < 2:8637521/140‑2 (MQ=255)
aCCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGAc > 2:9301553/1‑140 (MQ=255)
aCCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGAc > 1:6659581/1‑140 (MQ=255)
aCCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGAc > 1:4451601/1‑140 (MQ=255)
aCCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTGTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGAc > 2:10338308/1‑140 (MQ=255)
cccTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACa > 1:8651384/1‑140 (MQ=255)
ttAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGt < 1:1687805/140‑1 (MQ=255)
ttAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGt < 2:1439174/140‑1 (MQ=255)
ttAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGt > 1:7792863/1‑140 (MQ=255)
ttAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGt < 2:3573774/140‑1 (MQ=255)
ttAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTAATTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGCTGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGt < 2:7106983/140‑1 (MQ=255)
atAAGATTTCATGAATGTTCGCTCAAGGAAGAGACCTTTTTAATTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGt < 2:7331530/139‑1 (MQ=255)
aaGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCa > 1:1369023/1‑140 (MQ=255)
aaGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCa > 2:10229525/1‑140 (MQ=255)
aaGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTCTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCa > 1:9549935/1‑140 (MQ=255)
aaGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTGTTTATTTAAAGTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACAGTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCTTAGCTATGTTGACAAGTCa > 2:370416/1‑140 (MQ=255)
ttCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGAt < 2:3329398/121‑1 (MQ=255)
ttCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCt > 2:6181365/1‑140 (MQ=255)
ttCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTATATTAAAATTTTACATTCAGCGATGTAAATGTTCCGATTTACTATTACACTACATTTGATGCGATTTATCTCTTAAAGATTCATAGTTCTGTTGAAATGTCTCTCCt > 2:6759901/1‑140 (MQ=255)
tCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTg > 2:2987794/1‑140 (MQ=255)
tCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTg < 1:10229525/140‑1 (MQ=255)
tCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGAAATCTTGAAAAGACACTCCTg > 1:9903908/1‑140 (MQ=255)
cAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGc > 1:3254661/1‑140 (MQ=255)
aGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCg < 2:10113836/140‑1 (MQ=255)
tgAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGa < 2:7491053/139‑1 (MQ=255)
ttttGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTaa < 1:10075786/101‑1 (MQ=255)
ttttGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTa > 1:5425018/1‑140 (MQ=255)
ggCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGa < 1:10526752/80‑1 (MQ=255)
gTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAAttt < 2:2551535/140‑1 (MQ=255)
tCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTc > 1:3659684/1‑140 (MQ=255)
tCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACACTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGAAAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTc > 2:6404133/1‑140 (MQ=255)
ccTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGGTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTcg > 2:3244435/1‑139 (MQ=255)
ccTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAATATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCa > 1:5539102/1‑140 (MQ=255)
ccTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGAGTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTACTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCa > 2:3244381/1‑140 (MQ=255)
tttttATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAATTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGc > 2:11186472/1‑140 (MQ=255)
tttatttaAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCAt > 1:1503347/1‑140 (MQ=255)
tttatttaAATTTCACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCAGAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGAAGTAGCGTTAGTCCGCAATTTCAGCAt > 1:6125556/1‑140 (MQ=255)
ttaAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGc > 1:11003905/1‑140 (MQ=255)
aTTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTctgc < 1:11552115/140‑1 (MQ=255)
tCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGa < 2:2441301/63‑1 (MQ=255)
tCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGa > 1:2441301/1‑63 (MQ=255)
tCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTctgctg > 1:592845/1‑140 (MQ=255)
tCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTctgctg > 2:5618342/1‑140 (MQ=255)
cgcgATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCGGCa > 1:10861007/1‑140 (MQ=255)
cgcgATGTAAATGTTCCGATTTAAAATTACCCTACATATTATTCGTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGACACTCCTTCGATGTATCGTTAGTCAGCAATTTCAGAATAAAGCTGAGATTCTGCTGCa > 2:5046655/1‑140 (MQ=255)
tGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACaa < 1:11462982/75‑1 (MQ=255)
tGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACaa > 2:11462982/1‑75 (MQ=255)
tGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATAtc > 1:5968002/1‑140 (MQ=255)
ccGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTa > 1:5179416/1‑35 (MQ=255)
ccGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTa < 2:5179416/35‑1 (MQ=255)
ccGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTc < 2:1055538/72‑1 (MQ=255)
ccGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTc > 1:1055538/1‑72 (MQ=255)
ccGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATg > 1:9634740/1‑140 (MQ=255)
ccGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATg > 1:9681177/1‑140 (MQ=255)
ccGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATg > 1:2000889/1‑140 (MQ=255)
ccGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATg > 2:8175656/1‑140 (MQ=255)
ccGATTTAATATTACCCTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATg > 1:2536842/1‑140 (MQ=255)
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AAAGAATAGCTTTATTTATTAATAAAACGTGTCATTCTGATTAAGACCTTTTATCTTACCCTTAAGATTTCAGGAATTTTGGCTCATGGAAGAGTCCTTTTTATTTAAATTTTACATTCCGCGATGTAAATGTTCCGATTTAATATTACCTTACATTTGATGCTTTTTATCTCTTAAAGATTCATAGATCTGTTGACAAGTCACTCCTGCGATGTAGCGTTCGTCAGCAATTTCAGCATAAAGCTGAGCTTCTGCTGCAATATCTCCGAGCATGTTGGTGAGCATTCCTTCGGCGGTTT > NZ_CP025268/1643699‑1643997
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |