Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R5
|
785 |
665.2 |
22963641 |
98.6% |
22642150 |
138.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,090,561 |
C→T |
intergenic (+397/‑27) |
metK → / → galP |
methionine adenosyltransferase/galactose/proton symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,090,561 | 0 | C | T | 99.2%
| 1474.5
/ ‑5.4
| 397 | intergenic (+397/‑27) | metK/galP | methionine adenosyltransferase/galactose/proton symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (352/41); minor base G (3/0); total (356/41) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 410 total aligned reads displayed.
GTTTAATCTATGATGATATAACTCAATTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAACAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGCCTGGATATCGGTGTAATTGC > NZ_CP025268/3090424‑3090697
|
gTTTAATCTATGATGATATAACTCAATTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCAcaataa > 2:3511476/1‑140 (MQ=255)
ttAATCTATGATGATATAACTCAATTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGAGTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTAATCACCTATCTTATTTCCCAAGaaaa > 2:7306370/1‑140 (MQ=255)
tataACTCAATTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTgg > 1:3239750/1‑140 (MQ=255)
taACTCAAGTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATAATGGAg < 2:10015987/140‑1 (MQ=255)
aCTCAATTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAATAAATAACCATATGGGAggg > 1:10421480/1‑140 (MQ=255)
aaTTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGcatc > 2:5846489/1‑140 (MQ=255)
attattTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAgg < 1:1981485/134‑1 (MQ=255)
ttattTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCAGATTGGAGGGcatcat > 1:1512290/1‑140 (MQ=255)
ttCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACGCACCTAGCTTACTTCACAATAAAAAATAACCAGCTTGGAGGGCATCATGCCTg > 1:7646571/1‑140 (MQ=255)
tCATGCACTTAAATCATCACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACCACTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGa < 1:8263062/140‑1 (MQ=255)
tCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAAt < 2:2272421/113‑1 (MQ=255)
tCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGa > 1:7429657/1‑140 (MQ=255)
aTGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACg > 1:1695426/1‑140 (MQ=255)
cTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTaaa > 1:10011626/1‑140 (MQ=255)
cATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAgg < 2:5510326/140‑1 (MQ=255)
aCTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCg > 2:7767935/1‑140 (MQ=255)
aCTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCg > 1:5775411/1‑140 (MQ=255)
aCTAAGATAAAAGTTAGTGTAAGCTATTACACTGATGTGATTTTCTTCACATCTTTTTAAGTCGTACTCACCTATCTTCAATCTCAATAAATAATTAACTGATTGGAGGGCATATTGACTGACGCTATATCACTGGGGCg > 2:6773886/1‑140 (MQ=255)
aGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCa > 1:11346372/1‑140 (MQ=255)
aaaTGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACACTAAAAAATAACAATATTGGAGGGCATAATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACa > 2:8887264/1‑140 (MQ=255)
gTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGc > 1:3346681/1‑140 (MQ=255)
aGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCgg > 1:951749/1‑126 (MQ=255)
aGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAAt > 2:2143440/1‑140 (MQ=255)
aGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAAt > 1:3899880/1‑140 (MQ=255)
gtgtAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATg > 1:10472891/1‑140 (MQ=255)
aGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAg > 1:10627949/1‑87 (MQ=255)
aGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTCAAAAACAGGGGCGGTCCAACAAGGCAATGACGtt > 1:8119376/1‑140 (MQ=255)
aGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGtt > 2:11412582/1‑140 (MQ=255)
aGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGtt > 1:7955381/1‑140 (MQ=255)
aGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGtt > 1:4588084/1‑140 (MQ=255)
aGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGtt > 1:2386569/1‑140 (MQ=255)
aGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGACAAACAAGGCAATGACGtt > 1:7321986/1‑140 (MQ=255)
aGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTAACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGCCGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAAGGACGtt > 2:4463833/1‑140 (MQ=255)
aGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTGTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAAACATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGtt > 2:1666865/1‑140 (MQ=255)
aTTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTc > 2:2005995/1‑140 (MQ=255)
tACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCgg > 2:10848544/1‑139 (MQ=255)
tACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGt > 2:11099792/1‑140 (MQ=255)
tACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGt > 2:9099392/1‑140 (MQ=255)
tACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGt > 2:5152714/1‑140 (MQ=255)
tACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGt > 2:366981/1‑140 (MQ=255)
tACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAAACATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGTGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGt > 2:6985532/1‑140 (MQ=255)
tACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCAACTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGt > 1:7863650/1‑140 (MQ=255)
cacTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCt > 1:2080155/1‑140 (MQ=255)
tGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCt > 2:2565928/1‑140 (MQ=255)
aTGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTCAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTc > 2:2044013/1‑140 (MQ=255)
aTGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAATCAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTc > 1:3767802/1‑140 (MQ=255)
aTGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTc > 2:8099882/1‑140 (MQ=255)
aTGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTc > 1:6310695/1‑140 (MQ=255)
aTGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTc > 1:1139698/1‑140 (MQ=255)
aTGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTc > 2:7214721/1‑140 (MQ=255)
gtgATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCCATGACGTGTTTGGTCTGCTTCCt > 2:8222004/1‑140 (MQ=255)
tgATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGTCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCtt > 2:3832092/1‑140 (MQ=255)
aTTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTCTCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAATACAGGGGCGGTCTAACAAGGCAATGACGTTTGTCGTCTGGTGCCTTGc > 1:10167483/1‑140 (MQ=255)
aTTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGc > 2:10934662/1‑140 (MQ=255)
aTTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGc > 2:6673332/1‑140 (MQ=255)
aTTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGc > 1:1328187/1‑140 (MQ=255)
aTTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGc > 2:1787042/1‑140 (MQ=255)
aTTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGc > 2:5939745/1‑140 (MQ=255)
aTTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGc > 2:4306009/1‑140 (MQ=255)
aTTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGc > 1:6240382/1‑140 (MQ=255)
tGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGc > 2:1297892/1‑140 (MQ=255)
tGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCATAATTCACAATAAAAAATAACCAGATTGGAGGGCATCAAGCCTGACGCGAAAAAAAAGGCGCGGTCAAACAAGACAATGACGTTTTTCGTCAGATTCCTTGCCGc > 1:2721910/1‑140 (MQ=255)
cTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGctc > 1:9386108/1‑140 (MQ=255)
cTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGctc > 2:2872736/1‑140 (MQ=255)
cTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGctc > 1:7050125/1‑140 (MQ=255)
cacaTCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTgg < 2:9734379/140‑1 (MQ=255)
gtcgtACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCtt < 1:8099883/140‑1 (MQ=255)
tcgtACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCttt < 2:8528578/140‑1 (MQ=255)
cgtACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTg > 2:7445443/1‑140 (MQ=255)
cgtACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGACTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTg > 2:9579813/1‑140 (MQ=255)
cgtACTCACCTAGCTTAATTCACCATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACACGGCAATGACGTTGGTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGTTTACTCtgtg > 1:1237515/1‑140 (MQ=255)
gtACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTgg > 1:5461175/1‑140 (MQ=255)
gtACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGAGTACTCTTTgg > 1:10321940/1‑140 (MQ=255)
tACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGc < 1:11008406/140‑1 (MQ=255)
tACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGc > 2:7462031/1‑140 (MQ=255)
tACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGc > 2:4948029/1‑140 (MQ=255)
tACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAAACATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGc > 2:8357275/1‑140 (MQ=255)
aCTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGcc > 2:1122337/1‑140 (MQ=255)
aCCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGCCTGGa > 2:6515323/1‑140 (MQ=255)
tCTTAATTCACAATAAATAATAACCAGATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACCGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGCCTGGATATCg > 2:5341339/1‑140 (MQ=255)
tCTTAATTCACAATAAAAAATAAGCCTATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAATCAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCGTGCCGCTCTGGCGGGAGGCCGCTGTGGCCTGGCTGTCg > 2:938524/1‑140 (MQ=255)
tCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGCCTGGATATCg > 1:4279773/1‑140 (MQ=255)
tCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGCCTGGATATCg > 1:3587168/1‑140 (MQ=255)
tCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGCCTGGATATCg > 2:1890666/1‑140 (MQ=255)
tCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGCCTGGATATCg > 1:8844676/1‑140 (MQ=255)
tCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGCCTGGATATCg > 1:2194657/1‑140 (MQ=255)
tCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGCCTGGATATCg > 1:7218551/1‑140 (MQ=255)
tCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTGTGGCCTGGATATCg > 1:4499154/1‑140 (MQ=255)
tCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGAGTACTCTTTGGCCTGGATATCg > 1:1718445/1‑140 (MQ=255)
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GTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTGTGGCCTGGATATCG > SRR14920198.4528977/1‑151 (MQ=60)
GTACTCACCTATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCGTTGGCCTGGATATCG > SRR14920198.4308200/1‑151 (MQ=60)
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ATCTTAATTCACAATAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGCCTGGATATCGGTGTAATTGC > SRR14920198.1845964/1‑151 (MQ=60)
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GCAGATAACAGCGTTTAATCTATGATGATATAACTCAATTATTTTCATGCACTTAAATCATAACTAAGATAAATGTTAGTGTAAGCGATTACACTGATGTGATTTGCTTCACATCTTTTTACGTCGTACTCACCTATCTTAATTCACAACAAAAAATAACCATATTGGAGGGCATCATGCCTGACGCTAAAAAACAGGGGCGGTCAAACAAGGCAATGACGTTTTTCGTCTGCTTCCTTGCCGCTCTGGCGGGATTACTCTTTGGCCTGGATATCGGTGTAATTGCTGGCGCACTGC > NZ_CP025268/3090412‑3090708
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
