Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R3
|
778 |
586.6 |
19747158 |
98.0% |
19352214 |
137.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,936,791 |
(G)6→5 |
pseudogene (1097/1180 nt) |
purT → |
formate‑dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,936,786 | 0 | G | . | 98.1%
| 2457.9
/ 27.1
| 526 | pseudogene (1092/1180 nt) | purT | formate‑dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (6/4); new base . (223/293); total (229/297) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.44e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 570 total aligned reads displayed.
ATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCGATCCTCGATCGGGCATTTTG > NZ_CP025268/1936647‑1936925
|
tGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTACGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTgg > 2:382197/1‑140 (MQ=255)
gTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTgggg < 1:7428166/140‑1 (MQ=255)
tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg < 2:1288689/140‑1 (MQ=255)
tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGGAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg > 2:8388555/1‑140 (MQ=255)
tCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGGAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg < 1:3267745/140‑1 (MQ=255)
ccTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg > 2:5012460/1‑140 (MQ=255)
cTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTgggggtg > 2:8836660/1‑138 (MQ=255)
cAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCa > 2:8238304/1‑140 (MQ=255)
cAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGACTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTggggg < 2:6567541/135‑1 (MQ=255)
cAGCTTCTGCCGTTATACTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGCTAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCa < 2:5280354/140‑1 (MQ=255)
gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGCATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 1:3808507/140‑1 (MQ=255)
gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 1:5742504/140‑1 (MQ=255)
gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 1:8504464/140‑1 (MQ=255)
gCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACt < 1:7249902/140‑1 (MQ=255)
ttCTGCCGTTATTCTGCCCCAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAGTGTGCAGAATGCCGAAGGCGCGGA‑GTTGCAGATTCGTGTATGTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTgg > 2:8050459/1‑140 (MQ=255)
ttCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTgg < 1:488804/140‑1 (MQ=255)
ttCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTgg < 1:7555940/140‑1 (MQ=255)
tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCGGAATGTCACGGTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTGATTTGGTACGCCGGATCTTGAGGGCTGCCGGCGGC‑GGGGGGTGGCACTggg > 1:9651998/1‑139 (MQ=255)
tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 2:560395/1‑140 (MQ=255)
tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 1:5864779/1‑140 (MQ=255)
tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 1:9477730/1‑140 (MQ=255)
tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 1:3003788/1‑140 (MQ=255)
tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 2:1687284/1‑140 (MQ=255)
tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 1:4233946/1‑140 (MQ=255)
tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGGAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATGTGGTAAGCCGGAAATTGAGGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGc > 1:4123121/1‑140 (MQ=255)
tCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGGCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTAGTTGGTCAGCCGGAAATTGATGGCCGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACGGGc > 2:2228373/1‑140 (MQ=255)
cTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCt < 1:9150463/140‑1 (MQ=255)
tGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTa < 1:2110022/140‑1 (MQ=255)
tGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTa < 1:1441040/140‑1 (MQ=255)
tGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTa < 1:3344424/140‑1 (MQ=255)
gTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGc < 1:5290924/140‑1 (MQ=255)
ttATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCa < 1:6311983/140‑1 (MQ=255)
ttATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTGGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGTGGTGGCACTGGATACTGCa < 2:3513011/140‑1 (MQ=255)
gtATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCa < 2:4637584/139‑1 (MQ=255)
aTTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCaga < 1:2269478/140‑1 (MQ=255)
aTTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCaga < 1:7940156/140‑1 (MQ=255)
cTGCCACAACTGACCAGTCAGAAGGTCACGTTTGATATTGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGATTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GTGGGTGGCTCTGGCTACTGCagagag < 2:6440333/140‑1 (MQ=255)
gCCACAACTGACCAGTCAGTATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGGTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAgtg > 2:279830/1‑140 (MQ=255)
gCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAgtg < 1:200314/140‑1 (MQ=255)
aCTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGttgttg < 1:9349506/140‑1 (MQ=255)
cTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGa < 2:231479/140‑1 (MQ=255)
cTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGa < 1:5477938/140‑1 (MQ=255)
gACAAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGAAGATTCGTTTATTTGGTAAGCAGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGATGTTGACg > 2:7195035/1‑140 (MQ=255)
ccAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGcc > 1:6433865/1‑140 (MQ=255)
tCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGTCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTg < 2:9559118/140‑1 (MQ=255)
tCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTg < 2:4149290/140‑1 (MQ=255)
aTGTCCCGTTTGATAATGTGCCGAATGCCGTAGGCGCAGT‑TTTGCCGATTCGGTTAGGTGGTGCGCCGGCCGTTGATGGCAGCCGTCGTGTGGGGGG‑GGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGGTGGTGACGCCATTGATcgc > 2:3998713/1‑140 (MQ=255)
tttGATAATGTGCTGAATGCCGGAGGCGCCGA‑GTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATGGATGGCAGCCGTCGCCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGATGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCa < 2:7013147/140‑1 (MQ=255)
tttGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGCTTCGTTTAATTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCa < 2:6012993/140‑1 (MQ=255)
tttGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCa < 1:1225404/140‑1 (MQ=255)
tAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCAcgccg > 2:1216367/1‑140 (MQ=255)
tgtgCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGccgccg > 2:4367568/1‑140 (MQ=255)
gtgCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCgg > 2:3114722/1‑140 (MQ=255)
gtgCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCgg < 1:6540417/140‑1 (MQ=255)
gtgCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCgg < 1:4017080/140‑1 (MQ=255)
tgCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTTTTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCggc > 2:1947409/1‑139 (MQ=255)
tgCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGa < 1:8857828/140‑1 (MQ=255)
tgCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGa < 2:9028820/140‑1 (MQ=255)
tgCAGAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGa < 2:9228198/140‑1 (MQ=255)
gAATGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAgg < 2:334740/140‑1 (MQ=255)
aaTGCCGTAGGCTCAGA‑TATGCAGATTCGTTTATTTGGTATGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGt < 2:9427543/140‑1 (MQ=255)
aaTGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTCAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGt < 1:6079411/140‑1 (MQ=255)
tGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTaa < 2:6868371/140‑1 (MQ=255)
tGCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTaa < 2:2115294/140‑1 (MQ=255)
gCCGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTaaa > 2:5655553/1‑140 (MQ=255)
cGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAg > 1:2824841/1‑140 (MQ=255)
cGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAg > 1:1033543/1‑140 (MQ=255)
cGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAg > 2:9668176/1‑140 (MQ=255)
cGTAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAg > 1:6972847/1‑140 (MQ=255)
tAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa < 1:8136055/140‑1 (MQ=255)
tAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa < 1:5578146/140‑1 (MQ=255)
tAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa > 1:178554/1‑140 (MQ=255)
tAGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTa < 1:769326/140‑1 (MQ=255)
aGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTAc < 1:3614300/140‑1 (MQ=255)
aGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTAc < 1:8693587/140‑1 (MQ=255)
aGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTAc < 2:9336636/140‑1 (MQ=255)
aGGCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTAc < 1:4326693/140‑1 (MQ=255)
ggCGCAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGGAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACa < 2:1101225/140‑1 (MQ=255)
gcgcAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAg > 1:498757/1‑140 (MQ=255)
gcgcAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAg > 2:870329/1‑140 (MQ=255)
gcAGA‑TTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGa < 1:61416/123‑1 (MQ=255)
gCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAAccc > 1:4437298/1‑140 (MQ=255)
gTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCaaaaa > 1:2464152/1‑140 (MQ=255)
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ATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTG < SRR14920172.1463166/151‑1 (MQ=60)
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ATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTG < SRR14920172.9097662/151‑1 (MQ=60)
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TGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacgcgtagtaatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaggggggggggggggggggggggggg > SRR14920172.8759858/1‑56 (MQ=60)
TGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCC < SRR14920172.4920746/151‑1 (MQ=60)
GGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCT‑GGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCG > SRR14920172.9641966/1‑151 (MQ=60)
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GTCAGTATGGTCCTGCAGCTTCTGCCGTTATTCTGCCACAACTGACCAGTCAGAATGTCACGTTTGATAATGTGCAGAATGCCGTAGGCGCAGATTTGCAGATTCGTTTATTTGGTAAGCCGGAAATTGATGGCAGCCGTCGTCTGGGGGGTGGCACTGGCTACTGCAGAGAGTGTTGTTGACGCCATTGAACGCGCGAAGCACGCCGCCGGACAGGTAAAAGTACAGGGTTAAACCCGGCAAAAAAACGCTACAAAAATGCCCGATCCTCGATCGGGCATTTTGACTTTTACAGCTTAG > NZ_CP025268/1936641‑1936940
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |