| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A1 F21 I1 R3 | 778 | 586.6 | 19747158 | 98.0% | 19352214 | 137.9 |
| Predicted mutation | ||||||
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glycosyltransferase family 1 protein DapH/DapD/GlmU‑related protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 2,108,533 | 0 | T | C | 99.6% | 1774.0 / NA | 511 | I6V (ATC→GTC) *197* (TAA→TAG) | wbbK wbbJ | glycosyltransferase family 1 protein DapH/DapD/GlmU‑related protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (213/296); minor base A (2/0); total (215/296) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.77e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 511 total aligned reads displayed.
ATAACTTTCTTTTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGATTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGACTCCATTACCAATAA > NZ_CP025268/2108396‑2108669 | ctttctttTAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGACAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCt > 1:9190147/1‑140 (MQ=255) tttAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCAAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTcc < 1:7179411/140‑1 (MQ=255) ttAACTCTTTATCTGAATTGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTccc < 2:7176912/140‑1 (MQ=255) ttAACTCTTTAGCAGAATGGACTAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTccc < 1:4803686/140‑1 (MQ=255) 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TAATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGA < SRR14920172.7648703/151‑1 (MQ=60) AATGCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGAT < SRR14920172.457041/151‑1 (MQ=60) GCGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGNTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTT > SRR14920172.6340345/1‑151 (MQ=60) CGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTctgtctctta > SRR14920172.8117057/1‑141 (MQ=60) CGATAAAACTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTT > SRR14920172.499109/1‑151 (MQ=60) 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CTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTAC < SRR14920172.3937269/151‑1 (MQ=60) CTGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTAAGCTATTTCCAATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTGTATGATATTTGCTGGTAC > SRR14920172.1128319/1‑151 (MQ=60) TGACATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACT < SRR14920172.9603559/151‑1 (MQ=60) ATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCG < SRR14920172.3582611/151‑1 (MQ=60) ATTTTCTTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCG < SRR14920172.3582832/151‑1 (MQ=60) 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ATTTATTATTATTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCATTGTTAAAATTTACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATG < SRR14920172.5790077/151‑1 (MQ=60) ATTTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATG < SRR14920172.4642702/151‑1 (MQ=60) TTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGAC > SRR14920172.68271/1‑151 (MQ=60) TTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGAC < SRR14920172.9607237/151‑1 (MQ=60) TTATTATTAGTTGCTGCCAAAAATTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGAC < SRR14920172.3782708/151‑1 (MQ=60) 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TTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTC < SRR14920172.8723667/151‑1 (MQ=60) TTTTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTC < SRR14920172.5145777/151‑1 (MQ=60) TTTTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTA < SRR14920172.5135354/151‑1 (MQ=60) TTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAAC < SRR14920172.1443130/151‑1 (MQ=60) TTCAAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAAC < SRR14920172.31660/151‑1 (MQ=60) TCAAAATGTTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACA < SRR14920172.7491910/151‑1 (MQ=60) AAAATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAAC < SRR14920172.8888102/151‑1 (MQ=60) ATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGA > SRR14920172.7822470/1‑151 (MQ=60) ATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGA > SRR14920172.4599671/1‑151 (MQ=60) ATGGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGA > SRR14920172.5300987/1‑151 (MQ=60) TGGTAAAT‑GACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAAT < SRR14920172.61570/151‑1 (MQ=60) GGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCTTGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAAT > SRR14920172.2613615/1‑151 (MQ=60) GGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAAT > SRR14920172.8366861/1‑151 (MQ=60) GGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAAT > SRR14920172.4523635/1‑151 (MQ=60) GGTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAAT < SRR14920172.9242522/151‑1 (MQ=60) 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GTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATT > SRR14920172.9702739/1‑151 (MQ=60) GTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATT > SRR14920172.6487003/1‑151 (MQ=60) GTAAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATT > SRR14920172.6602136/1‑151 (MQ=60) TAAATGGACCGCAAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTG < SRR14920172.3277160/151‑1 (MQ=60) AAATGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGG < SRR14920172.2809782/151‑1 (MQ=60) 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TGGACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGC < SRR14920172.7818812/151‑1 (MQ=60) GACCGCCAGTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCG > SRR14920172.3707123/1‑151 (MQ=60) GTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGAC < SRR14920172.7825754/151‑1 (MQ=60) GTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGAC < SRR14920172.8764477/151‑1 (MQ=60) GTGGTAAAATTGACCGCAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGAC > SRR14920172.4012907/1‑151 (MQ=60) 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CAGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGACTCCATTACCAATAATT > SRR14920172.1169762/1‑151 (MQ=60) AGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGACTCCATTACCAATAATTG < SRR14920172.7982451/151‑1 (MQ=60) AGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGACTCCATTACCAATAATTG < SRR14920172.8938245/151‑1 (MQ=60) AGAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGACTCCATTACCAATAATTG < SRR14920172.4012879/151‑1 (MQ=60) GAAACAACGACTATGCTTTTTCCCATAATTTGGTCTCATGATTGTATTTCTTTATGATTTTTGCTGGTACTCCCGCAATGACAGTATTTTCGGGAATAGAACCTCTAACAACAGAATTGGCGCCGACTACGACTCCATTACCAATAATTGT > SRR14920172.2259154/1‑151 (MQ=60) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |