Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R3
|
778 |
586.6 |
19747158 |
98.0% |
19352214 |
137.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,595,629 |
A→G |
*119* (TAA→TAG) |
yffB → |
ArsC family reductase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,595,629 | 0 | A | G | 99.8%
| 1476.4
/ NA
| 426 | *119* (TAA→TAG) | yffB | ArsC family reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (281/143); minor base T (1/0); total (282/144) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 426 total aligned reads displayed.
ACCGATGCGGCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAATCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAACGTTTGCAGGCGATCGGTTTTACCGTTGAACGCATGGAC > NZ_CP025268/2595492‑2595764
|
aCCGATGCGGCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTTCCAGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTc > 2:1543080/1‑140 (MQ=255)
aCCGATGCGGCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTc < 2:5667073/140‑1 (MQ=255)
ccGATGCGGCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCt > 1:7908712/1‑140 (MQ=255)
ccGATGCGGCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCt > 2:2193199/1‑140 (MQ=255)
gATGCGGCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTAt < 1:5757094/140‑1 (MQ=255)
gATGCGGCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTAt > 1:7932251/1‑140 (MQ=255)
cGGCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCg > 2:4450195/1‑140 (MQ=255)
ggCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCACTTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGt > 1:5887014/1‑140 (MQ=255)
gCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTg < 1:9860641/140‑1 (MQ=255)
ccTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGc > 1:8730625/1‑140 (MQ=255)
tGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCTGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCgg > 1:131805/1‑140 (MQ=255)
gcggcATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAACCGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCNGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTAt < 1:6308114/140‑1 (MQ=255)
gcggcATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGTTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTAt < 1:5648791/140‑1 (MQ=255)
gcggcATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTAt < 2:7700300/140‑1 (MQ=255)
cggcATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTAtt > 1:7257398/1‑140 (MQ=255)
ggcATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTg > 2:1843985/1‑140 (MQ=255)
aTTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGc < 2:60062/140‑1 (MQ=255)
ttAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCt < 2:2654328/140‑1 (MQ=255)
ttAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCt > 1:3456490/1‑140 (MQ=255)
aaTGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGccc > 2:2049480/1‑126 (MQ=255)
aTGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGac > 1:8525858/1‑140 (MQ=255)
tGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACacaac > 2:2337686/1‑140 (MQ=255)
tGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACacaac > 2:3513968/1‑140 (MQ=255)
tGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAAATTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTCTTGAGCTGACacaac > 2:968949/1‑140 (MQ=255)
aaaTGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAg > 1:4176212/1‑140 (MQ=255)
aaaTGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAg > 2:5446236/1‑140 (MQ=255)
aaaTGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAg > 1:1505355/1‑140 (MQ=255)
aaaTGCCTGCAAGTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAg > 2:1119183/1‑140 (MQ=255)
aTGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCt > 1:5335192/1‑140 (MQ=255)
ccTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTAt > 1:7360849/1‑140 (MQ=255)
tGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTc > 1:896558/1‑140 (MQ=255)
gCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTcg < 1:8136596/140‑1 (MQ=255)
tATCCAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCgccgcc < 2:7601093/140‑1 (MQ=255)
tATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCgccgcc < 1:948988/140‑1 (MQ=255)
aTCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGccc < 1:4590942/140‑1 (MQ=255)
tgtatcGTCCTTTGCTCTGGGTGCGTGGTTAGGCTATGCTGCTGGGTTTGAGTGATTGCTGTTATGAGCATTTTTTCCTTGTGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTTTTGAGGTGACTCTTCAGCTTATTCgccgccgt < 2:3185667/135‑3 (MQ=255)
tCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCt > 1:5075841/1‑140 (MQ=255)
cGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCt < 1:5542656/140‑1 (MQ=255)
tCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTCTTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGa > 2:5059219/1‑140 (MQ=255)
cATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGt < 2:2234802/140‑1 (MQ=255)
cATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGt > 2:7377792/1‑140 (MQ=255)
ttGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTcc < 1:3072851/140‑1 (MQ=255)
ctGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCtgatg > 1:6103679/1‑140 (MQ=255)
tGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCtgatga < 1:7528670/140‑1 (MQ=255)
tGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCtgatga > 2:619640/1‑140 (MQ=255)
tGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCtgatga > 2:8054608/1‑140 (MQ=255)
tGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGATTCAGTGATTCCAGATAACAGCAATTATTCCATGAGGTGTAGTCAATGTCGTGCCCGGTAAATGAGCTGACACAACAGCTAATTCGCCGCACTTCCCTGAGACAtgaaga > 1:3623603/1‑140 (MQ=255)
tGCGTGCCCGGTAAGACTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCCGTTATTGAGCTGACACAACAGCTGATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTAAtgatga > 2:6954699/1‑140 (MQ=255)
cGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGatgatg > 2:4214186/1‑140 (MQ=255)
cGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGatgatg > 1:3505394/1‑140 (MQ=255)
cGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGatgatg > 1:1044393/1‑140 (MQ=255)
cGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGatgatg > 1:6938590/1‑140 (MQ=255)
cGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGatgatg > 1:7997054/1‑140 (MQ=255)
cGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGatgatg < 1:8697880/140‑1 (MQ=255)
ccGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGGTCTTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGa > 2:3771360/1‑140 (MQ=255)
ggTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATg < 2:8836382/140‑1 (MQ=255)
gTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGc > 1:9743657/1‑140 (MQ=255)
ccTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGc > 1:1754571/1‑140 (MQ=255)
tgctgcTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTttg < 1:3191450/140‑1 (MQ=255)
tgctgcTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTttg > 1:4488028/1‑140 (MQ=255)
tgctgcTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTttg < 2:8145704/140‑1 (MQ=255)
tgctgcTGGGTTTCAGTGAGTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGGAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACACCAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCCGGCTttg > 2:4818799/1‑140 (MQ=255)
gctgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttga > 1:670406/1‑140 (MQ=255)
ctgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGTGGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgat > 2:7923896/1‑140 (MQ=255)
ctgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgat < 1:4893594/140‑1 (MQ=255)
ctgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgat > 1:2992456/1‑140 (MQ=255)
ctgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgat > 1:1822519/1‑140 (MQ=255)
ctgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttaat > 1:9365253/1‑140 (MQ=255)
ctgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCGTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgat > 2:6356314/1‑140 (MQ=255)
tgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgatt > 1:2053728/1‑140 (MQ=255)
tgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgatt > 2:4292510/1‑140 (MQ=255)
tgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgatt > 1:1153754/1‑140 (MQ=255)
tgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgatt > 1:3763603/1‑140 (MQ=255)
tgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgatt > 2:4004050/1‑140 (MQ=255)
ggTGTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAAGTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgattga < 2:6587556/140‑1 (MQ=255)
tttCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGc > 2:9444093/1‑68 (MQ=255)
tttCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAAc > 1:167016/1‑140 (MQ=255)
tttCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCGTTGTTGATTGAAc > 2:1616271/1‑140 (MQ=255)
cAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAACGtt > 1:2833201/1‑140 (MQ=255)
gTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAACGTTTg > 1:5417691/1‑140 (MQ=255)
tGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAACGTTTGc < 1:4351544/140‑1 (MQ=255)
aTTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAACGTTTGCAg > 2:3802492/1‑140 (MQ=255)
aTTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAACGTTTGCAg > 2:2729162/1‑140 (MQ=255)
tCCCGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCACGTTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGATTTGTTGATTGAACGTTTGCAGGc > 2:3464423/1‑140 (MQ=255)
tCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAACGTTTGCAGGc > 2:303798/1‑140 (MQ=255)
aGTTATCATCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAACGTTTGCAGGCGAt < 1:23298/140‑1 (MQ=255)
taacAGCAATTTTTCCATGATGTGTATTCTATGTCGTGCCCGTTTATTGAGATGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGATTCATGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAACGTTTGCAGGCGATCgg > 2:7063560/4‑140 (MQ=255)
tATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGATCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCATGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAACGTTTGCAGGCGATCgg > 2:4739411/1‑140 (MQ=255)
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GCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTACGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCC < SRR14920172.197669/151‑1 (MQ=60)
GCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCC < SRR14920172.17676/151‑1 (MQ=60)
GCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCC < SRR14920172.8999405/151‑1 (MQ=60)
GCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCC < SRR14920172.8201445/151‑1 (MQ=60)
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ATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGA > SRR14920172.5768816/1‑151 (MQ=60)
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TATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGT > SRR14920172.1253753/1‑151 (MQ=60)
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TATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGT > SRR14920172.7976487/1‑151 (MQ=60)
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CCGCAATAAAATCACCGATGCGGCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAATCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAACGTTTGCAGGCGATCGGTTTTACCGTTGAACGCATGGACTTTGCCGATACGCAGA > NZ_CP025268/2595479‑2595780
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
