Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
870 |
341.9 |
11209456 |
97.2% |
10895591 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,595,629 |
A→G |
*119* (TAA→TAG) |
yffB → |
ArsC family reductase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,595,629 | 0 | A | G | 100.0%
| 699.1
/ NA
| 212 | *119* (TAA→TAG) | yffB | ArsC family reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (129/83); total (129/83) |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
CCGATGCGGCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAATCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAACGTTTGCAGGCGATCGGTTTTACCGTTGAACGCATGGA > NZ_CP025268/2595493‑2595763
|
ccGATGCGGCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCt > 2:5197776/1‑140 (MQ=255)
gATGCGGCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTAt > 1:4857350/1‑140 (MQ=255)
tGCGGCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGt > 1:4444300/1‑140 (MQ=255)
tGCGGCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGt > 2:1400755/1‑140 (MQ=255)
gCGGCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTc < 2:248515/140‑1 (MQ=255)
cGGCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCg > 2:1803317/1‑140 (MQ=255)
gCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTg < 2:1336659/140‑1 (MQ=255)
ccTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGc > 1:11205/1‑140 (MQ=255)
tGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCgg > 2:5263248/1‑140 (MQ=255)
gcggcgGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGt > 2:5464269/1‑140 (MQ=255)
gcggcATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTAt < 1:2329780/140‑1 (MQ=255)
cggcATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTAtt > 2:3553398/1‑140 (MQ=255)
cggcATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTAtt > 1:891386/1‑140 (MQ=255)
cggcATTAATGACTGAAATGCCTGCAATGATCAAACGTCCCTTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCCGGGTGTCATTAATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGGGTAGTCTATGTCGTGGCCGGTTAtt > 2:608740/1‑140 (MQ=255)
aTTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGc < 1:1219849/140‑1 (MQ=255)
ttAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCt < 1:1787972/140‑1 (MQ=255)
tGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACacaac > 2:2758609/1‑140 (MQ=255)
tGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACacaac > 1:3319047/1‑140 (MQ=255)
tGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACacaac > 1:5577278/1‑140 (MQ=255)
tGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACacaac > 1:4168346/1‑140 (MQ=255)
aaaTGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAGGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAg > 1:4779606/1‑140 (MQ=255)
aaaTGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAg > 2:3186228/1‑140 (MQ=255)
ccTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTAt > 2:721658/1‑140 (MQ=255)
tGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCGATGCTGCTTGGTTTCAGTGATTCCAGTTAGCAGCAAGTTTTCCAGGAGGTGTAGTCTATGTCGTTGTCGGTTATTGAGCTGACACATCAGCGTAttt > 2:46036/1‑139 (MQ=255)
gCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTcg < 2:891693/140‑1 (MQ=255)
gCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTcg < 2:4527261/140‑1 (MQ=255)
gCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTcg < 2:5060028/140‑1 (MQ=255)
gCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTcg > 1:2913098/1‑140 (MQ=255)
gCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTCCCCGGTAAGCCTATTCTGCTGGGGTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTAGTCCCCGGTGATTGAACTGACACAACAGCTTATTcg > 2:1244534/1‑140 (MQ=255)
aTTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTcgccg < 1:4294482/140‑1 (MQ=255)
tATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCgccgcc < 1:4652664/140‑1 (MQ=255)
tCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCt < 1:5118040/140‑1 (MQ=255)
tCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCt > 1:2486056/1‑140 (MQ=255)
aaaCGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTc > 1:4074439/1‑140 (MQ=255)
aaCGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTcc < 2:344782/140‑1 (MQ=255)
cagccATTGCTCTGCATGCCCGATAAGCCTATGCTGCTGGATTTCAGTAATTCCAGTTATCAGCAATTTATCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATCGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCt < 2:2175721/137‑1 (MQ=255)
tCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGa > 2:874121/1‑140 (MQ=255)
tCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGa > 2:2097714/1‑140 (MQ=255)
tCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGa > 1:499689/1‑140 (MQ=255)
tCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGa > 1:1370524/1‑140 (MQ=255)
gccATTGCTCTGCGTACCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCTCTGa > 2:3683522/2‑140 (MQ=255)
cATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGt < 2:1616118/140‑1 (MQ=255)
cATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGt > 1:665089/1‑140 (MQ=255)
ttGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTcc < 2:5360624/140‑1 (MQ=255)
ctctGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCtga < 1:3947313/140‑1 (MQ=255)
tGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCtgatga > 1:1803106/1‑140 (MQ=255)
tGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCtgatga > 1:3561180/1‑140 (MQ=255)
cGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCGATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTGGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGatgatg > 2:1179340/1‑140 (MQ=255)
cGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTTGGTCCTGatgatg > 2:2014533/1‑140 (MQ=255)
cGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTgatgata > 1:3485247/1‑139 (MQ=255)
cGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGatgatg > 1:2298525/1‑140 (MQ=255)
cGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGatgatg > 2:3885311/1‑140 (MQ=255)
cGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGatgatg > 2:5410035/1‑140 (MQ=255)
cGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGatgatg > 1:1160785/1‑140 (MQ=255)
cGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCAATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTGCCCTGAGTCCTGatgatg > 2:3996885/1‑140 (MQ=255)
tGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCa < 1:5101284/140‑1 (MQ=255)
gCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAg < 1:263819/140‑1 (MQ=255)
ccGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAggg > 2:4283852/1‑139 (MQ=255)
ccGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGa > 1:2226399/1‑140 (MQ=255)
caaGCCTATGCTGGTGGGTTTTAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGCAGTCTCTGTCGTGACCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCAGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGcc < 2:5480513/139‑1 (MQ=255)
aaGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCa > 2:4468668/1‑140 (MQ=255)
gCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAgg > 1:5454626/1‑140 (MQ=255)
ccTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGc > 2:1385077/1‑140 (MQ=255)
tgctgcTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTTCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCtgtg > 1:4105845/1‑140 (MQ=255)
tgctgcTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTttg > 2:4073848/1‑140 (MQ=255)
tgctgcTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTttg > 1:2839784/1‑140 (MQ=255)
tgctgcTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTttg < 1:95132/140‑1 (MQ=255)
tgctgcTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTttg > 2:1259865/1‑140 (MQ=255)
tgctgcTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGCAGTCTATGTCGGGCCCGGTTGTTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGGCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTttg > 2:5153536/1‑140 (MQ=255)
gctgctGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTttgt < 2:2930232/140‑1 (MQ=255)
gctgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCGTTGttga < 1:3173341/140‑1 (MQ=255)
ctgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATTATGCAGGATGCCAGGCTTTGtttat > 1:2644376/1‑140 (MQ=255)
ctgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgat > 1:2594788/1‑140 (MQ=255)
ctgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgat > 1:4478245/1‑140 (MQ=255)
ctgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgat > 1:5026908/1‑140 (MQ=255)
ctgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgat > 2:1273459/1‑140 (MQ=255)
tgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgatt > 1:1813931/1‑140 (MQ=255)
tgGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgatt > 2:4861214/1‑140 (MQ=255)
gggTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgattg > 2:4343544/1‑140 (MQ=255)
ggTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGttgattga < 2:2913098/140‑1 (MQ=255)
tttCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAAc > 2:3512435/1‑140 (MQ=255)
tttCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAAc > 2:2823377/1‑140 (MQ=255)
tGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGCTGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAACGTTTGc < 2:1846142/140‑1 (MQ=255)
aTTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAACGTTTGCAg > 2:3245154/1‑140 (MQ=255)
tCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCtga < 2:1144128/98‑1 (MQ=255)
tCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAACGTTTGCAGGc > 2:2598932/1‑140 (MQ=255)
ccAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAACGTTTGCAGGCg < 1:2396509/140‑1 (MQ=255)
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ccAGTTATCAGCAATTGTTCCATGAGGTGTAGTCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAACGTTTGCAGGCg < 2:2909304/140‑1 (MQ=255)
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GCAATAAAATCACCGATGCGGCCTCTGCGGCGGCATTAATGACTGAAATGCCTGCAATTATCAAACGTCCATTGCTCTGCGTGCCCGGTAAGCCTATGCTGCTGGGTTTCAGTGATTCCAGTTATCAGCAATTTTTCCATGAGGTGTAATCTATGTCGTGCCCGGTTATTGAGCTGACACAACAGCTTATTCGCCGCCCTTCCCTGAGTCCTGATGATGCAGGATGCCAGGCTTTGTTGATTGAACGTTTGCAGGCGATCGGTTTTACCGTTGAACGCATGGACTTTGCCGATACGCAG > NZ_CP025268/2595481‑2595779
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |