Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R3
|
778 |
586.6 |
19747158 |
98.0% |
19352214 |
137.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,785,155 |
C→T |
pseudogene (1594/4580 nt) |
ypjA ← |
adhesin‑like autotransporter YpjA/EhaD |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,785,155 | 0 | C | T | 99.8%
| 2088.0
/ NA
| 531 | pseudogene (1594/4580 nt) | ypjA | adhesin‑like autotransporter YpjA/EhaD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (263/267); minor base A (1/0); total (264/267) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.97e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 534 total aligned reads displayed.
CTACATTTTTAGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGCCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTA > NZ_CP025268/2785018‑2785292
|
cTACATTTTTAGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGtcc > 1:8490157/1‑140 (MQ=255)
tACATTTTTAGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCt > 1:1025982/1‑140 (MQ=255)
cATTTTTAGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGa > 2:5918064/1‑140 (MQ=255)
cATTTTTAGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGa > 1:2149937/1‑140 (MQ=255)
cATTTTTAGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGa < 1:3251723/140‑1 (MQ=255)
ttAGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTc > 1:9288939/1‑140 (MQ=255)
cTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAAcg < 1:5479019/140‑1 (MQ=255)
cTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAAcg > 1:2240125/1‑140 (MQ=255)
tGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATCACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCNCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAAcgc < 1:6299917/140‑1 (MQ=255)
aaTTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAAcgccg < 1:8773211/140‑1 (MQ=255)
ttCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACgccgcc < 1:6529942/140‑1 (MQ=255)
ttCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACgccgcc < 1:4862816/140‑1 (MQ=255)
ttCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGGTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACgccgcc < 1:1468202/140‑1 (MQ=255)
cTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCatt < 2:9437575/140‑1 (MQ=255)
tGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCatta < 2:9680994/140‑1 (MQ=255)
gATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCattat > 1:744654/1‑140 (MQ=255)
aTGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGGTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCattatt < 1:4597909/140‑1 (MQ=255)
aGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGt < 1:7715008/140‑1 (MQ=255)
cATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTATTGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCAGTATGAAGTCTGGTg > 2:4119000/1‑140 (MQ=255)
cATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTg > 2:1986658/1‑140 (MQ=255)
cATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTg < 2:663108/140‑1 (MQ=255)
cATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTg < 1:1255927/140‑1 (MQ=255)
aTCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGc > 2:717138/1‑140 (MQ=255)
cACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTa > 2:5167766/1‑140 (MQ=255)
cACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTa > 1:8649779/1‑140 (MQ=255)
cACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTa > 1:8883183/1‑140 (MQ=255)
cACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTa > 2:9217815/1‑140 (MQ=255)
cACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTa < 1:2496621/140‑1 (MQ=255)
cACCATAACTGTTGGGTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACACCCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTa > 2:5466082/1‑140 (MQ=255)
gTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGa < 2:3208970/94‑1 (MQ=255)
ttGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGc > 1:9144790/1‑140 (MQ=255)
ttGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGc > 1:2676520/1‑140 (MQ=255)
ttGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAAAGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTAAGCCTCACCACAGTCCTGAACCTCCAGAACGCAGCCATAATTCAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGc > 2:7549239/1‑140 (MQ=255)
tGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGcc < 2:3145361/140‑1 (MQ=255)
tGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGcc < 2:2536299/140‑1 (MQ=255)
ggTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGGGGTGGTGGTAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCGTAGCCTCACCACCGTCGTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGGTTTAGcct > 2:6010951/1‑140 (MQ=255)
ggTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCACTTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGcct > 1:4728310/1‑140 (MQ=255)
ggTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGcct < 1:5787368/140‑1 (MQ=255)
tCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGcctcct > 2:9623045/1‑140 (MQ=255)
tCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGcctcct > 2:1083702/1‑140 (MQ=255)
ccTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCtt > 2:3392444/1‑140 (MQ=255)
cTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTc > 2:4320775/1‑140 (MQ=255)
tttgATATGTGTTCAGTATGTCGTGGTAGTAATTAATTCGCCGACGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGATCCTCCAGAACGCCGACATTATTAAGTCTGGTGATATCTGTTTTAGCCTCCTTCt < 2:6863516/137‑1 (MQ=255)
ttCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCt > 2:5047276/1‑140 (MQ=255)
ttCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCt > 2:3695198/1‑140 (MQ=255)
ttCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCt > 1:4047607/1‑140 (MQ=255)
ttCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCt > 1:5189892/1‑140 (MQ=255)
cGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTgg > 2:8271096/1‑140 (MQ=255)
cGATAAGGGGTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGGTGCTCAACATGCTGAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTgg < 2:8905515/140‑1 (MQ=255)
aTAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGAc < 2:8598075/140‑1 (MQ=255)
gtgtTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATc < 1:6737679/140‑1 (MQ=255)
gtgtTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATc < 2:2220557/140‑1 (MQ=255)
tgtTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACACTCa > 2:3861420/1‑140 (MQ=255)
ttCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGc > 1:5345323/1‑140 (MQ=255)
ttCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGc > 1:9744902/1‑140 (MQ=255)
ccGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCtt > 1:6114247/1‑140 (MQ=255)
ccGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCtt > 2:1315658/1‑140 (MQ=255)
cGGAGGTCGTTGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTTTCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTa < 1:1707398/140‑1 (MQ=255)
ggTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGc < 1:1127202/140‑1 (MQ=255)
gTCGTGGAAGCACTTTATGAGCCGCCGTATTGTTGCTCCACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTAGTCTGTCTGGTGCTAGCTGTTTTGGCGTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCTcc > 2:1601662/1‑140 (MQ=255)
gTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTCGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCCTTCTTAAGTCTGGTGCTCTCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGcc > 2:1854623/1‑140 (MQ=255)
tCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCa < 2:8007498/140‑1 (MQ=255)
cGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAg > 2:2989434/1‑140 (MQ=255)
cGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAg > 1:6636235/1‑140 (MQ=255)
cGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAg > 1:2348192/1‑140 (MQ=255)
gTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGt < 2:7760756/140‑1 (MQ=255)
ggAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTAt < 2:5619693/140‑1 (MQ=255)
aaTTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCCGTATCAATgg > 1:6678950/1‑140 (MQ=255)
aTTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGgt > 1:5629550/1‑140 (MQ=255)
tGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTAt > 1:3071840/1‑140 (MQ=255)
cgccgcCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTAttt > 1:5891374/1‑140 (MQ=255)
ccgccgGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTAttttt > 1:7008429/1‑140 (MQ=255)
ggATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCg < 2:6343486/140‑1 (MQ=255)
ggATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCg < 1:4494169/140‑1 (MQ=255)
ggATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCg < 2:2836096/140‑1 (MQ=255)
gATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGa > 1:3484743/1‑140 (MQ=255)
aTTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAg < 1:940430/140‑1 (MQ=255)
gttgCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGtt < 1:313856/140‑1 (MQ=255)
gttgCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGtt < 1:8124410/140‑1 (MQ=255)
gtcgCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTCAACCTCCAGAACGCCGCCATTAGTAAGTCTGGTGCTATCTGTATTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGtt < 2:4747205/137‑1 (MQ=255)
cTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTCCCGCCAGTAACAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAg < 2:9290971/140‑1 (MQ=255)
cTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAg < 1:7834088/140‑1 (MQ=255)
cTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAg < 2:744654/140‑1 (MQ=255)
cAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGcc < 2:8184478/140‑1 (MQ=255)
cAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGcc > 1:383423/1‑140 (MQ=255)
cAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTAATAATTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGcc > 2:26804/1‑140 (MQ=255)
aaCATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCa < 1:9492291/140‑1 (MQ=255)
aCATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCAc < 2:8794740/140‑1 (MQ=255)
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TTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACC > SRR14920172.7184826/1‑151 (MQ=60)
TTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACC > SRR14920172.5936409/1‑151 (MQ=60)
GCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGT > SRR14920172.4286846/1‑151 (MQ=60)
GCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGT > SRR14920172.595632/1‑151 (MQ=60)
CTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTC < SRR14920172.3276824/151‑1 (MQ=60)
CTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTC < SRR14920172.7895917/151‑1 (MQ=60)
CTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTC < SRR14920172.7896393/151‑1 (MQ=60)
TCAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCA < SRR14920172.5520487/151‑1 (MQ=60)
CAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATaaagtaatgtacgtgcatctttagcaacactcagggccaacgactggccgagagtaggcttggtactagttgtcgcagaggttttagccacgtgcgtccg > SRR14920172.3099490/1‑51 (MQ=60)
CAACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAG < SRR14920172.9822612/151‑1 (MQ=60)
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AACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGT < SRR14920172.9567959/151‑1 (MQ=60)
ACATGCTTAGCCTCACCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTT > SRR14920172.4015659/1‑151 (MQ=60)
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CCACCGTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTATTTTCCA > SRR14920172.2375084/1‑151 (MQ=60)
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GTCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGGAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACA > SRR14920172.2209330/1‑151 (MQ=60)
TCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAA > SRR14920172.832870/1‑151 (MQ=60)
|
GCGTTTTCCAGCACTACATTTTTAGCTTCTGAATTCCTGATGTAGAAAGCATCACCATAACTGTTGGTTCCTTCGATAAGTGTTCCGGAGGTCGTGGAAGCAATTAATGCGCCGCCGGATTGTTGCTCAACATGCTTAGCCTCACCACCGCCCTGAACCTCCAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAA > NZ_CP025268/2785005‑2785305
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
