Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R3
|
778 |
586.6 |
19747158 |
98.0% |
19352214 |
137.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,266,812 |
T→C |
*313* (TAA→TAG) |
tdcA ← |
transcriptional regulator TdcA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,266,812 | 0 | T | C | 99.2%
| 442.5
/ NA
| 129 | *313* (TAA→TAG) | tdcA | transcriptional regulator TdcA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (75/53); minor base A (1/0); total (76/53) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
TCATCAATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAATTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGT > NZ_CP025268/3266676‑3266947
|
atcaATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAAcc > 2:2540016/1‑140 (MQ=255)
atcaATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAAcc > 1:7061721/1‑140 (MQ=255)
tcaATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCa > 2:2104019/1‑140 (MQ=255)
tcaATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCa > 1:1126592/1‑140 (MQ=255)
caATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCac < 2:2352587/140‑2 (MQ=255)
tAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTTATTAAAAACAAATAACTATCCAACtt > 2:7680924/1‑140 (MQ=255)
cgCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTc < 2:2628211/139‑1 (MQ=255)
aCCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTAtt > 1:9437678/1‑140 (MQ=255)
aCCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTAtt > 1:1896825/1‑140 (MQ=255)
cGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTaa < 1:2069792/140‑1 (MQ=255)
cGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTaa < 1:3290918/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:6665379/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:7061721/140‑1 (MQ=255)
aTCGTATGTAATATGCATTATACAACCTCTTCGCCTGAAATAAATATGTAGGGAACCGTACCCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCt < 1:7567401/140‑1 (MQ=255)
aTCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTATGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTATATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCt < 1:1776083/140‑1 (MQ=255)
aTCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCt < 1:1776084/140‑1 (MQ=255)
tCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCtt < 1:3419964/140‑1 (MQ=255)
tATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAATCAAATAAATAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGt > 2:7081740/1‑140 (MQ=255)
tATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGt > 1:7742517/1‑140 (MQ=255)
tATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGt > 2:5694736/1‑140 (MQ=255)
aTGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTc < 2:4192261/140‑1 (MQ=255)
tGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCt < 1:251288/140‑1 (MQ=255)
tGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCt > 1:3318114/1‑140 (MQ=255)
tGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCt < 1:7903755/140‑1 (MQ=255)
gTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTa < 1:5279333/140‑1 (MQ=255)
aaTATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTaca < 2:6062683/140‑1 (MQ=255)
aaTATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTaca < 1:8355196/140‑1 (MQ=255)
atatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTacac < 2:9384275/140‑1 (MQ=255)
atatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTacac < 1:6588138/140‑1 (MQ=255)
atatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTacac < 2:6792134/140‑1 (MQ=255)
atatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTacac > 1:9848959/1‑140 (MQ=255)
tatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAcc < 1:7594309/140‑1 (MQ=255)
tatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAAACAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAcc < 2:8612642/140‑1 (MQ=255)
tatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCNGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAcc > 1:6310158/1‑140 (MQ=255)
cATTATCACACCTCTTCGCCTGAATTAAAGCTGTAGGGAACCGTAACCGACCCCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATGTATGTTTAAAGAAAAACAAAGAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCGACACCCagt > 2:3757897/1‑138 (MQ=255)
aTTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCt > 1:3691023/1‑124 (MQ=255)
aTTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATta > 1:6966539/1‑140 (MQ=255)
aTTAAAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGAAAACTGCAAGACAGACAGGTGGATGATTTATGTGTATCTAAAAACACCTAACTAACCATCGGCTTTTAAGGGCCTTCGTCTACACACAttg > 2:7983827/1‑139 (MQ=255)
ttATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtat < 1:383897/140‑1 (MQ=255)
ttATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtat < 1:9540756/140‑1 (MQ=255)
ttATAAAAACTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTATAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtat < 2:9018901/140‑1 (MQ=255)
tataAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtata > 2:4830898/1‑140 (MQ=255)
tataAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtata > 2:5227349/1‑140 (MQ=255)
tataAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtata > 2:9635476/1‑140 (MQ=255)
tataAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtata > 1:7047837/1‑140 (MQ=255)
taAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAg > 2:1462353/1‑140 (MQ=255)
aaaaCCTCTTCGCCTGAACTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGACTTCGTCTACACCCATTATAAGa > 1:8211487/1‑140 (MQ=255)
aaCCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATg > 1:7849168/1‑140 (MQ=255)
ccTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGaa < 2:5039761/140‑1 (MQ=255)
ctTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATCAAAACAAATAACAAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATAc > 2:1371711/1‑140 (MQ=255)
ctTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATAc > 2:7549528/1‑140 (MQ=255)
ctTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATAc > 2:5293068/1‑140 (MQ=255)
ttCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATAct > 2:5628339/1‑140 (MQ=255)
ttAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAATCAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTaa > 2:4465357/1‑140 (MQ=255)
gTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAATACAGACAGGTGGATTATAAATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTACTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTccacca > 1:487350/1‑140 (MQ=255)
gTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTa > 1:2036761/1‑100 (MQ=255)
gTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTa < 2:2036761/100‑1 (MQ=255)
gTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTccacca > 1:487145/1‑140 (MQ=255)
accgtaaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGa > 1:7802419/1‑140 (MQ=255)
accgtaaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACATCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGa > 1:2884412/1‑140 (MQ=255)
cgtaaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTACATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAtg < 2:4264161/140‑1 (MQ=255)
cgtaaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAtg > 2:5475385/1‑140 (MQ=255)
accgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAtgctgc > 1:4444965/1‑140 (MQ=255)
accccTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTACATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATGAATTGCGTTCGTCTACACCCCTGATAAGATGAATTCTCTTTGGCTAATGCCACAAAAACCGATGCTGCtttt > 2:3044439/4‑140 (MQ=255)
acacCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCtttt > 1:5281303/1‑140 (MQ=255)
acCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCtttttt > 2:476460/1‑140 (MQ=255)
acCTGCAAGACAGACAGGTGGATCATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCtttttt > 1:9837340/1‑140 (MQ=255)
cTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTaa > 2:2553480/1‑140 (MQ=255)
tGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAATCAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCCTTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAAt > 2:3609679/1‑140 (MQ=255)
tGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAAt > 1:993835/1‑140 (MQ=255)
cAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATAc > 2:8509072/1‑140 (MQ=255)
gacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc > 1:5269851/1‑61 (MQ=255)
gacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:5269851/61‑1 (MQ=255)
gacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTCATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAtt > 2:8664253/1‑140 (MQ=255)
gacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAtt > 2:8664301/1‑140 (MQ=255)
gacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAtt > 2:6004574/1‑140 (MQ=255)
gacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAtt > 1:8669443/1‑140 (MQ=255)
acagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAttt > 2:828341/1‑140 (MQ=255)
acagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAttt < 1:6031042/140‑1 (MQ=255)
acagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAttt > 1:5022167/1‑140 (MQ=255)
acagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCGATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATAAGATAAttg > 2:8835134/1‑139 (MQ=255)
agGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAttttt < 2:3752045/140‑1 (MQ=255)
ggTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTc > 1:9706379/1‑140 (MQ=255)
ggATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGAc < 1:855978/140‑1 (MQ=255)
gATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGAcc > 2:3868303/1‑140 (MQ=255)
ttatttatGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCAt > 2:1429304/1‑140 (MQ=255)
tatttatGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATa < 1:4539339/140‑1 (MQ=255)
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TATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATAT < SRR14920172.4575007/151‑1 (MQ=60)
TGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCC > SRR14920172.3998228/1‑151 (MQ=60)
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AAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATG > SRR14920172.7695529/1‑151 (MQ=60)
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TCGCTTCAATAATGTCATCAATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAATTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAACC > NZ_CP025268/3266662‑3266962
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
