Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R2
|
777 |
572.4 |
18918554 |
98.5% |
18634775 |
138.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,266,812 |
T→C |
*313* (TAA→TAG) |
tdcA ← |
transcriptional regulator TdcA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,266,812 | 0 | T | C | 100.0%
| 464.4
/ NA
| 138 | *313* (TAA→TAG) | tdcA | transcriptional regulator TdcA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (75/63); total (75/63) |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
ATCAATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAATTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGT > NZ_CP025268/3266678‑3266947
|
atcaATAGCAACCGGCAGATCGTATGTCATATGCATTATCAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATTTAGGTAACCGGAACCGACACCTGCAAGACCGACAGGTGGATTATTTATGTGTAAATAAAAACAAATAACTaaac > 2:8193315/1‑138 (MQ=255)
atcaATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAAcc < 2:2022683/140‑1 (MQ=255)
atcaATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAAcc < 2:6911042/140‑1 (MQ=255)
atcaATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAAcc < 1:2355907/140‑1 (MQ=255)
aGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTc < 2:8043502/140‑1 (MQ=255)
cAACCGGCAGATCGTATGAAATATGCATTATAAAAACTCTTCGCGTGAATTAAATTTTTAGGTAAACTTAACCGACACATGAAAGACATACAGGTGGATAATTTATTTTTAAATAAAATCAAATAACTAAGAAAATTCTa > 2:1998448/1‑140 (MQ=255)
aCCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTAtt > 2:534112/1‑140 (MQ=255)
cGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTaa < 2:7537970/140‑1 (MQ=255)
ggCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAAt > 1:2700606/1‑140 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTACATATGTCGGTAACCGTAACCGCCACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGATTAAATAAAAACAAATAACTAAACAACTTCTATTAATTGcc < 2:2020958/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 1:4628064/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 1:3554142/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 1:5892084/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 1:6209214/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 1:2917498/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 1:7809242/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 1:7809474/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTATATTAATTGcc < 2:1152968/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTAAGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:2547590/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGAATATTTATGTTTAAATAAAACCAAATAACTATACATCTTCTTTTAATTGcc < 2:7963195/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATGATAAACCCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:7861354/140‑1 (MQ=255)
ctCGTATGTAATAAGCATTATAAAACCTCTTCGCCAGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCt < 2:7428303/139‑1 (MQ=255)
aTCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCt < 2:3404915/140‑1 (MQ=255)
aTCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCt < 1:4716227/140‑1 (MQ=255)
aTCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCt > 2:4069438/1‑140 (MQ=255)
tGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCt < 1:546110/140‑1 (MQ=255)
gTAATATTCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTa < 2:7228585/140‑1 (MQ=255)
gTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTa > 1:4253495/1‑140 (MQ=255)
gTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTa < 2:7228471/140‑1 (MQ=255)
aaTATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGGTTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTgca < 2:6977259/140‑1 (MQ=255)
aaTATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTaca < 1:7449369/140‑1 (MQ=255)
atatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTacac < 1:1388867/140‑1 (MQ=255)
tatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCCAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTGTAAATAAACACCAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAcc > 2:2626771/1‑140 (MQ=255)
tatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCACCTTCTATTAATTTCCTTCGTCTACAcc > 2:7047236/1‑140 (MQ=255)
tatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAcc > 1:7552584/1‑140 (MQ=255)
atGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAccc < 1:4567537/140‑1 (MQ=255)
tGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATATCTAACCAACTTATATTTATTGCCTTCGTCTACACCCa < 2:9008996/140‑1 (MQ=255)
gCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCAt > 1:7233560/1‑140 (MQ=255)
cATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCAtt > 1:6420053/1‑140 (MQ=255)
cATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCAtt > 2:5572055/1‑140 (MQ=255)
cATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCAtt > 2:936735/1‑140 (MQ=255)
aTTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATta > 1:5989466/1‑140 (MQ=255)
aTTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATta > 1:5711828/1‑140 (MQ=255)
ttATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtat < 1:5572055/140‑1 (MQ=255)
tataAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtata > 1:910828/1‑140 (MQ=255)
tataAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtata > 1:1874686/1‑140 (MQ=255)
tataAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtata > 1:5219605/1‑140 (MQ=255)
ataAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATaa < 1:2815829/140‑1 (MQ=255)
ataAAACCTCGTCGCCTTAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTAAATATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTATATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATaa < 2:6340748/140‑1 (MQ=255)
ccTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGCCAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGaa < 2:6470629/140‑1 (MQ=255)
ccTCTGCGCCTGAATGACATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGaa < 1:8449039/140‑1 (MQ=255)
ctTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTCACCAACTTCTAGTAATTGACTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATAc > 2:4394184/1‑140 (MQ=255)
ctTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATAc > 1:8937758/1‑140 (MQ=255)
ctTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATAc > 2:4705267/1‑140 (MQ=255)
tcaaTATGTAGGTCACCGTAACCGACACCCGCAACACCGACACGTGGATTATTTAAGTTTAAATAAAACCACAGAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAAt < 2:8775779/138‑1 (MQ=255)
tAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCAGCCAGACCGACAGGTGGATTATTTATGATTAAATAAAAACAACTAACTAACCATCTTCAATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAAt < 2:5719060/140‑1 (MQ=255)
tAAATATGTACGAAACCGTAACCGACACCTGCAACACAGACAGGTGGATTATTTATGTATAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTCATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAAt < 2:8775783/140‑1 (MQ=255)
gTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTccacca > 2:5219527/1‑140 (MQ=255)
gTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTccacca > 2:9429152/1‑140 (MQ=255)
gTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTccacca > 1:301004/1‑140 (MQ=255)
gTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTccacca > 1:6980807/1‑140 (MQ=255)
taaccgtaaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAAcc > 1:7801217/1‑140 (MQ=255)
aaccgtaaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCg > 1:9452970/1‑140 (MQ=255)
accgtaaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAATCAAATAACTAACCAACTTCTCTTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTAGAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGa > 2:4963460/1‑140 (MQ=255)
accgtaaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGa > 2:7146072/1‑140 (MQ=255)
taaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAtgct > 1:226100/1‑140 (MQ=255)
acCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCtttttt > 1:4355902/1‑140 (MQ=255)
cAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATActct > 1:5748050/1‑100 (MQ=255)
cAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATActct < 2:5748050/100‑1 (MQ=255)
cagacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATaa > 2:35904/1‑140 (MQ=255)
agacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAt < 2:1784290/140‑1 (MQ=255)
gacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAATCAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAACCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAtt > 2:4823142/1‑140 (MQ=255)
gacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAtt > 1:2484770/1‑140 (MQ=255)
gacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAtt > 1:4112603/1‑140 (MQ=255)
gacagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAtt > 2:44285/1‑140 (MQ=255)
acagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAttt > 1:135667/1‑140 (MQ=255)
acagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAttt > 1:8603832/1‑140 (MQ=255)
agGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAttttt > 1:1560581/1‑140 (MQ=255)
tGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGa > 1:393888/1‑140 (MQ=255)
tGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGa > 2:923838/1‑140 (MQ=255)
ggATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGAc > 1:2006024/1‑140 (MQ=255)
gATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAGGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGAcc > 1:3182766/1‑140 (MQ=255)
attattTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATGGCCGTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTGCACCAAAACCGATGATGCTTTTTTAATAAGATAATTTTTCGAcaa > 2:6758365/1‑138 (MQ=255)
tatttatGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATa > 1:536475/1‑140 (MQ=255)
tttatGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCtt > 2:1615491/1‑50 (MQ=255)
tttatGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCtt < 1:1615491/50‑1 (MQ=255)
tttatGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATAcc > 1:7367476/1‑140 (MQ=255)
atGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACcgcg < 2:8611945/140‑1 (MQ=255)
tttAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCa < 1:3620113/140‑1 (MQ=255)
tttAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATCGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCa > 2:4852759/1‑140 (MQ=255)
taaataaaAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCata > 2:6101894/1‑140 (MQ=255)
taaataaaAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCata > 1:1928778/1‑140 (MQ=255)
taaataaaAACAAATAACTAACCAACTTCTACTAATTGCCCTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCata < 1:8164612/140‑1 (MQ=255)
aaCAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCca < 1:923838/140‑1 (MQ=255)
aaCAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCca < 2:2700606/140‑1 (MQ=255)
aaCAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCca < 2:2699882/140‑1 (MQ=255)
aCAAATAACTAACCAACTTCTAGTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCcac < 1:7897103/140‑1 (MQ=255)
ataacTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGt < 1:2608278/140‑1 (MQ=255)
ataacTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGt < 1:2608300/140‑1 (MQ=255)
ataacTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGt > 1:4845967/1‑140 (MQ=255)
|
ATCAATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAATTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGT > NZ_CP025268/3266678‑3266947
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCAATAATGTCATCAATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAATTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAACC > NZ_CP025268/3266667‑3266962
|
TCAATAATGTCATCAATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACC < SRR14920173.8868295/151‑1 (MQ=60)
ATCAATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTA < SRR14920173.2369655/151‑1 (MQ=60)
CAATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAAT > SRR14920173.2715728/1‑151 (MQ=60)
CAATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAAT > SRR14920173.2716454/1‑151 (MQ=60)
GCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTA > SRR14920173.4278281/1‑151 (MQ=60)
TATCGTATGTAAAATGCATGATAAAACCTCTTCGCCTGAATTATATATGTAGGTACCCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACCGGTGGTTTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCATATTATATTAATTGCCTTCGTCTACAC < SRR14920173.7633907/151‑1 (MQ=60)
GATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAC < SRR14920173.5926439/151‑1 (MQ=60)
GATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAC < SRR14920173.3574937/151‑1 (MQ=60)
GATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAC < SRR14920173.6245387/151‑1 (MQ=60)
GATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAC < SRR14920173.2934564/151‑1 (MQ=60)
GATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAC < SRR14920173.4654984/151‑1 (MQ=60)
GATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAC < SRR14920173.7855859/151‑1 (MQ=60)
GATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAC < SRR14920173.7855626/151‑1 (MQ=60)
ATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACC < SRR14920173.4743686/151‑1 (MQ=60)
ATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACC > SRR14920173.7597374/1‑151 (MQ=60)
ccccccccattttcaagcagaagacggcatacgagatgtagctccgtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagCAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCC < SRR14920173.1624913/72‑1 (MQ=60)
GTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCAT > SRR14920173.7276353/1‑151 (MQ=60)
TATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATT > SRR14920173.8333233/1‑151 (MQ=60)
TATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATT > SRR14920173.6457682/1‑151 (MQ=60)
ATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTA > SRR14920173.5745081/1‑151 (MQ=60)
ATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTA > SRR14920173.6024379/1‑151 (MQ=60)
TGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTAT < SRR14920173.549247/151‑1 (MQ=60)
GTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATA < SRR14920173.5736452/151‑1 (MQ=60)
GTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATA > SRR14920173.1885488/1‑151 (MQ=60)
GTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATA > SRR14920173.915999/1‑151 (MQ=60)
GTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATA > SRR14920173.5249854/1‑151 (MQ=60)
AATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAG < SRR14920173.7493487/151‑1 (MQ=60)
ATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGA < SRR14920173.1581087/151‑1 (MQ=60)
ATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGA < SRR14920173.1397007/151‑1 (MQ=60)
ATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCAGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGATTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATACGA < SRR14920173.3710862/151‑1 (MQ=60)
ATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATG < SRR14920173.4594086/151‑1 (MQ=60)
GCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAA > SRR14920173.7467216/1‑151 (MQ=60)
TTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATAC > SRR14920173.4248311/1‑151 (MQ=60)
TTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATAC < SRR14920173.5604491/151‑1 (MQ=60)
TTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATAC < SRR14920173.5840734/151‑1 (MQ=60)
TTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATAC > SRR14920173.8990896/1‑151 (MQ=60)
ATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTC < SRR14920173.2832346/151‑1 (MQ=60)
CCTCTGCGCCTGAATGACATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGC < SRR14920173.8499390/151‑1 (MQ=60)
GAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCA > SRR14920173.302788/1‑151 (MQ=60)
GAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCA > SRR14920173.7022031/1‑151 (MQ=60)
AATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAA > SRR14920173.7202990/1‑151 (MQ=60)
AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACC > SRR14920173.7847559/1‑151 (MQ=60)
AATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCG > SRR14920173.9509304/1‑151 (MQ=60)
TGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGC < SRR14920173.3387205/151‑1 (MQ=60)
GTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCT > SRR14920173.227463/1‑151 (MQ=60)
gaagacggattacgcgatgtagctccgtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagactAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGTCTAATTCCACCAAAACCGATGCTG < SRR14920173.5635719/88‑1 (MQ=60)
AGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGC > SRR14920173.4635063/1‑151 (MQ=60)
AGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGC > SRR14920173.1893069/1‑151 (MQ=60)
CCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTT > SRR14920173.4381284/1‑151 (MQ=60)
ACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCtgtctcttatacacatctccgagcccac > SRR14920173.5781484/1‑123 (MQ=60)
CCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATT > SRR14920173.2499266/1‑151 (MQ=60)
CCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATT > SRR14920173.4136511/1‑151 (MQ=60)
CTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTT > SRR14920173.136522/1‑151 (MQ=60)
CTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTT > SRR14920173.8655119/1‑151 (MQ=60)
GCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTT > SRR14920173.1569680/1‑151 (MQ=60)
CAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTC > SRR14920173.2579083/1‑151 (MQ=60)
CAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTC > SRR14920173.6043542/1‑151 (MQ=60)
AGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGA > SRR14920173.396193/1‑151 (MQ=60)
GACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGAC > SRR14920173.2017570/1‑151 (MQ=60)
GACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGAC < SRR14920173.9335858/151‑1 (MQ=60)
ACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAGGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACC > SRR14920173.3201390/1‑151 (MQ=60)
GACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATA > SRR14920173.538564/1‑151 (MQ=60)
GACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATA > SRR14920173.539560/1‑151 (MQ=60)
CAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACC > SRR14920173.7411110/1‑151 (MQ=60)
CAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACC > SRR14920173.2885586/1‑151 (MQ=60)
CAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACC > SRR14920173.7871014/1‑151 (MQ=60)
TTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATA > SRR14920173.1939885/1‑151 (MQ=60)
tgtataagagacagAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTG < SRR14920173.4411416/137‑1 (MQ=60)
GTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCA > SRR14920173.8811395/1‑151 (MQ=60)
TTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCAC < SRR14920173.3641286/151‑1 (MQ=60)
TAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTACTAATTGCCCTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAG < SRR14920173.8213110/151‑1 (MQ=60)
AATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGT > SRR14920173.4874092/1‑151 (MQ=60)
AATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGT > SRR14920173.4874129/1‑151 (MQ=60)
AATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGT < SRR14920173.2054656/151‑1 (MQ=60)
AAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacggagctacatc > SRR14920173.824253/1‑106 (MQ=60)
AAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATG > SRR14920173.5239847/1‑151 (MQ=60)
AACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTT < SRR14920173.929088/151‑1 (MQ=60)
ACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACGGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTT > SRR14920173.8412171/1‑151 (MQ=60)
ACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTACTGTTT > SRR14920173.8320889/1‑151 (MQ=60)
ACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTT > SRR14920173.8575860/1‑151 (MQ=60)
ACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTT > SRR14920173.8320235/1‑151 (MQ=60)
ACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTT > SRR14920173.9009961/1‑151 (MQ=60)
ACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTT > SRR14920173.2195942/1‑151 (MQ=60)
ACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTT > SRR14920173.2704097/1‑151 (MQ=60)
ACAAATAACTAACCAACTTCTAGTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTT < SRR14920173.7943988/151‑1 (MQ=60)
CAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCTACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTC > SRR14920173.3547996/1‑151 (MQ=60)
CAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTCATGTTTC > SRR14920173.8131521/1‑151 (MQ=60)
CAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTC > SRR14920173.1668390/1‑151 (MQ=60)
CAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTC > SRR14920173.4121903/1‑151 (MQ=60)
CAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTC > SRR14920173.7658693/1‑151 (MQ=60)
CAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTC > SRR14920173.9128820/1‑151 (MQ=60)
CAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTC > SRR14920173.4374750/1‑151 (MQ=60)
CAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTC > SRR14920173.2536782/1‑151 (MQ=60)
CAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTC > SRR14920173.5569067/1‑151 (MQ=60)
ATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTC < SRR14920173.2623595/151‑1 (MQ=60)
ATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTC < SRR14920173.2623572/151‑1 (MQ=60)
TAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCA > SRR14920173.1848219/1‑151 (MQ=60)
TAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCA > SRR14920173.1078749/1‑151 (MQ=60)
TAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCA > SRR14920173.1959956/1‑151 (MQ=60)
TAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCA > SRR14920173.822779/1‑151 (MQ=60)
TAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCA > SRR14920173.3578846/1‑151 (MQ=60)
ACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGActgtctcttatacacatctccgagcccacgagacggagctacatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaatgggggggggggggggggggggggggggggggggg > SRR14920173.2502488/1‑46 (MQ=60)
CTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAACC > SRR14920173.2322750/1‑151 (MQ=60)
CTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAACC > SRR14920173.6985257/1‑151 (MQ=60)
CTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAACC > SRR14920173.4058087/1‑151 (MQ=60)
CTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAACC > SRR14920173.5021264/1‑151 (MQ=60)
|
TCAATAATGTCATCAATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAATTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAACC > NZ_CP025268/3266667‑3266962
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
